MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli O55:H7 str. RM12579 plasmid p12579_1

Total Repeats: 1083

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017653	TCA	2	6	306	311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387504722
2	NC_017653	GAA	2	6	321	326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387504722
3	NC_017653	TGA	2	6	495	500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504723
4	NC_017653	GGC	2	6	591	596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387504723
5	NC_017653	TCT	2	6	657	662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387504723
6	NC_017653	TCG	2	6	732	737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504723
7	NC_017653	TGA	2	6	1128	1133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504723
8	NC_017653	ACT	2	6	1142	1147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387504723
9	NC_017653	CCA	2	6	1190	1195	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387504723
10	NC_017653	TGG	2	6	1371	1376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387504723
11	NC_017653	CTG	2	6	1447	1452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504723
12	NC_017653	GTG	2	6	1669	1674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387504724
13	NC_017653	TGA	2	6	1687	1692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504724
14	NC_017653	GAA	2	6	1704	1709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387504724
15	NC_017653	AGT	2	6	1730	1735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504724
16	NC_017653	ATG	2	6	1818	1823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504724
17	NC_017653	GGA	2	6	2941	2946	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387504725
18	NC_017653	TAT	2	6	2956	2961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387504725
19	NC_017653	TGG	2	6	3450	3455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387504726
20	NC_017653	CAG	2	6	3508	3513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387504726
21	NC_017653	CCG	2	6	3523	3528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387504726
22	NC_017653	GTG	2	6	3539	3544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387504726
23	NC_017653	TTC	2	6	3597	3602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387504726
24	NC_017653	CAG	2	6	3673	3678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387504726
25	NC_017653	AGG	2	6	3754	3759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387504726
26	NC_017653	CGG	2	6	3770	3775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387504726
27	NC_017653	ACA	2	6	3826	3831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387504726
28	NC_017653	TGC	2	6	3838	3843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504726
29	NC_017653	CCG	2	6	3909	3914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387504726
30	NC_017653	GCC	2	6	3956	3961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387504726
31	NC_017653	CAG	2	6	3973	3978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387504726
32	NC_017653	CAC	2	6	4018	4023	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387504726
33	NC_017653	AAT	2	6	4105	4110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387504726
34	NC_017653	CAG	2	6	4170	4175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387504726
35	NC_017653	CGG	2	6	4208	4213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387504726
36	NC_017653	TGG	2	6	4314	4319	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387504726
37	NC_017653	CAG	2	6	4362	4367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387504727
38	NC_017653	CAG	2	6	4411	4416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387504727
39	NC_017653	CAG	2	6	4429	4434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387504727
40	NC_017653	AAT	2	6	4522	4527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387504727
41	NC_017653	ATA	2	6	4565	4570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387504727
42	NC_017653	ACG	2	6	4571	4576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387504727
43	NC_017653	ACC	2	6	4670	4675	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387504727
44	NC_017653	TGC	2	6	4696	4701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504727
45	NC_017653	TAA	2	6	4752	4757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387504727
46	NC_017653	TCA	2	6	4832	4837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387504727
47	NC_017653	AAT	2	6	4924	4929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387504727
48	NC_017653	CTT	2	6	5025	5030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387504727
49	NC_017653	GAT	2	6	5104	5109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504727
50	NC_017653	ACG	2	6	5400	5405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387504728
51	NC_017653	CAC	2	6	5556	5561	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387504728
52	NC_017653	GCA	2	6	5568	5573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387504728
53	NC_017653	CAT	2	6	5708	5713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387504728
54	NC_017653	TAA	2	6	5718	5723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387504728
55	NC_017653	CTG	2	6	5965	5970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504729
56	NC_017653	CAA	2	6	5978	5983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387504729
57	NC_017653	CGC	3	9	6021	6029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387504729
58	NC_017653	GCT	2	6	6044	6049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504729
59	NC_017653	TGG	2	6	6091	6096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387504729
60	NC_017653	TTA	2	6	6112	6117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387504729
61	NC_017653	TCC	2	6	6259	6264	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387504729
62	NC_017653	ACA	2	6	6382	6387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387504729
63	NC_017653	ATG	2	6	7984	7989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504730
64	NC_017653	TTC	2	6	8001	8006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387504730
65	NC_017653	CGA	2	6	8054	8059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387504730
66	NC_017653	GTA	2	6	8184	8189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504730
67	NC_017653	GTC	2	6	8267	8272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504731
68	NC_017653	CTT	2	6	8275	8280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387504731
69	NC_017653	GAC	2	6	8416	8421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387504731
70	NC_017653	TAA	2	6	8447	8452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387504731
71	NC_017653	GAA	2	6	8534	8539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387504731
72	NC_017653	TCT	2	6	8553	8558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387504731
73	NC_017653	AAC	2	6	8568	8573	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387504731
74	NC_017653	TTG	2	6	8681	8686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387504732
75	NC_017653	CCA	2	6	8732	8737	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387504732
76	NC_017653	TTC	2	6	8757	8762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387504732
77	NC_017653	GCG	2	6	8871	8876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387504732
78	NC_017653	CAT	2	6	8891	8896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387504732
79	NC_017653	CGG	2	6	8905	8910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387504732
80	NC_017653	TGG	2	6	8950	8955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387504732
81	NC_017653	TGA	2	6	8969	8974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504732
82	NC_017653	CTT	2	6	8980	8985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387504732
83	NC_017653	GGC	2	6	8999	9004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387504732
84	NC_017653	TCC	2	6	9012	9017	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387504732
85	NC_017653	CCA	2	6	9166	9171	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387504732
86	NC_017653	CGT	2	6	9295	9300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504732
87	NC_017653	TGG	2	6	9337	9342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387504732
88	NC_017653	GCG	2	6	9381	9386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387504732
89	NC_017653	CTG	2	6	9415	9420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504732
90	NC_017653	TGC	2	6	9434	9439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504732
91	NC_017653	CAT	2	6	9761	9766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387504732
92	NC_017653	GAC	2	6	9789	9794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387504732
93	NC_017653	CAA	2	6	9856	9861	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387504732
94	NC_017653	GCT	2	6	9928	9933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504732
95	NC_017653	ATG	2	6	9960	9965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504732
96	NC_017653	CCA	2	6	9990	9995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387504732
97	NC_017653	GAT	2	6	10097	10102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504732
98	NC_017653	GTA	2	6	10169	10174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504732
99	NC_017653	TCC	2	6	10272	10277	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387504732
100	NC_017653	AAT	2	6	10329	10334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387504732
101	NC_017653	ACG	2	6	10393	10398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387504732
102	NC_017653	AAC	2	6	10413	10418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387504732
103	NC_017653	GCT	2	6	10473	10478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504732
104	NC_017653	CGG	2	6	10513	10518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387504732
105	NC_017653	TGC	2	6	10590	10595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504732
106	NC_017653	TAG	2	6	10621	10626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504732
107	NC_017653	CAT	2	6	10682	10687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387504732
108	NC_017653	CAT	2	6	10702	10707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387504732
109	NC_017653	GGA	2	6	10780	10785	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387504732
110	NC_017653	AGT	3	9	10855	10863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504732
111	NC_017653	GAT	2	6	10951	10956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504732
112	NC_017653	GAT	3	9	11012	11020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504732
113	NC_017653	CCT	2	6	11032	11037	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387504732
114	NC_017653	GCA	2	6	11046	11051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387504732
115	NC_017653	TGC	2	6	11085	11090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504732
116	NC_017653	CGG	2	6	11171	11176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387504732
117	NC_017653	GAT	2	6	11321	11326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504732
118	NC_017653	TGC	2	6	11514	11519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504732
119	NC_017653	ATC	2	6	11528	11533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387504732
120	NC_017653	GTC	3	9	11537	11545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504732
121	NC_017653	TGG	2	6	11551	11556	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387504732
122	NC_017653	GCT	2	6	11581	11586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504732
123	NC_017653	ATT	2	6	11676	11681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387504732
124	NC_017653	TTG	2	6	11748	11753	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387504732
125	NC_017653	CTG	2	6	11774	11779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504732
126	NC_017653	TTC	2	6	11786	11791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387504732
127	NC_017653	CGC	2	6	11795	11800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387504732
128	NC_017653	GTT	2	6	11803	11808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387504732
129	NC_017653	GTG	2	6	11818	11823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387504732
130	NC_017653	CTG	2	6	11828	11833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504732
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254	NC_017653	TGC	2	6	20983	20988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504740
255	NC_017653	CAT	2	6	21257	21262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387504740
256	NC_017653	GAA	2	6	21270	21275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387504740
257	NC_017653	TGC	2	6	21353	21358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504740
258	NC_017653	GAA	2	6	21387	21392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387504740
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288	NC_017653	CTT	2	6	22939	22944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387504742
289	NC_017653	TGG	2	6	23096	23101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387504742
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294	NC_017653	CCG	2	6	23412	23417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387504742
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