MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli Xuzhou21 plasmid pO157

Total Repeats: 212

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017907	TTAT	2	8	2625	2632	25 %	75 %	0 %	0 %	387885601
2	NC_017907	ACAG	2	8	2986	2993	50 %	0 %	25 %	25 %	387885601
3	NC_017907	TTCT	2	8	3702	3709	0 %	75 %	0 %	25 %	387885602
4	NC_017907	GTAA	2	8	3864	3871	50 %	25 %	25 %	0 %	387885602
5	NC_017907	ACAG	2	8	5186	5193	50 %	0 %	25 %	25 %	387885602
6	NC_017907	TCAG	2	8	6321	6328	25 %	25 %	25 %	25 %	387885603
7	NC_017907	CACT	2	8	7089	7096	25 %	25 %	0 %	50 %	387885604
8	NC_017907	GAGG	2	8	8888	8895	25 %	0 %	75 %	0 %	387885606
9	NC_017907	CAGG	2	8	9091	9098	25 %	0 %	50 %	25 %	387885606
10	NC_017907	CGGA	2	8	9285	9292	25 %	0 %	50 %	25 %	387885607
11	NC_017907	GGGC	2	8	9426	9433	0 %	0 %	75 %	25 %	387885607
12	NC_017907	GCTG	2	8	9829	9836	0 %	25 %	50 %	25 %	387885608
13	NC_017907	TGAA	2	8	10130	10137	50 %	25 %	25 %	0 %	387885608
14	NC_017907	GCAG	2	8	10326	10333	25 %	0 %	50 %	25 %	387885609
15	NC_017907	ATTA	2	8	10457	10464	50 %	50 %	0 %	0 %	387885609
16	NC_017907	GATC	2	8	10582	10589	25 %	25 %	25 %	25 %	387885609
17	NC_017907	TCTG	2	8	10768	10775	0 %	50 %	25 %	25 %	387885609
18	NC_017907	TCAG	2	8	11022	11029	25 %	25 %	25 %	25 %	387885609
19	NC_017907	GGAG	2	8	11046	11053	25 %	0 %	75 %	0 %	387885609
20	NC_017907	GAGG	2	8	11095	11102	25 %	0 %	75 %	0 %	387885609
21	NC_017907	ACCC	2	8	12741	12748	25 %	0 %	0 %	75 %	387885611
22	NC_017907	GGCC	2	8	13059	13066	0 %	0 %	50 %	50 %	387885612
23	NC_017907	ATTC	2	8	13234	13241	25 %	50 %	0 %	25 %	387885612
24	NC_017907	TCTG	2	8	13452	13459	0 %	50 %	25 %	25 %	387885612
25	NC_017907	GGGA	2	8	13493	13500	25 %	0 %	75 %	0 %	387885612
26	NC_017907	AGCT	2	8	13524	13531	25 %	25 %	25 %	25 %	387885612
27	NC_017907	ATGG	2	8	13546	13553	25 %	25 %	50 %	0 %	387885612
28	NC_017907	GGCA	2	8	13557	13564	25 %	0 %	50 %	25 %	387885612
29	NC_017907	TCAG	2	8	13589	13596	25 %	25 %	25 %	25 %	387885612
30	NC_017907	CCCG	2	8	13647	13654	0 %	0 %	25 %	75 %	387885612
31	NC_017907	TCCA	2	8	13887	13894	25 %	25 %	0 %	50 %	387885613
32	NC_017907	GCAG	2	8	15265	15272	25 %	0 %	50 %	25 %	387885615
33	NC_017907	GAAA	2	8	16347	16354	75 %	0 %	25 %	0 %	387885616
34	NC_017907	GAAA	2	8	16598	16605	75 %	0 %	25 %	0 %	387885616
35	NC_017907	TAAA	2	8	16619	16626	75 %	25 %	0 %	0 %	387885617
36	NC_017907	TTCT	2	8	17312	17319	0 %	75 %	0 %	25 %	387885617
37	NC_017907	CTTT	2	8	17530	17537	0 %	75 %	0 %	25 %	387885617
38	NC_017907	GAGC	2	8	17560	17567	25 %	0 %	50 %	25 %	387885617
39	NC_017907	AATG	2	8	17857	17864	50 %	25 %	25 %	0 %	387885617
40	NC_017907	TGCT	2	8	17945	17952	0 %	50 %	25 %	25 %	387885617
41	NC_017907	AGAA	2	8	18240	18247	75 %	0 %	25 %	0 %	387885617
42	NC_017907	AACA	2	8	18379	18386	75 %	0 %	0 %	25 %	387885617
43	NC_017907	TATG	2	8	18573	18580	25 %	50 %	25 %	0 %	387885617
44	NC_017907	TTGC	2	8	19703	19710	0 %	50 %	25 %	25 %	387885618
45	NC_017907	TTGC	2	8	20360	20367	0 %	50 %	25 %	25 %	387885618
46	NC_017907	AATA	2	8	20674	20681	75 %	25 %	0 %	0 %	387885618
47	NC_017907	ATGG	2	8	20836	20843	25 %	25 %	50 %	0 %	387885618
48	NC_017907	TTCT	2	8	22245	22252	0 %	75 %	0 %	25 %	387885619
49	NC_017907	TAAA	2	8	22410	22417	75 %	25 %	0 %	0 %	387885619
50	NC_017907	AGGA	2	8	22479	22486	50 %	0 %	50 %	0 %	387885619
51	NC_017907	ATAC	2	8	22811	22818	50 %	25 %	0 %	25 %	387885619
52	NC_017907	GAAA	2	8	23090	23097	75 %	0 %	25 %	0 %	387885619
53	NC_017907	AAAC	2	8	23297	23304	75 %	0 %	0 %	25 %	387885620
54	NC_017907	CATC	2	8	24046	24053	25 %	25 %	0 %	50 %	387885622
55	NC_017907	AGTG	2	8	24462	24469	25 %	25 %	50 %	0 %	387885623
56	NC_017907	TGGA	2	8	24581	24588	25 %	25 %	50 %	0 %	387885623
57	NC_017907	GTGC	2	8	24622	24629	0 %	25 %	50 %	25 %	387885623
58	NC_017907	CGCC	2	8	24640	24647	0 %	0 %	25 %	75 %	387885623
59	NC_017907	CGGG	2	8	25008	25015	0 %	0 %	75 %	25 %	387885623
60	NC_017907	GACT	2	8	25424	25431	25 %	25 %	25 %	25 %	387885625
61	NC_017907	GAAT	2	8	26050	26057	50 %	25 %	25 %	0 %	387885625
62	NC_017907	CCCA	2	8	26062	26069	25 %	0 %	0 %	75 %	387885625
63	NC_017907	CAGA	2	8	26979	26986	50 %	0 %	25 %	25 %	387885628
64	NC_017907	CTTC	2	8	27614	27621	0 %	50 %	0 %	50 %	387885629
65	NC_017907	GGCG	2	8	27977	27984	0 %	0 %	75 %	25 %	387885629
66	NC_017907	ATAC	2	8	28200	28207	50 %	25 %	0 %	25 %	387885629
67	NC_017907	CATA	2	8	28217	28224	50 %	25 %	0 %	25 %	387885629
68	NC_017907	AGTG	2	8	29375	29382	25 %	25 %	50 %	0 %	387885632
69	NC_017907	CAGC	2	8	29627	29634	25 %	0 %	25 %	50 %	387885632
70	NC_017907	AGGA	2	8	29690	29697	50 %	0 %	50 %	0 %	387885632
71	NC_017907	CCAC	2	8	30844	30851	25 %	0 %	0 %	75 %	387885633
72	NC_017907	GATG	2	8	31051	31058	25 %	25 %	50 %	0 %	387885633
73	NC_017907	GACG	2	8	31065	31072	25 %	0 %	50 %	25 %	387885633
74	NC_017907	GTAA	2	8	31211	31218	50 %	25 %	25 %	0 %	387885633
75	NC_017907	CCAC	2	8	31225	31232	25 %	0 %	0 %	75 %	387885633
76	NC_017907	TTCC	2	8	31390	31397	0 %	50 %	0 %	50 %	387885633
77	NC_017907	TGGA	2	8	33777	33784	25 %	25 %	50 %	0 %	387885635
78	NC_017907	ACTG	2	8	34294	34301	25 %	25 %	25 %	25 %	387885636
79	NC_017907	GAAT	2	8	34519	34526	50 %	25 %	25 %	0 %	387885636
80	NC_017907	GCTG	2	8	34546	34553	0 %	25 %	50 %	25 %	387885636
81	NC_017907	CTTA	2	8	36310	36317	25 %	50 %	0 %	25 %	387885637
82	NC_017907	ACTC	2	8	36446	36453	25 %	25 %	0 %	50 %	387885637
83	NC_017907	ACAG	2	8	36893	36900	50 %	0 %	25 %	25 %	387885637
84	NC_017907	TGGA	2	8	37017	37024	25 %	25 %	50 %	0 %	387885637
85	NC_017907	AGGA	2	8	37239	37246	50 %	0 %	50 %	0 %	387885637
86	NC_017907	CTGG	2	8	37477	37484	0 %	25 %	50 %	25 %	387885637
87	NC_017907	GGAG	2	8	37880	37887	25 %	0 %	75 %	0 %	387885637
88	NC_017907	GTAT	2	8	38074	38081	25 %	50 %	25 %	0 %	387885638
89	NC_017907	GCTG	2	8	38299	38306	0 %	25 %	50 %	25 %	387885638
90	NC_017907	TTCA	2	8	38712	38719	25 %	50 %	0 %	25 %	387885638
91	NC_017907	TGGC	2	8	38834	38841	0 %	25 %	50 %	25 %	387885638
92	NC_017907	CGGG	2	8	38992	38999	0 %	0 %	75 %	25 %	387885639
93	NC_017907	CCGG	2	8	39106	39113	0 %	0 %	50 %	50 %	387885639
94	NC_017907	TGCG	2	8	39388	39395	0 %	25 %	50 %	25 %	387885640
95	NC_017907	GCAG	2	8	39877	39884	25 %	0 %	50 %	25 %	387885640
96	NC_017907	CAGT	2	8	41020	41027	25 %	25 %	25 %	25 %	387885643
97	NC_017907	GCGG	2	8	41681	41688	0 %	0 %	75 %	25 %	387885644
98	NC_017907	GGCA	2	8	42719	42726	25 %	0 %	50 %	25 %	387885646
99	NC_017907	CGCT	2	8	44576	44583	0 %	25 %	25 %	50 %	387885649
100	NC_017907	CCCG	2	8	44688	44695	0 %	0 %	25 %	75 %	387885649
101	NC_017907	GCCA	2	8	45448	45455	25 %	0 %	25 %	50 %	387885649
102	NC_017907	CAGT	2	8	45730	45737	25 %	25 %	25 %	25 %	387885650
103	NC_017907	GTCT	2	8	46163	46170	0 %	50 %	25 %	25 %	387885650
104	NC_017907	CTGT	2	8	46540	46547	0 %	50 %	25 %	25 %	387885651
105	NC_017907	TGCC	2	8	46801	46808	0 %	25 %	25 %	50 %	387885651
106	NC_017907	CAGA	2	8	47284	47291	50 %	0 %	25 %	25 %	387885652
107	NC_017907	ACTA	2	8	47932	47939	50 %	25 %	0 %	25 %	387885654
108	NC_017907	GAAC	2	8	48949	48956	50 %	0 %	25 %	25 %	387885654
109	NC_017907	TCTG	2	8	49317	49324	0 %	50 %	25 %	25 %	387885654
110	NC_017907	GAAG	2	8	49414	49421	50 %	0 %	50 %	0 %	387885654
111	NC_017907	GGAT	2	8	49477	49484	25 %	25 %	50 %	0 %	387885654
112	NC_017907	TCAG	2	8	49515	49522	25 %	25 %	25 %	25 %	387885654
113	NC_017907	CTGG	2	8	49824	49831	0 %	25 %	50 %	25 %	387885654
114	NC_017907	GAGG	2	8	50781	50788	25 %	0 %	75 %	0 %	387885656
115	NC_017907	GTTC	2	8	51867	51874	0 %	50 %	25 %	25 %	387885658
116	NC_017907	TCAG	2	8	51945	51952	25 %	25 %	25 %	25 %	387885658
117	NC_017907	CCGG	2	8	52000	52007	0 %	0 %	50 %	50 %	387885658
118	NC_017907	ATGG	2	8	52141	52148	25 %	25 %	50 %	0 %	387885658
119	NC_017907	TTGA	2	8	52469	52476	25 %	50 %	25 %	0 %	387885658
120	NC_017907	CGGG	2	8	52488	52495	0 %	0 %	75 %	25 %	387885658
121	NC_017907	GCAG	2	8	52657	52664	25 %	0 %	50 %	25 %	387885658
122	NC_017907	GAAG	2	8	53032	53039	50 %	0 %	50 %	0 %	387885658
123	NC_017907	GTGG	2	8	53092	53099	0 %	25 %	75 %	0 %	387885658
124	NC_017907	TATC	2	8	54775	54782	25 %	50 %	0 %	25 %	387885660
125	NC_017907	CGTA	2	8	54906	54913	25 %	25 %	25 %	25 %	387885660
126	NC_017907	GGCT	2	8	54991	54998	0 %	25 %	50 %	25 %	387885660
127	NC_017907	CATC	2	8	55115	55122	25 %	25 %	0 %	50 %	387885660
128	NC_017907	GAAC	2	8	55393	55400	50 %	0 %	25 %	25 %	387885661
129	NC_017907	GTAA	2	8	56243	56250	50 %	25 %	25 %	0 %	387885662
130	NC_017907	TAAT	2	8	56523	56530	50 %	50 %	0 %	0 %	387885662
131	NC_017907	TACC	2	8	56872	56879	25 %	25 %	0 %	50 %	387885662
132	NC_017907	ATGA	2	8	56999	57006	50 %	25 %	25 %	0 %	387885662
133	NC_017907	TAAC	2	8	57234	57241	50 %	25 %	0 %	25 %	387885662
134	NC_017907	GTTT	2	8	58032	58039	0 %	75 %	25 %	0 %	387885662
135	NC_017907	AGTG	2	8	58255	58262	25 %	25 %	50 %	0 %	387885662
136	NC_017907	ATAA	2	8	58322	58329	75 %	25 %	0 %	0 %	387885662
137	NC_017907	CTAC	2	8	58370	58377	25 %	25 %	0 %	50 %	387885662
138	NC_017907	AATT	2	8	58654	58661	50 %	50 %	0 %	0 %	387885662
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.