MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli UM146 plasmid pUM146

Total Repeats: 37

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017630	ACCGCC	2	12	3242	3253	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	386602515
2	NC_017630	TCCCCA	2	12	3554	3565	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	386602515
3	NC_017630	GCCCCA	2	12	6054	6065	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	386602516
4	NC_017630	CCACAT	2	12	6359	6370	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	386602516
5	NC_017630	ACGGTT	2	12	9997	10008	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386602517
6	NC_017630	TAAACT	2	12	13296	13307	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	386602520
7	NC_017630	GTAACT	2	12	15544	15555	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386602521
8	NC_017630	CCTGCC	2	12	17540	17551	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	386602522
9	NC_017630	TCATAA	2	12	18008	18019	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	386602523
10	NC_017630	TTCTTT	2	12	18057	18068	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	386602523
11	NC_017630	AACAGA	2	12	18178	18189	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	386602523
12	NC_017630	TTTCCA	2	12	27793	27804	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	386602537
13	NC_017630	TCAGAG	2	12	39542	39553	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386602556
14	NC_017630	TCAGAG	2	12	39560	39571	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386602556
15	NC_017630	TCCGGC	2	12	42460	42471	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386602561
16	NC_017630	CGCCAC	2	12	42711	42722	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	386602561
17	NC_017630	CCAGCG	2	12	42830	42841	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386602561
18	NC_017630	CTCATC	2	12	43724	43735	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	386602562
19	NC_017630	CAGTAG	5	30	44945	44974	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386602564
20	NC_017630	TGCTGA	2	12	46267	46278	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386602566
21	NC_017630	TCCGGT	2	12	50397	50408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386602572
22	NC_017630	GCGACA	2	12	55596	55607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386602579
23	NC_017630	TAAGTT	2	12	56687	56698	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386602581
24	NC_017630	GCTGTC	2	12	63645	63656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386602591
25	NC_017630	AAAATC	2	12	63825	63836	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	386602591
26	NC_017630	TGGATA	2	12	68043	68054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386602594
27	NC_017630	CTTGTT	2	12	74288	74299	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	386602598
28	NC_017630	TTCTTA	2	12	75523	75534	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	386602598
29	NC_017630	GCTCCT	2	12	78960	78971	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	386602602
30	NC_017630	AGGTGC	2	12	79808	79819	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386602603
31	NC_017630	ATTTTG	2	12	81057	81068	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	386602606
32	NC_017630	TGGCGG	2	12	86385	86396	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	386602611
33	NC_017630	TCTTTT	2	12	91921	91932	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	386602616
34	NC_017630	CAATAA	2	12	96030	96041	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	386602621
35	NC_017630	ACCAGA	2	12	101654	101665	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	386602631
36	NC_017630	ACGCAG	2	12	102875	102886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386602632
37	NC_017630	GCGCCA	2	12	104866	104877	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386602634

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.