MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli O104:H4 str. 2009EL-2050 plasmid p09EL50

Total Repeats: 126

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018651	AC	3	6	4557	4562	50 %	0 %	0 %	50 %	410485114
2	NC_018651	AT	3	6	5911	5916	50 %	50 %	0 %	0 %	410485116
3	NC_018651	TA	3	6	6349	6354	50 %	50 %	0 %	0 %	410485118
4	NC_018651	AG	3	6	6955	6960	50 %	0 %	50 %	0 %	410485118
5	NC_018651	GC	3	6	7444	7449	0 %	0 %	50 %	50 %	410485119
6	NC_018651	CA	3	6	7523	7528	50 %	0 %	0 %	50 %	410485119
7	NC_018651	AG	3	6	7736	7741	50 %	0 %	50 %	0 %	410485120
8	NC_018651	AG	4	8	8968	8975	50 %	0 %	50 %	0 %	410485121
9	NC_018651	TG	3	6	9408	9413	0 %	50 %	50 %	0 %	410485121
10	NC_018651	TC	3	6	11524	11529	0 %	50 %	0 %	50 %	410485123
11	NC_018651	CT	3	6	12644	12649	0 %	50 %	0 %	50 %	410485124
12	NC_018651	GA	3	6	12660	12665	50 %	0 %	50 %	0 %	410485124
13	NC_018651	AC	3	6	13604	13609	50 %	0 %	0 %	50 %	410485126
14	NC_018651	GT	3	6	15242	15247	0 %	50 %	50 %	0 %	410485128
15	NC_018651	TC	3	6	15902	15907	0 %	50 %	0 %	50 %	410485129
16	NC_018651	GT	3	6	17168	17173	0 %	50 %	50 %	0 %	410485130
17	NC_018651	TG	3	6	17239	17244	0 %	50 %	50 %	0 %	410485130
18	NC_018651	TC	3	6	17581	17586	0 %	50 %	0 %	50 %	410485130
19	NC_018651	GT	3	6	17884	17889	0 %	50 %	50 %	0 %	410485130
20	NC_018651	CA	3	6	18633	18638	50 %	0 %	0 %	50 %	410485132
21	NC_018651	AT	3	6	18744	18749	50 %	50 %	0 %	0 %	410485132
22	NC_018651	CG	3	6	21731	21736	0 %	0 %	50 %	50 %	410485137
23	NC_018651	GC	3	6	22015	22020	0 %	0 %	50 %	50 %	410485138
24	NC_018651	AT	3	6	22104	22109	50 %	50 %	0 %	0 %	410485138
25	NC_018651	AG	3	6	23889	23894	50 %	0 %	50 %	0 %	410485140
26	NC_018651	CT	3	6	24652	24657	0 %	50 %	0 %	50 %	410485142
27	NC_018651	CA	3	6	25221	25226	50 %	0 %	0 %	50 %	410485143
28	NC_018651	AG	3	6	28944	28949	50 %	0 %	50 %	0 %	410485147
29	NC_018651	GA	3	6	29660	29665	50 %	0 %	50 %	0 %	410485147
30	NC_018651	GC	3	6	29999	30004	0 %	0 %	50 %	50 %	410485147
31	NC_018651	AC	3	6	30326	30331	50 %	0 %	0 %	50 %	410485148
32	NC_018651	TC	3	6	31136	31141	0 %	50 %	0 %	50 %	410485148
33	NC_018651	TC	3	6	33132	33137	0 %	50 %	0 %	50 %	410485151
34	NC_018651	AG	3	6	33644	33649	50 %	0 %	50 %	0 %	410485153
35	NC_018651	AC	3	6	34549	34554	50 %	0 %	0 %	50 %	410485155
36	NC_018651	TC	3	6	35273	35278	0 %	50 %	0 %	50 %	410485157
37	NC_018651	CA	3	6	35296	35301	50 %	0 %	0 %	50 %	410485157
38	NC_018651	CA	3	6	35304	35309	50 %	0 %	0 %	50 %	410485157
39	NC_018651	CA	3	6	36615	36620	50 %	0 %	0 %	50 %	410485160
40	NC_018651	TC	3	6	36677	36682	0 %	50 %	0 %	50 %	410485160
41	NC_018651	AG	3	6	37477	37482	50 %	0 %	50 %	0 %	410485162
42	NC_018651	GC	3	6	37897	37902	0 %	0 %	50 %	50 %	410485162
43	NC_018651	CT	3	6	38365	38370	0 %	50 %	0 %	50 %	410485163
44	NC_018651	AG	3	6	38502	38507	50 %	0 %	50 %	0 %	410485163
45	NC_018651	AG	3	6	39355	39360	50 %	0 %	50 %	0 %	410485163
46	NC_018651	TA	3	6	40006	40011	50 %	50 %	0 %	0 %	410485164
47	NC_018651	TA	3	6	40057	40062	50 %	50 %	0 %	0 %	410485164
48	NC_018651	TA	3	6	40129	40134	50 %	50 %	0 %	0 %	410485164
49	NC_018651	CA	3	6	40539	40544	50 %	0 %	0 %	50 %	410485164
50	NC_018651	TG	3	6	40944	40949	0 %	50 %	50 %	0 %	410485165
51	NC_018651	AG	3	6	41141	41146	50 %	0 %	50 %	0 %	410485165
52	NC_018651	CT	3	6	41262	41267	0 %	50 %	0 %	50 %	410485165
53	NC_018651	CT	3	6	41364	41369	0 %	50 %	0 %	50 %	410485165
54	NC_018651	TC	3	6	41777	41782	0 %	50 %	0 %	50 %	410485166
55	NC_018651	AG	3	6	45285	45290	50 %	0 %	50 %	0 %	410485172
56	NC_018651	TA	3	6	46596	46601	50 %	50 %	0 %	0 %	410485174
57	NC_018651	AG	3	6	46608	46613	50 %	0 %	50 %	0 %	410485174
58	NC_018651	GA	3	6	47779	47784	50 %	0 %	50 %	0 %	410485176
59	NC_018651	AT	3	6	48112	48117	50 %	50 %	0 %	0 %	410485176
60	NC_018651	CA	3	6	48390	48395	50 %	0 %	0 %	50 %	410485177
61	NC_018651	CA	4	8	49213	49220	50 %	0 %	0 %	50 %	410485179
62	NC_018651	GT	3	6	49663	49668	0 %	50 %	50 %	0 %	410485179
63	NC_018651	GT	3	6	51383	51388	0 %	50 %	50 %	0 %	410485181
64	NC_018651	CA	3	6	54168	54173	50 %	0 %	0 %	50 %	410485182
65	NC_018651	GA	3	6	54928	54933	50 %	0 %	50 %	0 %	410485183
66	NC_018651	CA	3	6	55180	55185	50 %	0 %	0 %	50 %	410485183
67	NC_018651	AG	3	6	56504	56509	50 %	0 %	50 %	0 %	410485185
68	NC_018651	CG	4	8	57216	57223	0 %	0 %	50 %	50 %	410485185
69	NC_018651	CA	3	6	58381	58386	50 %	0 %	0 %	50 %	410485186
70	NC_018651	TA	3	6	59150	59155	50 %	50 %	0 %	0 %	410485186
71	NC_018651	GT	3	6	60109	60114	0 %	50 %	50 %	0 %	410485187
72	NC_018651	CA	3	6	63524	63529	50 %	0 %	0 %	50 %	410485193
73	NC_018651	TG	3	6	63554	63559	0 %	50 %	50 %	0 %	410485193
74	NC_018651	AT	3	6	64089	64094	50 %	50 %	0 %	0 %	410485194
75	NC_018651	CT	3	6	64202	64207	0 %	50 %	0 %	50 %	410485194
76	NC_018651	TA	3	6	64584	64589	50 %	50 %	0 %	0 %	410485195
77	NC_018651	GT	3	6	65505	65510	0 %	50 %	50 %	0 %	410485196
78	NC_018651	AG	3	6	66510	66515	50 %	0 %	50 %	0 %	410485197
79	NC_018651	AG	3	6	69537	69542	50 %	0 %	50 %	0 %	410485202
80	NC_018651	CT	3	6	69548	69553	0 %	50 %	0 %	50 %	410485202
81	NC_018651	GA	3	6	69900	69905	50 %	0 %	50 %	0 %	410485202
82	NC_018651	CG	3	6	73106	73111	0 %	0 %	50 %	50 %	410485204
83	NC_018651	GT	3	6	73767	73772	0 %	50 %	50 %	0 %	410485204
84	NC_018651	GT	3	6	74397	74402	0 %	50 %	50 %	0 %	410485204
85	NC_018651	AG	3	6	74720	74725	50 %	0 %	50 %	0 %	410485204
86	NC_018651	TC	3	6	76353	76358	0 %	50 %	0 %	50 %	410485206
87	NC_018651	TC	3	6	76450	76455	0 %	50 %	0 %	50 %	410485206
88	NC_018651	GC	3	6	76469	76474	0 %	0 %	50 %	50 %	410485206
89	NC_018651	GA	3	6	76673	76678	50 %	0 %	50 %	0 %	410485206
90	NC_018651	AT	3	6	77056	77061	50 %	50 %	0 %	0 %	410485206
91	NC_018651	TG	3	6	77543	77548	0 %	50 %	50 %	0 %	410485206
92	NC_018651	GC	4	8	77912	77919	0 %	0 %	50 %	50 %	410485206
93	NC_018651	TC	3	6	78100	78105	0 %	50 %	0 %	50 %	410485206
94	NC_018651	AC	3	6	78116	78121	50 %	0 %	0 %	50 %	410485206
95	NC_018651	CA	3	6	79914	79919	50 %	0 %	0 %	50 %	410485209
96	NC_018651	AT	3	6	79933	79938	50 %	50 %	0 %	0 %	410485209
97	NC_018651	GA	3	6	80089	80094	50 %	0 %	50 %	0 %	410485209
98	NC_018651	AT	3	6	80968	80973	50 %	50 %	0 %	0 %	410485210
99	NC_018651	AT	3	6	81002	81007	50 %	50 %	0 %	0 %	410485210
100	NC_018651	CT	4	8	81435	81442	0 %	50 %	0 %	50 %	410485210
101	NC_018651	AC	3	6	84688	84693	50 %	0 %	0 %	50 %	410485212
102	NC_018651	GT	3	6	85401	85406	0 %	50 %	50 %	0 %	410485215
103	NC_018651	TG	3	6	85631	85636	0 %	50 %	50 %	0 %	410485215
104	NC_018651	GA	3	6	85918	85923	50 %	0 %	50 %	0 %	410485215
105	NC_018651	TC	3	6	87282	87287	0 %	50 %	0 %	50 %	410485217
106	NC_018651	TC	3	6	87379	87384	0 %	50 %	0 %	50 %	410485217
107	NC_018651	GA	3	6	89765	89770	50 %	0 %	50 %	0 %	410485219
108	NC_018651	GC	3	6	90291	90296	0 %	0 %	50 %	50 %	410485219
109	NC_018651	TA	3	6	90544	90549	50 %	50 %	0 %	0 %	410485220
110	NC_018651	AG	3	6	90762	90767	50 %	0 %	50 %	0 %	410485220
111	NC_018651	TA	3	6	91880	91885	50 %	50 %	0 %	0 %	410485221
112	NC_018651	TG	3	6	91951	91956	0 %	50 %	50 %	0 %	410485221
113	NC_018651	TA	3	6	93702	93707	50 %	50 %	0 %	0 %	410485223
114	NC_018651	CG	3	6	93808	93813	0 %	0 %	50 %	50 %	410485223
115	NC_018651	GA	3	6	94860	94865	50 %	0 %	50 %	0 %	410485225
116	NC_018651	CT	3	6	96699	96704	0 %	50 %	0 %	50 %	410485228
117	NC_018651	TC	3	6	96756	96761	0 %	50 %	0 %	50 %	410485228
118	NC_018651	AG	3	6	97691	97696	50 %	0 %	50 %	0 %	410485230
119	NC_018651	TA	3	6	98459	98464	50 %	50 %	0 %	0 %	410485230
120	NC_018651	CT	3	6	100070	100075	0 %	50 %	0 %	50 %	410485230
121	NC_018651	AC	3	6	100774	100779	50 %	0 %	0 %	50 %	410485230
122	NC_018651	TG	3	6	102055	102060	0 %	50 %	50 %	0 %	410485231
123	NC_018651	AT	3	6	102116	102121	50 %	50 %	0 %	0 %	410485231
124	NC_018651	TG	3	6	102244	102249	0 %	50 %	50 %	0 %	410485231
125	NC_018651	GA	3	6	103696	103701	50 %	0 %	50 %	0 %	410485231
126	NC_018651	AC	3	6	107295	107300	50 %	0 %	0 %	50 %	410485234

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.