MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Erysipelothrix rhusiopathiae str. Fujisawa chromosome

Total Repeats: 33485

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_015601	GAT	2	6	326767	326772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336065537
6002	NC_015601	TTGGA	2	10	326834	326843	20 %	40 %	40 %	0 %	336065537
6003	NC_015601	T	6	6	326891	326896	0 %	100 %	0 %	0 %	336065537
6004	NC_015601	GGT	2	6	326966	326971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336065537
6005	NC_015601	ATT	2	6	327170	327175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336065537
6006	NC_015601	GAT	2	6	327191	327196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336065537
6007	NC_015601	ATG	2	6	327207	327212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336065537
6008	NC_015601	GAT	2	6	327220	327225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336065537
6009	NC_015601	ATGGC	2	10	327300	327309	20 %	20 %	40 %	20 %	336065537
6010	NC_015601	CAA	2	6	327314	327319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336065537
6011	NC_015601	AAT	2	6	327398	327403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336065537
6012	NC_015601	GAA	2	6	327413	327418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336065537
6013	NC_015601	GAA	2	6	327425	327430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336065537
6014	NC_015601	GAA	2	6	327433	327438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336065537
6015	NC_015601	AGA	2	6	327454	327459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336065537
6016	NC_015601	AGC	2	6	327493	327498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336065537
6017	NC_015601	CTTGAT	2	12	327527	327538	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	336065537
6018	NC_015601	TTAA	2	8	327539	327546	50 %	50 %	0 %	0 %	336065537
6019	NC_015601	AATT	2	8	327654	327661	50 %	50 %	0 %	0 %	336065537
6020	NC_015601	GTG	2	6	327823	327828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336065538
6021	NC_015601	GAC	2	6	327836	327841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336065538
6022	NC_015601	ACT	2	6	327863	327868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336065538
6023	NC_015601	GAC	2	6	327917	327922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336065538
6024	NC_015601	TTG	2	6	327957	327962	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336065538
6025	NC_015601	AG	3	6	328025	328030	50 %	0 %	50 %	0 %	336065538
6026	NC_015601	GAT	2	6	328155	328160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336065538
6027	NC_015601	TTG	2	6	328167	328172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336065538
6028	NC_015601	CAT	2	6	328424	328429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336065538
6029	NC_015601	CGT	2	6	328572	328577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336065539
6030	NC_015601	A	7	7	328599	328605	100 %	0 %	0 %	0 %	336065539
6031	NC_015601	ATC	2	6	328620	328625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336065539
6032	NC_015601	ATTGGG	2	12	328720	328731	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	336065539
6033	NC_015601	GAA	2	6	328738	328743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336065539
6034	NC_015601	TGCG	2	8	328748	328755	0 %	25 %	50 %	25 %	336065539
6035	NC_015601	ATG	2	6	328766	328771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336065539
6036	NC_015601	TCGA	2	8	328850	328857	25 %	25 %	25 %	25 %	336065539
6037	NC_015601	GC	3	6	328887	328892	0 %	0 %	50 %	50 %	336065539
6038	NC_015601	AAC	2	6	328893	328898	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336065539
6039	NC_015601	GGT	3	9	328987	328995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336065539
6040	NC_015601	ACTTGA	2	12	329025	329036	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	336065539
6041	NC_015601	CGT	2	6	329038	329043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336065539
6042	NC_015601	TTC	2	6	329060	329065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336065539
6043	NC_015601	ATT	2	6	329143	329148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336065539
6044	NC_015601	TAA	2	6	329295	329300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336065539
6045	NC_015601	TCAT	2	8	329411	329418	25 %	50 %	0 %	25 %	336065539
6046	NC_015601	TAA	2	6	329520	329525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336065539
6047	NC_015601	TCT	2	6	329555	329560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336065539
6048	NC_015601	GTAT	2	8	329582	329589	25 %	50 %	25 %	0 %	336065539
6049	NC_015601	AGA	2	6	329607	329612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336065539
6050	NC_015601	AAGT	2	8	329666	329673	50 %	25 %	25 %	0 %	336065539
6051	NC_015601	A	6	6	329806	329811	100 %	0 %	0 %	0 %	336065539
6052	NC_015601	TCA	2	6	331727	331732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336065540
6053	NC_015601	CTT	2	6	331806	331811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336065540
6054	NC_015601	CAT	2	6	331902	331907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336065540
6055	NC_015601	TG	3	6	331928	331933	0 %	50 %	50 %	0 %	336065540
6056	NC_015601	AG	3	6	331935	331940	50 %	0 %	50 %	0 %	336065540
6057	NC_015601	ATT	2	6	332023	332028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336065540
6058	NC_015601	TCA	2	6	332057	332062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336065540
6059	NC_015601	TGT	2	6	332074	332079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336065540
6060	NC_015601	AAT	2	6	332202	332207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336065540
6061	NC_015601	GCA	2	6	332249	332254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336065540
6062	NC_015601	ATT	2	6	332324	332329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336065540
6063	NC_015601	GTG	2	6	332376	332381	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336065540
6064	NC_015601	GAC	2	6	332416	332421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336065540
6065	NC_015601	ATG	2	6	332479	332484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336065540
6066	NC_015601	TCT	2	6	332606	332611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336065540
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6068	NC_015601	TCA	2	6	332819	332824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336065540
6069	NC_015601	TGT	2	6	332959	332964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336065540
6070	NC_015601	TAT	2	6	332973	332978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336065540
6071	NC_015601	ACGTTA	2	12	332979	332990	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	336065540
6072	NC_015601	GATTT	2	10	333020	333029	20 %	60 %	20 %	0 %	336065540
6073	NC_015601	AGACTT	2	12	333053	333064	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	336065540
6074	NC_015601	CAT	2	6	333109	333114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336065540
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6085	NC_015601	ACA	2	6	333941	333946	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336065540
6086	NC_015601	TGA	2	6	333957	333962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336065540
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6092	NC_015601	AAG	2	6	334390	334395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336065540
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6094	NC_015601	AT	3	6	334684	334689	50 %	50 %	0 %	0 %	336065540
6095	NC_015601	AACGGT	2	12	334714	334725	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	336065540
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6099	NC_015601	TCAT	2	8	335021	335028	25 %	50 %	0 %	25 %	336065540
6100	NC_015601	AAG	2	6	335074	335079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336065540
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6103	NC_015601	GCAA	2	8	335408	335415	50 %	0 %	25 %	25 %	336065541
6104	NC_015601	ATC	2	6	335416	335421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336065541
6105	NC_015601	CAGT	2	8	335436	335443	25 %	25 %	25 %	25 %	336065541
6106	NC_015601	CAA	2	6	335487	335492	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336065541
6107	NC_015601	TCA	2	6	335504	335509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336065541
6108	NC_015601	T	8	8	335530	335537	0 %	100 %	0 %	0 %	336065541
6109	NC_015601	TAA	2	6	335565	335570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336065541
6110	NC_015601	CAT	2	6	335635	335640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336065541
6111	NC_015601	TAA	2	6	335667	335672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336065541
6112	NC_015601	CTG	2	6	335694	335699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336065541
6113	NC_015601	GGAT	2	8	335771	335778	25 %	25 %	50 %	0 %	336065541
6114	NC_015601	TCTT	2	8	335807	335814	0 %	75 %	0 %	25 %	336065541
6115	NC_015601	TCT	2	6	335841	335846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336065541
6116	NC_015601	CAT	2	6	335847	335852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336065541
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6118	NC_015601	AAAG	2	8	335905	335912	75 %	0 %	25 %	0 %	336065541
6119	NC_015601	T	6	6	335933	335938	0 %	100 %	0 %	0 %	336065541
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6486	NC_015601	GAA	2	6	356492	356497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336065562
6487	NC_015601	ATG	2	6	356498	356503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336065562
6488	NC_015601	CAA	2	6	356510	356515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336065562
6489	NC_015601	T	6	6	356550	356555	0 %	100 %	0 %	0 %	336065562
6490	NC_015601	GAAA	2	8	356557	356564	75 %	0 %	25 %	0 %	336065562
6491	NC_015601	ATC	2	6	356684	356689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336065562
6492	NC_015601	CTC	2	6	356732	356737	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336065562
6493	NC_015601	ATT	2	6	356747	356752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336065562
6494	NC_015601	ATTTA	2	10	356814	356823	40 %	60 %	0 %	0 %	336065562
6495	NC_015601	ATC	2	6	356857	356862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336065563
6496	NC_015601	TG	3	6	356929	356934	0 %	50 %	50 %	0 %	336065563
6497	NC_015601	ACA	2	6	356964	356969	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336065563
6498	NC_015601	TGA	2	6	356971	356976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336065563
6499	NC_015601	ATG	3	9	356979	356987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336065563
6500	NC_015601	CA	3	6	357000	357005	50 %	0 %	0 %	50 %	336065563

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