MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli UM146 plasmid pUM146

Total Repeats: 175

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017630	CA	3	6	891	896	50 %	0 %	0 %	50 %	386602512
2	NC_017630	AT	3	6	932	937	50 %	50 %	0 %	0 %	386602512
3	NC_017630	CA	3	6	1684	1689	50 %	0 %	0 %	50 %	386602513
4	NC_017630	GT	3	6	1813	1818	0 %	50 %	50 %	0 %	386602513
5	NC_017630	CT	3	6	2406	2411	0 %	50 %	0 %	50 %	386602514
6	NC_017630	CT	3	6	2608	2613	0 %	50 %	0 %	50 %	386602514
7	NC_017630	TC	3	6	2626	2631	0 %	50 %	0 %	50 %	386602514
8	NC_017630	AG	3	6	3026	3031	50 %	0 %	50 %	0 %	386602514
9	NC_017630	CT	3	6	4389	4394	0 %	50 %	0 %	50 %	386602516
10	NC_017630	AC	3	6	5254	5259	50 %	0 %	0 %	50 %	386602516
11	NC_017630	GA	3	6	5301	5306	50 %	0 %	50 %	0 %	386602516
12	NC_017630	TG	3	6	6125	6130	0 %	50 %	50 %	0 %	386602516
13	NC_017630	CT	3	6	6246	6251	0 %	50 %	0 %	50 %	386602516
14	NC_017630	TG	3	6	6742	6747	0 %	50 %	50 %	0 %	386602516
15	NC_017630	CT	3	6	7328	7333	0 %	50 %	0 %	50 %	386602516
16	NC_017630	AT	3	6	8511	8516	50 %	50 %	0 %	0 %	386602516
17	NC_017630	GT	3	6	8638	8643	0 %	50 %	50 %	0 %	386602516
18	NC_017630	AG	4	8	9576	9583	50 %	0 %	50 %	0 %	386602517
19	NC_017630	CA	3	6	9989	9994	50 %	0 %	0 %	50 %	386602517
20	NC_017630	GT	3	6	10327	10332	0 %	50 %	50 %	0 %	386602517
21	NC_017630	AT	3	6	10943	10948	50 %	50 %	0 %	0 %	386602517
22	NC_017630	CA	4	8	11691	11698	50 %	0 %	0 %	50 %	386602518
23	NC_017630	GA	3	6	11802	11807	50 %	0 %	50 %	0 %	386602518
24	NC_017630	GA	3	6	13248	13253	50 %	0 %	50 %	0 %	386602520
25	NC_017630	TA	3	6	13276	13281	50 %	50 %	0 %	0 %	386602520
26	NC_017630	GA	3	6	13338	13343	50 %	0 %	50 %	0 %	386602520
27	NC_017630	TG	3	6	14831	14836	0 %	50 %	50 %	0 %	386602521
28	NC_017630	AC	3	6	15015	15020	50 %	0 %	0 %	50 %	386602521
29	NC_017630	TG	3	6	15647	15652	0 %	50 %	50 %	0 %	386602521
30	NC_017630	CA	3	6	15829	15834	50 %	0 %	0 %	50 %	386602521
31	NC_017630	AC	3	6	16631	16636	50 %	0 %	0 %	50 %	386602522
32	NC_017630	TG	3	6	17563	17568	0 %	50 %	50 %	0 %	386602522
33	NC_017630	AT	4	8	17986	17993	50 %	50 %	0 %	0 %	386602523
34	NC_017630	AT	3	6	18127	18132	50 %	50 %	0 %	0 %	386602523
35	NC_017630	GT	3	6	18433	18438	0 %	50 %	50 %	0 %	386602524
36	NC_017630	GA	3	6	18866	18871	50 %	0 %	50 %	0 %	386602524
37	NC_017630	TG	3	6	19198	19203	0 %	50 %	50 %	0 %	386602525
38	NC_017630	AT	3	6	19879	19884	50 %	50 %	0 %	0 %	386602527
39	NC_017630	TG	3	6	21718	21723	0 %	50 %	50 %	0 %	386602530
40	NC_017630	TC	3	6	23249	23254	0 %	50 %	0 %	50 %	386602531
41	NC_017630	GT	3	6	23306	23311	0 %	50 %	50 %	0 %	386602531
42	NC_017630	AT	3	6	23515	23520	50 %	50 %	0 %	0 %	386602532
43	NC_017630	AT	3	6	23676	23681	50 %	50 %	0 %	0 %	386602532
44	NC_017630	TG	3	6	26142	26147	0 %	50 %	50 %	0 %	386602537
45	NC_017630	CA	3	6	26767	26772	50 %	0 %	0 %	50 %	386602537
46	NC_017630	CT	3	6	27030	27035	0 %	50 %	0 %	50 %	386602537
47	NC_017630	GC	3	6	27036	27041	0 %	0 %	50 %	50 %	386602537
48	NC_017630	AC	3	6	27621	27626	50 %	0 %	0 %	50 %	386602537
49	NC_017630	TG	3	6	27741	27746	0 %	50 %	50 %	0 %	386602537
50	NC_017630	CG	3	6	28057	28062	0 %	0 %	50 %	50 %	386602537
51	NC_017630	AT	3	6	28390	28395	50 %	50 %	0 %	0 %	386602537
52	NC_017630	AT	3	6	28662	28667	50 %	50 %	0 %	0 %	386602538
53	NC_017630	AT	3	6	29320	29325	50 %	50 %	0 %	0 %	386602540
54	NC_017630	AT	3	6	29416	29421	50 %	50 %	0 %	0 %	386602540
55	NC_017630	CG	3	6	31175	31180	0 %	0 %	50 %	50 %	386602545
56	NC_017630	GC	3	6	31870	31875	0 %	0 %	50 %	50 %	386602546
57	NC_017630	GC	3	6	32932	32937	0 %	0 %	50 %	50 %	386602546
58	NC_017630	AT	3	6	33868	33873	50 %	50 %	0 %	0 %	386602548
59	NC_017630	AG	3	6	34076	34081	50 %	0 %	50 %	0 %	386602548
60	NC_017630	AG	3	6	34549	34554	50 %	0 %	50 %	0 %	386602549
61	NC_017630	CT	3	6	35386	35391	0 %	50 %	0 %	50 %	386602552
62	NC_017630	TA	3	6	35710	35715	50 %	50 %	0 %	0 %	386602552
63	NC_017630	CT	3	6	35717	35722	0 %	50 %	0 %	50 %	386602552
64	NC_017630	CA	3	6	35904	35909	50 %	0 %	0 %	50 %	386602552
65	NC_017630	CA	4	8	37473	37480	50 %	0 %	0 %	50 %	386602554
66	NC_017630	TA	4	8	37541	37548	50 %	50 %	0 %	0 %	386602554
67	NC_017630	AG	3	6	39984	39989	50 %	0 %	50 %	0 %	386602557
68	NC_017630	CA	3	6	40119	40124	50 %	0 %	0 %	50 %	386602557
69	NC_017630	GT	3	6	41322	41327	0 %	50 %	50 %	0 %	386602560
70	NC_017630	CA	3	6	41537	41542	50 %	0 %	0 %	50 %	386602560
71	NC_017630	CG	3	6	42814	42819	0 %	0 %	50 %	50 %	386602561
72	NC_017630	CT	3	6	43490	43495	0 %	50 %	0 %	50 %	386602561
73	NC_017630	TC	3	6	43734	43739	0 %	50 %	0 %	50 %	386602562
74	NC_017630	GC	3	6	44084	44089	0 %	0 %	50 %	50 %	386602563
75	NC_017630	CG	3	6	45097	45102	0 %	0 %	50 %	50 %	386602564
76	NC_017630	CG	3	6	45111	45116	0 %	0 %	50 %	50 %	386602564
77	NC_017630	CG	3	6	45206	45211	0 %	0 %	50 %	50 %	386602564
78	NC_017630	CA	3	6	45481	45486	50 %	0 %	0 %	50 %	386602565
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81	NC_017630	CG	3	6	47053	47058	0 %	0 %	50 %	50 %	386602566
82	NC_017630	GC	3	6	48734	48739	0 %	0 %	50 %	50 %	386602569
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84	NC_017630	GA	3	6	49392	49397	50 %	0 %	50 %	0 %	386602570
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88	NC_017630	CA	3	6	51264	51269	50 %	0 %	0 %	50 %	386602573
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91	NC_017630	TG	3	6	53167	53172	0 %	50 %	50 %	0 %	386602577
92	NC_017630	TG	3	6	53612	53617	0 %	50 %	50 %	0 %	386602577
93	NC_017630	AG	3	6	54330	54335	50 %	0 %	50 %	0 %	386602578
94	NC_017630	GA	3	6	54505	54510	50 %	0 %	50 %	0 %	386602578
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104	NC_017630	CG	3	6	58538	58543	0 %	0 %	50 %	50 %	386602584
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109	NC_017630	GC	3	6	62033	62038	0 %	0 %	50 %	50 %	386602588
110	NC_017630	TC	3	6	62078	62083	0 %	50 %	0 %	50 %	386602588
111	NC_017630	CT	4	8	63429	63436	0 %	50 %	0 %	50 %	386602590
112	NC_017630	TA	3	6	63724	63729	50 %	50 %	0 %	0 %	386602591
113	NC_017630	GC	3	6	63750	63755	0 %	0 %	50 %	50 %	386602591
114	NC_017630	TC	3	6	66074	66079	0 %	50 %	0 %	50 %	386602593
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120	NC_017630	GC	3	6	74629	74634	0 %	0 %	50 %	50 %	386602598
121	NC_017630	CG	3	6	75498	75503	0 %	0 %	50 %	50 %	386602598
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123	NC_017630	AT	3	6	76249	76254	50 %	50 %	0 %	0 %	386602599
124	NC_017630	TG	3	6	76704	76709	0 %	50 %	50 %	0 %	386602599
125	NC_017630	GA	3	6	78639	78644	50 %	0 %	50 %	0 %	386602602
126	NC_017630	CG	3	6	78753	78758	0 %	0 %	50 %	50 %	386602602
127	NC_017630	GA	4	8	78980	78987	50 %	0 %	50 %	0 %	386602602
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140	NC_017630	GT	3	6	88642	88647	0 %	50 %	50 %	0 %	386602614
141	NC_017630	AG	3	6	89017	89022	50 %	0 %	50 %	0 %	386602614
142	NC_017630	CG	3	6	89097	89102	0 %	0 %	50 %	50 %	386602614
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.