MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Erysipelothrix rhusiopathiae str. Fujisawa chromosome

Total Repeats: 33485

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015601	ATG	2	6	47766	47771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336065286
1002	NC_015601	TAA	2	6	47860	47865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336065286
1003	NC_015601	TTG	2	6	47880	47885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336065286
1004	NC_015601	AGC	2	6	47950	47955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336065286
1005	NC_015601	TGG	2	6	47986	47991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336065286
1006	NC_015601	AGA	2	6	48016	48021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336065286
1007	NC_015601	TAAAA	2	10	48075	48084	80 %	20 %	0 %	0 %	336065286
1008	NC_015601	AGA	2	6	48131	48136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336065287
1009	NC_015601	TTG	2	6	48214	48219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336065287
1010	NC_015601	TTGG	2	8	48421	48428	0 %	50 %	50 %	0 %	336065287
1011	NC_015601	AGA	2	6	48446	48451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336065287
1012	NC_015601	CT	3	6	48522	48527	0 %	50 %	0 %	50 %	336065287
1013	NC_015601	GGT	2	6	48528	48533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336065287
1014	NC_015601	CAA	3	9	48534	48542	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336065287
1015	NC_015601	ACA	2	6	48569	48574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336065287
1016	NC_015601	AGA	2	6	48626	48631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336065287
1017	NC_015601	CTT	2	6	48645	48650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336065287
1018	NC_015601	TGC	2	6	48659	48664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336065287
1019	NC_015601	TTG	2	6	48682	48687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336065287
1020	NC_015601	TTG	2	6	48751	48756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336065287
1021	NC_015601	TACC	2	8	48803	48810	25 %	25 %	0 %	50 %	336065287
1022	NC_015601	AGG	2	6	48821	48826	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336065287
1023	NC_015601	TAT	2	6	49015	49020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336065288
1024	NC_015601	TCT	2	6	49072	49077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336065288
1025	NC_015601	TAT	2	6	49087	49092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336065288
1026	NC_015601	TTC	2	6	49176	49181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336065288
1027	NC_015601	A	6	6	49194	49199	100 %	0 %	0 %	0 %	336065288
1028	NC_015601	CAA	2	6	49211	49216	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336065288
1029	NC_015601	AGC	2	6	49246	49251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336065288
1030	NC_015601	TGT	2	6	49320	49325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336065288
1031	NC_015601	GAAA	2	8	49327	49334	75 %	0 %	25 %	0 %	336065288
1032	NC_015601	TAT	2	6	49404	49409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336065288
1033	NC_015601	TTG	2	6	49419	49424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336065288
1034	NC_015601	ATT	2	6	49430	49435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336065288
1035	NC_015601	TGG	2	6	49449	49454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336065288
1036	NC_015601	CTG	2	6	49488	49493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336065288
1037	NC_015601	TGC	2	6	49495	49500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336065288
1038	NC_015601	AC	3	6	49511	49516	50 %	0 %	0 %	50 %	336065288
1039	NC_015601	TGC	2	6	49540	49545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336065288
1040	NC_015601	TGG	2	6	49570	49575	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336065288
1041	NC_015601	TC	3	6	49589	49594	0 %	50 %	0 %	50 %	336065288
1042	NC_015601	ATAA	2	8	49595	49602	75 %	25 %	0 %	0 %	336065288
1043	NC_015601	AGC	2	6	49637	49642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336065288
1044	NC_015601	TTA	2	6	49647	49652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336065288
1045	NC_015601	TCT	2	6	49657	49662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336065288
1046	NC_015601	CAA	2	6	49687	49692	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336065288
1047	NC_015601	ACA	2	6	49702	49707	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336065288
1048	NC_015601	ATT	2	6	49742	49747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336065288
1049	NC_015601	TTA	2	6	49751	49756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336065288
1050	NC_015601	GTT	2	6	49765	49770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336065288
1051	NC_015601	AAG	2	6	49806	49811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336065288
1052	NC_015601	CAT	2	6	49816	49821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336065288
1053	NC_015601	ATC	3	9	49824	49832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336065288
1054	NC_015601	ATG	2	6	49996	50001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336065289
1055	NC_015601	A	7	7	50056	50062	100 %	0 %	0 %	0 %	336065289
1056	NC_015601	GAT	2	6	50067	50072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336065289
1057	NC_015601	CA	3	6	50127	50132	50 %	0 %	0 %	50 %	336065289
1058	NC_015601	CTT	2	6	50221	50226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336065289
1059	NC_015601	GGTTC	2	10	50302	50311	0 %	40 %	40 %	20 %	336065289
1060	NC_015601	GTA	2	6	50443	50448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336065289
1061	NC_015601	AACTTA	2	12	50462	50473	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	336065289
1062	NC_015601	CCA	2	6	50617	50622	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336065289
1063	NC_015601	AATT	2	8	50657	50664	50 %	50 %	0 %	0 %	336065289
1064	NC_015601	TGA	2	6	50756	50761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336065289
1065	NC_015601	TCT	2	6	50789	50794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336065289
1066	NC_015601	CAC	2	6	50795	50800	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336065289
1067	NC_015601	CAA	2	6	50836	50841	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336065289
1068	NC_015601	A	6	6	50840	50845	100 %	0 %	0 %	0 %	336065289
1069	NC_015601	GAA	2	6	50890	50895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336065289
1070	NC_015601	AGA	2	6	50910	50915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336065289
1071	NC_015601	CAAA	2	8	50956	50963	75 %	0 %	0 %	25 %	336065289
1072	NC_015601	A	6	6	50969	50974	100 %	0 %	0 %	0 %	336065289
1073	NC_015601	AAGT	2	8	51050	51057	50 %	25 %	25 %	0 %	336065289
1074	NC_015601	ATCA	2	8	51058	51065	50 %	25 %	0 %	25 %	336065289
1075	NC_015601	GA	3	6	51254	51259	50 %	0 %	50 %	0 %	336065290
1076	NC_015601	A	7	7	51295	51301	100 %	0 %	0 %	0 %	336065290
1077	NC_015601	ATTA	2	8	51351	51358	50 %	50 %	0 %	0 %	336065290
1078	NC_015601	ATT	2	6	51364	51369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336065290
1079	NC_015601	CGACCA	2	12	51385	51396	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	336065290
1080	NC_015601	ATC	2	6	51421	51426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336065290
1081	NC_015601	TCT	2	6	51442	51447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336065290
1082	NC_015601	CAGC	2	8	51464	51471	25 %	0 %	25 %	50 %	336065290
1083	NC_015601	GAT	2	6	51486	51491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336065290
1084	NC_015601	AAT	2	6	51502	51507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336065290
1085	NC_015601	TA	3	6	51526	51531	50 %	50 %	0 %	0 %	336065290
1086	NC_015601	TTGG	2	8	51595	51602	0 %	50 %	50 %	0 %	336065290
1087	NC_015601	A	7	7	51696	51702	100 %	0 %	0 %	0 %	336065290
1088	NC_015601	T	8	8	51727	51734	0 %	100 %	0 %	0 %	336065291
1089	NC_015601	GAA	2	6	51737	51742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336065291
1090	NC_015601	GCAA	2	8	51811	51818	50 %	0 %	25 %	25 %	336065291
1091	NC_015601	TCATG	2	10	51884	51893	20 %	40 %	20 %	20 %	336065291
1092	NC_015601	TCCA	2	8	51908	51915	25 %	25 %	0 %	50 %	336065291
1093	NC_015601	ACC	2	6	52056	52061	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336065291
1094	NC_015601	T	6	6	52118	52123	0 %	100 %	0 %	0 %	336065291
1095	NC_015601	AC	3	6	52132	52137	50 %	0 %	0 %	50 %	336065291
1096	NC_015601	TAAT	2	8	52258	52265	50 %	50 %	0 %	0 %	336065291
1097	NC_015601	ATT	2	6	52279	52284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336065291
1098	NC_015601	TAT	2	6	52325	52330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336065291
1099	NC_015601	TTG	2	6	52335	52340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336065291
1100	NC_015601	GTT	2	6	52421	52426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336065291
1101	NC_015601	AT	3	6	52438	52443	50 %	50 %	0 %	0 %	336065291
1102	NC_015601	AAAG	2	8	52462	52469	75 %	0 %	25 %	0 %	336065291
1103	NC_015601	GGA	2	6	52490	52495	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336065291
1104	NC_015601	GTT	2	6	52501	52506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336065291
1105	NC_015601	AAT	2	6	52510	52515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336065291
1106	NC_015601	TCC	2	6	52563	52568	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336065291
1107	NC_015601	TGT	2	6	52572	52577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336065291
1108	NC_015601	TG	3	6	52661	52666	0 %	50 %	50 %	0 %	336065291
1109	NC_015601	ATC	2	6	52739	52744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336065292
1110	NC_015601	TTCC	2	8	52747	52754	0 %	50 %	0 %	50 %	336065292
1111	NC_015601	GCT	2	6	52806	52811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336065292
1112	NC_015601	AT	3	6	52836	52841	50 %	50 %	0 %	0 %	336065292
1113	NC_015601	AGC	2	6	52884	52889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336065292
1114	NC_015601	ATG	2	6	52907	52912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336065292
1115	NC_015601	ACA	2	6	52932	52937	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336065292
1116	NC_015601	TCCAT	2	10	52953	52962	20 %	40 %	0 %	40 %	336065292
1117	NC_015601	ACA	2	6	52968	52973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336065292
1118	NC_015601	CGT	2	6	52992	52997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336065292
1119	NC_015601	TGA	2	6	53000	53005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336065292
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1121	NC_015601	TCA	2	6	53184	53189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336065292
1122	NC_015601	CAA	2	6	53218	53223	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336065292
1123	NC_015601	CAT	2	6	53293	53298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336065292
1124	NC_015601	A	6	6	53520	53525	100 %	0 %	0 %	0 %	336065293
1125	NC_015601	TTA	3	9	53535	53543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336065293
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