MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli O55:H7 str. RM12579 plasmid p12579_1

Total Repeats: 190

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017653	ACGC	2	8	335	342	25 %	0 %	25 %	50 %	387504722
2	NC_017653	GTTC	2	8	868	875	0 %	50 %	25 %	25 %	387504723
3	NC_017653	GATT	2	8	1244	1251	25 %	50 %	25 %	0 %	387504723
4	NC_017653	CTGT	2	8	1557	1564	0 %	50 %	25 %	25 %	387504724
5	NC_017653	GACT	2	8	3408	3415	25 %	25 %	25 %	25 %	387504726
6	NC_017653	CGGA	2	8	4653	4660	25 %	0 %	50 %	25 %	387504727
7	NC_017653	CAGA	2	8	4785	4792	50 %	0 %	25 %	25 %	387504727
8	NC_017653	CTGG	2	8	5600	5607	0 %	25 %	50 %	25 %	387504728
9	NC_017653	AAGA	2	8	5640	5647	75 %	0 %	25 %	0 %	387504728
10	NC_017653	GCTG	2	8	5681	5688	0 %	25 %	50 %	25 %	387504728
11	NC_017653	TGTT	2	8	8039	8046	0 %	75 %	25 %	0 %	387504730
12	NC_017653	CAGC	2	8	8774	8781	25 %	0 %	25 %	50 %	387504732
13	NC_017653	ACTC	2	8	10213	10220	25 %	25 %	0 %	50 %	387504732
14	NC_017653	TTTA	2	8	10259	10266	25 %	75 %	0 %	0 %	387504732
15	NC_017653	TTCT	2	8	10631	10638	0 %	75 %	0 %	25 %	387504732
16	NC_017653	CTGG	2	8	10926	10933	0 %	25 %	50 %	25 %	387504732
17	NC_017653	CCCA	2	8	11063	11070	25 %	0 %	0 %	75 %	387504732
18	NC_017653	TATC	2	8	11491	11498	25 %	50 %	0 %	25 %	387504732
19	NC_017653	ATCG	2	8	12095	12102	25 %	25 %	25 %	25 %	387504732
20	NC_017653	CCAT	2	8	12684	12691	25 %	25 %	0 %	50 %	387504732
21	NC_017653	ACTG	2	8	13338	13345	25 %	25 %	25 %	25 %	387504732
22	NC_017653	CTGG	2	8	13659	13666	0 %	25 %	50 %	25 %	387504732
23	NC_017653	CTGC	2	8	13930	13937	0 %	25 %	25 %	50 %	387504732
24	NC_017653	GGCT	2	8	14070	14077	0 %	25 %	50 %	25 %	387504732
25	NC_017653	TGAT	2	8	14113	14120	25 %	50 %	25 %	0 %	387504732
26	NC_017653	CGGT	2	8	14344	14351	0 %	25 %	50 %	25 %	387504732
27	NC_017653	GAAT	2	8	14918	14925	50 %	25 %	25 %	0 %	387504732
28	NC_017653	CAGC	2	8	14941	14948	25 %	0 %	25 %	50 %	387504732
29	NC_017653	CCAG	2	8	15210	15217	25 %	0 %	25 %	50 %	387504732
30	NC_017653	GCTG	2	8	15610	15617	0 %	25 %	50 %	25 %	387504733
31	NC_017653	TGGC	2	8	15708	15715	0 %	25 %	50 %	25 %	387504733
32	NC_017653	ACGC	2	8	15848	15855	25 %	0 %	25 %	50 %	387504733
33	NC_017653	TTCA	2	8	16823	16830	25 %	50 %	0 %	25 %	387504733
34	NC_017653	GAAC	2	8	17101	17108	50 %	0 %	25 %	25 %	387504733
35	NC_017653	GTAT	2	8	17297	17304	25 %	50 %	25 %	0 %	387504734
36	NC_017653	GGCG	2	8	17613	17620	0 %	0 %	75 %	25 %	387504734
37	NC_017653	GCAG	2	8	17792	17799	25 %	0 %	50 %	25 %	387504734
38	NC_017653	TCAA	2	8	18216	18223	50 %	25 %	0 %	25 %	387504734
39	NC_017653	TTTC	2	8	18343	18350	0 %	75 %	0 %	25 %	387504735
40	NC_017653	TGGA	2	8	18673	18680	25 %	25 %	50 %	0 %	387504737
41	NC_017653	TGGT	2	8	18991	18998	0 %	50 %	50 %	0 %	387504737
42	NC_017653	GACT	2	8	19146	19153	25 %	25 %	25 %	25 %	387504737
43	NC_017653	GAAT	2	8	19365	19372	50 %	25 %	25 %	0 %	387504738
44	NC_017653	GAGT	2	8	19458	19465	25 %	25 %	50 %	0 %	387504738
45	NC_017653	AACC	2	8	19642	19649	50 %	0 %	0 %	50 %	387504738
46	NC_017653	CATT	2	8	20281	20288	25 %	50 %	0 %	25 %	387504739
47	NC_017653	TTCC	2	8	21167	21174	0 %	50 %	0 %	50 %	387504740
48	NC_017653	CCAG	2	8	21523	21530	25 %	0 %	25 %	50 %	387504741
49	NC_017653	TTAC	2	8	21915	21922	25 %	50 %	0 %	25 %	387504742
50	NC_017653	ATGT	2	8	24804	24811	25 %	50 %	25 %	0 %	387504743
51	NC_017653	ACTC	2	8	25620	25627	25 %	25 %	0 %	50 %	387504744
52	NC_017653	TTGA	2	8	27137	27144	25 %	50 %	25 %	0 %	387504745
53	NC_017653	CATC	2	8	28294	28301	25 %	25 %	0 %	50 %	387504747
54	NC_017653	AATT	2	8	29368	29375	50 %	50 %	0 %	0 %	387504748
55	NC_017653	CTGT	2	8	29447	29454	0 %	50 %	25 %	25 %	387504748
56	NC_017653	GCTG	2	8	29863	29870	0 %	25 %	50 %	25 %	387504749
57	NC_017653	GGCT	2	8	30340	30347	0 %	25 %	50 %	25 %	387504750
58	NC_017653	GACG	2	8	30457	30464	25 %	0 %	50 %	25 %	387504750
59	NC_017653	CAGG	2	8	31802	31809	25 %	0 %	50 %	25 %	387504753
60	NC_017653	GTCA	2	8	32178	32185	25 %	25 %	25 %	25 %	387504753
61	NC_017653	TTGA	2	8	32186	32193	25 %	50 %	25 %	0 %	387504753
62	NC_017653	GCAG	2	8	32254	32261	25 %	0 %	50 %	25 %	387504753
63	NC_017653	AATT	2	8	32577	32584	50 %	50 %	0 %	0 %	387504754
64	NC_017653	GCTT	2	8	33038	33045	0 %	50 %	25 %	25 %	387504754
65	NC_017653	ATCA	2	8	34030	34037	50 %	25 %	0 %	25 %	387504754
66	NC_017653	TCCA	2	8	34327	34334	25 %	25 %	0 %	50 %	387504754
67	NC_017653	GTAA	2	8	34495	34502	50 %	25 %	25 %	0 %	387504754
68	NC_017653	TCAT	2	8	34523	34530	25 %	50 %	0 %	25 %	387504754
69	NC_017653	AAAG	2	8	36080	36087	75 %	0 %	25 %	0 %	387504757
70	NC_017653	TTTG	2	8	36290	36297	0 %	75 %	25 %	0 %	387504757
71	NC_017653	AAAT	2	8	36310	36317	75 %	25 %	0 %	0 %	387504757
72	NC_017653	CAAC	2	8	36943	36950	50 %	0 %	0 %	50 %	387504757
73	NC_017653	CAGC	2	8	37153	37160	25 %	0 %	25 %	50 %	387504757
74	NC_017653	GAAT	2	8	37253	37260	50 %	25 %	25 %	0 %	387504757
75	NC_017653	ATCA	2	8	37676	37683	50 %	25 %	0 %	25 %	387504758
76	NC_017653	TCAT	2	8	37696	37703	25 %	50 %	0 %	25 %	387504759
77	NC_017653	GCAA	2	8	37819	37826	50 %	0 %	25 %	25 %	387504759
78	NC_017653	GGTT	2	8	37959	37966	0 %	50 %	50 %	0 %	387504759
79	NC_017653	TTTC	2	8	38501	38508	0 %	75 %	0 %	25 %	387504759
80	NC_017653	GCTT	2	8	38596	38603	0 %	50 %	25 %	25 %	387504759
81	NC_017653	TATT	2	8	38803	38810	25 %	75 %	0 %	0 %	387504759
82	NC_017653	TTTC	2	8	39206	39213	0 %	75 %	0 %	25 %	387504759
83	NC_017653	CCGT	2	8	40220	40227	0 %	25 %	25 %	50 %	387504759
84	NC_017653	CAGC	2	8	41882	41889	25 %	0 %	25 %	50 %	387504760
85	NC_017653	GTTG	2	8	42393	42400	0 %	50 %	50 %	0 %	387504761
86	NC_017653	GGTA	2	8	42454	42461	25 %	25 %	50 %	0 %	387504761
87	NC_017653	GATA	2	8	42804	42811	50 %	25 %	25 %	0 %	387504762
88	NC_017653	GCAA	2	8	43062	43069	50 %	0 %	25 %	25 %	387504762
89	NC_017653	ATTG	2	8	44061	44068	25 %	50 %	25 %	0 %	387504763
90	NC_017653	TCTT	2	8	44123	44130	0 %	75 %	0 %	25 %	387504763
91	NC_017653	TAAT	2	8	44257	44264	50 %	50 %	0 %	0 %	387504764
92	NC_017653	TTTA	2	8	44348	44355	25 %	75 %	0 %	0 %	387504764
93	NC_017653	AAAC	2	8	44531	44538	75 %	0 %	0 %	25 %	387504764
94	NC_017653	ATAA	2	8	44670	44677	75 %	25 %	0 %	0 %	387504765
95	NC_017653	ACAA	2	8	45876	45883	75 %	0 %	0 %	25 %	387504766
96	NC_017653	CGAC	2	8	46651	46658	25 %	0 %	25 %	50 %	387504767
97	NC_017653	AGCG	2	8	46694	46701	25 %	0 %	50 %	25 %	387504767
98	NC_017653	TTCG	2	8	46802	46809	0 %	50 %	25 %	25 %	387504767
99	NC_017653	TTTC	2	8	47257	47264	0 %	75 %	0 %	25 %	387504767
100	NC_017653	TTCA	2	8	47543	47550	25 %	50 %	0 %	25 %	387504768
101	NC_017653	TCTG	2	8	47638	47645	0 %	50 %	25 %	25 %	387504768
102	NC_017653	TTTA	2	8	47812	47819	25 %	75 %	0 %	0 %	387504768
103	NC_017653	TCAG	2	8	50298	50305	25 %	25 %	25 %	25 %	387504772
104	NC_017653	CTTA	2	8	50941	50948	25 %	50 %	0 %	25 %	387504773
105	NC_017653	AGAC	2	8	51494	51501	50 %	0 %	25 %	25 %	387504773
106	NC_017653	ATCA	2	8	51656	51663	50 %	25 %	0 %	25 %	387504773
107	NC_017653	CGCA	2	8	51770	51777	25 %	0 %	25 %	50 %	387504773
108	NC_017653	GGCT	2	8	52976	52983	0 %	25 %	50 %	25 %	387504774
109	NC_017653	GTCG	2	8	53165	53172	0 %	25 %	50 %	25 %	387504774
110	NC_017653	CAGG	2	8	53863	53870	25 %	0 %	50 %	25 %	387504774
111	NC_017653	GAGG	2	8	55706	55713	25 %	0 %	75 %	0 %	387504776
112	NC_017653	ATCA	2	8	56022	56029	50 %	25 %	0 %	25 %	387504776
113	NC_017653	TTTC	2	8	56033	56040	0 %	75 %	0 %	25 %	387504776
114	NC_017653	TCAG	2	8	56671	56678	25 %	25 %	25 %	25 %	387504776
115	NC_017653	GCTG	2	8	56720	56727	0 %	25 %	50 %	25 %	387504776
116	NC_017653	AGCA	2	8	57344	57351	50 %	0 %	25 %	25 %	387504777
117	NC_017653	TCCC	2	8	57401	57408	0 %	25 %	0 %	75 %	387504777
118	NC_017653	ATCG	2	8	58506	58513	25 %	25 %	25 %	25 %	387504778
119	NC_017653	CCCA	2	8	58586	58593	25 %	0 %	0 %	75 %	387504778
120	NC_017653	CGTT	2	8	58695	58702	0 %	50 %	25 %	25 %	387504778
121	NC_017653	GCTT	2	8	60090	60097	0 %	50 %	25 %	25 %	387504781
122	NC_017653	GCTG	2	8	60320	60327	0 %	25 %	50 %	25 %	387504782
123	NC_017653	CCAA	2	8	60746	60753	50 %	0 %	0 %	50 %	387504782
124	NC_017653	GGCA	2	8	62215	62222	25 %	0 %	50 %	25 %	387504784
125	NC_017653	CTGG	2	8	62873	62880	0 %	25 %	50 %	25 %	387504785
126	NC_017653	GGAA	2	8	63423	63430	50 %	0 %	50 %	0 %	387504785
127	NC_017653	ACAT	2	8	63646	63653	50 %	25 %	0 %	25 %	387504785
128	NC_017653	AACA	2	8	64184	64191	75 %	0 %	0 %	25 %	387504785
129	NC_017653	CATT	2	8	66359	66366	25 %	50 %	0 %	25 %	387504786
130	NC_017653	ATTA	2	8	66675	66682	50 %	50 %	0 %	0 %	387504787
131	NC_017653	GATT	2	8	68088	68095	25 %	50 %	25 %	0 %	387504789
132	NC_017653	TCGT	2	8	68219	68226	0 %	50 %	25 %	25 %	387504789
133	NC_017653	ATCG	2	8	69002	69009	25 %	25 %	25 %	25 %	387504789
134	NC_017653	AACA	2	8	69699	69706	75 %	0 %	0 %	25 %	387504790
135	NC_017653	GATT	2	8	70124	70131	25 %	50 %	25 %	0 %	387504790
136	NC_017653	CCGC	2	8	70532	70539	0 %	0 %	25 %	75 %	387504791
137	NC_017653	CATC	2	8	70842	70849	25 %	25 %	0 %	50 %	387504791
138	NC_017653	GATT	2	8	71024	71031	25 %	50 %	25 %	0 %	387504792
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.