MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli UMNK88 plasmid pUMNK88_Ent

Total Repeats: 24

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017640	TGACAC	2	12	28	39	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386612082
2	NC_017640	TGGATA	2	12	226	237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386612082
3	NC_017640	ATCAGT	2	12	7610	7621	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386612088
4	NC_017640	TCCGCC	2	12	11196	11207	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	386612091
5	NC_017640	CATCAG	2	12	12763	12774	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386612092
6	NC_017640	AGTGGA	2	12	13069	13080	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	386612093
7	NC_017640	TTCAGC	2	12	13764	13775	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386612094
8	NC_017640	AGTTCA	2	12	16745	16756	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386612099
9	NC_017640	GCCCCA	2	12	27839	27850	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	386612109
10	NC_017640	CCACAT	2	12	28145	28156	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	386612109
11	NC_017640	GTAACT	2	12	36688	36699	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386612113
12	NC_017640	CCTGCC	2	12	38685	38696	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	386612114
13	NC_017640	AACAGA	2	12	39324	39335	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	386612116
14	NC_017640	GTTGAC	2	12	39582	39593	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386612116
15	NC_017640	CAACCA	2	12	44885	44896	50 %	0 %	0 %	50 %	386612123
16	NC_017640	ATCACT	2	12	45090	45101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386612123
17	NC_017640	TTTCCA	2	12	49320	49331	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	386612126
18	NC_017640	TTCATT	2	12	56553	56564	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	386612136
19	NC_017640	CTGCCA	2	12	60871	60882	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386612140
20	NC_017640	TCCGGC	2	12	62940	62951	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386612141
21	NC_017640	CGCCAC	2	12	63191	63202	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	386612141
22	NC_017640	CCAGCG	2	12	63310	63321	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386612141
23	NC_017640	GGCTGA	2	12	64414	64425	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386612142
24	NC_017640	CCATCA	2	12	69187	69198	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	386612147

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.