MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Escherichia coli O55:H7 str. RM12579 plasmid p12579_2

Total Repeats: 959

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017657	A	7	7	32979	32985	100 %	0 %	0 %	0 %	387504888
502	NC_017657	TCT	2	6	32991	32996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387504888
503	NC_017657	GTTT	2	8	33033	33040	0 %	75 %	25 %	0 %	387504888
504	NC_017657	GCAGAG	2	12	33066	33077	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	387504888
505	NC_017657	TCT	2	6	33084	33089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387504888
506	NC_017657	GTG	2	6	33090	33095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387504888
507	NC_017657	TA	3	6	33115	33120	50 %	50 %	0 %	0 %	387504888
508	NC_017657	A	6	6	33130	33135	100 %	0 %	0 %	0 %	387504888
509	NC_017657	A	6	6	33159	33164	100 %	0 %	0 %	0 %	387504888
510	NC_017657	TGC	2	6	33227	33232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504888
511	NC_017657	CCA	2	6	33234	33239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387504888
512	NC_017657	CGT	2	6	33246	33251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504888
513	NC_017657	CAG	2	6	33327	33332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387504888
514	NC_017657	AG	3	6	33331	33336	50 %	0 %	50 %	0 %	387504888
515	NC_017657	TAT	2	6	33384	33389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387504888
516	NC_017657	TAT	2	6	33441	33446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387504888
517	NC_017657	GGA	2	6	33447	33452	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387504888
518	NC_017657	GTT	2	6	33830	33835	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387504889
519	NC_017657	TAT	2	6	33837	33842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387504889
520	NC_017657	CGG	2	6	33955	33960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387504889
521	NC_017657	CCA	2	6	34075	34080	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387504889
522	NC_017657	T	6	6	34115	34120	0 %	100 %	0 %	0 %	387504889
523	NC_017657	GGGA	2	8	34154	34161	25 %	0 %	75 %	0 %	387504889
524	NC_017657	TCTTT	2	10	34176	34185	0 %	80 %	0 %	20 %	387504889
525	NC_017657	TTC	3	9	34186	34194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387504889
526	NC_017657	CTGG	2	8	34195	34202	0 %	25 %	50 %	25 %	387504889
527	NC_017657	CGG	2	6	34244	34249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387504889
528	NC_017657	ATA	2	6	34288	34293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387504889
529	NC_017657	T	6	6	34298	34303	0 %	100 %	0 %	0 %	387504889
530	NC_017657	ACG	2	6	34329	34334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387504889
531	NC_017657	T	6	6	34335	34340	0 %	100 %	0 %	0 %	387504889
532	NC_017657	CAC	2	6	34341	34346	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387504889
533	NC_017657	TTC	2	6	34365	34370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387504889
534	NC_017657	T	6	6	34375	34380	0 %	100 %	0 %	0 %	387504889
535	NC_017657	AGA	2	6	34758	34763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387504890
536	NC_017657	TCT	2	6	34876	34881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387504890
537	NC_017657	ATG	2	6	34899	34904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504890
538	NC_017657	TGC	2	6	34954	34959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504890
539	NC_017657	ACC	2	6	35119	35124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387504890
540	NC_017657	TGA	2	6	35125	35130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504890
541	NC_017657	CTC	2	6	35185	35190	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387504890
542	NC_017657	CAG	2	6	35336	35341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387504890
543	NC_017657	AGA	2	6	35459	35464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387504890
544	NC_017657	GCA	2	6	35494	35499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387504890
545	NC_017657	TCA	2	6	35550	35555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387504890
546	NC_017657	ATC	2	6	35654	35659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387504890
547	NC_017657	ATGCTC	2	12	35673	35684	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	387504890
548	NC_017657	AAAG	2	8	35772	35779	75 %	0 %	25 %	0 %	387504890
549	NC_017657	GCA	2	6	35965	35970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387504890
550	NC_017657	ATC	2	6	36030	36035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387504890
551	NC_017657	TGA	2	6	36546	36551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504891
552	NC_017657	A	6	6	36575	36580	100 %	0 %	0 %	0 %	387504891
553	NC_017657	GC	3	6	36617	36622	0 %	0 %	50 %	50 %	387504891
554	NC_017657	CT	3	6	36667	36672	0 %	50 %	0 %	50 %	387504891
555	NC_017657	GCG	2	6	36673	36678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387504891
556	NC_017657	TGC	2	6	36681	36686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504891
557	NC_017657	AC	3	6	36704	36709	50 %	0 %	0 %	50 %	387504891
558	NC_017657	GCAG	2	8	36774	36781	25 %	0 %	50 %	25 %	387504891
559	NC_017657	GA	3	6	36786	36791	50 %	0 %	50 %	0 %	387504891
560	NC_017657	ATG	2	6	36821	36826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504891
561	NC_017657	AG	3	6	36843	36848	50 %	0 %	50 %	0 %	387504891
562	NC_017657	TGCTGA	2	12	36861	36872	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387504891
563	NC_017657	AAG	2	6	36955	36960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387504891
564	NC_017657	TGCT	2	8	36971	36978	0 %	50 %	25 %	25 %	387504891
565	NC_017657	A	7	7	37028	37034	100 %	0 %	0 %	0 %	387504891
566	NC_017657	GCA	2	6	37086	37091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387504891
567	NC_017657	TCAGT	2	10	37133	37142	20 %	40 %	20 %	20 %	387504891
568	NC_017657	AAC	2	6	37187	37192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387504891
569	NC_017657	TCA	2	6	37261	37266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387504891
570	NC_017657	TTG	2	6	37280	37285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387504891
571	NC_017657	TCT	2	6	37365	37370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387504891
572	NC_017657	GGT	2	6	37422	37427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387504891
573	NC_017657	CTG	2	6	37529	37534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504891
574	NC_017657	ATCA	2	8	37657	37664	50 %	25 %	0 %	25 %	387504891
575	NC_017657	AGAAA	2	10	37679	37688	80 %	0 %	20 %	0 %	387504891
576	NC_017657	AATT	2	8	37719	37726	50 %	50 %	0 %	0 %	387504891
577	NC_017657	AG	3	6	37789	37794	50 %	0 %	50 %	0 %	387504891
578	NC_017657	GAA	2	6	37815	37820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387504891
579	NC_017657	A	7	7	37879	37885	100 %	0 %	0 %	0 %	387504891
580	NC_017657	AT	3	6	37943	37948	50 %	50 %	0 %	0 %	387504891
581	NC_017657	TTG	2	6	38111	38116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387504891
582	NC_017657	TGAT	2	8	38195	38202	25 %	50 %	25 %	0 %	387504891
583	NC_017657	TAAA	2	8	38242	38249	75 %	25 %	0 %	0 %	387504891
584	NC_017657	ACAG	2	8	38273	38280	50 %	0 %	25 %	25 %	387504892
585	NC_017657	TAA	2	6	38289	38294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387504892
586	NC_017657	AGAA	2	8	38296	38303	75 %	0 %	25 %	0 %	387504892
587	NC_017657	TA	3	6	38304	38309	50 %	50 %	0 %	0 %	387504892
588	NC_017657	ATA	2	6	38328	38333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387504892
589	NC_017657	GCAA	2	8	38357	38364	50 %	0 %	25 %	25 %	387504892
590	NC_017657	A	7	7	38389	38395	100 %	0 %	0 %	0 %	387504892
591	NC_017657	AG	3	6	38481	38486	50 %	0 %	50 %	0 %	387504892
592	NC_017657	AT	3	6	38543	38548	50 %	50 %	0 %	0 %	387504892
593	NC_017657	C	6	6	38549	38554	0 %	0 %	0 %	100 %	387504892
594	NC_017657	CAC	2	6	38567	38572	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387504892
595	NC_017657	ATT	2	6	38575	38580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387504892
596	NC_017657	ATA	2	6	38584	38589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387504892
597	NC_017657	CTG	2	6	39876	39881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504893
598	NC_017657	T	7	7	39898	39904	0 %	100 %	0 %	0 %	387504893
599	NC_017657	GTA	2	6	39913	39918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504893
600	NC_017657	CGA	2	6	40010	40015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387504893
601	NC_017657	ATT	2	6	40063	40068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387504893
602	NC_017657	ATG	2	6	40137	40142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504893
603	NC_017657	TGT	2	6	40175	40180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387504893
604	NC_017657	ATA	2	6	40333	40338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387504893
605	NC_017657	TCT	2	6	40409	40414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387504893
606	NC_017657	TGA	2	6	40437	40442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504893
607	NC_017657	T	6	6	40446	40451	0 %	100 %	0 %	0 %	387504893
608	NC_017657	GAT	2	6	40658	40663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504894
609	NC_017657	TGACCC	2	12	40668	40679	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	387504894
610	NC_017657	TTA	2	6	40713	40718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387504894
611	NC_017657	CCAG	2	8	40733	40740	25 %	0 %	25 %	50 %	387504894
612	NC_017657	TTC	2	6	40758	40763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387504894
613	NC_017657	C	6	6	40808	40813	0 %	0 %	0 %	100 %	387504894
614	NC_017657	ACT	2	6	40895	40900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387504894
615	NC_017657	CAA	2	6	40954	40959	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387504894
616	NC_017657	CAG	2	6	40964	40969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387504894
617	NC_017657	GAA	2	6	41030	41035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387504894
618	NC_017657	TGT	2	6	41083	41088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387504894
619	NC_017657	TGGC	2	8	41112	41119	0 %	25 %	50 %	25 %	387504894
620	NC_017657	ATC	2	6	41197	41202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387504894
621	NC_017657	TCA	2	6	41338	41343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387504894
622	NC_017657	CAG	2	6	41409	41414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387504894
623	NC_017657	GT	4	8	41435	41442	0 %	50 %	50 %	0 %	387504894
624	NC_017657	ATT	2	6	41477	41482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387504894
625	NC_017657	CAA	2	6	41515	41520	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387504894
626	NC_017657	A	7	7	41525	41531	100 %	0 %	0 %	0 %	387504894
627	NC_017657	CAA	2	6	41549	41554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387504894
628	NC_017657	GAA	2	6	41693	41698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387504894
629	NC_017657	AGAA	2	8	41714	41721	75 %	0 %	25 %	0 %	387504894
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