MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli W chromosome

Total Repeats: 2713

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017664	CGCTG	2	10	692	701	0 %	20 %	40 %	40 %	386707736
2	NC_017664	ATTGC	2	10	3395	3404	20 %	40 %	20 %	20 %	386707737
3	NC_017664	GAAAG	2	10	6655	6664	60 %	0 %	40 %	0 %	386707740
4	NC_017664	CGCAG	2	10	9638	9647	20 %	0 %	40 %	40 %	386707743
5	NC_017664	CGTAC	2	10	11066	11075	20 %	20 %	20 %	40 %	386707744
6	NC_017664	CGCGC	2	10	12053	12062	0 %	0 %	40 %	60 %	386707746
7	NC_017664	CCGAT	2	10	17770	17779	20 %	20 %	20 %	40 %	386707752
8	NC_017664	AGCGA	2	10	18158	18167	40 %	0 %	40 %	20 %	386707752
9	NC_017664	GTTTT	2	10	20576	20585	0 %	80 %	20 %	0 %	386707755
10	NC_017664	TTTAT	2	10	21632	21641	20 %	80 %	0 %	0 %	386707755
11	NC_017664	GCGAA	2	10	35659	35668	40 %	0 %	40 %	20 %	386707766
12	NC_017664	CCGTT	2	10	36553	36562	0 %	40 %	20 %	40 %	386707766
13	NC_017664	CACGG	2	10	36930	36939	20 %	0 %	40 %	40 %	386707766
14	NC_017664	CGAAT	2	10	39639	39648	40 %	20 %	20 %	20 %	386707770
15	NC_017664	CCATG	2	10	41177	41186	20 %	20 %	20 %	40 %	386707771
16	NC_017664	CCGTA	2	10	42823	42832	20 %	20 %	20 %	40 %	386707772
17	NC_017664	GTACA	2	10	43313	43322	40 %	20 %	20 %	20 %	386707772
18	NC_017664	TTAAA	2	10	43561	43570	60 %	40 %	0 %	0 %	386707772
19	NC_017664	ACCCA	2	10	44304	44313	40 %	0 %	0 %	60 %	386707773
20	NC_017664	TTTGA	2	10	45931	45940	20 %	60 %	20 %	0 %	386707774
21	NC_017664	CGGCG	2	10	46182	46191	0 %	0 %	60 %	40 %	386707774
22	NC_017664	AATCA	2	10	46464	46473	60 %	20 %	0 %	20 %	386707775
23	NC_017664	CGGTT	2	10	47419	47428	0 %	40 %	40 %	20 %	386707776
24	NC_017664	TGGCG	2	10	49111	49120	0 %	20 %	60 %	20 %	386707778
25	NC_017664	TGCAC	2	10	50873	50882	20 %	20 %	20 %	40 %	386707779
26	NC_017664	AGGGC	2	10	51958	51967	20 %	0 %	60 %	20 %	386707780
27	NC_017664	GGCGC	2	10	51992	52001	0 %	0 %	60 %	40 %	386707780
28	NC_017664	GAAAC	2	10	52805	52814	60 %	0 %	20 %	20 %	386707780
29	NC_017664	AACGT	2	10	54717	54726	40 %	20 %	20 %	20 %	386707783
30	NC_017664	GCGTC	2	10	57701	57710	0 %	20 %	40 %	40 %	386707786
31	NC_017664	ATGTT	2	10	58515	58524	20 %	60 %	20 %	0 %	386707787
32	NC_017664	CTTCG	2	10	58948	58957	0 %	40 %	20 %	40 %	386707787
33	NC_017664	TGCGT	2	10	59234	59243	0 %	40 %	40 %	20 %	386707787
34	NC_017664	AAAGT	2	10	64968	64977	60 %	20 %	20 %	0 %	386707790
35	NC_017664	AGTCG	2	10	65937	65946	20 %	20 %	40 %	20 %	386707791
36	NC_017664	GGTGA	2	10	67216	67225	20 %	20 %	60 %	0 %	386707791
37	NC_017664	TCGCG	2	10	69823	69832	0 %	20 %	40 %	40 %	386707793
38	NC_017664	GATGG	2	10	78177	78186	20 %	20 %	60 %	0 %	386707800
39	NC_017664	CTGGA	2	10	80077	80086	20 %	20 %	40 %	20 %	386707802
40	NC_017664	CCTGG	2	10	81651	81660	0 %	20 %	40 %	40 %	386707804
41	NC_017664	CTGGT	2	10	83370	83379	0 %	40 %	40 %	20 %	386707805
42	NC_017664	GACCG	2	10	83918	83927	20 %	0 %	40 %	40 %	386707806
43	NC_017664	ATGTT	2	10	86467	86476	20 %	60 %	20 %	0 %	386707808
44	NC_017664	AAAAC	2	10	86882	86891	80 %	0 %	0 %	20 %	386707808
45	NC_017664	TGCAT	2	10	87409	87418	20 %	40 %	20 %	20 %	386707809
46	NC_017664	ATTCC	2	10	87579	87588	20 %	40 %	0 %	40 %	386707809
47	NC_017664	AGTTC	2	10	92672	92681	20 %	40 %	20 %	20 %	386707813
48	NC_017664	CGTGG	2	10	94045	94054	0 %	20 %	60 %	20 %	386707815
49	NC_017664	TATCG	2	10	94552	94561	20 %	40 %	20 %	20 %	386707815
50	NC_017664	GCCTG	2	10	98884	98893	0 %	20 %	40 %	40 %	386707819
51	NC_017664	GTTTG	2	10	99328	99337	0 %	60 %	40 %	0 %	386707819
52	NC_017664	ACCGT	2	10	100797	100806	20 %	20 %	20 %	40 %	386707820
53	NC_017664	ATCAG	2	10	102570	102579	40 %	20 %	20 %	20 %	386707822
54	NC_017664	AGCCG	2	10	104338	104347	20 %	0 %	40 %	40 %	386707823
55	NC_017664	GCGCA	2	10	106666	106675	20 %	0 %	40 %	40 %	386707825
56	NC_017664	TGGCG	2	10	107660	107669	0 %	20 %	60 %	20 %	386707826
57	NC_017664	CCGGC	2	10	110630	110639	0 %	0 %	40 %	60 %	386707829
58	NC_017664	CGCGG	2	10	113839	113848	0 %	0 %	60 %	40 %	386707832
59	NC_017664	ATCCC	2	10	116083	116092	20 %	20 %	0 %	60 %	386707835
60	NC_017664	CATCG	2	10	116096	116105	20 %	20 %	20 %	40 %	386707835
61	NC_017664	TAACG	2	10	116790	116799	40 %	20 %	20 %	20 %	386707835
62	NC_017664	ATGCC	2	10	117249	117258	20 %	20 %	20 %	40 %	386707835
63	NC_017664	AATGC	2	10	118532	118541	40 %	20 %	20 %	20 %	386707836
64	NC_017664	TCTGT	2	10	119478	119487	0 %	60 %	20 %	20 %	386707838
65	NC_017664	GCATG	2	10	120571	120580	20 %	20 %	40 %	20 %	386707839
66	NC_017664	AGCAG	2	10	121909	121918	40 %	0 %	40 %	20 %	386707841
67	NC_017664	TCAGC	2	10	122777	122786	20 %	20 %	20 %	40 %	386707841
68	NC_017664	CGAAG	2	10	123824	123833	40 %	0 %	40 %	20 %	386707842
69	NC_017664	ACACG	2	10	123957	123966	40 %	0 %	20 %	40 %	386707842
70	NC_017664	TCGCG	2	10	124218	124227	0 %	20 %	40 %	40 %	386707842
71	NC_017664	GCATC	2	10	124308	124317	20 %	20 %	20 %	40 %	386707842
72	NC_017664	GACTG	2	10	125626	125635	20 %	20 %	40 %	20 %	386707843
73	NC_017664	AGAGC	2	10	126036	126045	40 %	0 %	40 %	20 %	386707843
74	NC_017664	AGGCG	2	10	131308	131317	20 %	0 %	60 %	20 %	386707846
75	NC_017664	GGTTG	2	10	131965	131974	0 %	40 %	60 %	0 %	386707846
76	NC_017664	TCTGG	2	10	134611	134620	0 %	40 %	40 %	20 %	386707847
77	NC_017664	GGGCA	2	10	136023	136032	20 %	0 %	60 %	20 %	386707848
78	NC_017664	CAGCG	2	10	136302	136311	20 %	0 %	40 %	40 %	386707849
79	NC_017664	CCGTC	2	10	143132	143141	0 %	20 %	20 %	60 %	386707854
80	NC_017664	GTGAA	2	10	143142	143151	40 %	20 %	40 %	0 %	386707854
81	NC_017664	GTTCA	2	10	143529	143538	20 %	40 %	20 %	20 %	386707855
82	NC_017664	ATCCA	2	10	143855	143864	40 %	20 %	0 %	40 %	386707855
83	NC_017664	CTTTA	2	10	145118	145127	20 %	60 %	0 %	20 %	386707857
84	NC_017664	TGGCG	2	10	145345	145354	0 %	20 %	60 %	20 %	386707857
85	NC_017664	CGGGC	2	10	146533	146542	0 %	0 %	60 %	40 %	386707859
86	NC_017664	TTTCA	2	10	147658	147667	20 %	60 %	0 %	20 %	386707860
87	NC_017664	GGGAG	2	10	148983	148992	20 %	0 %	80 %	0 %	386707861
88	NC_017664	TGAAG	2	10	150881	150890	40 %	20 %	40 %	0 %	386707863
89	NC_017664	TTTGC	2	10	157971	157980	0 %	60 %	20 %	20 %	386707870
90	NC_017664	GCGAG	2	10	159779	159788	20 %	0 %	60 %	20 %	386707872
91	NC_017664	GGCGT	2	10	160217	160226	0 %	20 %	60 %	20 %	386707872
92	NC_017664	ATCAG	2	10	160855	160864	40 %	20 %	20 %	20 %	386707873
93	NC_017664	ACCAC	2	10	163120	163129	40 %	0 %	0 %	60 %	386707876
94	NC_017664	GGCGT	2	10	164823	164832	0 %	20 %	60 %	20 %	386707877
95	NC_017664	CGACG	2	10	165862	165871	20 %	0 %	40 %	40 %	386707877
96	NC_017664	AAAAC	2	10	169849	169858	80 %	0 %	0 %	20 %	386707880
97	NC_017664	TGGTT	2	10	170106	170115	0 %	60 %	40 %	0 %	386707880
98	NC_017664	AACCT	2	10	172187	172196	40 %	20 %	0 %	40 %	386707882
99	NC_017664	TGGTC	2	10	172229	172238	0 %	40 %	40 %	20 %	386707882
100	NC_017664	TGGCG	2	10	173474	173483	0 %	20 %	60 %	20 %	386707883
101	NC_017664	CGGCG	2	10	174104	174113	0 %	0 %	60 %	40 %	386707883
102	NC_017664	CGGCG	2	10	174185	174194	0 %	0 %	60 %	40 %	386707883
103	NC_017664	TTCCA	2	10	174715	174724	20 %	40 %	0 %	40 %	386707883
104	NC_017664	GGTCC	2	10	179038	179047	0 %	20 %	40 %	40 %	386707888
105	NC_017664	ACGGG	2	10	180955	180964	20 %	0 %	60 %	20 %	386707890
106	NC_017664	GTGAT	2	10	183114	183123	20 %	40 %	40 %	0 %	386707891
107	NC_017664	GTGAT	2	10	183405	183414	20 %	40 %	40 %	0 %	386707891
108	NC_017664	GCCAG	2	10	187121	187130	20 %	0 %	40 %	40 %	386707895
109	NC_017664	GTTCT	2	10	188562	188571	0 %	60 %	20 %	20 %	386707895
110	NC_017664	CTGAA	2	10	190554	190563	40 %	20 %	20 %	20 %	386707897
111	NC_017664	AAGCG	2	10	190618	190627	40 %	0 %	40 %	20 %	386707897
112	NC_017664	TGGTG	2	10	192524	192533	0 %	40 %	60 %	0 %	386707899
113	NC_017664	TGCAC	2	10	192650	192659	20 %	20 %	20 %	40 %	386707899
114	NC_017664	TGCGC	2	10	193043	193052	0 %	20 %	40 %	40 %	386707899
115	NC_017664	CATGG	2	10	194886	194895	20 %	20 %	40 %	20 %	386707901
116	NC_017664	CAGAT	2	10	195925	195934	40 %	20 %	20 %	20 %	386707902
117	NC_017664	ACTTT	2	10	196058	196067	20 %	60 %	0 %	20 %	386707902
118	NC_017664	GACGT	2	10	199978	199987	20 %	20 %	40 %	20 %	386707905
119	NC_017664	CGACG	2	10	201805	201814	20 %	0 %	40 %	40 %	386707907
120	NC_017664	ATGCC	2	10	204373	204382	20 %	20 %	20 %	40 %	386707910
121	NC_017664	GGATG	2	10	204635	204644	20 %	20 %	60 %	0 %	386707910
122	NC_017664	TGGCC	2	10	205699	205708	0 %	20 %	40 %	40 %	386707912
123	NC_017664	ACCGC	2	10	205712	205721	20 %	0 %	20 %	60 %	386707912
124	NC_017664	GTAAC	2	10	206442	206451	40 %	20 %	20 %	20 %	386707912
125	NC_017664	AGCCG	2	10	207070	207079	20 %	0 %	40 %	40 %	386707912
126	NC_017664	GGTGG	2	10	207179	207188	0 %	20 %	80 %	0 %	386707912
127	NC_017664	TTAAC	2	10	215322	215331	40 %	40 %	0 %	20 %	386707919
128	NC_017664	ACGGT	2	10	218190	218199	20 %	20 %	40 %	20 %	386707923
129	NC_017664	TGATT	2	10	221031	221040	20 %	60 %	20 %	0 %	386707926
130	NC_017664	GTGAA	2	10	232862	232871	40 %	20 %	40 %	0 %	386707933
131	NC_017664	TAATT	2	10	233046	233055	40 %	60 %	0 %	0 %	386707933
132	NC_017664	ACTGG	2	10	235984	235993	20 %	20 %	40 %	20 %	386707936
133	NC_017664	CGCGG	2	10	237029	237038	0 %	0 %	60 %	40 %	386707938
134	NC_017664	TTTAA	2	10	239409	239418	40 %	60 %	0 %	0 %	386707940
135	NC_017664	TGATC	2	10	240764	240773	20 %	40 %	20 %	20 %	386707942
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143	NC_017664	ATTTC	2	10	252538	252547	20 %	60 %	0 %	20 %	386707949
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251	NC_017664	TTTTC	2	10	445553	445562	0 %	80 %	0 %	20 %	386708152
252	NC_017664	CCGGT	2	10	447701	447710	0 %	20 %	40 %	40 %	386708154
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257	NC_017664	GTTTG	2	10	454346	454355	0 %	60 %	40 %	0 %	386708160
258	NC_017664	GGCGC	2	10	454530	454539	0 %	0 %	60 %	40 %	386708160
259	NC_017664	CTTAC	2	10	455402	455411	20 %	40 %	0 %	40 %	386708161
260	NC_017664	TTGCG	2	10	456668	456677	0 %	40 %	40 %	20 %	386708162
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262	NC_017664	ATCAT	2	10	461604	461613	40 %	40 %	0 %	20 %	386708168
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