MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Enterococcus faecium DO plasmid 3

Total Repeats: 178

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017963	CCATT	2	10	1393	1402	20 %	40 %	0 %	40 %	389869888
2	NC_017963	TTTTG	2	10	2868	2877	0 %	80 %	20 %	0 %	389869889
3	NC_017963	TTTTC	2	10	3450	3459	0 %	80 %	0 %	20 %	389869889
4	NC_017963	TCTCT	2	10	3688	3697	0 %	60 %	0 %	40 %	389869889
5	NC_017963	TTTCC	2	10	6473	6482	0 %	60 %	0 %	40 %	389869893
6	NC_017963	TTCTT	2	10	8578	8587	0 %	80 %	0 %	20 %	389869895
7	NC_017963	TGTAC	2	10	16573	16582	20 %	40 %	20 %	20 %	389869904
8	NC_017963	TAAAA	2	10	18089	18098	80 %	20 %	0 %	0 %	389869905
9	NC_017963	TAAGC	2	10	19722	19731	40 %	20 %	20 %	20 %	389869905
10	NC_017963	TTTCG	2	10	21579	21588	0 %	60 %	20 %	20 %	389869906
11	NC_017963	GTTTT	2	10	23856	23865	0 %	80 %	20 %	0 %	389869910
12	NC_017963	TGGAT	2	10	25019	25028	20 %	40 %	40 %	0 %	389869910
13	NC_017963	TTGAT	2	10	29524	29533	20 %	60 %	20 %	0 %	389869915
14	NC_017963	ATGGA	2	10	37647	37656	40 %	20 %	40 %	0 %	389869926
15	NC_017963	CGGGC	2	10	38867	38876	0 %	0 %	60 %	40 %	389869927
16	NC_017963	GATTT	2	10	42482	42491	20 %	60 %	20 %	0 %	389869934
17	NC_017963	TAATT	2	10	42773	42782	40 %	60 %	0 %	0 %	389869934
18	NC_017963	TTTGC	2	10	44560	44569	0 %	60 %	20 %	20 %	389869935
19	NC_017963	ATTAA	2	10	45893	45902	60 %	40 %	0 %	0 %	389869937
20	NC_017963	AAGAA	2	10	50447	50456	80 %	0 %	20 %	0 %	389869941
21	NC_017963	ATTTT	2	10	51762	51771	20 %	80 %	0 %	0 %	389869942
22	NC_017963	TTTCT	2	10	53563	53572	0 %	80 %	0 %	20 %	389869943
23	NC_017963	GTTTG	2	10	55082	55091	0 %	60 %	40 %	0 %	389869944
24	NC_017963	ATTTA	2	10	55279	55288	40 %	60 %	0 %	0 %	389869945
25	NC_017963	ATGTA	2	10	57730	57739	40 %	40 %	20 %	0 %	389869948
26	NC_017963	GAACA	2	10	59612	59621	60 %	0 %	20 %	20 %	389869951
27	NC_017963	GATAT	2	10	62121	62130	40 %	40 %	20 %	0 %	389869952
28	NC_017963	AACGA	2	10	65725	65734	60 %	0 %	20 %	20 %	389869956
29	NC_017963	TCGCT	2	10	66090	66099	0 %	40 %	20 %	40 %	389869957
30	NC_017963	GAAAA	2	10	66934	66943	80 %	0 %	20 %	0 %	389869958
31	NC_017963	AATTT	2	10	69935	69944	40 %	60 %	0 %	0 %	389869963
32	NC_017963	TGATG	2	10	70567	70576	20 %	40 %	40 %	0 %	389869964
33	NC_017963	TCCTT	2	10	74141	74150	0 %	60 %	0 %	40 %	389869970
34	NC_017963	ATTTG	2	10	74619	74628	20 %	60 %	20 %	0 %	389869970
35	NC_017963	TTCAT	2	10	74735	74744	20 %	60 %	0 %	20 %	389869970
36	NC_017963	CGTTG	2	10	77258	77267	0 %	40 %	40 %	20 %	389869974
37	NC_017963	CAAAA	2	10	80437	80446	80 %	0 %	0 %	20 %	389869977
38	NC_017963	TGGAT	2	10	80765	80774	20 %	40 %	40 %	0 %	389869977
39	NC_017963	TTTTA	2	10	80818	80827	20 %	80 %	0 %	0 %	389869977
40	NC_017963	CAAAA	2	10	81185	81194	80 %	0 %	0 %	20 %	389869977
41	NC_017963	TGGTA	2	10	81629	81638	20 %	40 %	40 %	0 %	389869977
42	NC_017963	GAATA	2	10	82059	82068	60 %	20 %	20 %	0 %	389869978
43	NC_017963	TTCGC	2	10	82577	82586	0 %	40 %	20 %	40 %	389869978
44	NC_017963	TCTTT	2	10	84889	84898	0 %	80 %	0 %	20 %	389869980
45	NC_017963	ATGGC	2	10	85354	85363	20 %	20 %	40 %	20 %	389869980
46	NC_017963	AACAA	2	10	87267	87276	80 %	0 %	0 %	20 %	389869982
47	NC_017963	CTTTT	2	10	89847	89856	0 %	80 %	0 %	20 %	389869985
48	NC_017963	AAAGA	2	10	89874	89883	80 %	0 %	20 %	0 %	389869985
49	NC_017963	AAGTC	2	10	91445	91454	40 %	20 %	20 %	20 %	389869987
50	NC_017963	TTCTT	2	10	94340	94349	0 %	80 %	0 %	20 %	389869992
51	NC_017963	TGAAT	2	10	95219	95228	40 %	40 %	20 %	0 %	389869992
52	NC_017963	ATCAA	2	10	95874	95883	60 %	20 %	0 %	20 %	389869993
53	NC_017963	TGGTA	2	10	96627	96636	20 %	40 %	40 %	0 %	389869994
54	NC_017963	AAGGA	2	10	96950	96959	60 %	0 %	40 %	0 %	389869994
55	NC_017963	AACCA	2	10	99638	99647	60 %	0 %	0 %	40 %	389869998
56	NC_017963	TGGTT	2	10	99664	99673	0 %	60 %	40 %	0 %	389869998
57	NC_017963	ATTCT	2	10	100387	100396	20 %	60 %	0 %	20 %	389869999
58	NC_017963	AATGC	2	10	102281	102290	40 %	20 %	20 %	20 %	389870000
59	NC_017963	AATTT	2	10	102438	102447	40 %	60 %	0 %	0 %	389870000
60	NC_017963	TAAAT	2	10	103899	103908	60 %	40 %	0 %	0 %	389870002
61	NC_017963	CAAAC	2	10	104096	104105	60 %	0 %	0 %	40 %	389870003
62	NC_017963	AGAAA	2	10	105615	105624	80 %	0 %	20 %	0 %	389870004
63	NC_017963	ATTGT	2	10	107273	107282	20 %	60 %	20 %	0 %	389870005
64	NC_017963	GTAAA	2	10	107942	107951	60 %	20 %	20 %	0 %	389870006
65	NC_017963	AAGGT	2	10	108032	108041	40 %	20 %	40 %	0 %	389870006
66	NC_017963	TTTTC	2	10	114246	114255	0 %	80 %	0 %	20 %	389870011
67	NC_017963	TCATC	2	10	115682	115691	20 %	40 %	0 %	40 %	389870012
68	NC_017963	ATTGT	2	10	117070	117079	20 %	60 %	20 %	0 %	389870013
69	NC_017963	TCTTT	2	10	117720	117729	0 %	80 %	0 %	20 %	389870014
70	NC_017963	TTTCA	2	10	123052	123061	20 %	60 %	0 %	20 %	389870018
71	NC_017963	TATCA	2	10	123121	123130	40 %	40 %	0 %	20 %	389870018
72	NC_017963	GATCA	2	10	123382	123391	40 %	20 %	20 %	20 %	389870018
73	NC_017963	AATTC	2	10	126048	126057	40 %	40 %	0 %	20 %	389870020
74	NC_017963	AAACA	2	10	130962	130971	80 %	0 %	0 %	20 %	389870027
75	NC_017963	AAATC	2	10	132642	132651	60 %	20 %	0 %	20 %	389870029
76	NC_017963	ACAAT	2	10	133578	133587	60 %	20 %	0 %	20 %	389870031
77	NC_017963	TTTCT	2	10	135236	135245	0 %	80 %	0 %	20 %	389870032
78	NC_017963	GTTTG	2	10	136756	136765	0 %	60 %	40 %	0 %	389870035
79	NC_017963	ATTTA	2	10	136953	136962	40 %	60 %	0 %	0 %	389870036
80	NC_017963	TAATA	2	10	137383	137392	60 %	40 %	0 %	0 %	389870037
81	NC_017963	TTTTA	2	10	139117	139126	20 %	80 %	0 %	0 %	389870039
82	NC_017963	AAAAT	2	10	139962	139971	80 %	20 %	0 %	0 %	389870039
83	NC_017963	TCTTT	2	10	140292	140301	0 %	80 %	0 %	20 %	389870039
84	NC_017963	CTATG	2	10	141614	141623	20 %	40 %	20 %	20 %	389870041
85	NC_017963	CATCG	2	10	143170	143179	20 %	20 %	20 %	40 %	389870042
86	NC_017963	ATCAC	2	10	143746	143755	40 %	20 %	0 %	40 %	389870042
87	NC_017963	AGTGG	2	10	144241	144250	20 %	20 %	60 %	0 %	389870042
88	NC_017963	AACCG	2	10	144853	144862	40 %	0 %	20 %	40 %	389870043
89	NC_017963	GCAGA	2	10	147445	147454	40 %	0 %	40 %	20 %	389870045
90	NC_017963	ATCCA	2	10	153016	153025	40 %	20 %	0 %	40 %	389870048
91	NC_017963	TAATG	2	10	154605	154614	40 %	40 %	20 %	0 %	389870049
92	NC_017963	AATGA	2	10	155242	155251	60 %	20 %	20 %	0 %	389870049
93	NC_017963	TTACT	2	10	156603	156612	20 %	60 %	0 %	20 %	389870051
94	NC_017963	CATAG	2	10	160220	160229	40 %	20 %	20 %	20 %	389870054
95	NC_017963	ACAAT	2	10	160822	160831	60 %	20 %	0 %	20 %	389870055
96	NC_017963	ACAAT	2	10	162262	162271	60 %	20 %	0 %	20 %	389870056
97	NC_017963	TTTAT	2	10	163613	163622	20 %	80 %	0 %	0 %	389870057
98	NC_017963	GTCCA	2	10	163669	163678	20 %	20 %	20 %	40 %	389870057
99	NC_017963	AATAA	2	10	165300	165309	80 %	20 %	0 %	0 %	389870060
100	NC_017963	AATTA	2	10	166818	166827	60 %	40 %	0 %	0 %	389870061
101	NC_017963	TAACA	2	10	169444	169453	60 %	20 %	0 %	20 %	389870063
102	NC_017963	TTATA	2	10	169724	169733	40 %	60 %	0 %	0 %	389870064
103	NC_017963	CTTTT	2	10	171042	171051	0 %	80 %	0 %	20 %	389870066
104	NC_017963	TGGAT	2	10	171233	171242	20 %	40 %	40 %	0 %	389870067
105	NC_017963	AAAAG	2	10	172311	172320	80 %	0 %	20 %	0 %	389870069
106	NC_017963	ACCTT	2	10	173117	173126	20 %	40 %	0 %	40 %	389870069
107	NC_017963	TTTAC	2	10	173207	173216	20 %	60 %	0 %	20 %	389870069
108	NC_017963	TTTCT	2	10	173441	173450	0 %	80 %	0 %	20 %	389870069
109	NC_017963	ATTTT	2	10	174414	174423	20 %	80 %	0 %	0 %	389870070
110	NC_017963	TATCT	2	10	174424	174433	20 %	60 %	0 %	20 %	389870070
111	NC_017963	ATTTT	2	10	174479	174488	20 %	80 %	0 %	0 %	389870070
112	NC_017963	CTAAT	2	10	175313	175322	40 %	40 %	0 %	20 %	389870071
113	NC_017963	TTGTT	2	10	176422	176431	0 %	80 %	20 %	0 %	389870072
114	NC_017963	AAATA	2	10	176517	176526	80 %	20 %	0 %	0 %	389870072
115	NC_017963	AACCA	2	10	178010	178019	60 %	0 %	0 %	40 %	389870074
116	NC_017963	GCGAA	2	10	178265	178274	40 %	0 %	40 %	20 %	389870074
117	NC_017963	TCATT	2	10	178584	178593	20 %	60 %	0 %	20 %	389870075
118	NC_017963	TTATT	2	10	179331	179340	20 %	80 %	0 %	0 %	389870076
119	NC_017963	AACCA	2	10	180613	180622	60 %	0 %	0 %	40 %	389870079
120	NC_017963	GCGAA	2	10	180868	180877	40 %	0 %	40 %	20 %	389870079
121	NC_017963	TCATC	2	10	182724	182733	20 %	40 %	0 %	40 %	389870082
122	NC_017963	TCTCT	2	10	185041	185050	0 %	60 %	0 %	40 %	389870086
123	NC_017963	CTTTT	2	10	186026	186035	0 %	80 %	0 %	20 %	389870087
124	NC_017963	TGGAT	2	10	186218	186227	20 %	40 %	40 %	0 %	389870087
125	NC_017963	GACTT	2	10	188740	188749	20 %	40 %	20 %	20 %	389870090
126	NC_017963	TCTTT	2	10	190011	190020	0 %	80 %	0 %	20 %	389870091
127	NC_017963	TTTTC	2	10	191941	191950	0 %	80 %	0 %	20 %	389870093
128	NC_017963	TGGTG	2	10	192605	192614	0 %	40 %	60 %	0 %	389870093
129	NC_017963	TTTTA	2	10	193579	193588	20 %	80 %	0 %	0 %	389870094
130	NC_017963	ATTTT	2	10	194178	194187	20 %	80 %	0 %	0 %	389870095
131	NC_017963	AACAA	2	10	194853	194862	80 %	0 %	0 %	20 %	389870095
132	NC_017963	ACAAT	2	10	196150	196159	60 %	20 %	0 %	20 %	389870097
133	NC_017963	TTGTA	2	10	197619	197628	20 %	60 %	20 %	0 %	389870098
134	NC_017963	TGCCA	2	10	198023	198032	20 %	20 %	20 %	40 %	389870098
135	NC_017963	TTTTC	2	10	199077	199086	0 %	80 %	0 %	20 %	389870099
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177	NC_017963	TGGAT	2	10	250090	250099	20 %	40 %	40 %	0 %	389870170
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.