MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli Xuzhou21 plasmid pO157_Sal

Total Repeats: 102

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017903	CTGG	2	8	135	142	0 %	25 %	50 %	25 %	387873358
2	NC_017903	TATG	2	8	219	226	25 %	50 %	25 %	0 %	387873358
3	NC_017903	CTTT	2	8	397	404	0 %	75 %	0 %	25 %	387873358
4	NC_017903	AATG	2	8	456	463	50 %	25 %	25 %	0 %	387873358
5	NC_017903	ATTG	2	8	589	596	25 %	50 %	25 %	0 %	387873358
6	NC_017903	AGGA	2	8	729	736	50 %	0 %	50 %	0 %	387873358
7	NC_017903	GTAT	2	8	1396	1403	25 %	50 %	25 %	0 %	387873359
8	NC_017903	ATAA	2	8	2089	2096	75 %	25 %	0 %	0 %	387873360
9	NC_017903	AGCA	2	8	2651	2658	50 %	0 %	25 %	25 %	387873361
10	NC_017903	TAAA	2	8	2955	2962	75 %	25 %	0 %	0 %	387873361
11	NC_017903	TCTT	2	8	3024	3031	0 %	75 %	0 %	25 %	387873362
12	NC_017903	CTTT	2	8	3568	3575	0 %	75 %	0 %	25 %	387873363
13	NC_017903	TGAC	2	8	3797	3804	25 %	25 %	25 %	25 %	387873364
14	NC_017903	GCTG	2	8	3870	3877	0 %	25 %	50 %	25 %	387873364
15	NC_017903	ACAT	2	8	3967	3974	50 %	25 %	0 %	25 %	387873364
16	NC_017903	TATT	2	8	4022	4029	25 %	75 %	0 %	0 %	387873364
17	NC_017903	ATGA	2	8	4228	4235	50 %	25 %	25 %	0 %	387873364
18	NC_017903	CGTT	2	8	4812	4819	0 %	50 %	25 %	25 %	387873364
19	NC_017903	GGTA	2	8	4863	4870	25 %	25 %	50 %	0 %	387873364
20	NC_017903	CCTG	2	8	6042	6049	0 %	25 %	25 %	50 %	387873364
21	NC_017903	AAGC	2	8	6404	6411	50 %	0 %	25 %	25 %	387873365
22	NC_017903	TAAC	2	8	6465	6472	50 %	25 %	0 %	25 %	387873365
23	NC_017903	AACG	2	8	6528	6535	50 %	0 %	25 %	25 %	387873365
24	NC_017903	ACTT	2	8	6592	6599	25 %	50 %	0 %	25 %	387873365
25	NC_017903	ATAA	2	8	6897	6904	75 %	25 %	0 %	0 %	387873365
26	NC_017903	CAAC	2	8	7023	7030	50 %	0 %	0 %	50 %	387873366
27	NC_017903	AGAA	2	8	7218	7225	75 %	0 %	25 %	0 %	387873367
28	NC_017903	CTTA	2	8	7480	7487	25 %	50 %	0 %	25 %	387873367
29	NC_017903	AAAG	2	8	7919	7926	75 %	0 %	25 %	0 %	387873367
30	NC_017903	CAGG	2	8	8142	8149	25 %	0 %	50 %	25 %	387873368
31	NC_017903	ATGG	2	8	8306	8313	25 %	25 %	50 %	0 %	387873368
32	NC_017903	GTAG	2	8	8965	8972	25 %	25 %	50 %	0 %	387873369
33	NC_017903	AATG	2	8	10024	10031	50 %	25 %	25 %	0 %	387873370
34	NC_017903	TGCT	2	8	10212	10219	0 %	50 %	25 %	25 %	387873370
35	NC_017903	GAAA	2	8	10459	10466	75 %	0 %	25 %	0 %	387873370
36	NC_017903	AGGT	2	8	10929	10936	25 %	25 %	50 %	0 %	387873370
37	NC_017903	CTTT	2	8	11382	11389	0 %	75 %	0 %	25 %	387873371
38	NC_017903	AAAG	2	8	11447	11454	75 %	0 %	25 %	0 %	387873371
39	NC_017903	ATAA	2	8	12029	12036	75 %	25 %	0 %	0 %	387873371
40	NC_017903	ATGA	2	8	12164	12171	50 %	25 %	25 %	0 %	387873371
41	NC_017903	AATC	2	8	12430	12437	50 %	25 %	0 %	25 %	387873371
42	NC_017903	TATC	2	8	12607	12614	25 %	50 %	0 %	25 %	387873371
43	NC_017903	ACGA	2	8	12818	12825	50 %	0 %	25 %	25 %	387873371
44	NC_017903	AATC	2	8	13599	13606	50 %	25 %	0 %	25 %	387873373
45	NC_017903	GAAA	2	8	14376	14383	75 %	0 %	25 %	0 %	387873374
46	NC_017903	TTTA	2	8	14720	14727	25 %	75 %	0 %	0 %	387873374
47	NC_017903	CTGG	2	8	15350	15357	0 %	25 %	50 %	25 %	387873374
48	NC_017903	AAGA	2	8	15481	15488	75 %	0 %	25 %	0 %	387873374
49	NC_017903	CCTT	2	8	15521	15528	0 %	50 %	0 %	50 %	387873374
50	NC_017903	GACA	2	8	16044	16051	50 %	0 %	25 %	25 %	387873374
51	NC_017903	AATG	2	8	16068	16075	50 %	25 %	25 %	0 %	387873374
52	NC_017903	TTCT	2	8	16323	16330	0 %	75 %	0 %	25 %	387873375
53	NC_017903	GAAA	2	8	16677	16684	75 %	0 %	25 %	0 %	387873375
54	NC_017903	TGAC	2	8	16755	16762	25 %	25 %	25 %	25 %	387873376
55	NC_017903	AGCA	2	8	17664	17671	50 %	0 %	25 %	25 %	387873378
56	NC_017903	TCGC	3	12	17830	17841	0 %	25 %	25 %	50 %	387873378
57	NC_017903	AAAT	2	8	18422	18429	75 %	25 %	0 %	0 %	387873379
58	NC_017903	GAAA	2	8	18580	18587	75 %	0 %	25 %	0 %	387873379
59	NC_017903	TCAA	2	8	18599	18606	50 %	25 %	0 %	25 %	387873379
60	NC_017903	GCCA	2	8	19188	19195	25 %	0 %	25 %	50 %	387873380
61	NC_017903	GATA	2	8	19196	19203	50 %	25 %	25 %	0 %	387873380
62	NC_017903	TAAA	2	8	19609	19616	75 %	25 %	0 %	0 %	387873381
63	NC_017903	AGTT	2	8	20031	20038	25 %	50 %	25 %	0 %	387873383
64	NC_017903	GCTG	2	8	20077	20084	0 %	25 %	50 %	25 %	387873383
65	NC_017903	CTTC	2	8	21137	21144	0 %	50 %	0 %	50 %	387873385
66	NC_017903	AAAG	2	8	21247	21254	75 %	0 %	25 %	0 %	387873385
67	NC_017903	TTAT	2	8	21429	21436	25 %	75 %	0 %	0 %	387873386
68	NC_017903	CAAT	2	8	21713	21720	50 %	25 %	0 %	25 %	387873387
69	NC_017903	CATT	2	8	21925	21932	25 %	50 %	0 %	25 %	387873387
70	NC_017903	GAAT	2	8	22076	22083	50 %	25 %	25 %	0 %	387873387
71	NC_017903	ATTT	2	8	22115	22122	25 %	75 %	0 %	0 %	387873388
72	NC_017903	ATTA	2	8	23005	23012	50 %	50 %	0 %	0 %	387873390
73	NC_017903	AAAT	2	8	23113	23120	75 %	25 %	0 %	0 %	387873390
74	NC_017903	TATC	2	8	23272	23279	25 %	50 %	0 %	25 %	387873391
75	NC_017903	CCAG	2	8	23879	23886	25 %	0 %	25 %	50 %	387873392
76	NC_017903	CAGG	2	8	23905	23912	25 %	0 %	50 %	25 %	387873392
77	NC_017903	TAGA	2	8	24294	24301	50 %	25 %	25 %	0 %	387873393
78	NC_017903	AGCA	2	8	25495	25502	50 %	0 %	25 %	25 %	387873394
79	NC_017903	TTTC	2	8	25754	25761	0 %	75 %	0 %	25 %	387873394
80	NC_017903	GCTC	2	8	25937	25944	0 %	25 %	25 %	50 %	387873394
81	NC_017903	CTTT	2	8	27456	27463	0 %	75 %	0 %	25 %	387873394
82	NC_017903	TATT	2	8	27689	27696	25 %	75 %	0 %	0 %	387873394
83	NC_017903	CTGT	2	8	28028	28035	0 %	50 %	25 %	25 %	387873394
84	NC_017903	AATT	2	8	28465	28472	50 %	50 %	0 %	0 %	387873396
85	NC_017903	CTTT	2	8	28549	28556	0 %	75 %	0 %	25 %	387873396
86	NC_017903	TCAA	2	8	30765	30772	50 %	25 %	0 %	25 %	387873399
87	NC_017903	AATG	2	8	31364	31371	50 %	25 %	25 %	0 %	387873401
88	NC_017903	AAAG	2	8	31759	31766	75 %	0 %	25 %	0 %	387873402
89	NC_017903	TAAG	3	12	32181	32192	50 %	25 %	25 %	0 %	387873402
90	NC_017903	CTTA	2	8	32397	32404	25 %	50 %	0 %	25 %	387873403
91	NC_017903	GATT	2	8	32539	32546	25 %	50 %	25 %	0 %	387873403
92	NC_017903	AGCA	2	8	32839	32846	50 %	0 %	25 %	25 %	387873403
93	NC_017903	AAGC	2	8	33180	33187	50 %	0 %	25 %	25 %	387873403
94	NC_017903	AAAT	2	8	33725	33732	75 %	25 %	0 %	0 %	387873404
95	NC_017903	GATG	2	8	34862	34869	25 %	25 %	50 %	0 %	387873407
96	NC_017903	TCGT	2	8	34916	34923	0 %	50 %	25 %	25 %	387873407
97	NC_017903	CAGC	2	8	35373	35380	25 %	0 %	25 %	50 %	387873408
98	NC_017903	ACGA	2	8	35556	35563	50 %	0 %	25 %	25 %	387873408
99	NC_017903	CATA	2	8	35767	35774	50 %	25 %	0 %	25 %	387873408
100	NC_017903	TAAA	2	8	35783	35790	75 %	25 %	0 %	0 %	387873408
101	NC_017903	GGAA	2	8	36240	36247	50 %	0 %	50 %	0 %	387873408
102	NC_017903	ATTT	2	8	36442	36449	25 %	75 %	0 %	0 %	387873409

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.