MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Erwinia amylovora ATCC 49946 plasmid 1

Total Repeats: 270

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013972	AGT	2	6	33	38	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	293386374
2	NC_013972	CCT	2	6	51	56	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	293386374
3	NC_013972	CAG	2	6	123	128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	293386374
4	NC_013972	CAG	2	6	333	338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	293386374
5	NC_013972	TGA	2	6	339	344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	293386374
6	NC_013972	TGC	2	6	780	785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293386374
7	NC_013972	TGA	2	6	956	961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	293386374
8	NC_013972	ATC	2	6	1252	1257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	293386375
9	NC_013972	CTG	2	6	1312	1317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293386375
10	NC_013972	TGC	2	6	1318	1323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293386375
11	NC_013972	ACC	2	6	1374	1379	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	293386375
12	NC_013972	TGC	2	6	1389	1394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293386375
13	NC_013972	TGA	2	6	1528	1533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	293386376
14	NC_013972	GTG	2	6	1565	1570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	293386376
15	NC_013972	CAC	2	6	1611	1616	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	293386376
16	NC_013972	CGG	2	6	1649	1654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	293386376
17	NC_013972	ATT	2	6	1790	1795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	293386376
18	NC_013972	GCA	2	6	1897	1902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	293386376
19	NC_013972	TTC	2	6	2367	2372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	293386377
20	NC_013972	GAC	2	6	2704	2709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	293386378
21	NC_013972	TCA	2	6	2828	2833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	293386379
22	NC_013972	GAG	2	6	2856	2861	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	293386379
23	NC_013972	CTG	2	6	2895	2900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293386379
24	NC_013972	TCT	2	6	2963	2968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	293386379
25	NC_013972	ACT	2	6	3020	3025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	293386379
26	NC_013972	GAT	2	6	3579	3584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	293386381
27	NC_013972	CGC	2	6	3947	3952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	293386382
28	NC_013972	GCT	2	6	3980	3985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293386382
29	NC_013972	CTT	2	6	4015	4020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	293386382
30	NC_013972	TGT	2	6	4027	4032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	293386382
31	NC_013972	TAA	2	6	4071	4076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	293386382
32	NC_013972	GTT	2	6	4154	4159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	293386382
33	NC_013972	ATT	2	6	4214	4219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	293386382
34	NC_013972	TCA	2	6	4407	4412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	293386382
35	NC_013972	CGG	2	6	5090	5095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	293386383
36	NC_013972	GAT	2	6	5114	5119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	293386383
37	NC_013972	CTC	2	6	5142	5147	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	293386383
38	NC_013972	TGA	2	6	5290	5295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	293386383
39	NC_013972	CTG	2	6	5561	5566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293386383
40	NC_013972	CTT	2	6	5582	5587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	293386383
41	NC_013972	ATG	2	6	5770	5775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	293386384
42	NC_013972	CGG	2	6	5789	5794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	293386384
43	NC_013972	CCA	2	6	5849	5854	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	293386384
44	NC_013972	CGA	2	6	5856	5861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	293386384
45	NC_013972	GCT	2	6	5937	5942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293386384
46	NC_013972	CAG	2	6	5968	5973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	293386384
47	NC_013972	ATG	2	6	5992	5997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	293386384
48	NC_013972	GCG	2	6	6206	6211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	293386384
49	NC_013972	CTG	2	6	6223	6228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293386384
50	NC_013972	GCA	2	6	6288	6293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	293386384
51	NC_013972	GGT	2	6	6333	6338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	293386384
52	NC_013972	GCC	2	6	6388	6393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	293386384
53	NC_013972	GCG	2	6	6424	6429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	293386384
54	NC_013972	GCG	2	6	6448	6453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	293386384
55	NC_013972	TGC	2	6	6522	6527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293386384
56	NC_013972	GCG	2	6	6604	6609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	293386384
57	NC_013972	CGA	2	6	6720	6725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	293386384
58	NC_013972	TGC	2	6	6770	6775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293386384
59	NC_013972	GGC	2	6	6778	6783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	293386384
60	NC_013972	ACT	2	6	6806	6811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	293386384
61	NC_013972	GAT	2	6	6901	6906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	293386384
62	NC_013972	CGG	2	6	6951	6956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	293386384
63	NC_013972	TGG	2	6	7065	7070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	293386384
64	NC_013972	GAA	2	6	7074	7079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	293386384
65	NC_013972	CGG	2	6	7446	7451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	293386385
66	NC_013972	AGC	2	6	7519	7524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	293386385
67	NC_013972	CCA	2	6	7536	7541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	293386385
68	NC_013972	AGC	2	6	7543	7548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	293386385
69	NC_013972	TGC	2	6	7553	7558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293386385
70	NC_013972	GCA	2	6	7625	7630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	293386385
71	NC_013972	CCA	2	6	7704	7709	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	293386385
72	NC_013972	GGC	2	6	7768	7773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	293386385
73	NC_013972	CGG	2	6	7806	7811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	293386385
74	NC_013972	CAA	2	6	7812	7817	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	293386385
75	NC_013972	CCG	2	6	7860	7865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	293386385
76	NC_013972	TGA	2	6	7914	7919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	293386385
77	NC_013972	TGA	2	6	7947	7952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	293386385
78	NC_013972	GTT	2	6	8076	8081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	293386385
79	NC_013972	TGG	2	6	8085	8090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	293386385
80	NC_013972	TTC	2	6	8119	8124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	293386385
81	NC_013972	TGC	2	6	8193	8198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293386385
82	NC_013972	CAG	2	6	8251	8256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	293386385
83	NC_013972	TGC	2	6	8270	8275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293386385
84	NC_013972	CCA	2	6	8277	8282	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	293386385
85	NC_013972	CCT	2	6	8303	8308	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	293386385
86	NC_013972	CCT	2	6	8322	8327	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	293386385
87	NC_013972	TGC	3	9	8329	8337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293386385
88	NC_013972	GAG	2	6	8425	8430	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	293386385
89	NC_013972	ATG	2	6	8435	8440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	293386385
90	NC_013972	GAT	2	6	8645	8650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	293386385
91	NC_013972	GAC	2	6	8666	8671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	293386385
92	NC_013972	ATC	2	6	8786	8791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	293386385
93	NC_013972	TCT	2	6	9437	9442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	293386386
94	NC_013972	GCT	2	6	9540	9545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293386386
95	NC_013972	GTC	2	6	9623	9628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293386386
96	NC_013972	TGG	2	6	9630	9635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	293386386
97	NC_013972	GAA	2	6	10098	10103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	293386387
98	NC_013972	GGC	2	6	10622	10627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	293386388
99	NC_013972	TGG	2	6	10768	10773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	293386388
100	NC_013972	CTT	2	6	10873	10878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	293386388
101	NC_013972	AAG	2	6	10910	10915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	293386388
102	NC_013972	GCA	2	6	10934	10939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	293386388
103	NC_013972	GAT	2	6	11078	11083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	293386388
104	NC_013972	TGA	2	6	11284	11289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	293386388
105	NC_013972	CAA	2	6	11449	11454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	293386389
106	NC_013972	TGG	2	6	11505	11510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	293386389
107	NC_013972	ATC	2	6	11629	11634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	293386390
108	NC_013972	CGC	2	6	11670	11675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	293386390
109	NC_013972	TGC	2	6	11679	11684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293386390
110	NC_013972	GCG	2	6	11715	11720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	293386390
111	NC_013972	CGG	2	6	11723	11728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	293386390
112	NC_013972	GCC	2	6	11884	11889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	293386390
113	NC_013972	CAG	2	6	11970	11975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	293386390
114	NC_013972	CGG	2	6	12038	12043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	293386390
115	NC_013972	GCC	2	6	12102	12107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	293386390
116	NC_013972	CGG	2	6	12215	12220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	293386390
117	NC_013972	GCC	2	6	12253	12258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	293386390
118	NC_013972	CCA	2	6	12293	12298	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	293386390
119	NC_013972	CTC	2	6	12399	12404	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	293386390
120	NC_013972	CAT	2	6	12416	12421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	293386390
121	NC_013972	GCA	2	6	12445	12450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	293386390
122	NC_013972	CAG	2	6	12453	12458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	293386390
123	NC_013972	GCA	2	6	12461	12466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	293386390
124	NC_013972	TGC	2	6	12523	12528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293386390
125	NC_013972	GCA	2	6	12548	12553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	293386390
126	NC_013972	CGC	2	6	12646	12651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	293386391
127	NC_013972	CGG	2	6	12743	12748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	293386391
128	NC_013972	CAG	2	6	12753	12758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	293386391
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251	NC_013972	TTA	2	6	23842	23847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	293386408
252	NC_013972	ACC	2	6	23976	23981	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	293386408
253	NC_013972	ACG	2	6	24206	24211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	293386409
254	NC_013972	GAA	2	6	24212	24217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	293386409
255	NC_013972	GCC	2	6	24262	24267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	293386409
256	NC_013972	TCA	2	6	24397	24402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	293386409
257	NC_013972	TCA	2	6	24974	24979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	293386410
258	NC_013972	GCG	2	6	25015	25020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	293386410
259	NC_013972	GAT	2	6	25140	25145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	293386411
260	NC_013972	GCT	2	6	25154	25159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293386411
261	NC_013972	TGG	2	6	25224	25229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	293386411
262	NC_013972	CTG	2	6	25333	25338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293386411
263	NC_013972	ACA	2	6	25434	25439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	293386411
264	NC_013972	GAA	2	6	25444	25449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	293386411
265	NC_013972	TGC	2	6	25518	25523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293386411
266	NC_013972	CGG	2	6	25532	25537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	293386411
267	NC_013972	AAT	2	6	25655	25660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	293386411
268	NC_013972	ATC	2	6	27944	27949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	293386414
269	NC_013972	TTA	2	6	28011	28016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	293386414
270	NC_013972	GTC	2	6	28039	28044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293386414

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.