MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Erwinia billingiae Eb661 plasmid pEB170

Total Repeats: 58

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014305	ACCGCG	2	12	845	856	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	300713133
2	NC_014305	ACACCG	2	12	12143	12154	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	300713150
3	NC_014305	ACTTCA	2	12	16084	16095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300713157
4	NC_014305	GTTGAA	2	12	16525	16536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300713157
5	NC_014305	GGGTCA	2	12	21251	21262	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	300713163
6	NC_014305	ATTTAT	2	12	22726	22737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300713165
7	NC_014305	ACCTTC	2	12	26446	26457	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	300713172
8	NC_014305	CCGCGC	2	12	26536	26547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300713172
9	NC_014305	CGGTGC	2	12	28283	28294	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	300713174
10	NC_014305	AAATGA	2	12	30550	30561	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	300713176
11	NC_014305	GCAGGC	2	12	30739	30750	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	300713176
12	NC_014305	AACGTG	2	12	50028	50039	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	300713205
13	NC_014305	TTTCCC	2	12	52615	52626	0 %	50 %	0 %	50 %	300713210
14	NC_014305	CGCCTG	2	12	55072	55083	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	300713215
15	NC_014305	TCATTT	2	12	55262	55273	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	300713215
16	NC_014305	AAAATA	2	12	67119	67130	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	300713228
17	NC_014305	ACCGGC	2	12	67233	67244	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	300713228
18	NC_014305	TTCTGT	2	12	68126	68137	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	300713230
19	NC_014305	CGGTGG	2	12	69173	69184	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	300713231
20	NC_014305	GAATAA	2	12	70566	70577	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	300713235
21	NC_014305	TTCAAT	2	12	72905	72916	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	300713240
22	NC_014305	AATCTT	2	12	85072	85083	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	300713255
23	NC_014305	TGCGGC	2	12	88221	88232	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	300713257
24	NC_014305	GTTCAG	2	12	90794	90805	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	300713259
25	NC_014305	CCTGGC	2	12	93055	93066	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	300713262
26	NC_014305	CGCCAG	2	12	95816	95827	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	300713264
27	NC_014305	GCCAGC	2	12	95964	95975	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	300713264
28	NC_014305	TGGCGC	2	12	96975	96986	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	300713265
29	NC_014305	TTCAAC	2	12	98618	98629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300713266
30	NC_014305	GTAACT	2	12	98765	98776	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	300713266
31	NC_014305	TCGCTG	2	12	100853	100864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300713268
32	NC_014305	CATTTC	2	12	103652	103663	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	300713272
33	NC_014305	CTAAAG	2	12	108636	108647	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	300713278
34	NC_014305	GGTGGG	2	12	113004	113015	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	300713285
35	NC_014305	CACTGG	2	12	113700	113711	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	300713287
36	NC_014305	CGCTGG	2	12	113871	113882	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	300713287
37	NC_014305	GCAGGC	2	12	123694	123705	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	300713300
38	NC_014305	GGCGCT	2	12	126652	126663	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	300713306
39	NC_014305	AACGTC	2	12	129515	129526	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	300713309
40	NC_014305	CAATCT	2	12	133310	133321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300713316
41	NC_014305	TTCCCT	2	12	134741	134752	0 %	50 %	0 %	50 %	300713318
42	NC_014305	TTTTGC	2	12	135765	135776	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	300713319
43	NC_014305	CTTATC	2	12	136974	136985	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	300713320
44	NC_014305	ACCGGG	2	12	137786	137797	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	300713322
45	NC_014305	GGGCAG	2	12	139217	139228	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	300713324
46	NC_014305	TGCGGA	2	12	140437	140448	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	300713325
47	NC_014305	GGCCGG	2	12	149673	149684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300713337
48	NC_014305	CAACAC	2	12	152302	152313	50 %	0 %	0 %	50 %	300713340
49	NC_014305	GGCAGG	2	12	153555	153566	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	300713343
50	NC_014305	GCGCAG	2	12	154619	154630	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	300713343
51	NC_014305	GCGCTG	2	12	155820	155831	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	300713344
52	NC_014305	TGCAGG	2	12	159949	159960	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	300713348
53	NC_014305	TCGCGC	2	12	160012	160023	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	300713348
54	NC_014305	GCTGCA	2	12	160862	160873	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	300713348
55	NC_014305	TGACGG	2	12	164455	164466	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	300713349
56	NC_014305	CGCTGG	2	12	164898	164909	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	300713349
57	NC_014305	GGGCGG	2	12	165867	165878	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	300713349
58	NC_014305	ACGGTA	2	12	166884	166895	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	300713349

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.