MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Enterobacter cloacae subsp. cloacae ATCC 13047 plasmid pECL_A

Total Repeats: 116

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014107	AATGG	2	10	4861	4870	40 %	20 %	40 %	0 %	295697847
2	NC_014107	ATTTC	2	10	5133	5142	20 %	60 %	0 %	20 %	295697847
3	NC_014107	GGCGA	2	10	5500	5509	20 %	0 %	60 %	20 %	295697848
4	NC_014107	AGACC	2	10	7586	7595	40 %	0 %	20 %	40 %	295697851
5	NC_014107	TTTGC	2	10	8802	8811	0 %	60 %	20 %	20 %	295697852
6	NC_014107	TGATC	2	10	8844	8853	20 %	40 %	20 %	20 %	295697852
7	NC_014107	CATCG	2	10	8959	8968	20 %	20 %	20 %	40 %	295697853
8	NC_014107	TTCCC	2	10	10045	10054	0 %	40 %	0 %	60 %	295697855
9	NC_014107	AGTTA	2	10	10176	10185	40 %	40 %	20 %	0 %	295697855
10	NC_014107	GGTCA	2	10	13845	13854	20 %	20 %	40 %	20 %	295697858
11	NC_014107	CGTAT	2	10	15187	15196	20 %	40 %	20 %	20 %	295697860
12	NC_014107	CGGCA	2	10	18022	18031	20 %	0 %	40 %	40 %	295697863
13	NC_014107	ACGCA	2	10	19383	19392	40 %	0 %	20 %	40 %	295697867
14	NC_014107	GACAG	2	10	21411	21420	40 %	0 %	40 %	20 %	295697867
15	NC_014107	TTATC	2	10	21512	21521	20 %	60 %	0 %	20 %	295697867
16	NC_014107	ATTCG	2	10	21927	21936	20 %	40 %	20 %	20 %	295697868
17	NC_014107	CGTCG	2	10	23511	23520	0 %	20 %	40 %	40 %	295697869
18	NC_014107	CTGTC	2	10	23642	23651	0 %	40 %	20 %	40 %	295697869
19	NC_014107	AGGCA	2	10	25479	25488	40 %	0 %	40 %	20 %	295697869
20	NC_014107	TGGGT	2	10	26615	26624	0 %	40 %	60 %	0 %	295697870
21	NC_014107	AGCTC	2	10	29942	29951	20 %	20 %	20 %	40 %	295697875
22	NC_014107	TATCC	2	10	31069	31078	20 %	40 %	0 %	40 %	295697875
23	NC_014107	GATAT	2	10	32876	32885	40 %	40 %	20 %	0 %	295697879
24	NC_014107	TTTGG	2	10	33101	33110	0 %	60 %	40 %	0 %	295697879
25	NC_014107	GCGCG	2	10	34404	34413	0 %	0 %	60 %	40 %	295697881
26	NC_014107	AACCG	2	10	37528	37537	40 %	0 %	20 %	40 %	295697885
27	NC_014107	AGAAT	2	10	38750	38759	60 %	20 %	20 %	0 %	295697888
28	NC_014107	TCAGC	2	10	38982	38991	20 %	20 %	20 %	40 %	295697888
29	NC_014107	TCCTT	2	10	41583	41592	0 %	60 %	0 %	40 %	295697896
30	NC_014107	TGCAC	2	10	42312	42321	20 %	20 %	20 %	40 %	295697897
31	NC_014107	CTGAA	2	10	45449	45458	40 %	20 %	20 %	20 %	295697902
32	NC_014107	CTCTG	2	10	47279	47288	0 %	40 %	20 %	40 %	295697904
33	NC_014107	CGTTT	2	10	49447	49456	0 %	60 %	20 %	20 %	295697905
34	NC_014107	CTTTC	2	10	49555	49564	0 %	60 %	0 %	40 %	295697905
35	NC_014107	AGGGC	2	10	50689	50698	20 %	0 %	60 %	20 %	295697907
36	NC_014107	GGCCT	2	10	51170	51179	0 %	20 %	40 %	40 %	295697907
37	NC_014107	GCAGT	2	10	51953	51962	20 %	20 %	40 %	20 %	295697909
38	NC_014107	TTTAA	2	10	52545	52554	40 %	60 %	0 %	0 %	295697911
39	NC_014107	GAAGG	2	10	54148	54157	40 %	0 %	60 %	0 %	295697913
40	NC_014107	TGTCG	2	10	55482	55491	0 %	40 %	40 %	20 %	295697917
41	NC_014107	GCGTG	13	65	56842	56906	0 %	20 %	60 %	20 %	295697922
42	NC_014107	GCCGT	2	10	57117	57126	0 %	20 %	40 %	40 %	295697923
43	NC_014107	CGCGC	2	10	59328	59337	0 %	0 %	40 %	60 %	295697926
44	NC_014107	ACTGC	2	10	60617	60626	20 %	20 %	20 %	40 %	295697927
45	NC_014107	CTGCA	2	10	63758	63767	20 %	20 %	20 %	40 %	295697934
46	NC_014107	GCCAT	2	10	67027	67036	20 %	20 %	20 %	40 %	295697937
47	NC_014107	CGGAT	2	10	69314	69323	20 %	20 %	40 %	20 %	295697940
48	NC_014107	GCGGT	2	10	71180	71189	0 %	20 %	60 %	20 %	295697942
49	NC_014107	ATCCC	2	10	73261	73270	20 %	20 %	0 %	60 %	295697946
50	NC_014107	TGGGA	2	10	75041	75050	20 %	20 %	60 %	0 %	295697947
51	NC_014107	ACGAT	2	10	75744	75753	40 %	20 %	20 %	20 %	295697948
52	NC_014107	CAGTT	2	10	79751	79760	20 %	40 %	20 %	20 %	295697953
53	NC_014107	GCATC	2	10	83029	83038	20 %	20 %	20 %	40 %	295697958
54	NC_014107	GCCCG	2	10	83533	83542	0 %	0 %	40 %	60 %	295697958
55	NC_014107	GCCCA	2	10	89093	89102	20 %	0 %	20 %	60 %	295697966
56	NC_014107	CAGGG	2	10	90826	90835	20 %	0 %	60 %	20 %	295697970
57	NC_014107	CGGTC	2	10	90868	90877	0 %	20 %	40 %	40 %	295697970
58	NC_014107	GCTGA	2	10	91462	91471	20 %	20 %	40 %	20 %	295697971
59	NC_014107	GCAGG	2	10	93849	93858	20 %	0 %	60 %	20 %	295697976
60	NC_014107	CGGTC	2	10	93892	93901	0 %	20 %	40 %	40 %	295697976
61	NC_014107	TGCAT	2	10	95534	95543	20 %	40 %	20 %	20 %	295697979
62	NC_014107	TGCGC	2	10	95640	95649	0 %	20 %	40 %	40 %	295697979
63	NC_014107	CAAAG	2	10	101556	101565	60 %	0 %	20 %	20 %	295697991
64	NC_014107	TCCGT	2	10	103328	103337	0 %	40 %	20 %	40 %	295697995
65	NC_014107	TACCG	2	10	112342	112351	20 %	20 %	20 %	40 %	295698007
66	NC_014107	GGCCT	2	10	112780	112789	0 %	20 %	40 %	40 %	295698007
67	NC_014107	ATCGC	2	10	113276	113285	20 %	20 %	20 %	40 %	295698007
68	NC_014107	GGGCT	2	10	115073	115082	0 %	20 %	60 %	20 %	295698011
69	NC_014107	GTCAG	2	10	120555	120564	20 %	20 %	40 %	20 %	295698015
70	NC_014107	AGCTC	2	10	121285	121294	20 %	20 %	20 %	40 %	295698016
71	NC_014107	ATCCG	2	10	123751	123760	20 %	20 %	20 %	40 %	295698019
72	NC_014107	TGACC	2	10	125697	125706	20 %	20 %	20 %	40 %	295698020
73	NC_014107	CAGAC	2	10	126562	126571	40 %	0 %	20 %	40 %	295698020
74	NC_014107	GCAGC	2	10	126604	126613	20 %	0 %	40 %	40 %	295698020
75	NC_014107	GGAAG	2	10	129486	129495	40 %	0 %	60 %	0 %	295698020
76	NC_014107	GTGCG	2	10	133128	133137	0 %	20 %	60 %	20 %	295698025
77	NC_014107	CGGGC	2	10	133840	133849	0 %	0 %	60 %	40 %	295698025
78	NC_014107	CATGT	2	10	138083	138092	20 %	40 %	20 %	20 %	295698031
79	NC_014107	TGTTT	2	10	139819	139828	0 %	80 %	20 %	0 %	295698032
80	NC_014107	AAGGG	2	10	140421	140430	40 %	0 %	60 %	0 %	295698032
81	NC_014107	CGGTT	2	10	142624	142633	0 %	40 %	40 %	20 %	295698035
82	NC_014107	TTCAG	2	10	144260	144269	20 %	40 %	20 %	20 %	295698039
83	NC_014107	CAGGA	2	10	144691	144700	40 %	0 %	40 %	20 %	295698040
84	NC_014107	GTGGC	2	10	149304	149313	0 %	20 %	60 %	20 %	295698044
85	NC_014107	ATTTC	2	10	150645	150654	20 %	60 %	0 %	20 %	295698045
86	NC_014107	ATGTT	2	10	154035	154044	20 %	60 %	20 %	0 %	295698049
87	NC_014107	CCGTC	2	10	154716	154725	0 %	20 %	20 %	60 %	295698050
88	NC_014107	CATTT	2	10	155247	155256	20 %	60 %	0 %	20 %	295698051
89	NC_014107	TGTGG	2	10	162198	162207	0 %	40 %	60 %	0 %	295698062
90	NC_014107	CCGCG	2	10	165479	165488	0 %	0 %	40 %	60 %	295698065
91	NC_014107	GCGAC	2	10	166548	166557	20 %	0 %	40 %	40 %	295698065
92	NC_014107	CGAGG	2	10	170499	170508	20 %	0 %	60 %	20 %	295698072
93	NC_014107	GCGAT	2	10	172644	172653	20 %	20 %	40 %	20 %	295698077
94	NC_014107	CGGCC	2	10	173941	173950	0 %	0 %	40 %	60 %	295698079
95	NC_014107	CTGGC	2	10	175559	175568	0 %	20 %	40 %	40 %	295698079
96	NC_014107	TGCTC	2	10	176351	176360	0 %	40 %	20 %	40 %	295698080
97	NC_014107	AGGCC	2	10	176540	176549	20 %	0 %	40 %	40 %	295698080
98	NC_014107	TTAGT	2	10	176742	176751	20 %	60 %	20 %	0 %	295698081
99	NC_014107	GTGCG	2	10	176836	176845	0 %	20 %	60 %	20 %	295698081
100	NC_014107	GATCG	2	10	177119	177128	20 %	20 %	40 %	20 %	295698081
101	NC_014107	TAAAT	2	10	178725	178734	60 %	40 %	0 %	0 %	295698083
102	NC_014107	TTTAT	2	10	179779	179788	20 %	80 %	0 %	0 %	295698086
103	NC_014107	GTGAT	2	10	180482	180491	20 %	40 %	40 %	0 %	295698086
104	NC_014107	ATTGC	2	10	182462	182471	20 %	40 %	20 %	20 %	295698087
105	NC_014107	ATTAT	2	10	182912	182921	40 %	60 %	0 %	0 %	295698087
106	NC_014107	ACAAA	2	10	186869	186878	80 %	0 %	0 %	20 %	295698094
107	NC_014107	TGCTC	2	10	187400	187409	0 %	40 %	20 %	40 %	295698095
108	NC_014107	AGGCC	2	10	187589	187598	20 %	0 %	40 %	40 %	295698095
109	NC_014107	TCAGC	2	10	188065	188074	20 %	20 %	20 %	40 %	295698096
110	NC_014107	CGGTG	2	10	188216	188225	0 %	20 %	60 %	20 %	295698096
111	NC_014107	GGACG	2	10	188377	188386	20 %	0 %	60 %	20 %	295698096
112	NC_014107	GGCCT	2	10	189701	189710	0 %	20 %	40 %	40 %	295698098
113	NC_014107	GAGCA	2	10	189890	189899	40 %	0 %	40 %	20 %	295698098
114	NC_014107	CCAGC	2	10	191341	191350	20 %	0 %	20 %	60 %	295698101
115	NC_014107	ATGGC	2	10	192233	192242	20 %	20 %	40 %	20 %	295698102
116	NC_014107	GACAG	2	10	193925	193934	40 %	0 %	40 %	20 %	295698106

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.