MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli O55:H7 str. RM12579 plasmid p12579_1

Total Repeats: 112

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017653	CG	3	6	313	318	0 %	0 %	50 %	50 %	387504722
2	NC_017653	GC	3	6	673	678	0 %	0 %	50 %	50 %	387504723
3	NC_017653	CG	3	6	1320	1325	0 %	0 %	50 %	50 %	387504723
4	NC_017653	TA	3	6	2978	2983	50 %	50 %	0 %	0 %	387504725
5	NC_017653	GT	4	8	4909	4916	0 %	50 %	50 %	0 %	387504727
6	NC_017653	TG	3	6	5084	5089	0 %	50 %	50 %	0 %	387504727
7	NC_017653	TC	3	6	8206	8211	0 %	50 %	0 %	50 %	387504731
8	NC_017653	GC	4	8	9425	9432	0 %	0 %	50 %	50 %	387504732
9	NC_017653	GC	3	6	9799	9804	0 %	0 %	50 %	50 %	387504732
10	NC_017653	GC	3	6	10113	10118	0 %	0 %	50 %	50 %	387504732
11	NC_017653	GA	3	6	10357	10362	50 %	0 %	50 %	0 %	387504732
12	NC_017653	CG	3	6	10397	10402	0 %	0 %	50 %	50 %	387504732
13	NC_017653	TG	3	6	10427	10432	0 %	50 %	50 %	0 %	387504732
14	NC_017653	CG	3	6	12381	12386	0 %	0 %	50 %	50 %	387504732
15	NC_017653	GC	4	8	13863	13870	0 %	0 %	50 %	50 %	387504732
16	NC_017653	CA	4	8	14774	14781	50 %	0 %	0 %	50 %	387504732
17	NC_017653	GT	3	6	14872	14877	0 %	50 %	50 %	0 %	387504732
18	NC_017653	GT	3	6	15160	15165	0 %	50 %	50 %	0 %	387504732
19	NC_017653	CT	3	6	15857	15862	0 %	50 %	0 %	50 %	387504733
20	NC_017653	TG	3	6	15945	15950	0 %	50 %	50 %	0 %	387504733
21	NC_017653	GC	3	6	16534	16539	0 %	0 %	50 %	50 %	387504733
22	NC_017653	GC	3	6	16789	16794	0 %	0 %	50 %	50 %	387504733
23	NC_017653	AT	3	6	18303	18308	50 %	50 %	0 %	0 %	387504735
24	NC_017653	CG	3	6	18317	18322	0 %	0 %	50 %	50 %	387504735
25	NC_017653	GT	3	6	18894	18899	0 %	50 %	50 %	0 %	387504737
26	NC_017653	TA	3	6	19321	19326	50 %	50 %	0 %	0 %	387504738
27	NC_017653	GC	3	6	21110	21115	0 %	0 %	50 %	50 %	387504740
28	NC_017653	GC	3	6	23918	23923	0 %	0 %	50 %	50 %	387504742
29	NC_017653	TG	3	6	24015	24020	0 %	50 %	50 %	0 %	387504742
30	NC_017653	GC	3	6	24406	24411	0 %	0 %	50 %	50 %	387504742
31	NC_017653	CG	3	6	24505	24510	0 %	0 %	50 %	50 %	387504742
32	NC_017653	GC	3	6	26115	26120	0 %	0 %	50 %	50 %	387504744
33	NC_017653	CG	5	10	26677	26686	0 %	0 %	50 %	50 %	387504744
34	NC_017653	AT	3	6	27403	27408	50 %	50 %	0 %	0 %	387504745
35	NC_017653	AT	3	6	27763	27768	50 %	50 %	0 %	0 %	387504746
36	NC_017653	TG	3	6	28365	28370	0 %	50 %	50 %	0 %	387504747
37	NC_017653	TC	3	6	29359	29364	0 %	50 %	0 %	50 %	387504748
38	NC_017653	AC	3	6	29700	29705	50 %	0 %	0 %	50 %	387504748
39	NC_017653	AT	3	6	31849	31854	50 %	50 %	0 %	0 %	387504753
40	NC_017653	GA	3	6	32112	32117	50 %	0 %	50 %	0 %	387504753
41	NC_017653	CA	3	6	32266	32271	50 %	0 %	0 %	50 %	387504753
42	NC_017653	TA	3	6	32291	32296	50 %	50 %	0 %	0 %	387504753
43	NC_017653	AG	3	6	34247	34252	50 %	0 %	50 %	0 %	387504754
44	NC_017653	GC	3	6	34912	34917	0 %	0 %	50 %	50 %	387504755
45	NC_017653	AT	3	6	35544	35549	50 %	50 %	0 %	0 %	387504756
46	NC_017653	TG	3	6	37337	37342	0 %	50 %	50 %	0 %	387504758
47	NC_017653	AT	3	6	39568	39573	50 %	50 %	0 %	0 %	387504759
48	NC_017653	AC	3	6	40916	40921	50 %	0 %	0 %	50 %	387504759
49	NC_017653	GA	3	6	40925	40930	50 %	0 %	50 %	0 %	387504759
50	NC_017653	TG	3	6	41399	41404	0 %	50 %	50 %	0 %	387504760
51	NC_017653	AG	3	6	42760	42765	50 %	0 %	50 %	0 %	387504762
52	NC_017653	AT	4	8	43656	43663	50 %	50 %	0 %	0 %	387504763
53	NC_017653	AT	3	6	43709	43714	50 %	50 %	0 %	0 %	387504763
54	NC_017653	AG	3	6	43726	43731	50 %	0 %	50 %	0 %	387504763
55	NC_017653	AT	4	8	43813	43820	50 %	50 %	0 %	0 %	387504763
56	NC_017653	AG	3	6	43844	43849	50 %	0 %	50 %	0 %	387504763
57	NC_017653	GC	3	6	45899	45904	0 %	0 %	50 %	50 %	387504766
58	NC_017653	GC	3	6	46205	46210	0 %	0 %	50 %	50 %	387504766
59	NC_017653	AT	3	6	46582	46587	50 %	50 %	0 %	0 %	387504767
60	NC_017653	AC	3	6	47465	47470	50 %	0 %	0 %	50 %	387504768
61	NC_017653	CG	3	6	51887	51892	0 %	0 %	50 %	50 %	387504773
62	NC_017653	GT	4	8	51978	51985	0 %	50 %	50 %	0 %	387504773
63	NC_017653	AG	3	6	53487	53492	50 %	0 %	50 %	0 %	387504774
64	NC_017653	AC	3	6	53713	53718	50 %	0 %	0 %	50 %	387504774
65	NC_017653	CG	3	6	54171	54176	0 %	0 %	50 %	50 %	387504774
66	NC_017653	CG	3	6	55606	55611	0 %	0 %	50 %	50 %	387504776
67	NC_017653	CT	3	6	56085	56090	0 %	50 %	0 %	50 %	387504776
68	NC_017653	AC	3	6	56378	56383	50 %	0 %	0 %	50 %	387504776
69	NC_017653	AT	3	6	56460	56465	50 %	50 %	0 %	0 %	387504776
70	NC_017653	AC	3	6	57059	57064	50 %	0 %	0 %	50 %	387504777
71	NC_017653	AG	3	6	58448	58453	50 %	0 %	50 %	0 %	387504778
72	NC_017653	AC	3	6	58767	58772	50 %	0 %	0 %	50 %	387504778
73	NC_017653	GC	3	6	62209	62214	0 %	0 %	50 %	50 %	387504784
74	NC_017653	CA	3	6	62441	62446	50 %	0 %	0 %	50 %	387504784
75	NC_017653	GC	3	6	62973	62978	0 %	0 %	50 %	50 %	387504785
76	NC_017653	GC	3	6	64578	64583	0 %	0 %	50 %	50 %	387504785
77	NC_017653	GC	3	6	66092	66097	0 %	0 %	50 %	50 %	387504786
78	NC_017653	TA	3	6	66509	66514	50 %	50 %	0 %	0 %	387504787
79	NC_017653	CT	3	6	67184	67189	0 %	50 %	0 %	50 %	387504788
80	NC_017653	GC	3	6	67315	67320	0 %	0 %	50 %	50 %	387504788
81	NC_017653	CG	3	6	68230	68235	0 %	0 %	50 %	50 %	387504789
82	NC_017653	TG	3	6	70039	70044	0 %	50 %	50 %	0 %	387504790
83	NC_017653	CG	3	6	70246	70251	0 %	0 %	50 %	50 %	387504790
84	NC_017653	AG	3	6	71535	71540	50 %	0 %	50 %	0 %	387504792
85	NC_017653	AT	3	6	73033	73038	50 %	50 %	0 %	0 %	387504794
86	NC_017653	GC	3	6	73816	73821	0 %	0 %	50 %	50 %	387504795
87	NC_017653	CG	3	6	74549	74554	0 %	0 %	50 %	50 %	387504795
88	NC_017653	CA	3	6	74937	74942	50 %	0 %	0 %	50 %	387504796
89	NC_017653	AG	3	6	75896	75901	50 %	0 %	50 %	0 %	387504798
90	NC_017653	CG	3	6	76839	76844	0 %	0 %	50 %	50 %	387504801
91	NC_017653	GC	3	6	77869	77874	0 %	0 %	50 %	50 %	387504802
92	NC_017653	GC	3	6	78616	78621	0 %	0 %	50 %	50 %	387504803
93	NC_017653	CG	3	6	79664	79669	0 %	0 %	50 %	50 %	387504804
94	NC_017653	TG	3	6	81493	81498	0 %	50 %	50 %	0 %	387504806
95	NC_017653	GA	3	6	82893	82898	50 %	0 %	50 %	0 %	387504809
96	NC_017653	CA	3	6	83695	83700	50 %	0 %	0 %	50 %	387504811
97	NC_017653	AC	3	6	84300	84305	50 %	0 %	0 %	50 %	387504812
98	NC_017653	TA	3	6	85060	85065	50 %	50 %	0 %	0 %	387504814
99	NC_017653	GC	3	6	86569	86574	0 %	0 %	50 %	50 %	387504817
100	NC_017653	TG	3	6	86983	86988	0 %	50 %	50 %	0 %	387504818
101	NC_017653	CG	3	6	87283	87288	0 %	0 %	50 %	50 %	387504819
102	NC_017653	AT	3	6	87488	87493	50 %	50 %	0 %	0 %	387504820
103	NC_017653	AT	3	6	87677	87682	50 %	50 %	0 %	0 %	387504820
104	NC_017653	GC	3	6	88944	88949	0 %	0 %	50 %	50 %	387504822
105	NC_017653	CT	3	6	89462	89467	0 %	50 %	0 %	50 %	387504823
106	NC_017653	CG	4	8	90214	90221	0 %	0 %	50 %	50 %	387504824
107	NC_017653	CG	3	6	90727	90732	0 %	0 %	50 %	50 %	387504824
108	NC_017653	GC	3	6	92127	92132	0 %	0 %	50 %	50 %	387504825
109	NC_017653	GC	3	6	92451	92456	0 %	0 %	50 %	50 %	387504826
110	NC_017653	AT	3	6	92590	92595	50 %	50 %	0 %	0 %	387504826
111	NC_017653	AC	3	6	92715	92720	50 %	0 %	0 %	50 %	387504826
112	NC_017653	CA	3	6	92721	92726	50 %	0 %	0 %	50 %	387504826

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.