MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Erwinia sp. Ejp617 chromosome

Total Repeats: 72126

< Previous12...133134135136137138139140141142143144145Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
72001	NC_017445	AGC	2	6	3902685	3902690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385789054
72002	NC_017445	CTG	2	6	3902705	3902710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385789054
72003	NC_017445	CTG	2	6	3902720	3902725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385789054
72004	NC_017445	ATTG	2	8	3902752	3902759	25 %	50 %	25 %	0 %	385789054
72005	NC_017445	GGT	2	6	3902792	3902797	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385789054
72006	NC_017445	GC	3	6	3902807	3902812	0 %	0 %	50 %	50 %	385789054
72007	NC_017445	ACC	2	6	3902859	3902864	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385789054
72008	NC_017445	CAG	2	6	3902897	3902902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385789054
72009	NC_017445	TCA	2	6	3902941	3902946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385789054
72010	NC_017445	ACGG	2	8	3903009	3903016	25 %	0 %	50 %	25 %	385789054
72011	NC_017445	GC	3	6	3903063	3903068	0 %	0 %	50 %	50 %	385789054
72012	NC_017445	CTGC	2	8	3903085	3903092	0 %	25 %	25 %	50 %	385789054
72013	NC_017445	AGC	2	6	3903153	3903158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385789054
72014	NC_017445	CAC	2	6	3903176	3903181	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385789054
72015	NC_017445	CAA	2	6	3903265	3903270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385789055
72016	NC_017445	AAC	2	6	3903274	3903279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385789055
72017	NC_017445	GCG	2	6	3903292	3903297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385789055
72018	NC_017445	GATGCA	2	12	3903391	3903402	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385789055
72019	NC_017445	AGG	2	6	3903417	3903422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385789055
72020	NC_017445	CTG	2	6	3903443	3903448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385789055
72021	NC_017445	GCG	2	6	3903480	3903485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385789055
72022	NC_017445	GCCC	2	8	3903514	3903521	0 %	0 %	25 %	75 %	385789055
72023	NC_017445	TCA	2	6	3903559	3903564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385789055
72024	NC_017445	ATT	2	6	3903575	3903580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385789055
72025	NC_017445	ATA	2	6	3903639	3903644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385789055
72026	NC_017445	T	6	6	3903645	3903650	0 %	100 %	0 %	0 %	385789055
72027	NC_017445	GGC	2	6	3903661	3903666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385789055
72028	NC_017445	CGGTAC	2	12	3903688	3903699	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	385789055
72029	NC_017445	GAT	2	6	3903746	3903751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385789055
72030	NC_017445	TCCT	2	8	3903770	3903777	0 %	50 %	0 %	50 %	385789055
72031	NC_017445	TAA	2	6	3903792	3903797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385789055
72032	NC_017445	T	6	6	3904034	3904039	0 %	100 %	0 %	0 %	385789055
72033	NC_017445	CATC	2	8	3904069	3904076	25 %	25 %	0 %	50 %	385789055
72034	NC_017445	CAG	2	6	3904341	3904346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385789056
72035	NC_017445	TAT	2	6	3904404	3904409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385789056
72036	NC_017445	GCT	2	6	3904410	3904415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385789056
72037	NC_017445	GAGCTG	2	12	3904474	3904485	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385789056
72038	NC_017445	TGA	2	6	3904493	3904498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385789056
72039	NC_017445	GCCT	2	8	3904514	3904521	0 %	25 %	25 %	50 %	385789056
72040	NC_017445	CGC	2	6	3904568	3904573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385789056
72041	NC_017445	CACG	2	8	3904637	3904644	25 %	0 %	25 %	50 %	385789056
72042	NC_017445	GCC	2	6	3904665	3904670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385789056
72043	NC_017445	CA	3	6	3904694	3904699	50 %	0 %	0 %	50 %	385789056
72044	NC_017445	CAC	2	6	3904792	3904797	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385789056
72045	NC_017445	AAAT	2	8	3904944	3904951	75 %	25 %	0 %	0 %	385789057
72046	NC_017445	TCG	2	6	3905121	3905126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385789057
72047	NC_017445	GTT	2	6	3905134	3905139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385789057
72048	NC_017445	A	6	6	3905202	3905207	100 %	0 %	0 %	0 %	385789057
72049	NC_017445	CTT	2	6	3905248	3905253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385789057
72050	NC_017445	CAC	2	6	3905309	3905314	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385789057
72051	NC_017445	TTG	2	6	3905470	3905475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385789058
72052	NC_017445	ACGG	2	8	3905482	3905489	25 %	0 %	50 %	25 %	385789058
72053	NC_017445	CGA	3	9	3905507	3905515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385789058
72054	NC_017445	T	6	6	3905533	3905538	0 %	100 %	0 %	0 %	385789058
72055	NC_017445	TCC	2	6	3905584	3905589	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385789058
72056	NC_017445	GAC	2	6	3905599	3905604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385789058
72057	NC_017445	GCT	2	6	3905657	3905662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385789058
72058	NC_017445	CCA	2	6	3905687	3905692	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385789058
72059	NC_017445	CCG	2	6	3905743	3905748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385789058
72060	NC_017445	GCA	2	6	3905824	3905829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385789058
72061	NC_017445	CGT	2	6	3905840	3905845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385789058
72062	NC_017445	CGAT	2	8	3905860	3905867	25 %	25 %	25 %	25 %	385789058
72063	NC_017445	A	6	6	3905905	3905910	100 %	0 %	0 %	0 %	385789058
72064	NC_017445	CGG	2	6	3905935	3905940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385789058
72065	NC_017445	AGC	2	6	3905944	3905949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385789058
72066	NC_017445	GGTC	2	8	3905960	3905967	0 %	25 %	50 %	25 %	385789058
72067	NC_017445	GTA	2	6	3906051	3906056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385789058
72068	NC_017445	ATCC	2	8	3906099	3906106	25 %	25 %	0 %	50 %	385789058
72069	NC_017445	GGCT	2	8	3906107	3906114	0 %	25 %	50 %	25 %	385789058
72070	NC_017445	CGT	2	6	3906148	3906153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385789058
72071	NC_017445	GAG	2	6	3906168	3906173	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385789058
72072	NC_017445	CAG	2	6	3906219	3906224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385789058
72073	NC_017445	CGGT	2	8	3906251	3906258	0 %	25 %	50 %	25 %	385789058
72074	NC_017445	TG	3	6	3906376	3906381	0 %	50 %	50 %	0 %	385789058
72075	NC_017445	CAG	2	6	3906405	3906410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385789058
72076	NC_017445	CAG	2	6	3906429	3906434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385789058
72077	NC_017445	CGA	2	6	3906449	3906454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385789058
72078	NC_017445	AGG	2	6	3906493	3906498	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385789058
72079	NC_017445	C	6	6	3906535	3906540	0 %	0 %	0 %	100 %	385789058
72080	NC_017445	CAG	2	6	3906594	3906599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385789058
72081	NC_017445	GC	3	6	3906718	3906723	0 %	0 %	50 %	50 %	385789058
72082	NC_017445	GCA	2	6	3906800	3906805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385789058
72083	NC_017445	TCA	2	6	3906811	3906816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385789058
72084	NC_017445	CTG	2	6	3906835	3906840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385789058
72085	NC_017445	A	7	7	3906874	3906880	100 %	0 %	0 %	0 %	385789058
72086	NC_017445	CGT	2	6	3906885	3906890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385789058
72087	NC_017445	TGG	2	6	3906902	3906907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385789058
72088	NC_017445	GTT	2	6	3906933	3906938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385789058
72089	NC_017445	CAG	2	6	3907014	3907019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385789058
72090	NC_017445	AC	3	6	3907307	3907312	50 %	0 %	0 %	50 %	385789059
72091	NC_017445	CGC	2	6	3907324	3907329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385789059
72092	NC_017445	A	8	8	3907384	3907391	100 %	0 %	0 %	0 %	385789059
72093	NC_017445	CTG	2	6	3907393	3907398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385789059
72094	NC_017445	GCT	2	6	3907404	3907409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385789059
72095	NC_017445	CAT	2	6	3907431	3907436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385789059
72096	NC_017445	CAC	2	6	3907479	3907484	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385789059
72097	NC_017445	GC	3	6	3907548	3907553	0 %	0 %	50 %	50 %	385789059
72098	NC_017445	GC	3	6	3907556	3907561	0 %	0 %	50 %	50 %	385789059
72099	NC_017445	TCA	2	6	3907565	3907570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385789059
72100	NC_017445	TGG	2	6	3907616	3907621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385789059
72101	NC_017445	CCATT	2	10	3907645	3907654	20 %	40 %	0 %	40 %	385789059
72102	NC_017445	ATG	2	6	3907670	3907675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385789059
72103	NC_017445	CGG	2	6	3907698	3907703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385789059
72104	NC_017445	GCGA	2	8	3907809	3907816	25 %	0 %	50 %	25 %	385789059
72105	NC_017445	GGC	2	6	3907905	3907910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385789059
72106	NC_017445	CAG	2	6	3907960	3907965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385789059
72107	NC_017445	TGC	2	6	3908000	3908005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385789059
72108	NC_017445	ACCC	2	8	3908101	3908108	25 %	0 %	0 %	75 %	385789059
72109	NC_017445	GCC	2	6	3908120	3908125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385789059
72110	NC_017445	GGT	3	9	3908163	3908171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385789059
72111	NC_017445	TCA	2	6	3908176	3908181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385789059
72112	NC_017445	CAC	2	6	3908259	3908264	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385789059
72113	NC_017445	CGCAG	2	10	3908295	3908304	20 %	0 %	40 %	40 %	385789059
72114	NC_017445	CTG	3	9	3908320	3908328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385789059
72115	NC_017445	ATC	2	6	3908359	3908364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385789059
72116	NC_017445	CGATAT	2	12	3908418	3908429	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385789059
72117	NC_017445	GCA	2	6	3908445	3908450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385789059
72118	NC_017445	CTG	2	6	3908464	3908469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385789059
72119	NC_017445	CAG	2	6	3908484	3908489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385789059
72120	NC_017445	CAGC	2	8	3908542	3908549	25 %	0 %	25 %	50 %	385789059
72121	NC_017445	GAC	2	6	3908593	3908598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385789059
72122	NC_017445	CAG	2	6	3908635	3908640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385789059
72123	NC_017445	TGA	2	6	3908649	3908654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385789059
72124	NC_017445	CG	3	6	3908664	3908669	0 %	0 %	50 %	50 %	385789059
72125	NC_017445	GCG	2	6	3908734	3908739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385789059
72126	NC_017445	GCA	2	6	3908802	3908807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385789059

< Previous12...133134135136137138139140141142143144145Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.