MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli O55:H7 str. RM12579 plasmid p12579_2

Total Repeats: 83

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017657	A	8	8	1899	1906	100 %	0 %	0 %	0 %	387504848
2	NC_017657	A	6	6	1956	1961	100 %	0 %	0 %	0 %	387504848
3	NC_017657	A	6	6	4452	4457	100 %	0 %	0 %	0 %	387504850
4	NC_017657	T	6	6	4998	5003	0 %	100 %	0 %	0 %	387504851
5	NC_017657	T	6	6	5307	5312	0 %	100 %	0 %	0 %	387504851
6	NC_017657	A	6	6	5769	5774	100 %	0 %	0 %	0 %	387504852
7	NC_017657	T	6	6	6086	6091	0 %	100 %	0 %	0 %	387504852
8	NC_017657	A	6	6	6094	6099	100 %	0 %	0 %	0 %	387504852
9	NC_017657	T	6	6	6423	6428	0 %	100 %	0 %	0 %	387504853
10	NC_017657	A	6	6	8077	8082	100 %	0 %	0 %	0 %	387504856
11	NC_017657	A	6	6	8086	8091	100 %	0 %	0 %	0 %	387504856
12	NC_017657	A	6	6	8785	8790	100 %	0 %	0 %	0 %	387504857
13	NC_017657	T	7	7	8819	8825	0 %	100 %	0 %	0 %	387504858
14	NC_017657	G	6	6	9733	9738	0 %	0 %	100 %	0 %	387504859
15	NC_017657	G	6	6	10184	10189	0 %	0 %	100 %	0 %	387504860
16	NC_017657	T	6	6	10830	10835	0 %	100 %	0 %	0 %	387504861
17	NC_017657	T	6	6	11227	11232	0 %	100 %	0 %	0 %	387504861
18	NC_017657	A	7	7	11503	11509	100 %	0 %	0 %	0 %	387504862
19	NC_017657	C	6	6	11613	11618	0 %	0 %	0 %	100 %	387504862
20	NC_017657	A	6	6	11690	11695	100 %	0 %	0 %	0 %	387504862
21	NC_017657	A	6	6	12242	12247	100 %	0 %	0 %	0 %	387504863
22	NC_017657	G	6	6	14909	14914	0 %	0 %	100 %	0 %	387504868
23	NC_017657	T	6	6	15400	15405	0 %	100 %	0 %	0 %	387504868
24	NC_017657	A	6	6	16191	16196	100 %	0 %	0 %	0 %	387504868
25	NC_017657	T	6	6	16377	16382	0 %	100 %	0 %	0 %	387504868
26	NC_017657	A	6	6	17370	17375	100 %	0 %	0 %	0 %	387504868
27	NC_017657	G	7	7	17849	17855	0 %	0 %	100 %	0 %	387504869
28	NC_017657	A	6	6	18022	18027	100 %	0 %	0 %	0 %	387504869
29	NC_017657	A	6	6	18130	18135	100 %	0 %	0 %	0 %	387504869
30	NC_017657	G	6	6	18480	18485	0 %	0 %	100 %	0 %	387504870
31	NC_017657	C	7	7	21477	21483	0 %	0 %	0 %	100 %	387504871
32	NC_017657	G	6	6	21760	21765	0 %	0 %	100 %	0 %	387504871
33	NC_017657	G	9	9	23433	23441	0 %	0 %	100 %	0 %	387504873
34	NC_017657	G	8	8	23823	23830	0 %	0 %	100 %	0 %	387504874
35	NC_017657	G	7	7	24630	24636	0 %	0 %	100 %	0 %	387504876
36	NC_017657	T	7	7	24931	24937	0 %	100 %	0 %	0 %	387504876
37	NC_017657	G	8	8	25542	25549	0 %	0 %	100 %	0 %	387504877
38	NC_017657	C	6	6	25579	25584	0 %	0 %	0 %	100 %	387504877
39	NC_017657	T	6	6	25914	25919	0 %	100 %	0 %	0 %	387504877
40	NC_017657	A	6	6	27253	27258	100 %	0 %	0 %	0 %	387504878
41	NC_017657	G	6	6	27865	27870	0 %	0 %	100 %	0 %	387504880
42	NC_017657	G	7	7	28329	28335	0 %	0 %	100 %	0 %	387504880
43	NC_017657	T	6	6	28626	28631	0 %	100 %	0 %	0 %	387504880
44	NC_017657	A	6	6	28753	28758	100 %	0 %	0 %	0 %	387504881
45	NC_017657	T	6	6	29552	29557	0 %	100 %	0 %	0 %	387504882
46	NC_017657	A	6	6	32482	32487	100 %	0 %	0 %	0 %	387504887
47	NC_017657	A	6	6	32931	32936	100 %	0 %	0 %	0 %	387504888
48	NC_017657	A	7	7	32979	32985	100 %	0 %	0 %	0 %	387504888
49	NC_017657	A	6	6	33130	33135	100 %	0 %	0 %	0 %	387504888
50	NC_017657	A	6	6	33159	33164	100 %	0 %	0 %	0 %	387504888
51	NC_017657	T	6	6	34115	34120	0 %	100 %	0 %	0 %	387504889
52	NC_017657	T	6	6	34298	34303	0 %	100 %	0 %	0 %	387504889
53	NC_017657	T	6	6	34335	34340	0 %	100 %	0 %	0 %	387504889
54	NC_017657	T	6	6	34375	34380	0 %	100 %	0 %	0 %	387504889
55	NC_017657	A	6	6	36575	36580	100 %	0 %	0 %	0 %	387504891
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58	NC_017657	A	7	7	38389	38395	100 %	0 %	0 %	0 %	387504892
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60	NC_017657	T	7	7	39898	39904	0 %	100 %	0 %	0 %	387504893
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63	NC_017657	A	7	7	41525	41531	100 %	0 %	0 %	0 %	387504894
64	NC_017657	A	6	6	42388	42393	100 %	0 %	0 %	0 %	387504894
65	NC_017657	A	6	6	42935	42940	100 %	0 %	0 %	0 %	387504894
66	NC_017657	A	6	6	43565	43570	100 %	0 %	0 %	0 %	387504894
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69	NC_017657	A	7	7	48097	48103	100 %	0 %	0 %	0 %	387504899
70	NC_017657	A	6	6	49825	49830	100 %	0 %	0 %	0 %	387504901
71	NC_017657	T	6	6	49968	49973	0 %	100 %	0 %	0 %	387504901
72	NC_017657	A	6	6	50034	50039	100 %	0 %	0 %	0 %	387504901
73	NC_017657	T	6	6	52757	52762	0 %	100 %	0 %	0 %	387504904
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81	NC_017657	G	6	6	62235	62240	0 %	0 %	100 %	0 %	387504918
82	NC_017657	G	6	6	63053	63058	0 %	0 %	100 %	0 %	387504919
83	NC_017657	A	6	6	63725	63730	100 %	0 %	0 %	0 %	387504920

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.