MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli O104:H4 str. 2009EL-2050 chromosome

Total Repeats: 66657

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018650	CCG	2	6	28	33	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410480140
2	NC_018650	GCA	2	6	50	55	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410480140
3	NC_018650	TAA	2	6	200	205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410480140
4	NC_018650	TGC	2	6	356	361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480140
5	NC_018650	GGC	2	6	488	493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410480140
6	NC_018650	GTT	2	6	533	538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410480140
7	NC_018650	GGC	2	6	546	551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410480140
8	NC_018650	CTG	2	6	573	578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480140
9	NC_018650	AAC	2	6	678	683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410480140
10	NC_018650	CTA	2	6	704	709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410480140
11	NC_018650	CTG	2	6	726	731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480140
12	NC_018650	CGA	2	6	734	739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410480140
13	NC_018650	TAA	2	6	755	760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410480140
14	NC_018650	CTG	2	6	801	806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480140
15	NC_018650	TGA	2	6	949	954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410480140
16	NC_018650	CGA	2	6	962	967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410480140
17	NC_018650	AGA	2	6	1171	1176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410480140
18	NC_018650	TAC	2	6	1188	1193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410480140
19	NC_018650	TGG	2	6	1319	1324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410480140
20	NC_018650	ACG	2	6	1335	1340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410480140
21	NC_018650	AGA	2	6	1397	1402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410480140
22	NC_018650	TTA	2	6	1468	1473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410480141
23	NC_018650	ACA	2	6	1482	1487	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410480141
24	NC_018650	GGT	2	6	1504	1509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410480141
25	NC_018650	CTG	2	6	1537	1542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480141
26	NC_018650	TGG	2	6	1598	1603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410480141
27	NC_018650	CGA	2	6	1640	1645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410480141
28	NC_018650	GCG	2	6	1777	1782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410480141
29	NC_018650	GAA	2	6	1933	1938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410480141
30	NC_018650	CGG	2	6	2064	2069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410480141
31	NC_018650	GCA	2	6	2096	2101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410480141
32	NC_018650	TGG	2	6	2147	2152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410480141
33	NC_018650	CCG	2	6	2172	2177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410480141
34	NC_018650	GAA	2	6	2187	2192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410480141
35	NC_018650	CAA	2	6	2322	2327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410480141
36	NC_018650	GAA	2	6	2338	2343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410480141
37	NC_018650	ATG	2	6	2452	2457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410480141
38	NC_018650	TGT	2	6	2517	2522	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410480141
39	NC_018650	TTG	2	6	2556	2561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410480142
40	NC_018650	AGG	2	6	2734	2739	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410480142
41	NC_018650	CGG	2	6	2918	2923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410480142
42	NC_018650	AGA	2	6	2934	2939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410480142
43	NC_018650	AGC	2	6	3016	3021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410480142
44	NC_018650	GCG	2	6	3027	3032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410480142
45	NC_018650	GAT	2	6	3444	3449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410480142
46	NC_018650	TGA	3	9	3464	3472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410480142
47	NC_018650	GCT	2	6	3482	3487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480142
48	NC_018650	CTC	2	6	3660	3665	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410480143
49	NC_018650	CAC	2	6	3751	3756	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410480143
50	NC_018650	GGT	2	6	3768	3773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410480143
51	NC_018650	CGA	2	6	3786	3791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410480143
52	NC_018650	CGG	3	9	3908	3916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410480143
53	NC_018650	CGG	2	6	3978	3983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410480143
54	NC_018650	GTA	2	6	4006	4011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410480143
55	NC_018650	AGA	2	6	4278	4283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410480143
56	NC_018650	GGC	2	6	4300	4305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410480143
57	NC_018650	TCT	2	6	4361	4366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410480143
58	NC_018650	CAA	2	6	4452	4457	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410480143
59	NC_018650	CGG	2	6	4473	4478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410480143
60	NC_018650	GCG	2	6	4501	4506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410480143
61	NC_018650	AAG	2	6	4538	4543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410480143
62	NC_018650	TCC	2	6	4639	4644	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410480143
63	NC_018650	TCT	2	6	4666	4671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410480143
64	NC_018650	CAG	2	6	4693	4698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410480143
65	NC_018650	CTG	2	6	4723	4728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480143
66	NC_018650	TGC	2	6	4773	4778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480143
67	NC_018650	GCG	2	6	4792	4797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410480143
68	NC_018650	CCG	2	6	4818	4823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410480143
69	NC_018650	TGG	2	6	4907	4912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410480143
70	NC_018650	GGC	2	6	4927	4932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410480143
71	NC_018650	CAT	4	12	5118	5129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410480143
72	NC_018650	GCT	2	6	5166	5171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480143
73	NC_018650	CTT	2	6	5178	5183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410480143
74	NC_018650	GCC	2	6	5235	5240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410480143
75	NC_018650	GAA	2	6	5253	5258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410480143
76	NC_018650	GAC	2	6	5284	5289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410480143
77	NC_018650	CGT	2	6	5437	5442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480143
78	NC_018650	TGG	2	6	5691	5696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410480143
79	NC_018650	TCG	2	6	5703	5708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480143
80	NC_018650	GAA	2	6	5746	5751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410480143
81	NC_018650	CGT	2	6	5776	5781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480143
82	NC_018650	TCG	2	6	5832	5837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480143
83	NC_018650	ACC	2	6	5899	5904	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410480143
84	NC_018650	GTC	2	6	5918	5923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480143
85	NC_018650	TGC	2	6	5927	5932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480143
86	NC_018650	GTT	2	6	5967	5972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410480143
87	NC_018650	CAC	2	6	5973	5978	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410480143
88	NC_018650	CGT	2	6	6004	6009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480143
89	NC_018650	GCG	2	6	6037	6042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410480143
90	NC_018650	TTA	2	6	6095	6100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410480144
91	NC_018650	CGC	2	6	6164	6169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410480144
92	NC_018650	AAG	2	6	6177	6182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410480144
93	NC_018650	ATC	2	6	6202	6207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410480144
94	NC_018650	ATC	2	6	6239	6244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410480144
95	NC_018650	TGA	2	6	6308	6313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410480145
96	NC_018650	GAG	2	6	6375	6380	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410480145
97	NC_018650	GGC	2	6	6384	6389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410480145
98	NC_018650	TGC	2	6	6397	6402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480145
99	NC_018650	GGC	2	6	6420	6425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410480145
100	NC_018650	ATT	2	6	6594	6599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410480145
101	NC_018650	CAC	2	6	6628	6633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410480145
102	NC_018650	CTG	2	6	6669	6674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480145
103	NC_018650	CTG	2	6	6852	6857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480146
104	NC_018650	CCG	2	6	6877	6882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410480146
105	NC_018650	ACG	2	6	6933	6938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410480146
106	NC_018650	ACT	2	6	7000	7005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410480146
107	NC_018650	GCC	2	6	7038	7043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410480146
108	NC_018650	GAC	2	6	7080	7085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410480146
109	NC_018650	CAC	2	6	7145	7150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410480146
110	NC_018650	CTA	2	6	7178	7183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410480146
111	NC_018650	CCA	2	6	7207	7212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410480146
112	NC_018650	TGA	3	9	7270	7278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410480146
113	NC_018650	TGA	2	6	7280	7285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410480146
114	NC_018650	GAA	2	6	7446	7451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410480146
115	NC_018650	AAG	2	6	7543	7548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410480146
116	NC_018650	ATT	2	6	7667	7672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410480147
117	NC_018650	ATG	2	6	7714	7719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410480147
118	NC_018650	TGC	2	6	7746	7751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480147
119	NC_018650	TCT	2	6	7945	7950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410480147
120	NC_018650	AGT	3	9	7961	7969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410480147
121	NC_018650	CAT	2	6	8730	8735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410480148
122	NC_018650	TGG	2	6	8912	8917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410480148
123	NC_018650	GCA	2	6	8938	8943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410480148
124	NC_018650	GAT	2	6	8994	8999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410480148
125	NC_018650	CAA	2	6	9003	9008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410480148
126	NC_018650	TGC	2	6	9059	9064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480148
127	NC_018650	GGC	2	6	9237	9242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410480148
128	NC_018650	GCA	2	6	9490	9495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410480149
129	NC_018650	ATT	2	6	9588	9593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410480149
130	NC_018650	GCG	2	6	9637	9642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410480149
131	NC_018650	TGA	2	6	9760	9765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410480149
132	NC_018650	CAT	2	6	9777	9782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410480149
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134	NC_018650	TTG	2	6	9969	9974	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410480149
135	NC_018650	CGG	2	6	10099	10104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410480149
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139	NC_018650	GCA	2	6	10719	10724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410480150
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142	NC_018650	GGC	2	6	11082	11087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410480151
143	NC_018650	CGG	2	6	11123	11128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410480151
144	NC_018650	CGG	2	6	11137	11142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410480151
145	NC_018650	GAA	2	6	11208	11213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410480151
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149	NC_018650	ATG	2	6	11596	11601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410480151
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154	NC_018650	CGA	2	6	11819	11824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410480151
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159	NC_018650	CCG	2	6	12450	12455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410480152
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162	NC_018650	GCC	2	6	12607	12612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410480152
163	NC_018650	GGC	2	6	12662	12667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410480152
164	NC_018650	TGG	2	6	12672	12677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410480152
165	NC_018650	GAA	2	6	12694	12699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410480152
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254	NC_018650	ATC	2	6	19860	19865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410480159
255	NC_018650	GGC	2	6	20184	20189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410480160
256	NC_018650	TGC	2	6	20206	20211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480160
257	NC_018650	TGG	2	6	20233	20238	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410480160
258	NC_018650	TGC	2	6	20251	20256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480160
259	NC_018650	ATT	2	6	20322	20327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410480160
260	NC_018650	TCA	2	6	20461	20466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410480160
261	NC_018650	ATG	2	6	20544	20549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410480160
262	NC_018650	TGA	2	6	20704	20709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410480160
263	NC_018650	CGG	2	6	20788	20793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410480160
264	NC_018650	GGC	2	6	20901	20906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410480160
265	NC_018650	GCA	2	6	20924	20929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410480160
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267	NC_018650	TGG	2	6	21118	21123	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410480160
268	NC_018650	ATG	2	6	21312	21317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410480160
269	NC_018650	CTG	2	6	21351	21356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480160
270	NC_018650	ACC	2	6	21471	21476	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410480160
271	NC_018650	TCA	2	6	21734	21739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410480160
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273	NC_018650	ACC	2	6	21977	21982	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410480161
274	NC_018650	GTT	2	6	22088	22093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410480161
275	NC_018650	CGG	2	6	22114	22119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410480161
276	NC_018650	GGC	2	6	22145	22150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410480161
277	NC_018650	TGG	2	6	22161	22166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410480161
278	NC_018650	ACT	2	6	22206	22211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410480161
279	NC_018650	CGT	2	6	22244	22249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480161
280	NC_018650	TTG	2	6	22320	22325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410480161
281	NC_018650	CTA	2	6	22357	22362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410480161
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283	NC_018650	CAA	2	6	22560	22565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410480162
284	NC_018650	GAA	2	6	22695	22700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410480163
285	NC_018650	TTG	2	6	22737	22742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410480163
286	NC_018650	GAC	2	6	22823	22828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410480163
287	NC_018650	GTT	2	6	22883	22888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410480163
288	NC_018650	GCC	2	6	22928	22933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410480163
289	NC_018650	ATT	2	6	23013	23018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410480163
290	NC_018650	TTA	2	6	23039	23044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410480163
291	NC_018650	CAT	2	6	23121	23126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410480163
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293	NC_018650	CCT	2	6	23241	23246	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410480164
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297	NC_018650	CTG	2	6	23674	23679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480165
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323	NC_018650	GGC	2	6	25725	25730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410480167
324	NC_018650	GAT	2	6	25965	25970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410480167
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326	NC_018650	GAT	2	6	26025	26030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410480167
327	NC_018650	GCC	2	6	26044	26049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410480167
328	NC_018650	GGC	2	6	26081	26086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410480167
329	NC_018650	TCA	2	6	26158	26163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410480168
330	NC_018650	CCA	2	6	26179	26184	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410480168
331	NC_018650	GGC	2	6	26240	26245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410480168
332	NC_018650	CAA	2	6	26351	26356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410480168
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340	NC_018650	TCA	2	6	26929	26934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410480168
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364	NC_018650	GTT	3	9	28401	28409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410480170
365	NC_018650	CGG	2	6	28422	28427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410480170
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371	NC_018650	TGC	2	6	29417	29422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480172
372	NC_018650	CAA	2	6	29495	29500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410480173
373	NC_018650	TCA	2	6	29512	29517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410480173
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375	NC_018650	CGC	2	6	29650	29655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410480173
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