MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli UMNK88 plasmid pUMNK88_Ent

Total Repeats: 96

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017640	TG	3	6	334	339	0 %	50 %	50 %	0 %	386612082
2	NC_017640	AG	3	6	632	637	50 %	0 %	50 %	0 %	386612082
3	NC_017640	GT	3	6	1473	1478	0 %	50 %	50 %	0 %	386612083
4	NC_017640	CT	3	6	4816	4821	0 %	50 %	0 %	50 %	386612084
5	NC_017640	AT	3	6	5089	5094	50 %	50 %	0 %	0 %	386612084
6	NC_017640	AT	3	6	5098	5103	50 %	50 %	0 %	0 %	386612084
7	NC_017640	TG	3	6	6040	6045	0 %	50 %	50 %	0 %	386612085
8	NC_017640	CA	3	6	6148	6153	50 %	0 %	0 %	50 %	386612085
9	NC_017640	CT	3	6	7851	7856	0 %	50 %	0 %	50 %	386612088
10	NC_017640	AT	3	6	10029	10034	50 %	50 %	0 %	0 %	386612090
11	NC_017640	GT	3	6	11758	11763	0 %	50 %	50 %	0 %	386612091
12	NC_017640	AG	3	6	12518	12523	50 %	0 %	50 %	0 %	386612091
13	NC_017640	AT	3	6	14683	14688	50 %	50 %	0 %	0 %	386612096
14	NC_017640	CA	3	6	14804	14809	50 %	0 %	0 %	50 %	386612096
15	NC_017640	TG	3	6	16804	16809	0 %	50 %	50 %	0 %	386612099
16	NC_017640	GC	3	6	16852	16857	0 %	0 %	50 %	50 %	386612099
17	NC_017640	CT	3	6	17095	17100	0 %	50 %	0 %	50 %	386612099
18	NC_017640	GT	3	6	17169	17174	0 %	50 %	50 %	0 %	386612099
19	NC_017640	AC	3	6	18141	18146	50 %	0 %	0 %	50 %	386612100
20	NC_017640	AT	3	6	19465	19470	50 %	50 %	0 %	0 %	386612101
21	NC_017640	TA	4	8	19786	19793	50 %	50 %	0 %	0 %	386612101
22	NC_017640	AT	3	6	19906	19911	50 %	50 %	0 %	0 %	386612101
23	NC_017640	GA	3	6	20058	20063	50 %	0 %	50 %	0 %	386612101
24	NC_017640	AT	3	6	20161	20166	50 %	50 %	0 %	0 %	386612101
25	NC_017640	AT	3	6	20230	20235	50 %	50 %	0 %	0 %	386612101
26	NC_017640	CT	3	6	20300	20305	0 %	50 %	0 %	50 %	386612102
27	NC_017640	AC	3	6	20359	20364	50 %	0 %	0 %	50 %	386612102
28	NC_017640	AT	3	6	20367	20372	50 %	50 %	0 %	0 %	386612102
29	NC_017640	TG	3	6	23496	23501	0 %	50 %	50 %	0 %	386612106
30	NC_017640	CA	3	6	24418	24423	50 %	0 %	0 %	50 %	386612107
31	NC_017640	GA	3	6	27079	27084	50 %	0 %	50 %	0 %	386612109
32	NC_017640	TG	3	6	27910	27915	0 %	50 %	50 %	0 %	386612109
33	NC_017640	GC	3	6	27988	27993	0 %	0 %	50 %	50 %	386612109
34	NC_017640	CT	3	6	28031	28036	0 %	50 %	0 %	50 %	386612109
35	NC_017640	TG	3	6	28531	28536	0 %	50 %	50 %	0 %	386612109
36	NC_017640	CT	3	6	29061	29066	0 %	50 %	0 %	50 %	386612109
37	NC_017640	CT	3	6	29122	29127	0 %	50 %	0 %	50 %	386612109
38	NC_017640	GT	3	6	30439	30444	0 %	50 %	50 %	0 %	386612109
39	NC_017640	GT	3	6	32185	32190	0 %	50 %	50 %	0 %	386612110
40	NC_017640	AT	3	6	32805	32810	50 %	50 %	0 %	0 %	386612110
41	NC_017640	AT	3	6	33990	33995	50 %	50 %	0 %	0 %	386612111
42	NC_017640	TG	3	6	35975	35980	0 %	50 %	50 %	0 %	386612113
43	NC_017640	AC	3	6	36159	36164	50 %	0 %	0 %	50 %	386612113
44	NC_017640	GT	3	6	37950	37955	0 %	50 %	50 %	0 %	386612114
45	NC_017640	TG	3	6	38708	38713	0 %	50 %	50 %	0 %	386612114
46	NC_017640	AT	3	6	39273	39278	50 %	50 %	0 %	0 %	386612116
47	NC_017640	GA	3	6	40011	40016	50 %	0 %	50 %	0 %	386612116
48	NC_017640	TG	3	6	42570	42575	0 %	50 %	50 %	0 %	386612120
49	NC_017640	AT	3	6	44237	44242	50 %	50 %	0 %	0 %	386612121
50	NC_017640	TC	3	6	44282	44287	0 %	50 %	0 %	50 %	386612122
51	NC_017640	AC	3	6	44625	44630	50 %	0 %	0 %	50 %	386612122
52	NC_017640	CG	3	6	47617	47622	0 %	0 %	50 %	50 %	386612126
53	NC_017640	TG	3	6	47666	47671	0 %	50 %	50 %	0 %	386612126
54	NC_017640	GC	3	6	48085	48090	0 %	0 %	50 %	50 %	386612126
55	NC_017640	CA	3	6	48291	48296	50 %	0 %	0 %	50 %	386612126
56	NC_017640	CT	3	6	48554	48559	0 %	50 %	0 %	50 %	386612126
57	NC_017640	GC	3	6	48560	48565	0 %	0 %	50 %	50 %	386612126
58	NC_017640	AC	3	6	49148	49153	50 %	0 %	0 %	50 %	386612126
59	NC_017640	TG	3	6	49268	49273	0 %	50 %	50 %	0 %	386612126
60	NC_017640	CG	3	6	49584	49589	0 %	0 %	50 %	50 %	386612126
61	NC_017640	CG	3	6	51625	51630	0 %	0 %	50 %	50 %	386612129
62	NC_017640	GC	3	6	52320	52325	0 %	0 %	50 %	50 %	386612130
63	NC_017640	GC	3	6	53383	53388	0 %	0 %	50 %	50 %	386612131
64	NC_017640	AT	3	6	54327	54332	50 %	50 %	0 %	0 %	386612132
65	NC_017640	AG	3	6	54539	54544	50 %	0 %	50 %	0 %	386612132
66	NC_017640	TA	3	6	56173	56178	50 %	50 %	0 %	0 %	386612135
67	NC_017640	CT	3	6	56180	56185	0 %	50 %	0 %	50 %	386612135
68	NC_017640	CA	3	6	56367	56372	50 %	0 %	0 %	50 %	386612135
69	NC_017640	TC	3	6	56613	56618	0 %	50 %	0 %	50 %	386612136
70	NC_017640	GA	3	6	56677	56682	50 %	0 %	50 %	0 %	386612136
71	NC_017640	CT	3	6	60820	60825	0 %	50 %	0 %	50 %	386612140
72	NC_017640	CA	3	6	62017	62022	50 %	0 %	0 %	50 %	386612141
73	NC_017640	AC	4	8	62736	62743	50 %	0 %	0 %	50 %	386612141
74	NC_017640	AT	3	6	63915	63920	50 %	50 %	0 %	0 %	386612141
75	NC_017640	CT	3	6	63975	63980	0 %	50 %	0 %	50 %	386612142
76	NC_017640	GC	3	6	64586	64591	0 %	0 %	50 %	50 %	386612142
77	NC_017640	CA	3	6	65960	65965	50 %	0 %	0 %	50 %	386612144
78	NC_017640	GC	3	6	66151	66156	0 %	0 %	50 %	50 %	386612144
79	NC_017640	TC	3	6	67359	67364	0 %	50 %	0 %	50 %	386612145
80	NC_017640	CG	3	6	67534	67539	0 %	0 %	50 %	50 %	386612145
81	NC_017640	CG	3	6	68828	68833	0 %	0 %	50 %	50 %	386612146
82	NC_017640	GA	3	6	69898	69903	50 %	0 %	50 %	0 %	386612148
83	NC_017640	CA	3	6	70527	70532	50 %	0 %	0 %	50 %	386612150
84	NC_017640	GT	4	8	71210	71217	0 %	50 %	50 %	0 %	386612151
85	NC_017640	GC	3	6	71471	71476	0 %	0 %	50 %	50 %	386612151
86	NC_017640	TA	3	6	73385	73390	50 %	50 %	0 %	0 %	386612153
87	NC_017640	TA	4	8	73433	73440	50 %	50 %	0 %	0 %	386612153
88	NC_017640	AT	3	6	73754	73759	50 %	50 %	0 %	0 %	386612153
89	NC_017640	CA	4	8	74039	74046	50 %	0 %	0 %	50 %	386612153
90	NC_017640	CA	3	6	75597	75602	50 %	0 %	0 %	50 %	386612155
91	NC_017640	CA	3	6	76448	76453	50 %	0 %	0 %	50 %	386612156
92	NC_017640	CG	3	6	76505	76510	0 %	0 %	50 %	50 %	386612156
93	NC_017640	GA	3	6	77536	77541	50 %	0 %	50 %	0 %	386612157
94	NC_017640	CT	3	6	77627	77632	0 %	50 %	0 %	50 %	386612157
95	NC_017640	TC	3	6	77974	77979	0 %	50 %	0 %	50 %	386612157
96	NC_017640	AC	3	6	80871	80876	50 %	0 %	0 %	50 %	386612162

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.