MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli ETEC H10407 plasmid p948

Total Repeats: 183

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017724	CTAC	2	8	1470	1477	25 %	25 %	0 %	50 %	387610387
2	NC_017724	TCTG	2	8	1898	1905	0 %	50 %	25 %	25 %	387610387
3	NC_017724	GGCT	2	8	2701	2708	0 %	25 %	50 %	25 %	387610387
4	NC_017724	AGTA	2	8	3580	3587	50 %	25 %	25 %	0 %	387610387
5	NC_017724	GCTT	2	8	3900	3907	0 %	50 %	25 %	25 %	387610387
6	NC_017724	AGCC	2	8	4150	4157	25 %	0 %	25 %	50 %	387610387
7	NC_017724	CATG	2	8	4249	4256	25 %	25 %	25 %	25 %	387610387
8	NC_017724	TTTA	2	8	4505	4512	25 %	75 %	0 %	0 %	387610387
9	NC_017724	CCAC	2	8	6696	6703	25 %	0 %	0 %	75 %	387610388
10	NC_017724	ATAC	2	8	6876	6883	50 %	25 %	0 %	25 %	387610388
11	NC_017724	GTAA	2	8	7063	7070	50 %	25 %	25 %	0 %	387610388
12	NC_017724	CCAC	2	8	7077	7084	25 %	0 %	0 %	75 %	387610388
13	NC_017724	TTCC	2	8	7242	7249	0 %	50 %	0 %	50 %	387610388
14	NC_017724	TCTT	2	8	7319	7326	0 %	75 %	0 %	25 %	387610388
15	NC_017724	TCAG	2	8	8893	8900	25 %	25 %	25 %	25 %	387610390
16	NC_017724	GGAT	2	8	9130	9137	25 %	25 %	50 %	0 %	387610390
17	NC_017724	AGAA	2	8	9406	9413	75 %	0 %	25 %	0 %	387610390
18	NC_017724	TGGC	2	8	9426	9433	0 %	25 %	50 %	25 %	387610390
19	NC_017724	CTGA	2	8	9468	9475	25 %	25 %	25 %	25 %	387610390
20	NC_017724	TGGC	2	8	9921	9928	0 %	25 %	50 %	25 %	387610390
21	NC_017724	TAAA	2	8	10411	10418	75 %	25 %	0 %	0 %	387610391
22	NC_017724	ACGG	2	8	11496	11503	25 %	0 %	50 %	25 %	387610392
23	NC_017724	CTCA	2	8	11528	11535	25 %	25 %	0 %	50 %	387610392
24	NC_017724	CGTC	2	8	11611	11618	0 %	25 %	25 %	50 %	387610392
25	NC_017724	AATC	2	8	11917	11924	50 %	25 %	0 %	25 %	387610392
26	NC_017724	GCCA	2	8	12222	12229	25 %	0 %	25 %	50 %	387610392
27	NC_017724	CCTG	2	8	12501	12508	0 %	25 %	25 %	50 %	387610392
28	NC_017724	GGTG	2	8	15988	15995	0 %	25 %	75 %	0 %	387610393
29	NC_017724	CCAC	2	8	17057	17064	25 %	0 %	0 %	75 %	387610393
30	NC_017724	TCAC	2	8	17387	17394	25 %	25 %	0 %	50 %	387610393
31	NC_017724	CCGA	2	8	17776	17783	25 %	0 %	25 %	50 %	387610394
32	NC_017724	CCGG	2	8	17812	17819	0 %	0 %	50 %	50 %	387610394
33	NC_017724	GCCC	2	8	17909	17916	0 %	0 %	25 %	75 %	387610394
34	NC_017724	CGCT	2	8	18125	18132	0 %	25 %	25 %	50 %	387610394
35	NC_017724	AGGA	2	8	18253	18260	50 %	0 %	50 %	0 %	387610394
36	NC_017724	GACC	2	8	18263	18270	25 %	0 %	25 %	50 %	387610394
37	NC_017724	TCCG	2	8	18557	18564	0 %	25 %	25 %	50 %	387610394
38	NC_017724	GCAG	2	8	19229	19236	25 %	0 %	50 %	25 %	387610394
39	NC_017724	TTCT	2	8	19928	19935	0 %	75 %	0 %	25 %	387610395
40	NC_017724	CCAC	2	8	20701	20708	25 %	0 %	0 %	75 %	387610396
41	NC_017724	ATAC	2	8	20881	20888	50 %	25 %	0 %	25 %	387610396
42	NC_017724	GTAA	2	8	21068	21075	50 %	25 %	25 %	0 %	387610396
43	NC_017724	CCAC	2	8	21082	21089	25 %	0 %	0 %	75 %	387610396
44	NC_017724	TTCC	2	8	21247	21254	0 %	50 %	0 %	50 %	387610396
45	NC_017724	TCTT	2	8	21324	21331	0 %	75 %	0 %	25 %	387610396
46	NC_017724	TTCG	2	8	22754	22761	0 %	50 %	25 %	25 %	387610398
47	NC_017724	CTGT	2	8	24351	24358	0 %	50 %	25 %	25 %	387610400
48	NC_017724	GTCG	2	8	24447	24454	0 %	25 %	50 %	25 %	387610400
49	NC_017724	GGTA	2	8	24491	24498	25 %	25 %	50 %	0 %	387610400
50	NC_017724	AGAA	2	8	24926	24933	75 %	0 %	25 %	0 %	387610401
51	NC_017724	TCTG	2	8	25427	25434	0 %	50 %	25 %	25 %	387610402
52	NC_017724	GGAA	2	8	26446	26453	50 %	0 %	50 %	0 %	387610404
53	NC_017724	TTAC	2	8	26625	26632	25 %	50 %	0 %	25 %	387610404
54	NC_017724	GTAT	2	8	26812	26819	25 %	50 %	25 %	0 %	387610404
55	NC_017724	GTGG	2	8	26992	26999	0 %	25 %	75 %	0 %	387610404
56	NC_017724	TGGA	2	8	29054	29061	25 %	25 %	50 %	0 %	387610406
57	NC_017724	ACTG	2	8	29571	29578	25 %	25 %	25 %	25 %	387610407
58	NC_017724	GAAT	2	8	29796	29803	50 %	25 %	25 %	0 %	387610407
59	NC_017724	GCTG	2	8	29823	29830	0 %	25 %	50 %	25 %	387610407
60	NC_017724	GCTG	2	8	31253	31260	0 %	25 %	50 %	25 %	387610408
61	NC_017724	TTCA	2	8	31666	31673	25 %	50 %	0 %	25 %	387610408
62	NC_017724	CCAC	2	8	31881	31888	25 %	0 %	0 %	75 %	387610409
63	NC_017724	ATAC	2	8	32061	32068	50 %	25 %	0 %	25 %	387610409
64	NC_017724	GTAA	2	8	32248	32255	50 %	25 %	25 %	0 %	387610409
65	NC_017724	CCAC	2	8	32262	32269	25 %	0 %	0 %	75 %	387610409
66	NC_017724	TTCC	2	8	32427	32434	0 %	50 %	0 %	50 %	387610409
67	NC_017724	TCTT	2	8	32504	32511	0 %	75 %	0 %	25 %	387610409
68	NC_017724	CTGA	2	8	34230	34237	25 %	25 %	25 %	25 %	387610411
69	NC_017724	GCCT	2	8	35017	35024	0 %	25 %	25 %	50 %	387610413
70	NC_017724	GGCT	2	8	35115	35122	0 %	25 %	50 %	25 %	387610413
71	NC_017724	AGAA	2	8	35913	35920	75 %	0 %	25 %	0 %	387610414
72	NC_017724	AAAT	2	8	35921	35928	75 %	25 %	0 %	0 %	387610414
73	NC_017724	GGAA	2	8	36781	36788	50 %	0 %	50 %	0 %	387610416
74	NC_017724	AGTT	2	8	37932	37939	25 %	50 %	25 %	0 %	387610417
75	NC_017724	TCCT	2	8	38079	38086	0 %	50 %	0 %	50 %	387610417
76	NC_017724	ATTT	2	8	38360	38367	25 %	75 %	0 %	0 %	387610417
77	NC_017724	AGTG	2	8	38624	38631	25 %	25 %	50 %	0 %	387610418
78	NC_017724	CAAT	2	8	39782	39789	50 %	25 %	0 %	25 %	387610419
79	NC_017724	ACTT	2	8	39893	39900	25 %	50 %	0 %	25 %	387610419
80	NC_017724	AGGG	2	8	40217	40224	25 %	0 %	75 %	0 %	387610419
81	NC_017724	GAAG	2	8	40366	40373	50 %	0 %	50 %	0 %	387610419
82	NC_017724	TTCT	2	8	40661	40668	0 %	75 %	0 %	25 %	387610419
83	NC_017724	ATGG	2	8	40746	40753	25 %	25 %	50 %	0 %	387610419
84	NC_017724	ACTG	2	8	40803	40810	25 %	25 %	25 %	25 %	387610419
85	NC_017724	TTCA	2	8	41055	41062	25 %	50 %	0 %	25 %	387610419
86	NC_017724	CTGG	2	8	41185	41192	0 %	25 %	50 %	25 %	387610419
87	NC_017724	CCAG	2	8	41317	41324	25 %	0 %	25 %	50 %	387610419
88	NC_017724	AAGT	2	8	41438	41445	50 %	25 %	25 %	0 %	387610419
89	NC_017724	TGAA	2	8	41507	41514	50 %	25 %	25 %	0 %	387610419
90	NC_017724	TATT	2	8	41774	41781	25 %	75 %	0 %	0 %	387610420
91	NC_017724	TAAA	2	8	42245	42252	75 %	25 %	0 %	0 %	387610420
92	NC_017724	AAAC	2	8	42677	42684	75 %	0 %	0 %	25 %	387610420
93	NC_017724	AAAG	2	8	43876	43883	75 %	0 %	25 %	0 %	387610421
94	NC_017724	AGGA	2	8	46086	46093	50 %	0 %	50 %	0 %	387610424
95	NC_017724	TGGA	2	8	46360	46367	25 %	25 %	50 %	0 %	387610425
96	NC_017724	GAAA	2	8	46614	46621	75 %	0 %	25 %	0 %	387610425
97	NC_017724	TCGC	2	8	47082	47089	0 %	25 %	25 %	50 %	387610425
98	NC_017724	GAAA	2	8	47273	47280	75 %	0 %	25 %	0 %	387610426
99	NC_017724	TATT	2	8	47612	47619	25 %	75 %	0 %	0 %	387610426
100	NC_017724	ATTT	2	8	48194	48201	25 %	75 %	0 %	0 %	387610427
101	NC_017724	AAAT	2	8	49749	49756	75 %	25 %	0 %	0 %	387610430
102	NC_017724	CAGC	2	8	50744	50751	25 %	0 %	25 %	50 %	387610431
103	NC_017724	GCAG	2	8	51541	51548	25 %	0 %	50 %	25 %	387610432
104	NC_017724	CCAC	2	8	51992	51999	25 %	0 %	0 %	75 %	387610433
105	NC_017724	ATAC	2	8	52172	52179	50 %	25 %	0 %	25 %	387610433
106	NC_017724	GTAA	2	8	52359	52366	50 %	25 %	25 %	0 %	387610433
107	NC_017724	CCAC	2	8	52373	52380	25 %	0 %	0 %	75 %	387610433
108	NC_017724	TCTT	2	8	52615	52622	0 %	75 %	0 %	25 %	387610433
109	NC_017724	TGTT	2	8	55098	55105	0 %	75 %	25 %	0 %	387610438
110	NC_017724	GCCA	2	8	55153	55160	25 %	0 %	25 %	50 %	387610438
111	NC_017724	CCCG	2	8	55174	55181	0 %	0 %	25 %	75 %	387610438
112	NC_017724	CCGC	2	8	56169	56176	0 %	0 %	25 %	75 %	387610439
113	NC_017724	GCCA	2	8	57592	57599	25 %	0 %	25 %	50 %	387610441
114	NC_017724	TGAA	2	8	57714	57721	50 %	25 %	25 %	0 %	387610441
115	NC_017724	CAGC	2	8	58127	58134	25 %	0 %	25 %	50 %	387610441
116	NC_017724	ATAC	2	8	58352	58359	50 %	25 %	0 %	25 %	387610441
117	NC_017724	AAAG	2	8	59268	59275	75 %	0 %	25 %	0 %	387610442
118	NC_017724	AAAC	2	8	59283	59290	75 %	0 %	0 %	25 %	387610442
119	NC_017724	CAGG	2	8	59592	59599	25 %	0 %	50 %	25 %	387610442
120	NC_017724	ATCT	2	8	59629	59636	25 %	50 %	0 %	25 %	387610442
121	NC_017724	GAAA	2	8	59779	59786	75 %	0 %	25 %	0 %	387610443
122	NC_017724	CAAA	2	8	60518	60525	75 %	0 %	0 %	25 %	387610444
123	NC_017724	GAAG	2	8	61170	61177	50 %	0 %	50 %	0 %	387610444
124	NC_017724	TCAA	2	8	61762	61769	50 %	25 %	0 %	25 %	387610445
125	NC_017724	GCAG	2	8	64556	64563	25 %	0 %	50 %	25 %	387610448
126	NC_017724	CAAT	2	8	65499	65506	50 %	25 %	0 %	25 %	387610449
127	NC_017724	CAAT	2	8	66159	66166	50 %	25 %	0 %	25 %	387610449
128	NC_017724	TGAT	2	8	66242	66249	25 %	50 %	25 %	0 %	387610449
129	NC_017724	ATCT	2	8	66413	66420	25 %	50 %	0 %	25 %	387610450
130	NC_017724	TCCG	2	8	67798	67805	0 %	25 %	25 %	50 %	387610452
131	NC_017724	ATTA	2	8	67908	67915	50 %	50 %	0 %	0 %	387610452
132	NC_017724	GCCA	2	8	69635	69642	25 %	0 %	25 %	50 %	387610453
133	NC_017724	CAGC	2	8	69768	69775	25 %	0 %	25 %	50 %	387610453
134	NC_017724	AGGA	2	8	70108	70115	50 %	0 %	50 %	0 %	387610454
135	NC_017724	TCAA	2	8	71340	71347	50 %	25 %	0 %	25 %	387610455
136	NC_017724	GGGC	2	8	71403	71410	0 %	0 %	75 %	25 %	387610455
137	NC_017724	GATT	2	8	72462	72469	25 %	50 %	25 %	0 %	387610456
138	NC_017724	GTTC	2	8	72586	72593	0 %	50 %	25 %	25 %	387610456
139	NC_017724	CCTG	2	8	72923	72930	0 %	25 %	25 %	50 %	387610456
140	NC_017724	TCGC	2	8	73441	73448	0 %	25 %	25 %	50 %	387610456
141	NC_017724	CTGA	2	8	73483	73490	25 %	25 %	25 %	25 %	387610456
142	NC_017724	CCGA	2	8	73638	73645	25 %	0 %	25 %	50 %	387610456
143	NC_017724	ATAA	2	8	74326	74333	75 %	25 %	0 %	0 %	387610456
144	NC_017724	AAGC	2	8	74707	74714	50 %	0 %	25 %	25 %	387610456
145	NC_017724	AACG	2	8	75955	75962	50 %	0 %	25 %	25 %	387610458
146	NC_017724	ATTT	2	8	76025	76032	25 %	75 %	0 %	0 %	387610458
147	NC_017724	ACAA	2	8	76101	76108	75 %	0 %	0 %	25 %	387610458
148	NC_017724	TTTG	2	8	77286	77293	0 %	75 %	25 %	0 %	387610459
149	NC_017724	TAAT	2	8	77363	77370	50 %	50 %	0 %	0 %	387610459
150	NC_017724	GGAT	2	8	77674	77681	25 %	25 %	50 %	0 %	387610459
151	NC_017724	TCTT	2	8	77730	77737	0 %	75 %	0 %	25 %	387610460
152	NC_017724	CTAT	2	8	78253	78260	25 %	50 %	0 %	25 %	387610460
153	NC_017724	TATT	2	8	78725	78732	25 %	75 %	0 %	0 %	387610460
154	NC_017724	AGAA	2	8	78762	78769	75 %	0 %	25 %	0 %	387610460
155	NC_017724	ACAA	2	8	78775	78782	75 %	0 %	0 %	25 %	387610460
156	NC_017724	TTTA	2	8	79129	79136	25 %	75 %	0 %	0 %	387610461
157	NC_017724	GCTG	2	8	80458	80465	0 %	25 %	50 %	25 %	387610463
158	NC_017724	TGGC	2	8	80591	80598	0 %	25 %	50 %	25 %	387610463
159	NC_017724	TTAC	2	8	82075	82082	25 %	50 %	0 %	25 %	387610465
160	NC_017724	GTAT	2	8	82262	82269	25 %	50 %	25 %	0 %	387610465
161	NC_017724	GTGG	2	8	82442	82449	0 %	25 %	75 %	0 %	387610465
162	NC_017724	TTGA	2	8	83696	83703	25 %	50 %	25 %	0 %	387610467
163	NC_017724	TATT	2	8	83774	83781	25 %	75 %	0 %	0 %	387610467
164	NC_017724	TTAT	2	8	83947	83954	25 %	75 %	0 %	0 %	387610467
165	NC_017724	GAAA	2	8	84140	84147	75 %	0 %	25 %	0 %	387610467
166	NC_017724	AAAT	2	8	84281	84288	75 %	25 %	0 %	0 %	387610467
167	NC_017724	AAAT	2	8	84372	84379	75 %	25 %	0 %	0 %	387610467
168	NC_017724	GAAT	2	8	84460	84467	50 %	25 %	25 %	0 %	387610467
169	NC_017724	TACT	2	8	84473	84480	25 %	50 %	0 %	25 %	387610467
170	NC_017724	CAAA	2	8	84593	84600	75 %	0 %	0 %	25 %	387610467
171	NC_017724	AAAC	2	8	84690	84697	75 %	0 %	0 %	25 %	387610467
172	NC_017724	CCAG	2	8	86420	86427	25 %	0 %	25 %	50 %	387610468
173	NC_017724	GCGT	2	8	88138	88145	0 %	25 %	50 %	25 %	387610469
174	NC_017724	GCTG	2	8	88317	88324	0 %	25 %	50 %	25 %	387610469
175	NC_017724	GTTT	2	8	88381	88388	0 %	75 %	25 %	0 %	387610469
176	NC_017724	CTGC	2	8	90999	91006	0 %	25 %	25 %	50 %	387610472
177	NC_017724	GGAA	2	8	92183	92190	50 %	0 %	50 %	0 %	387610474
178	NC_017724	TTAC	2	8	92362	92369	25 %	50 %	0 %	25 %	387610474
179	NC_017724	GTAT	2	8	92549	92556	25 %	50 %	25 %	0 %	387610474
180	NC_017724	GTGG	2	8	92729	92736	0 %	25 %	75 %	0 %	387610474
181	NC_017724	TGCC	2	8	93078	93085	0 %	25 %	25 %	50 %	387610475
182	NC_017724	GCCG	2	8	93456	93463	0 %	0 %	50 %	50 %	387610475
183	NC_017724	CTGG	2	8	93572	93579	0 %	25 %	50 %	25 %	387610476

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.