MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli O55:H7 str. RM12579 chromosome

Total Repeats: 10870

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017656	CAGG	2	8	419	426	25 %	0 %	50 %	25 %	387504935
2	NC_017656	ACCA	2	8	465	472	50 %	0 %	0 %	50 %	387504935
3	NC_017656	GCTG	2	8	974	981	0 %	25 %	50 %	25 %	387504935
4	NC_017656	GGAC	2	8	1012	1019	25 %	0 %	50 %	25 %	387504935
5	NC_017656	CCAG	2	8	2002	2009	25 %	0 %	25 %	50 %	387504935
6	NC_017656	GCAA	2	8	3029	3036	50 %	0 %	25 %	25 %	387504936
7	NC_017656	ATGA	2	8	3127	3134	50 %	25 %	25 %	0 %	387504936
8	NC_017656	CAGC	2	8	3282	3289	25 %	0 %	25 %	50 %	387504936
9	NC_017656	TTCA	2	8	3427	3434	25 %	50 %	0 %	25 %	387504936
10	NC_017656	AGCG	2	8	3564	3571	25 %	0 %	50 %	25 %	387504936
11	NC_017656	CTGA	2	8	3850	3857	25 %	25 %	25 %	25 %	387504937
12	NC_017656	CAGT	2	8	5765	5772	25 %	25 %	25 %	25 %	387504939
13	NC_017656	GCGG	2	8	6098	6105	0 %	0 %	75 %	25 %	387504939
14	NC_017656	AGCG	2	8	6269	6276	25 %	0 %	50 %	25 %	387504939
15	NC_017656	GCCA	2	8	7226	7233	25 %	0 %	25 %	50 %	387504940
16	NC_017656	GCAT	2	8	7955	7962	25 %	25 %	25 %	25 %	387504940
17	NC_017656	CAAC	2	8	8334	8341	50 %	0 %	0 %	50 %	387504941
18	NC_017656	TTGA	2	8	8387	8394	25 %	50 %	25 %	0 %	387504941
19	NC_017656	AAGA	2	8	8810	8817	75 %	0 %	25 %	0 %	387504941
20	NC_017656	GCTG	2	8	8989	8996	0 %	25 %	50 %	25 %	387504941
21	NC_017656	GGTG	2	8	9661	9668	0 %	25 %	75 %	0 %	387504942
22	NC_017656	AGAT	2	8	9994	10001	50 %	25 %	25 %	0 %	387504943
23	NC_017656	AGAA	2	8	10268	10275	75 %	0 %	25 %	0 %	387504943
24	NC_017656	GCAG	2	8	10671	10678	25 %	0 %	50 %	25 %	387504944
25	NC_017656	CATT	2	8	11349	11356	25 %	50 %	0 %	25 %	387504944
26	NC_017656	CAGT	2	8	11496	11503	25 %	25 %	25 %	25 %	387504945
27	NC_017656	ATGG	2	8	12216	12223	25 %	25 %	50 %	0 %	387504946
28	NC_017656	TGGT	2	8	12307	12314	0 %	50 %	50 %	0 %	387504946
29	NC_017656	ACCG	2	8	12674	12681	25 %	0 %	25 %	50 %	387504946
30	NC_017656	CAAC	2	8	12820	12827	50 %	0 %	0 %	50 %	387504946
31	NC_017656	AAGA	2	8	12894	12901	75 %	0 %	25 %	0 %	387504946
32	NC_017656	CCAT	2	8	13471	13478	25 %	25 %	0 %	50 %	387504946
33	NC_017656	GGTT	2	8	16285	16292	0 %	50 %	50 %	0 %	387504949
34	NC_017656	GTGG	2	8	16909	16916	0 %	25 %	75 %	0 %	387504949
35	NC_017656	CGTT	2	8	17281	17288	0 %	50 %	25 %	25 %	387504949
36	NC_017656	TTTA	2	8	17453	17460	25 %	75 %	0 %	0 %	387504950
37	NC_017656	CCAC	2	8	17756	17763	25 %	0 %	0 %	75 %	387504950
38	NC_017656	AATA	2	8	18386	18393	75 %	25 %	0 %	0 %	387504951
39	NC_017656	CTTC	2	8	18408	18415	0 %	50 %	0 %	50 %	387504951
40	NC_017656	TGTT	2	8	19681	19688	0 %	75 %	25 %	0 %	387504952
41	NC_017656	TGGC	2	8	20142	20149	0 %	25 %	50 %	25 %	387504952
42	NC_017656	GAAC	2	8	20775	20782	50 %	0 %	25 %	25 %	387504952
43	NC_017656	TGAG	2	8	21031	21038	25 %	25 %	50 %	0 %	387504952
44	NC_017656	TAAA	2	8	21175	21182	75 %	25 %	0 %	0 %	387504952
45	NC_017656	CTTT	2	8	22122	22129	0 %	75 %	0 %	25 %	387504953
46	NC_017656	ATAA	2	8	22340	22347	75 %	25 %	0 %	0 %	387504953
47	NC_017656	TATT	2	8	24660	24667	25 %	75 %	0 %	0 %	387504955
48	NC_017656	CAGT	2	8	25660	25667	25 %	25 %	25 %	25 %	387504957
49	NC_017656	CATA	2	8	25817	25824	50 %	25 %	0 %	25 %	387504958
50	NC_017656	GCGT	2	8	26281	26288	0 %	25 %	50 %	25 %	387504958
51	NC_017656	CCGC	2	8	26704	26711	0 %	0 %	25 %	75 %	387504958
52	NC_017656	CTGG	2	8	27061	27068	0 %	25 %	50 %	25 %	387504959
53	NC_017656	CTGC	2	8	27522	27529	0 %	25 %	25 %	50 %	387504959
54	NC_017656	ACTC	2	8	28401	28408	25 %	25 %	0 %	50 %	387504959
55	NC_017656	GTGG	2	8	29277	29284	0 %	25 %	75 %	0 %	387504959
56	NC_017656	GCTG	2	8	29631	29638	0 %	25 %	50 %	25 %	387504960
57	NC_017656	ATGG	2	8	30491	30498	25 %	25 %	50 %	0 %	387504961
58	NC_017656	TTGA	2	8	31362	31369	25 %	50 %	25 %	0 %	387504962
59	NC_017656	TGGC	2	8	31905	31912	0 %	25 %	50 %	25 %	387504963
60	NC_017656	CTGG	2	8	32365	32372	0 %	25 %	50 %	25 %	387504963
61	NC_017656	GTGG	2	8	32530	32537	0 %	25 %	75 %	0 %	387504963
62	NC_017656	GCTG	2	8	32882	32889	0 %	25 %	50 %	25 %	387504964
63	NC_017656	CGTG	2	8	33359	33366	0 %	25 %	50 %	25 %	387504964
64	NC_017656	TCCT	2	8	34141	34148	0 %	50 %	0 %	50 %	387504965
65	NC_017656	CTTA	2	8	34169	34176	25 %	50 %	0 %	25 %	387504965
66	NC_017656	AGCC	2	8	35071	35078	25 %	0 %	25 %	50 %	387504965
67	NC_017656	GGGC	2	8	35213	35220	0 %	0 %	75 %	25 %	387504966
68	NC_017656	GACC	2	8	35337	35344	25 %	0 %	25 %	50 %	387504966
69	NC_017656	TGAT	2	8	35786	35793	25 %	50 %	25 %	0 %	387504966
70	NC_017656	CGCA	2	8	36337	36344	25 %	0 %	25 %	50 %	387504966
71	NC_017656	CTGT	2	8	36511	36518	0 %	50 %	25 %	25 %	387504966
72	NC_017656	GGCG	2	8	36687	36694	0 %	0 %	75 %	25 %	387504966
73	NC_017656	ACCG	2	8	36841	36848	25 %	0 %	25 %	50 %	387504966
74	NC_017656	CGTC	2	8	37315	37322	0 %	25 %	25 %	50 %	387504966
75	NC_017656	GGCG	2	8	37524	37531	0 %	0 %	75 %	25 %	387504966
76	NC_017656	TGGC	2	8	37778	37785	0 %	25 %	50 %	25 %	387504966
77	NC_017656	GCTG	2	8	37791	37798	0 %	25 %	50 %	25 %	387504966
78	NC_017656	GCAC	2	8	38376	38383	25 %	0 %	25 %	50 %	387504966
79	NC_017656	GGTG	2	8	38722	38729	0 %	25 %	75 %	0 %	387504967
80	NC_017656	AAGA	2	8	38957	38964	75 %	0 %	25 %	0 %	387504967
81	NC_017656	CCAT	2	8	39443	39450	25 %	25 %	0 %	50 %	387504968
82	NC_017656	ATTT	2	8	40657	40664	25 %	75 %	0 %	0 %	387504970
83	NC_017656	TTCT	2	8	40669	40676	0 %	75 %	0 %	25 %	387504970
84	NC_017656	TTCA	2	8	40800	40807	25 %	50 %	0 %	25 %	387504970
85	NC_017656	CAGC	2	8	41013	41020	25 %	0 %	25 %	50 %	387504970
86	NC_017656	CCCG	2	8	41176	41183	0 %	0 %	25 %	75 %	387504970
87	NC_017656	TCGG	2	8	41648	41655	0 %	25 %	50 %	25 %	387504970
88	NC_017656	GGCG	2	8	41927	41934	0 %	0 %	75 %	25 %	387504970
89	NC_017656	CCAT	2	8	42461	42468	25 %	25 %	0 %	50 %	387504971
90	NC_017656	TGAT	2	8	42483	42490	25 %	50 %	25 %	0 %	387504971
91	NC_017656	AGGC	2	8	43014	43021	25 %	0 %	50 %	25 %	387504971
92	NC_017656	CCGA	2	8	44100	44107	25 %	0 %	25 %	50 %	387504972
93	NC_017656	CCCG	2	8	44496	44503	0 %	0 %	25 %	75 %	387504972
94	NC_017656	TCCA	2	8	44548	44555	25 %	25 %	0 %	50 %	387504972
95	NC_017656	TTAA	2	8	44801	44808	50 %	50 %	0 %	0 %	387504973
96	NC_017656	TATC	2	8	45194	45201	25 %	50 %	0 %	25 %	387504973
97	NC_017656	CACC	2	8	45345	45352	25 %	0 %	0 %	75 %	387504973
98	NC_017656	AGCC	2	8	45912	45919	25 %	0 %	25 %	50 %	387504973
99	NC_017656	CCAG	2	8	46112	46119	25 %	0 %	25 %	50 %	387504973
100	NC_017656	AACC	2	8	46120	46127	50 %	0 %	0 %	50 %	387504973
101	NC_017656	GAAA	2	8	46271	46278	75 %	0 %	25 %	0 %	387504973
102	NC_017656	GTGC	2	8	46816	46823	0 %	25 %	50 %	25 %	387504974
103	NC_017656	TGAT	2	8	47052	47059	25 %	50 %	25 %	0 %	387504974
104	NC_017656	CTGC	2	8	47312	47319	0 %	25 %	25 %	50 %	387504974
105	NC_017656	GTCG	2	8	48178	48185	0 %	25 %	50 %	25 %	387504975
106	NC_017656	ATGG	2	8	48285	48292	25 %	25 %	50 %	0 %	387504975
107	NC_017656	GTTA	2	8	48662	48669	25 %	50 %	25 %	0 %	387504976
108	NC_017656	CACC	2	8	49213	49220	25 %	0 %	0 %	75 %	387504976
109	NC_017656	ATTG	2	8	49460	49467	25 %	50 %	25 %	0 %	387504976
110	NC_017656	CCTT	2	8	49672	49679	0 %	50 %	0 %	50 %	387504976
111	NC_017656	TGTT	2	8	50499	50506	0 %	75 %	25 %	0 %	387504978
112	NC_017656	TGTT	2	8	50744	50751	0 %	75 %	25 %	0 %	387504978
113	NC_017656	TGTT	2	8	50934	50941	0 %	75 %	25 %	0 %	387504978
114	NC_017656	CTGG	2	8	51199	51206	0 %	25 %	50 %	25 %	387504978
115	NC_017656	TGCG	2	8	52404	52411	0 %	25 %	50 %	25 %	387504980
116	NC_017656	ATGA	2	8	52559	52566	50 %	25 %	25 %	0 %	387504980
117	NC_017656	GGCG	2	8	52723	52730	0 %	0 %	75 %	25 %	387504980
118	NC_017656	GGCG	2	8	52900	52907	0 %	0 %	75 %	25 %	387504980
119	NC_017656	GGAT	2	8	53514	53521	25 %	25 %	50 %	0 %	387504980
120	NC_017656	AACC	2	8	53584	53591	50 %	0 %	0 %	50 %	387504980
121	NC_017656	CAGG	2	8	53681	53688	25 %	0 %	50 %	25 %	387504980
122	NC_017656	TGGC	2	8	53947	53954	0 %	25 %	50 %	25 %	387504980
123	NC_017656	CCTG	2	8	54282	54289	0 %	25 %	25 %	50 %	387504981
124	NC_017656	TAAA	2	8	54320	54327	75 %	25 %	0 %	0 %	387504981
125	NC_017656	GCAG	2	8	55406	55413	25 %	0 %	50 %	25 %	387504984
126	NC_017656	ACCC	2	8	55421	55428	25 %	0 %	0 %	75 %	387504984
127	NC_017656	AATG	2	8	56183	56190	50 %	25 %	25 %	0 %	387504985
128	NC_017656	GGCA	2	8	57631	57638	25 %	0 %	50 %	25 %	387504987
129	NC_017656	CGGT	2	8	58232	58239	0 %	25 %	50 %	25 %	387504987
130	NC_017656	GTCA	2	8	58755	58762	25 %	25 %	25 %	25 %	387504988
131	NC_017656	GCTT	2	8	59924	59931	0 %	50 %	25 %	25 %	387504989
132	NC_017656	ACCT	2	8	60004	60011	25 %	25 %	0 %	50 %	387504989
133	NC_017656	AGTA	2	8	60222	60229	50 %	25 %	25 %	0 %	387504989
134	NC_017656	CACC	2	8	61398	61405	25 %	0 %	0 %	75 %	387504989
135	NC_017656	CTAC	2	8	61508	61515	25 %	25 %	0 %	50 %	387504989
136	NC_017656	GTAC	2	8	61754	61761	25 %	25 %	25 %	25 %	387504989
137	NC_017656	GCCA	2	8	62547	62554	25 %	0 %	25 %	50 %	387504990
138	NC_017656	GAAT	2	8	62566	62573	50 %	25 %	25 %	0 %	387504990
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