MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli Xuzhou21 plasmid pO157_Sal

Total Repeats: 420

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017903	CTG	2	6	668	673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387873358
2	NC_017903	TAC	2	6	723	728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387873358
3	NC_017903	AAG	2	6	835	840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387873358
4	NC_017903	AAG	2	6	901	906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387873358
5	NC_017903	TAT	2	6	967	972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387873358
6	NC_017903	TGC	2	6	1103	1108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387873359
7	NC_017903	CCT	2	6	1192	1197	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387873359
8	NC_017903	GAA	2	6	1285	1290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387873359
9	NC_017903	GAA	2	6	1417	1422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387873359
10	NC_017903	TTC	2	6	1525	1530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387873359
11	NC_017903	ATT	2	6	1787	1792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387873360
12	NC_017903	AGA	2	6	1904	1909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387873360
13	NC_017903	ATG	2	6	1946	1951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387873360
14	NC_017903	AGT	2	6	1995	2000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387873360
15	NC_017903	AAC	2	6	2064	2069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387873360
16	NC_017903	TAT	2	6	2280	2285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387873361
17	NC_017903	TGC	2	6	2292	2297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387873361
18	NC_017903	ATT	2	6	2362	2367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387873361
19	NC_017903	ACT	2	6	2426	2431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387873361
20	NC_017903	TTA	2	6	2610	2615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387873361
21	NC_017903	TGA	2	6	2643	2648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387873361
22	NC_017903	CTA	2	6	2679	2684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387873361
23	NC_017903	AAT	2	6	2689	2694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387873361
24	NC_017903	GAA	2	6	2718	2723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387873361
25	NC_017903	TAA	2	6	2748	2753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387873361
26	NC_017903	AAT	2	6	2827	2832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387873361
27	NC_017903	GCG	2	6	2835	2840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387873361
28	NC_017903	GCT	2	6	2926	2931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387873361
29	NC_017903	TGC	2	6	3068	3073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387873362
30	NC_017903	GGT	2	6	3075	3080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387873362
31	NC_017903	GTG	2	6	3085	3090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387873362
32	NC_017903	GCG	2	6	3147	3152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387873362
33	NC_017903	CGG	2	6	3281	3286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387873362
34	NC_017903	TAA	2	6	3291	3296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387873362
35	NC_017903	TTA	2	6	3349	3354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387873363
36	NC_017903	GAT	3	9	3363	3371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387873363
37	NC_017903	GAA	4	12	3381	3392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387873363
38	NC_017903	TCA	2	6	3486	3491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387873363
39	NC_017903	TGC	2	6	3493	3498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387873363
40	NC_017903	CAA	2	6	3556	3561	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387873363
41	NC_017903	ATT	2	6	3576	3581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387873363
42	NC_017903	TGA	2	6	3698	3703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387873363
43	NC_017903	ATG	2	6	3715	3720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387873363
44	NC_017903	ATG	2	6	3998	4003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387873364
45	NC_017903	TAC	2	6	4093	4098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387873364
46	NC_017903	CAT	2	6	4267	4272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387873364
47	NC_017903	AGA	2	6	4293	4298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387873364
48	NC_017903	AGT	2	6	4311	4316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387873364
49	NC_017903	ATG	2	6	4370	4375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387873364
50	NC_017903	ATC	2	6	4522	4527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387873364
51	NC_017903	TGA	2	6	4569	4574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387873364
52	NC_017903	GTT	2	6	4648	4653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387873364
53	NC_017903	TGC	2	6	4733	4738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387873364
54	NC_017903	ATG	2	6	4906	4911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387873364
55	NC_017903	CAA	2	6	4949	4954	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387873364
56	NC_017903	TCT	2	6	5009	5014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387873364
57	NC_017903	ATG	3	9	5128	5136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387873364
58	NC_017903	GAT	2	6	5221	5226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387873364
59	NC_017903	TGA	2	6	5331	5336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387873364
60	NC_017903	TGC	2	6	5427	5432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387873364
61	NC_017903	CGG	2	6	5478	5483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387873364
62	NC_017903	TTC	2	6	5638	5643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387873364
63	NC_017903	GAA	2	6	5704	5709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387873364
64	NC_017903	GCA	2	6	5901	5906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387873364
65	NC_017903	CTT	2	6	5976	5981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387873364
66	NC_017903	TGA	2	6	6033	6038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387873364
67	NC_017903	GCT	2	6	6079	6084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387873364
68	NC_017903	ATC	2	6	6091	6096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387873364
69	NC_017903	ATG	3	9	6185	6193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387873364
70	NC_017903	AAG	2	6	6194	6199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387873364
71	NC_017903	CAG	2	6	6374	6379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387873365
72	NC_017903	TGC	2	6	6553	6558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387873365
73	NC_017903	ATA	2	6	6561	6566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387873365
74	NC_017903	ATA	2	6	6651	6656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387873365
75	NC_017903	ATA	2	6	6669	6674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387873365
76	NC_017903	TCT	2	6	6787	6792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387873365
77	NC_017903	CGC	2	6	6863	6868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387873365
78	NC_017903	AGA	2	6	6880	6885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387873365
79	NC_017903	ATG	2	6	7306	7311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387873367
80	NC_017903	TGG	2	6	7329	7334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387873367
81	NC_017903	GCG	2	6	7348	7353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387873367
82	NC_017903	CAG	2	6	7454	7459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387873367
83	NC_017903	TGT	2	6	7524	7529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387873367
84	NC_017903	TTG	2	6	7628	7633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387873367
85	NC_017903	CAA	2	6	7716	7721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387873367
86	NC_017903	GAT	3	9	7846	7854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387873367
87	NC_017903	TAA	2	6	7860	7865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387873367
88	NC_017903	CGA	2	6	8017	8022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387873368
89	NC_017903	TGA	2	6	8060	8065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387873368
90	NC_017903	TGA	2	6	8135	8140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387873368
91	NC_017903	AAT	2	6	8196	8201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387873368
92	NC_017903	AAC	2	6	8224	8229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387873368
93	NC_017903	TGC	2	6	8342	8347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387873368
94	NC_017903	GAT	2	6	8457	8462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387873368
95	NC_017903	GAA	2	6	8535	8540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387873368
96	NC_017903	AAT	3	9	8571	8579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387873368
97	NC_017903	ATT	2	6	8580	8585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387873368
98	NC_017903	TAC	2	6	8687	8692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387873368
99	NC_017903	TGA	2	6	8720	8725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387873368
100	NC_017903	TGA	3	9	8766	8774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387873369
101	NC_017903	AGA	2	6	8922	8927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387873369
102	NC_017903	TGA	2	6	9002	9007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387873369
103	NC_017903	AGA	2	6	9033	9038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387873369
104	NC_017903	AGA	3	9	9048	9056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387873369
105	NC_017903	AGC	2	6	9063	9068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387873369
106	NC_017903	AGA	2	6	9087	9092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387873369
107	NC_017903	ACA	2	6	9161	9166	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387873369
108	NC_017903	TGG	2	6	9285	9290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387873369
109	NC_017903	GGC	2	6	9291	9296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387873369
110	NC_017903	GGT	2	6	9337	9342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387873369
111	NC_017903	ATT	2	6	9504	9509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387873369
112	NC_017903	ACA	2	6	9589	9594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387873369
113	NC_017903	TGA	2	6	9729	9734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387873369
114	NC_017903	TAA	2	6	9753	9758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387873369
115	NC_017903	ATA	2	6	9767	9772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387873369
116	NC_017903	ATA	2	6	9797	9802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387873369
117	NC_017903	GCC	2	6	9811	9816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387873369
118	NC_017903	ATC	2	6	9898	9903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387873369
119	NC_017903	AAT	2	6	9925	9930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387873369
120	NC_017903	GAA	2	6	10137	10142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387873370
121	NC_017903	AAT	2	6	10321	10326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387873370
122	NC_017903	CCT	2	6	10331	10336	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387873370
123	NC_017903	AAC	2	6	10482	10487	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387873370
124	NC_017903	CTT	2	6	10493	10498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387873370
125	NC_017903	CTG	3	9	10884	10892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387873370
126	NC_017903	TCA	2	6	10907	10912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387873370
127	NC_017903	ACA	2	6	10937	10942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387873370
128	NC_017903	AGA	2	6	11038	11043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387873370
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130	NC_017903	GGC	2	6	11183	11188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387873371
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379	NC_017903	TCC	2	6	33128	33133	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387873403
380	NC_017903	TGT	2	6	33162	33167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387873403
381	NC_017903	GTA	2	6	33368	33373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387873403
382	NC_017903	TCA	2	6	33589	33594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387873404
383	NC_017903	GCT	2	6	33699	33704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387873404
384	NC_017903	TCA	3	9	33706	33714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387873404
385	NC_017903	GTT	2	6	33734	33739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387873404
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387	NC_017903	TGT	2	6	33949	33954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387873405
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403	NC_017903	CAT	2	6	35238	35243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387873407
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412	NC_017903	TTG	2	6	35914	35919	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387873408
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420	NC_017903	GCC	2	6	36649	36654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387873409

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.