MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Erwinia sp. Ejp617 plasmid pJE05

Total Repeats: 43

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017444	GCT	2	6	678	683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785418
2	NC_017444	T	6	6	694	699	0 %	100 %	0 %	0 %	385785418
3	NC_017444	AGC	2	6	746	751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785418
4	NC_017444	G	6	6	765	770	0 %	0 %	100 %	0 %	385785418
5	NC_017444	CA	3	6	777	782	50 %	0 %	0 %	50 %	385785418
6	NC_017444	GA	3	6	858	863	50 %	0 %	50 %	0 %	385785418
7	NC_017444	TGA	2	6	925	930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385785419
8	NC_017444	CGC	2	6	953	958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385785419
9	NC_017444	T	6	6	976	981	0 %	100 %	0 %	0 %	385785419
10	NC_017444	G	6	6	995	1000	0 %	0 %	100 %	0 %	385785419
11	NC_017444	CGC	2	6	1054	1059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385785419
12	NC_017444	ACCGCT	2	12	1074	1085	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	385785419
13	NC_017444	CGCC	2	8	1097	1104	0 %	0 %	25 %	75 %	385785419
14	NC_017444	GAG	2	6	1140	1145	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385785419
15	NC_017444	CGG	2	6	1409	1414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385785420
16	NC_017444	A	6	6	1506	1511	100 %	0 %	0 %	0 %	385785421
17	NC_017444	CGA	2	6	1517	1522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785421
18	NC_017444	GCT	3	9	1530	1538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785421
19	NC_017444	GCGT	2	8	1541	1548	0 %	25 %	50 %	25 %	385785421
20	NC_017444	AAG	2	6	1554	1559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385785421
21	NC_017444	AGGC	2	8	1620	1627	25 %	0 %	50 %	25 %	385785421
22	NC_017444	TGA	2	6	1649	1654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385785421
23	NC_017444	GCA	2	6	1661	1666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785421
24	NC_017444	GCCGC	2	10	1697	1706	0 %	0 %	40 %	60 %	385785421
25	NC_017444	CAGA	2	8	1920	1927	50 %	0 %	25 %	25 %	385785422
26	NC_017444	AC	3	6	1932	1937	50 %	0 %	0 %	50 %	385785422
27	NC_017444	ATT	2	6	1972	1977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385785423
28	NC_017444	GTAG	2	8	1990	1997	25 %	25 %	50 %	0 %	385785423
29	NC_017444	AGG	2	6	2004	2009	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385785423
30	NC_017444	TTC	2	6	2075	2080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385785423
31	NC_017444	ATC	2	6	2103	2108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385785423
32	NC_017444	ATG	2	6	2123	2128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385785423
33	NC_017444	GAT	2	6	2181	2186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385785423
34	NC_017444	GAT	3	9	2244	2252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385785423
35	NC_017444	GC	3	6	2260	2265	0 %	0 %	50 %	50 %	385785423
36	NC_017444	CAA	2	6	2295	2300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385785423
37	NC_017444	GCG	2	6	2324	2329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385785423
38	NC_017444	CTG	2	6	2347	2352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785423
39	NC_017444	TCCG	2	8	2396	2403	0 %	25 %	25 %	50 %	385785423
40	NC_017444	AGA	2	6	2412	2417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385785423
41	NC_017444	CTG	2	6	2482	2487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785423
42	NC_017444	A	6	6	2502	2507	100 %	0 %	0 %	0 %	385785423
43	NC_017444	TGC	2	6	2534	2539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785423

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.