MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ethanoligenens harbinense YUAN-3 chromosome

Total Repeats: 58797

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_014828	AGC	3	9	167664	167672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317131160
3502	NC_014828	ATG	2	6	167709	167714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317131160
3503	NC_014828	TGA	2	6	167823	167828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317131161
3504	NC_014828	CCA	2	6	167850	167855	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317131161
3505	NC_014828	CGT	2	6	167862	167867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317131161
3506	NC_014828	TGG	2	6	167883	167888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317131161
3507	NC_014828	CGG	2	6	167894	167899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317131161
3508	NC_014828	TCG	2	6	167963	167968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317131161
3509	NC_014828	ACG	2	6	167979	167984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317131161
3510	NC_014828	GTT	2	6	167986	167991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	317131161
3511	NC_014828	GCT	3	9	168018	168026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317131161
3512	NC_014828	CGC	2	6	168027	168032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317131161
3513	NC_014828	GCTG	2	8	168048	168055	0 %	25 %	50 %	25 %	317131161
3514	NC_014828	CGG	3	9	168101	168109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317131161
3515	NC_014828	AC	3	6	168164	168169	50 %	0 %	0 %	50 %	317131161
3516	NC_014828	GCG	2	6	168214	168219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317131161
3517	NC_014828	CAG	2	6	168307	168312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317131161
3518	NC_014828	TGA	2	6	168315	168320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317131161
3519	NC_014828	CGT	2	6	168369	168374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317131161
3520	NC_014828	GAT	2	6	168592	168597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317131162
3521	NC_014828	T	6	6	168634	168639	0 %	100 %	0 %	0 %	317131162
3522	NC_014828	T	6	6	168642	168647	0 %	100 %	0 %	0 %	317131162
3523	NC_014828	GTT	2	6	168712	168717	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	317131162
3524	NC_014828	A	6	6	168721	168726	100 %	0 %	0 %	0 %	317131162
3525	NC_014828	CGAG	2	8	168756	168763	25 %	0 %	50 %	25 %	317131162
3526	NC_014828	TCGA	2	8	168764	168771	25 %	25 %	25 %	25 %	317131162
3527	NC_014828	T	6	6	168775	168780	0 %	100 %	0 %	0 %	317131162
3528	NC_014828	GTG	2	6	168812	168817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317131162
3529	NC_014828	TGA	2	6	168861	168866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317131162
3530	NC_014828	GT	4	8	168979	168986	0 %	50 %	50 %	0 %	317131162
3531	NC_014828	GCT	2	6	168994	168999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317131162
3532	NC_014828	CCA	2	6	169008	169013	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317131162
3533	NC_014828	TGA	3	9	169098	169106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317131162
3534	NC_014828	CAC	2	6	169138	169143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317131162
3535	NC_014828	CGT	2	6	169158	169163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317131162
3536	NC_014828	AGC	2	6	169184	169189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317131162
3537	NC_014828	GCA	2	6	169197	169202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317131162
3538	NC_014828	AGAT	2	8	169235	169242	50 %	25 %	25 %	0 %	317131162
3539	NC_014828	TGT	2	6	169257	169262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	317131162
3540	NC_014828	TGA	2	6	169278	169283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317131162
3541	NC_014828	ATA	2	6	169309	169314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317131162
3542	NC_014828	GGC	2	6	169360	169365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317131162
3543	NC_014828	GCA	2	6	169446	169451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317131162
3544	NC_014828	GCG	2	6	169455	169460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317131162
3545	NC_014828	CGCC	2	8	169461	169468	0 %	0 %	25 %	75 %	317131162
3546	NC_014828	CACC	2	8	169551	169558	25 %	0 %	0 %	75 %	317131162
3547	NC_014828	CTG	2	6	169582	169587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317131162
3548	NC_014828	CGATC	2	10	170018	170027	20 %	20 %	20 %	40 %	317131163
3549	NC_014828	CCG	2	6	170033	170038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317131163
3550	NC_014828	CG	3	6	170048	170053	0 %	0 %	50 %	50 %	317131163
3551	NC_014828	GCGA	2	8	170065	170072	25 %	0 %	50 %	25 %	317131163
3552	NC_014828	CCG	2	6	170089	170094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317131163
3553	NC_014828	CCG	2	6	170103	170108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317131163
3554	NC_014828	CAC	2	6	170115	170120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317131163
3555	NC_014828	CCG	2	6	170145	170150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317131163
3556	NC_014828	CGG	2	6	170177	170182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317131163
3557	NC_014828	CGTC	2	8	170189	170196	0 %	25 %	25 %	50 %	317131163
3558	NC_014828	GGCG	2	8	170213	170220	0 %	0 %	75 %	25 %	317131163
3559	NC_014828	TCC	2	6	170239	170244	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	317131163
3560	NC_014828	CGG	2	6	170276	170281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317131163
3561	NC_014828	CGG	2	6	170285	170290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317131163
3562	NC_014828	T	6	6	170315	170320	0 %	100 %	0 %	0 %	317131163
3563	NC_014828	GGC	2	6	170327	170332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317131163
3564	NC_014828	GCG	2	6	170333	170338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317131163
3565	NC_014828	CGT	2	6	170363	170368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317131163
3566	NC_014828	TGA	2	6	170372	170377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317131163
3567	NC_014828	GCCG	2	8	170405	170412	0 %	0 %	50 %	50 %	317131163
3568	NC_014828	GGC	2	6	170429	170434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317131163
3569	NC_014828	CCG	2	6	170441	170446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317131163
3570	NC_014828	GCA	2	6	170447	170452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317131163
3571	NC_014828	GC	3	6	170466	170471	0 %	0 %	50 %	50 %	317131163
3572	NC_014828	TCA	3	9	170513	170521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317131163
3573	NC_014828	GC	3	6	170533	170538	0 %	0 %	50 %	50 %	317131163
3574	NC_014828	GTCC	2	8	170552	170559	0 %	25 %	25 %	50 %	317131163
3575	NC_014828	GCC	2	6	170634	170639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317131163
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3577	NC_014828	CCCTGT	2	12	170671	170682	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	317131163
3578	NC_014828	CG	3	6	170967	170972	0 %	0 %	50 %	50 %	317131164
3579	NC_014828	GCCG	2	8	170985	170992	0 %	0 %	50 %	50 %	317131164
3580	NC_014828	CCA	2	6	171098	171103	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317131164
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3582	NC_014828	CG	4	8	171191	171198	0 %	0 %	50 %	50 %	317131164
3583	NC_014828	TTG	2	6	171241	171246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	317131164
3584	NC_014828	GAC	2	6	171282	171287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317131164
3585	NC_014828	CCA	2	6	171290	171295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317131164
3586	NC_014828	ACC	2	6	171400	171405	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317131164
3587	NC_014828	CG	3	6	171407	171412	0 %	0 %	50 %	50 %	317131164
3588	NC_014828	GCGCC	2	10	171422	171431	0 %	0 %	40 %	60 %	317131164
3589	NC_014828	CAGC	2	8	171440	171447	25 %	0 %	25 %	50 %	317131164
3590	NC_014828	ACC	2	6	171457	171462	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317131164
3591	NC_014828	CCA	2	6	171494	171499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317131164
3592	NC_014828	AAT	2	6	171628	171633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317131165
3593	NC_014828	AT	3	6	171668	171673	50 %	50 %	0 %	0 %	317131165
3594	NC_014828	TGCG	2	8	171702	171709	0 %	25 %	50 %	25 %	317131165
3595	NC_014828	ACC	2	6	171716	171721	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317131165
3596	NC_014828	CGG	2	6	171726	171731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317131165
3597	NC_014828	GCG	2	6	171834	171839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317131165
3598	NC_014828	GCA	2	6	171852	171857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317131165
3599	NC_014828	GCG	2	6	171877	171882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317131165
3600	NC_014828	CG	4	8	171881	171888	0 %	0 %	50 %	50 %	317131165
3601	NC_014828	GGC	2	6	171901	171906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317131165
3602	NC_014828	ATA	2	6	171914	171919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317131165
3603	NC_014828	CTG	2	6	172214	172219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317131166
3604	NC_014828	GCG	2	6	172265	172270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317131166
3605	NC_014828	ATT	2	6	172296	172301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	317131166
3606	NC_014828	GGC	2	6	172307	172312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317131166
3607	NC_014828	GCC	2	6	172331	172336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317131166
3608	NC_014828	CCGCC	2	10	172377	172386	0 %	0 %	20 %	80 %	317131166
3609	NC_014828	CGC	3	9	172395	172403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317131166
3610	NC_014828	GAGC	2	8	172435	172442	25 %	0 %	50 %	25 %	317131166
3611	NC_014828	AAC	2	6	172471	172476	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	317131166
3612	NC_014828	TGC	2	6	172491	172496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317131166
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3614	NC_014828	CG	4	8	172538	172545	0 %	0 %	50 %	50 %	317131166
3615	NC_014828	GGC	2	6	172683	172688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317131166
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3617	NC_014828	AC	3	6	172725	172730	50 %	0 %	0 %	50 %	317131166
3618	NC_014828	CCG	2	6	172775	172780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317131167
3619	NC_014828	CG	3	6	172779	172784	0 %	0 %	50 %	50 %	317131167
3620	NC_014828	GGCA	2	8	172843	172850	25 %	0 %	50 %	25 %	317131167
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3622	NC_014828	CTGCG	2	10	172938	172947	0 %	20 %	40 %	40 %	317131167
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3745	NC_014828	CG	4	8	177391	177398	0 %	0 %	50 %	50 %	317131172
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3985	NC_014828	CAT	2	6	188462	188467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317131183
3986	NC_014828	GAA	2	6	188511	188516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317131183
3987	NC_014828	GTG	2	6	188559	188564	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317131183
3988	NC_014828	GAA	2	6	188565	188570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317131183
3989	NC_014828	GCTG	2	8	188575	188582	0 %	25 %	50 %	25 %	317131183
3990	NC_014828	G	6	6	188589	188594	0 %	0 %	100 %	0 %	317131183
3991	NC_014828	AGA	2	6	188608	188613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317131183
3992	NC_014828	CGG	2	6	188744	188749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317131183
3993	NC_014828	TCG	2	6	188866	188871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317131184
3994	NC_014828	T	6	6	188883	188888	0 %	100 %	0 %	0 %	317131184
3995	NC_014828	GCGCC	2	10	188963	188972	0 %	0 %	40 %	60 %	317131184
3996	NC_014828	GC	3	6	188984	188989	0 %	0 %	50 %	50 %	317131184
3997	NC_014828	GC	4	8	189020	189027	0 %	0 %	50 %	50 %	317131184
3998	NC_014828	GCC	2	6	189170	189175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317131184
3999	NC_014828	GCGG	3	12	189206	189217	0 %	0 %	75 %	25 %	317131184
4000	NC_014828	AAT	2	6	189251	189256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317131184

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