MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Enterobacter cloacae subsp. cloacae ATCC 13047 plasmid pECL_B

Total Repeats: 194

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014108	CCGT	2	8	303	310	0 %	25 %	25 %	50 %	295698116
2	NC_014108	GAAA	2	8	552	559	75 %	0 %	25 %	0 %	295698117
3	NC_014108	AACC	2	8	1840	1847	50 %	0 %	0 %	50 %	295698119
4	NC_014108	AGTT	2	8	1888	1895	25 %	50 %	25 %	0 %	295698119
5	NC_014108	GGAA	2	8	1975	1982	50 %	0 %	50 %	0 %	295698119
6	NC_014108	TCAT	2	8	2085	2092	25 %	50 %	0 %	25 %	295698119
7	NC_014108	AGAC	2	8	2618	2625	50 %	0 %	25 %	25 %	295698120
8	NC_014108	TCTT	2	8	2774	2781	0 %	75 %	0 %	25 %	295698120
9	NC_014108	GCAA	2	8	3045	3052	50 %	0 %	25 %	25 %	295698120
10	NC_014108	GAAG	2	8	3219	3226	50 %	0 %	50 %	0 %	295698120
11	NC_014108	CCGC	2	8	4813	4820	0 %	0 %	25 %	75 %	295698124
12	NC_014108	CCGT	2	8	5598	5605	0 %	25 %	25 %	50 %	295698126
13	NC_014108	CGAG	2	8	5884	5891	25 %	0 %	50 %	25 %	295698127
14	NC_014108	GGCA	2	8	7036	7043	25 %	0 %	50 %	25 %	295698130
15	NC_014108	CAGA	2	8	7105	7112	50 %	0 %	25 %	25 %	295698130
16	NC_014108	GTAA	2	8	7166	7173	50 %	25 %	25 %	0 %	295698130
17	NC_014108	TGCT	2	8	7561	7568	0 %	50 %	25 %	25 %	295698131
18	NC_014108	CTTT	2	8	7625	7632	0 %	75 %	0 %	25 %	295698131
19	NC_014108	GTCA	2	8	8033	8040	25 %	25 %	25 %	25 %	295698133
20	NC_014108	CTTG	2	8	8432	8439	0 %	50 %	25 %	25 %	295698133
21	NC_014108	TAAC	2	8	8465	8472	50 %	25 %	0 %	25 %	295698133
22	NC_014108	AACC	2	8	10678	10685	50 %	0 %	0 %	50 %	295698138
23	NC_014108	CTGT	2	8	11612	11619	0 %	50 %	25 %	25 %	295698140
24	NC_014108	CCTG	2	8	11636	11643	0 %	25 %	25 %	50 %	295698140
25	NC_014108	TTCT	2	8	11686	11693	0 %	75 %	0 %	25 %	295698140
26	NC_014108	CCAG	2	8	13170	13177	25 %	0 %	25 %	50 %	295698143
27	NC_014108	TGCC	2	8	13229	13236	0 %	25 %	25 %	50 %	295698143
28	NC_014108	AATT	2	8	13637	13644	50 %	50 %	0 %	0 %	295698144
29	NC_014108	TGAA	2	8	13650	13657	50 %	25 %	25 %	0 %	295698144
30	NC_014108	GTAA	2	8	15942	15949	50 %	25 %	25 %	0 %	295698148
31	NC_014108	CAGC	2	8	16148	16155	25 %	0 %	25 %	50 %	295698148
32	NC_014108	GAAA	2	8	16635	16642	75 %	0 %	25 %	0 %	295698149
33	NC_014108	AAAG	2	8	17425	17432	75 %	0 %	25 %	0 %	295698151
34	NC_014108	CGAA	2	8	17474	17481	50 %	0 %	25 %	25 %	295698151
35	NC_014108	ATTT	2	8	17781	17788	25 %	75 %	0 %	0 %	295698152
36	NC_014108	AGGT	2	8	17869	17876	25 %	25 %	50 %	0 %	295698152
37	NC_014108	CATC	2	8	18271	18278	25 %	25 %	0 %	50 %	295698153
38	NC_014108	TTCC	2	8	18678	18685	0 %	50 %	0 %	50 %	295698154
39	NC_014108	GCTC	2	8	18871	18878	0 %	25 %	25 %	50 %	295698155
40	NC_014108	TCTT	2	8	19102	19109	0 %	75 %	0 %	25 %	295698156
41	NC_014108	GAAT	2	8	19333	19340	50 %	25 %	25 %	0 %	295698157
42	NC_014108	AATA	2	8	19559	19566	75 %	25 %	0 %	0 %	295698157
43	NC_014108	AGCA	2	8	19870	19877	50 %	0 %	25 %	25 %	295698158
44	NC_014108	TAAT	2	8	20183	20190	50 %	50 %	0 %	0 %	295698158
45	NC_014108	TCCT	2	8	21308	21315	0 %	50 %	0 %	50 %	295698161
46	NC_014108	TAAT	2	8	21760	21767	50 %	50 %	0 %	0 %	295698161
47	NC_014108	CTGA	2	8	22072	22079	25 %	25 %	25 %	25 %	295698161
48	NC_014108	CTCA	2	8	22085	22092	25 %	25 %	0 %	50 %	295698161
49	NC_014108	ATAC	2	8	22129	22136	50 %	25 %	0 %	25 %	295698161
50	NC_014108	TTTG	2	8	22198	22205	0 %	75 %	25 %	0 %	295698161
51	NC_014108	CGCA	2	8	22382	22389	25 %	0 %	25 %	50 %	295698161
52	NC_014108	TTCT	2	8	22454	22461	0 %	75 %	0 %	25 %	295698161
53	NC_014108	TCGT	2	8	22820	22827	0 %	50 %	25 %	25 %	295698162
54	NC_014108	TATT	2	8	22874	22881	25 %	75 %	0 %	0 %	295698162
55	NC_014108	GCAA	2	8	23878	23885	50 %	0 %	25 %	25 %	295698164
56	NC_014108	TGCC	2	8	24558	24565	0 %	25 %	25 %	50 %	295698165
57	NC_014108	TGAA	2	8	24842	24849	50 %	25 %	25 %	0 %	295698165
58	NC_014108	TGCA	2	8	26397	26404	25 %	25 %	25 %	25 %	295698168
59	NC_014108	CTGC	2	8	26721	26728	0 %	25 %	25 %	50 %	295698168
60	NC_014108	ATGC	2	8	27088	27095	25 %	25 %	25 %	25 %	295698169
61	NC_014108	GAAA	2	8	27719	27726	75 %	0 %	25 %	0 %	295698170
62	NC_014108	GCTT	2	8	27973	27980	0 %	50 %	25 %	25 %	295698171
63	NC_014108	CAGC	2	8	29149	29156	25 %	0 %	25 %	50 %	295698174
64	NC_014108	AATC	2	8	29420	29427	50 %	25 %	0 %	25 %	295698174
65	NC_014108	AATG	2	8	29768	29775	50 %	25 %	25 %	0 %	295698175
66	NC_014108	GCCT	2	8	29797	29804	0 %	25 %	25 %	50 %	295698175
67	NC_014108	AGCC	2	8	30271	30278	25 %	0 %	25 %	50 %	295698175
68	NC_014108	GTGG	2	8	30598	30605	0 %	25 %	75 %	0 %	295698176
69	NC_014108	ATGA	2	8	30637	30644	50 %	25 %	25 %	0 %	295698176
70	NC_014108	CTGG	2	8	30673	30680	0 %	25 %	50 %	25 %	295698176
71	NC_014108	CCTG	2	8	30683	30690	0 %	25 %	25 %	50 %	295698176
72	NC_014108	CTTG	2	8	31356	31363	0 %	50 %	25 %	25 %	295698178
73	NC_014108	TATT	2	8	32588	32595	25 %	75 %	0 %	0 %	295698180
74	NC_014108	ATCC	2	8	32938	32945	25 %	25 %	0 %	50 %	295698180
75	NC_014108	ATGG	2	8	33312	33319	25 %	25 %	50 %	0 %	295698180
76	NC_014108	ACAA	2	8	34002	34009	75 %	0 %	0 %	25 %	295698181
77	NC_014108	CTGA	2	8	34163	34170	25 %	25 %	25 %	25 %	295698181
78	NC_014108	CAGA	2	8	35477	35484	50 %	0 %	25 %	25 %	295698182
79	NC_014108	AGCG	2	8	35562	35569	25 %	0 %	50 %	25 %	295698182
80	NC_014108	CGGG	2	8	35601	35608	0 %	0 %	75 %	25 %	295698182
81	NC_014108	TGAA	2	8	35868	35875	50 %	25 %	25 %	0 %	295698182
82	NC_014108	TCCG	2	8	36950	36957	0 %	25 %	25 %	50 %	295698183
83	NC_014108	AACG	2	8	37065	37072	50 %	0 %	25 %	25 %	295698183
84	NC_014108	ATAA	2	8	37303	37310	75 %	25 %	0 %	0 %	295698183
85	NC_014108	TGAA	2	8	37694	37701	50 %	25 %	25 %	0 %	295698183
86	NC_014108	ACTG	2	8	37747	37754	25 %	25 %	25 %	25 %	295698183
87	NC_014108	AGAC	2	8	38354	38361	50 %	0 %	25 %	25 %	295698183
88	NC_014108	AAAC	2	8	38539	38546	75 %	0 %	0 %	25 %	295698183
89	NC_014108	AGCG	2	8	38589	38596	25 %	0 %	50 %	25 %	295698183
90	NC_014108	TGCC	2	8	39022	39029	0 %	25 %	25 %	50 %	295698184
91	NC_014108	GGTA	2	8	39183	39190	25 %	25 %	50 %	0 %	295698184
92	NC_014108	TTCA	2	8	39247	39254	25 %	50 %	0 %	25 %	295698184
93	NC_014108	AGTT	2	8	39294	39301	25 %	50 %	25 %	0 %	295698184
94	NC_014108	GTCA	2	8	39704	39711	25 %	25 %	25 %	25 %	295698184
95	NC_014108	CCTG	2	8	39851	39858	0 %	25 %	25 %	50 %	295698184
96	NC_014108	GTAT	2	8	39985	39992	25 %	50 %	25 %	0 %	295698184
97	NC_014108	GCAT	2	8	41045	41052	25 %	25 %	25 %	25 %	295698185
98	NC_014108	CTTC	2	8	41560	41567	0 %	50 %	0 %	50 %	295698185
99	NC_014108	GCCA	2	8	41652	41659	25 %	0 %	25 %	50 %	295698185
100	NC_014108	TCCT	2	8	41968	41975	0 %	50 %	0 %	50 %	295698185
101	NC_014108	GATG	2	8	42249	42256	25 %	25 %	50 %	0 %	295698185
102	NC_014108	CTGG	2	8	42613	42620	0 %	25 %	50 %	25 %	295698186
103	NC_014108	GTAT	2	8	42693	42700	25 %	50 %	25 %	0 %	295698186
104	NC_014108	TGTT	2	8	43214	43221	0 %	75 %	25 %	0 %	295698187
105	NC_014108	GCGA	2	8	43967	43974	25 %	0 %	50 %	25 %	295698188
106	NC_014108	AAAT	2	8	44327	44334	75 %	25 %	0 %	0 %	295698189
107	NC_014108	AAAC	2	8	45222	45229	75 %	0 %	0 %	25 %	295698190
108	NC_014108	TCGT	2	8	45444	45451	0 %	50 %	25 %	25 %	295698190
109	NC_014108	TCCT	2	8	45761	45768	0 %	50 %	0 %	50 %	295698191
110	NC_014108	TTCC	2	8	46368	46375	0 %	50 %	0 %	50 %	295698191
111	NC_014108	CATT	2	8	46470	46477	25 %	50 %	0 %	25 %	295698191
112	NC_014108	GATG	2	8	46947	46954	25 %	25 %	50 %	0 %	295698192
113	NC_014108	GGGA	2	8	47366	47373	25 %	0 %	75 %	0 %	295698192
114	NC_014108	ATGA	2	8	48139	48146	50 %	25 %	25 %	0 %	295698192
115	NC_014108	CAGA	2	8	49141	49148	50 %	0 %	25 %	25 %	295698192
116	NC_014108	GCAG	2	8	49599	49606	25 %	0 %	50 %	25 %	295698192
117	NC_014108	TCCG	2	8	50448	50455	0 %	25 %	25 %	50 %	295698192
118	NC_014108	CTTC	2	8	50650	50657	0 %	50 %	0 %	50 %	295698192
119	NC_014108	CAGC	2	8	50659	50666	25 %	0 %	25 %	50 %	295698192
120	NC_014108	TAAC	2	8	50836	50843	50 %	25 %	0 %	25 %	295698192
121	NC_014108	TGGC	2	8	51072	51079	0 %	25 %	50 %	25 %	295698193
122	NC_014108	GCAG	2	8	51447	51454	25 %	0 %	50 %	25 %	295698194
123	NC_014108	TGAC	2	8	51635	51642	25 %	25 %	25 %	25 %	295698195
124	NC_014108	GTAC	2	8	51690	51697	25 %	25 %	25 %	25 %	295698195
125	NC_014108	CAGG	2	8	52003	52010	25 %	0 %	50 %	25 %	295698195
126	NC_014108	CAGC	2	8	52126	52133	25 %	0 %	25 %	50 %	295698195
127	NC_014108	CCCG	2	8	52912	52919	0 %	0 %	25 %	75 %	295698197
128	NC_014108	TAAA	2	8	53715	53722	75 %	25 %	0 %	0 %	295698199
129	NC_014108	ATTC	2	8	54916	54923	25 %	50 %	0 %	25 %	295698199
130	NC_014108	GTCG	2	8	55715	55722	0 %	25 %	50 %	25 %	295698200
131	NC_014108	CCAG	2	8	55979	55986	25 %	0 %	25 %	50 %	295698200
132	NC_014108	CAAA	3	12	57444	57455	75 %	0 %	0 %	25 %	295698201
133	NC_014108	GAAT	2	8	57696	57703	50 %	25 %	25 %	0 %	295698201
134	NC_014108	CGTC	2	8	57873	57880	0 %	25 %	25 %	50 %	295698202
135	NC_014108	ATCT	2	8	58127	58134	25 %	50 %	0 %	25 %	295698202
136	NC_014108	GTTC	2	8	58816	58823	0 %	50 %	25 %	25 %	295698203
137	NC_014108	GGGT	2	8	59077	59084	0 %	25 %	75 %	0 %	295698203
138	NC_014108	ACAA	2	8	59203	59210	75 %	0 %	0 %	25 %	295698203
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.