MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli KO11FL plasmid pEKO1101

Total Repeats: 1159

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016904	ATT	2	6	275	280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378715378
2	NC_016904	TGC	2	6	374	379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715378
3	NC_016904	TGC	2	6	533	538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715379
4	NC_016904	CGA	2	6	615	620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715379
5	NC_016904	GAA	2	6	759	764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378715379
6	NC_016904	ACC	2	6	864	869	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378715380
7	NC_016904	CAG	2	6	1029	1034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715380
8	NC_016904	GAA	2	6	1158	1163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378715380
9	NC_016904	CAA	2	6	1168	1173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378715380
10	NC_016904	CTG	2	6	1364	1369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715380
11	NC_016904	TCA	2	6	1450	1455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378715380
12	NC_016904	CAG	2	6	1488	1493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715380
13	NC_016904	TGA	2	6	1628	1633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378715380
14	NC_016904	GGT	2	6	1665	1670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378715380
15	NC_016904	AAG	2	6	1712	1717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378715380
16	NC_016904	CCG	2	6	1722	1727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715380
17	NC_016904	GTC	2	6	1728	1733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715380
18	NC_016904	CAG	2	6	1919	1924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715380
19	NC_016904	GCT	2	6	2152	2157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715380
20	NC_016904	AAT	2	6	2187	2192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378715380
21	NC_016904	GGT	2	6	2216	2221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378715380
22	NC_016904	TGC	2	6	2392	2397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715380
23	NC_016904	CCA	2	6	3097	3102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378715381
24	NC_016904	GAT	2	6	3108	3113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378715381
25	NC_016904	CTG	2	6	3177	3182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715381
26	NC_016904	CAC	2	6	3195	3200	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378715381
27	NC_016904	CTG	2	6	3222	3227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715381
28	NC_016904	TTG	2	6	3283	3288	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378715381
29	NC_016904	GTC	2	6	3410	3415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715381
30	NC_016904	CAG	2	6	3456	3461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715381
31	NC_016904	CTG	2	6	3480	3485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715381
32	NC_016904	CGT	2	6	3548	3553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715381
33	NC_016904	GAT	2	6	3680	3685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378715381
34	NC_016904	AGC	2	6	3694	3699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715381
35	NC_016904	CGC	2	6	3724	3729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715381
36	NC_016904	CCA	2	6	4165	4170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378715382
37	NC_016904	CAA	2	6	4190	4195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378715382
38	NC_016904	ACC	2	6	4278	4283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378715382
39	NC_016904	GCA	2	6	4284	4289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715382
40	NC_016904	AAG	2	6	4310	4315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378715382
41	NC_016904	CAC	2	6	5146	5151	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378715383
42	NC_016904	CAC	2	6	5291	5296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378715384
43	NC_016904	TCT	2	6	5346	5351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378715384
44	NC_016904	CAG	2	6	5534	5539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715384
45	NC_016904	TTC	2	6	5634	5639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378715384
46	NC_016904	CAC	2	6	5855	5860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378715384
47	NC_016904	CTC	2	6	5870	5875	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378715384
48	NC_016904	AGC	2	6	5892	5897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715384
49	NC_016904	CGG	2	6	6127	6132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378715384
50	NC_016904	CGT	2	6	6169	6174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715384
51	NC_016904	AAT	2	6	6816	6821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378715385
52	NC_016904	TGC	2	6	6827	6832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715385
53	NC_016904	TGC	2	6	6955	6960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715385
54	NC_016904	TGA	2	6	7191	7196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378715386
55	NC_016904	GAG	2	6	7204	7209	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378715386
56	NC_016904	GAA	2	6	7237	7242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378715386
57	NC_016904	CTG	2	6	7266	7271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715386
58	NC_016904	AGG	2	6	7370	7375	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378715386
59	NC_016904	GAA	2	6	7380	7385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378715386
60	NC_016904	AGC	2	6	7409	7414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715386
61	NC_016904	TAA	2	6	7563	7568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378715386
62	NC_016904	CCG	2	6	7577	7582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715386
63	NC_016904	TGC	2	6	7685	7690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715386
64	NC_016904	CAT	2	6	7725	7730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378715386
65	NC_016904	ATG	2	6	7778	7783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378715386
66	NC_016904	GCT	2	6	7849	7854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715386
67	NC_016904	ATC	2	6	7918	7923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378715386
68	NC_016904	TGA	2	6	7963	7968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378715386
69	NC_016904	CGG	2	6	8035	8040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378715387
70	NC_016904	CTG	2	6	8091	8096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715387
71	NC_016904	TGC	2	6	8149	8154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715387
72	NC_016904	AGC	2	6	8263	8268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715387
73	NC_016904	GCC	2	6	8280	8285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715387
74	NC_016904	CAG	2	6	8313	8318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715387
75	NC_016904	TGG	2	6	8374	8379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378715387
76	NC_016904	TAA	2	6	8408	8413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378715387
77	NC_016904	GCC	2	6	8493	8498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715387
78	NC_016904	GGT	2	6	8955	8960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378715388
79	NC_016904	TTG	2	6	8989	8994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378715388
80	NC_016904	AAG	2	6	9354	9359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378715388
81	NC_016904	TGA	2	6	9409	9414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378715388
82	NC_016904	AGG	2	6	9503	9508	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378715388
83	NC_016904	GAA	2	6	9531	9536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378715388
84	NC_016904	TGG	2	6	9702	9707	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378715389
85	NC_016904	CTT	3	9	9726	9734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378715389
86	NC_016904	GTC	2	6	9792	9797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715389
87	NC_016904	TGA	2	6	10392	10397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378715390
88	NC_016904	GGA	2	6	10428	10433	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378715390
89	NC_016904	GAT	2	6	10498	10503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378715390
90	NC_016904	TGT	2	6	10611	10616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378715390
91	NC_016904	CAG	2	6	10636	10641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715390
92	NC_016904	CAA	2	6	10707	10712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378715390
93	NC_016904	TTC	2	6	10811	10816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378715390
94	NC_016904	GAT	2	6	10861	10866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378715390
95	NC_016904	GGT	2	6	10891	10896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378715390
96	NC_016904	TTA	2	6	11156	11161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378715390
97	NC_016904	ATG	2	6	11171	11176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378715390
98	NC_016904	TCA	2	6	11177	11182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378715390
99	NC_016904	TGG	3	9	11217	11225	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378715390
100	NC_016904	GAA	2	6	11250	11255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378715390
101	NC_016904	TGA	2	6	11271	11276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378715390
102	NC_016904	GGT	2	6	11338	11343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378715390
103	NC_016904	TGA	2	6	11356	11361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378715390
104	NC_016904	GCT	2	6	11376	11381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715391
105	NC_016904	GCG	2	6	11495	11500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378715391
106	NC_016904	GAT	2	6	11567	11572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378715391
107	NC_016904	TAA	2	6	11575	11580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378715391
108	NC_016904	CTC	2	6	11682	11687	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378715391
109	NC_016904	AGA	2	6	11732	11737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378715391
110	NC_016904	TCA	2	6	11953	11958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378715392
111	NC_016904	AAT	2	6	11959	11964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378715392
112	NC_016904	GCG	2	6	12064	12069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378715392
113	NC_016904	AAT	2	6	12072	12077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378715392
114	NC_016904	GTC	2	6	12172	12177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715392
115	NC_016904	AAC	2	6	12237	12242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378715392
116	NC_016904	CTG	2	6	12303	12308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715392
117	NC_016904	GGT	2	6	12316	12321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378715392
118	NC_016904	CTT	2	6	12323	12328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378715392
119	NC_016904	TTG	2	6	12584	12589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378715392
120	NC_016904	TGA	2	6	12679	12684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378715392
121	NC_016904	TCA	2	6	12739	12744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378715392
122	NC_016904	TCT	2	6	12848	12853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378715392
123	NC_016904	CAG	2	6	13169	13174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715393
124	NC_016904	CAG	2	6	13253	13258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715393
125	NC_016904	CTG	2	6	13329	13334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715393
126	NC_016904	AAC	2	6	13416	13421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378715393
127	NC_016904	TGC	2	6	13480	13485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715393
128	NC_016904	GTC	2	6	13498	13503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715394
129	NC_016904	CAG	2	6	13519	13524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715394
130	NC_016904	GTT	2	6	13635	13640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378715394
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132	NC_016904	CTG	2	6	13860	13865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715395
133	NC_016904	CCT	2	6	13983	13988	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378715395
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142	NC_016904	GTG	2	6	14565	14570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378715396
143	NC_016904	CTG	2	6	14620	14625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715396
144	NC_016904	GGT	2	6	14671	14676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378715396
145	NC_016904	AGT	2	6	14761	14766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378715396
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252	NC_016904	CTT	2	6	22484	22489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378715407
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256	NC_016904	TGA	2	6	22701	22706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378715407
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374	NC_016904	AAT	2	6	31512	31517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378715421
375	NC_016904	TCA	2	6	31618	31623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378715421
376	NC_016904	AGC	2	6	31689	31694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715421
377	NC_016904	TCA	2	6	31711	31716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378715421
378	NC_016904	GCA	2	6	32120	32125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715422
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388	NC_016904	GCT	2	6	33569	33574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715423
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390	NC_016904	GTC	2	6	33667	33672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715423
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497	NC_016904	TCC	2	6	43084	43089	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378715432
498	NC_016904	TGC	2	6	43135	43140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715432
499	NC_016904	AAG	2	6	43171	43176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378715432
500	NC_016904	GCA	2	6	43235	43240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715432

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