MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Escherichia coli O55:H7 str. RM12579 chromosome

Total Repeats: 93411

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_017656	CAG	2	6	248161	248166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387505144
4502	NC_017656	AAT	2	6	248188	248193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387505144
4503	NC_017656	GC	5	10	248209	248218	0 %	0 %	50 %	50 %	387505144
4504	NC_017656	CAGC	2	8	248227	248234	25 %	0 %	25 %	50 %	387505144
4505	NC_017656	GTT	2	6	248352	248357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387505144
4506	NC_017656	CG	4	8	248364	248371	0 %	0 %	50 %	50 %	387505144
4507	NC_017656	ATAA	2	8	248383	248390	75 %	25 %	0 %	0 %	387505144
4508	NC_017656	GCA	2	6	248412	248417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387505144
4509	NC_017656	CCG	2	6	248436	248441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387505144
4510	NC_017656	CGG	2	6	248480	248485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387505144
4511	NC_017656	GCA	2	6	248508	248513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387505144
4512	NC_017656	GCT	2	6	248532	248537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387505144
4513	NC_017656	GCT	2	6	248580	248585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387505144
4514	NC_017656	AAT	2	6	248650	248655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387505144
4515	NC_017656	CGC	2	6	248662	248667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387505144
4516	NC_017656	GCCA	2	8	248672	248679	25 %	0 %	25 %	50 %	387505144
4517	NC_017656	TTC	2	6	248707	248712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387505144
4518	NC_017656	CCA	2	6	248737	248742	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387505144
4519	NC_017656	CAG	2	6	248752	248757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387505144
4520	NC_017656	CAG	2	6	248776	248781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387505144
4521	NC_017656	AGT	2	6	248843	248848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387505144
4522	NC_017656	GTAA	2	8	248924	248931	50 %	25 %	25 %	0 %	387505145
4523	NC_017656	CAT	2	6	248953	248958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387505145
4524	NC_017656	ATC	2	6	248969	248974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387505145
4525	NC_017656	AAC	2	6	248975	248980	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387505145
4526	NC_017656	TGC	2	6	248993	248998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387505145
4527	NC_017656	CCT	2	6	249018	249023	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387505145
4528	NC_017656	GCC	2	6	249104	249109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387505145
4529	NC_017656	CTGC	2	8	249141	249148	0 %	25 %	25 %	50 %	387505145
4530	NC_017656	AGC	2	6	249196	249201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387505145
4531	NC_017656	CAG	2	6	249250	249255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387505145
4532	NC_017656	CCAG	2	8	249369	249376	25 %	0 %	25 %	50 %	387505145
4533	NC_017656	CCA	2	6	249456	249461	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387505145
4534	NC_017656	GGC	2	6	249543	249548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387505145
4535	NC_017656	GCG	2	6	249564	249569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387505145
4536	NC_017656	GCC	2	6	249596	249601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387505145
4537	NC_017656	GTC	2	6	249631	249636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387505145
4538	NC_017656	CGC	2	6	249684	249689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387505145
4539	NC_017656	GGT	2	6	249703	249708	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387505145
4540	NC_017656	GCC	2	6	249728	249733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387505145
4541	NC_017656	ATC	2	6	249793	249798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387505145
4542	NC_017656	CAG	2	6	249865	249870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387505145
4543	NC_017656	CTGG	2	8	249940	249947	0 %	25 %	50 %	25 %	387505145
4544	NC_017656	T	6	6	249955	249960	0 %	100 %	0 %	0 %	387505145
4545	NC_017656	GCG	2	6	249975	249980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387505145
4546	NC_017656	CAG	2	6	250030	250035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387505145
4547	NC_017656	TTC	2	6	250237	250242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387505145
4548	NC_017656	CAG	2	6	250255	250260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387505145
4549	NC_017656	GGCA	2	8	250324	250331	25 %	0 %	50 %	25 %	387505146
4550	NC_017656	G	6	6	250339	250344	0 %	0 %	100 %	0 %	387505146
4551	NC_017656	GCG	2	6	250389	250394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387505146
4552	NC_017656	TCA	2	6	250449	250454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387505146
4553	NC_017656	CAG	2	6	250481	250486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387505146
4554	NC_017656	GCG	2	6	250636	250641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387505146
4555	NC_017656	GGT	2	6	250661	250666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387505146
4556	NC_017656	CAC	2	6	250670	250675	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387505146
4557	NC_017656	CAG	2	6	250706	250711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387505146
4558	NC_017656	CAG	2	6	250826	250831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387505146
4559	NC_017656	CCG	2	6	250871	250876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387505146
4560	NC_017656	CGG	2	6	250913	250918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387505146
4561	NC_017656	GTG	2	6	250923	250928	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387505146
4562	NC_017656	TCA	2	6	250996	251001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387505146
4563	NC_017656	TCG	2	6	251078	251083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387505147
4564	NC_017656	GCC	2	6	251159	251164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387505147
4565	NC_017656	CAG	3	9	251176	251184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387505147
4566	NC_017656	GCG	2	6	251190	251195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387505147
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4568	NC_017656	CGTC	2	8	251271	251278	0 %	25 %	25 %	50 %	387505147
4569	NC_017656	GCA	2	6	251319	251324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387505147
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4572	NC_017656	CAG	2	6	251413	251418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387505147
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4593	NC_017656	CTG	2	6	252319	252324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387505147
4594	NC_017656	CTG	3	9	252355	252363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387505147
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4599	NC_017656	CGA	2	6	252541	252546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387505147
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4601	NC_017656	TGC	2	6	252640	252645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387505147
4602	NC_017656	CAT	2	6	252657	252662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387505147
4603	NC_017656	CCG	2	6	252696	252701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387505147
4604	NC_017656	AAT	2	6	252715	252720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387505147
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4607	NC_017656	T	6	6	252799	252804	0 %	100 %	0 %	0 %	387505147
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4612	NC_017656	TCG	2	6	252926	252931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387505147
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4743	NC_017656	GTC	2	6	260073	260078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387505153
4744	NC_017656	GCA	2	6	260210	260215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387505153
4745	NC_017656	GGC	2	6	260251	260256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387505153
4746	NC_017656	TCC	2	6	260257	260262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387505153
4747	NC_017656	GCA	2	6	260279	260284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387505153
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4756	NC_017656	GCTG	2	8	260669	260676	0 %	25 %	50 %	25 %	387505154
4757	NC_017656	CTGC	2	8	260783	260790	0 %	25 %	25 %	50 %	387505154
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4763	NC_017656	CT	3	6	261285	261290	0 %	50 %	0 %	50 %	387505155
4764	NC_017656	CTTT	2	8	261304	261311	0 %	75 %	0 %	25 %	387505155
4765	NC_017656	GTT	2	6	261323	261328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387505155
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4772	NC_017656	CCA	2	6	262229	262234	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387505156
4773	NC_017656	CTG	2	6	262266	262271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387505156
4774	NC_017656	AGGC	2	8	262274	262281	25 %	0 %	50 %	25 %	387505156
4775	NC_017656	GAT	2	6	262287	262292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387505156
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4785	NC_017656	TTAT	2	8	262857	262864	25 %	75 %	0 %	0 %	387505158
4786	NC_017656	CAGT	2	8	262976	262983	25 %	25 %	25 %	25 %	387505158
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4856	NC_017656	CGGGG	2	10	267425	267434	0 %	0 %	80 %	20 %	387505162
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4987	NC_017656	G	6	6	273258	273263	0 %	0 %	100 %	0 %	387505164
4988	NC_017656	ATT	3	9	273335	273343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387505164
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4990	NC_017656	TGA	2	6	273438	273443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387505164
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4992	NC_017656	TAGC	2	8	273482	273489	25 %	25 %	25 %	25 %	387505164
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