MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli O83:H1 str. NRG 857C plasmid pO83_CORR

Total Repeats: 197

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017659	CT	3	6	2338	2343	0 %	50 %	0 %	50 %	387615191
2	NC_017659	GA	3	6	2913	2918	50 %	0 %	50 %	0 %	387615191
3	NC_017659	GC	3	6	3619	3624	0 %	0 %	50 %	50 %	387615192
4	NC_017659	TG	3	6	4222	4227	0 %	50 %	50 %	0 %	387615192
5	NC_017659	GC	3	6	4662	4667	0 %	0 %	50 %	50 %	387615192
6	NC_017659	GC	3	6	5275	5280	0 %	0 %	50 %	50 %	387615192
7	NC_017659	CT	3	6	5829	5834	0 %	50 %	0 %	50 %	387615192
8	NC_017659	GC	3	6	6120	6125	0 %	0 %	50 %	50 %	387615192
9	NC_017659	CG	3	6	6904	6909	0 %	0 %	50 %	50 %	387615192
10	NC_017659	GC	3	6	7501	7506	0 %	0 %	50 %	50 %	387615193
11	NC_017659	TA	3	6	8901	8906	50 %	50 %	0 %	0 %	387615194
12	NC_017659	AT	3	6	10124	10129	50 %	50 %	0 %	0 %	387615195
13	NC_017659	GC	3	6	11359	11364	0 %	0 %	50 %	50 %	387615195
14	NC_017659	TA	3	6	12124	12129	50 %	50 %	0 %	0 %	387615196
15	NC_017659	TG	4	8	12237	12244	0 %	50 %	50 %	0 %	387615196
16	NC_017659	AT	3	6	13078	13083	50 %	50 %	0 %	0 %	387615197
17	NC_017659	GC	3	6	13898	13903	0 %	0 %	50 %	50 %	387615198
18	NC_017659	TG	3	6	14062	14067	0 %	50 %	50 %	0 %	387615198
19	NC_017659	AT	3	6	15179	15184	50 %	50 %	0 %	0 %	387615199
20	NC_017659	AT	3	6	15459	15464	50 %	50 %	0 %	0 %	387615200
21	NC_017659	AT	4	8	15475	15482	50 %	50 %	0 %	0 %	387615200
22	NC_017659	CA	3	6	17958	17963	50 %	0 %	0 %	50 %	387615203
23	NC_017659	TC	3	6	18410	18415	0 %	50 %	0 %	50 %	387615204
24	NC_017659	GC	3	6	19118	19123	0 %	0 %	50 %	50 %	387615205
25	NC_017659	AC	4	8	19877	19884	50 %	0 %	0 %	50 %	387615206
26	NC_017659	AG	3	6	19906	19911	50 %	0 %	50 %	0 %	387615206
27	NC_017659	TC	3	6	20137	20142	0 %	50 %	0 %	50 %	387615206
28	NC_017659	TC	3	6	20660	20665	0 %	50 %	0 %	50 %	387615207
29	NC_017659	AT	3	6	22414	22419	50 %	50 %	0 %	0 %	387615209
30	NC_017659	CG	3	6	22741	22746	0 %	0 %	50 %	50 %	387615209
31	NC_017659	AT	3	6	22763	22768	50 %	50 %	0 %	0 %	387615209
32	NC_017659	GA	3	6	23455	23460	50 %	0 %	50 %	0 %	387615209
33	NC_017659	GA	3	6	24275	24280	50 %	0 %	50 %	0 %	387615209
34	NC_017659	GC	3	6	25436	25441	0 %	0 %	50 %	50 %	387615210
35	NC_017659	CT	3	6	25711	25716	0 %	50 %	0 %	50 %	387615211
36	NC_017659	CT	3	6	28312	28317	0 %	50 %	0 %	50 %	387615214
37	NC_017659	AG	3	6	28592	28597	50 %	0 %	50 %	0 %	387615214
38	NC_017659	CT	3	6	28660	28665	0 %	50 %	0 %	50 %	387615214
39	NC_017659	GC	3	6	29773	29778	0 %	0 %	50 %	50 %	387615216
40	NC_017659	GC	3	6	29821	29826	0 %	0 %	50 %	50 %	387615216
41	NC_017659	AT	3	6	31416	31421	50 %	50 %	0 %	0 %	387615217
42	NC_017659	AT	3	6	33637	33642	50 %	50 %	0 %	0 %	387615219
43	NC_017659	CA	3	6	34554	34559	50 %	0 %	0 %	50 %	387615220
44	NC_017659	TC	3	6	34589	34594	0 %	50 %	0 %	50 %	387615220
45	NC_017659	GC	3	6	35059	35064	0 %	0 %	50 %	50 %	387615221
46	NC_017659	CG	3	6	35656	35661	0 %	0 %	50 %	50 %	387615221
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48	NC_017659	CG	4	8	38756	38763	0 %	0 %	50 %	50 %	387615224
49	NC_017659	GC	3	6	38952	38957	0 %	0 %	50 %	50 %	387615224
50	NC_017659	GC	4	8	39539	39546	0 %	0 %	50 %	50 %	387615225
51	NC_017659	CT	3	6	40058	40063	0 %	50 %	0 %	50 %	387615226
52	NC_017659	CG	3	6	40119	40124	0 %	0 %	50 %	50 %	387615226
53	NC_017659	GC	3	6	40651	40656	0 %	0 %	50 %	50 %	387615227
54	NC_017659	GC	3	6	41922	41927	0 %	0 %	50 %	50 %	387615227
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56	NC_017659	AT	3	6	43504	43509	50 %	50 %	0 %	0 %	387615228
57	NC_017659	TC	3	6	44552	44557	0 %	50 %	0 %	50 %	387615231
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59	NC_017659	GA	3	6	45617	45622	50 %	0 %	50 %	0 %	387615232
60	NC_017659	TC	3	6	47907	47912	0 %	50 %	0 %	50 %	387615235
61	NC_017659	CG	3	6	48025	48030	0 %	0 %	50 %	50 %	387615235
62	NC_017659	TG	3	6	49693	49698	0 %	50 %	50 %	0 %	387615236
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68	NC_017659	GC	3	6	52299	52304	0 %	0 %	50 %	50 %	387615239
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72	NC_017659	AT	3	6	54314	54319	50 %	50 %	0 %	0 %	387615241
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81	NC_017659	CG	3	6	60169	60174	0 %	0 %	50 %	50 %	387615248
82	NC_017659	AT	3	6	61210	61215	50 %	50 %	0 %	0 %	387615249
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85	NC_017659	TA	3	6	63066	63071	50 %	50 %	0 %	0 %	387615251
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112	NC_017659	CT	3	6	81596	81601	0 %	50 %	0 %	50 %	387615275
113	NC_017659	CT	3	6	81798	81803	0 %	50 %	0 %	50 %	387615275
114	NC_017659	TC	3	6	81816	81821	0 %	50 %	0 %	50 %	387615275
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123	NC_017659	TG	4	8	87862	87869	0 %	50 %	50 %	0 %	387615277
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129	NC_017659	AT	3	6	90905	90910	50 %	50 %	0 %	0 %	387615280
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.