MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Erwinia amylovora CFBP1430 plasmid pEA29

Total Repeats: 253

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013957	AGT	2	6	33	38	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291615523
2	NC_013957	CCT	2	6	51	56	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291615523
3	NC_013957	CAG	2	6	123	128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291615523
4	NC_013957	CAG	2	6	333	338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291615523
5	NC_013957	TGA	2	6	339	344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291615523
6	NC_013957	TGC	2	6	780	785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291615523
7	NC_013957	TGA	2	6	956	961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291615523
8	NC_013957	ACC	2	6	1374	1379	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291615524
9	NC_013957	TGC	2	6	1389	1394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291615524
10	NC_013957	CCG	2	6	1459	1464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291615524
11	NC_013957	CGG	2	6	1478	1483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291615524
12	NC_013957	TGA	2	6	1528	1533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291615524
13	NC_013957	GTG	2	6	1565	1570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291615524
14	NC_013957	CAC	2	6	1611	1616	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291615524
15	NC_013957	CGG	2	6	1649	1654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291615524
16	NC_013957	ATT	2	6	1790	1795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	291615525
17	NC_013957	TCA	2	6	2828	2833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291615526
18	NC_013957	GAG	2	6	2856	2861	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291615526
19	NC_013957	CTG	2	6	2895	2900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291615526
20	NC_013957	TCT	2	6	2963	2968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291615526
21	NC_013957	ACT	2	6	3020	3025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291615526
22	NC_013957	CGC	2	6	3947	3952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291615527
23	NC_013957	GCT	2	6	3980	3985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291615527
24	NC_013957	CTT	2	6	4015	4020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291615527
25	NC_013957	TGT	2	6	4027	4032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291615527
26	NC_013957	TAA	2	6	4071	4076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	291615527
27	NC_013957	TCA	2	6	4407	4412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291615528
28	NC_013957	CGG	2	6	5090	5095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291615529
29	NC_013957	GAT	2	6	5114	5119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291615529
30	NC_013957	CTC	2	6	5142	5147	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291615529
31	NC_013957	TGA	2	6	5290	5295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291615529
32	NC_013957	CTG	2	6	5561	5566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291615529
33	NC_013957	CTT	2	6	5582	5587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291615529
34	NC_013957	ATG	2	6	5770	5775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291615530
35	NC_013957	CGG	2	6	5789	5794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291615530
36	NC_013957	CCA	2	6	5849	5854	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291615530
37	NC_013957	CGA	2	6	5856	5861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291615530
38	NC_013957	GCT	2	6	5937	5942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291615530
39	NC_013957	CAG	2	6	5968	5973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291615530
40	NC_013957	ATG	2	6	5992	5997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291615530
41	NC_013957	GCG	2	6	6206	6211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291615530
42	NC_013957	CTG	2	6	6223	6228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291615530
43	NC_013957	GCA	2	6	6288	6293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291615530
44	NC_013957	GGT	2	6	6333	6338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291615530
45	NC_013957	GCC	2	6	6388	6393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291615530
46	NC_013957	GCG	2	6	6424	6429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291615530
47	NC_013957	GCG	2	6	6448	6453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291615530
48	NC_013957	TGC	2	6	6522	6527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291615530
49	NC_013957	GCG	2	6	6604	6609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291615530
50	NC_013957	CGA	2	6	6720	6725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291615530
51	NC_013957	TGC	2	6	6770	6775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291615530
52	NC_013957	GGC	2	6	6778	6783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291615530
53	NC_013957	ACT	2	6	6806	6811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291615530
54	NC_013957	GAT	2	6	6901	6906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291615530
55	NC_013957	CGG	2	6	6951	6956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291615530
56	NC_013957	TGG	2	6	7065	7070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291615530
57	NC_013957	GAA	2	6	7074	7079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291615530
58	NC_013957	CTC	2	6	7182	7187	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291615531
59	NC_013957	CAC	2	6	7317	7322	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291615531
60	NC_013957	CGG	2	6	7446	7451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291615532
61	NC_013957	AGC	2	6	7519	7524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291615532
62	NC_013957	CCA	2	6	7536	7541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291615532
63	NC_013957	AGC	2	6	7543	7548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291615532
64	NC_013957	TGC	2	6	7553	7558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291615532
65	NC_013957	GCA	2	6	7625	7630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291615532
66	NC_013957	CCA	2	6	7704	7709	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291615532
67	NC_013957	GGC	2	6	7768	7773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291615532
68	NC_013957	CGG	2	6	7806	7811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291615532
69	NC_013957	CAA	2	6	7812	7817	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291615532
70	NC_013957	CCG	2	6	7860	7865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291615532
71	NC_013957	TGA	2	6	7914	7919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291615532
72	NC_013957	TGA	2	6	7947	7952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291615532
73	NC_013957	GTT	2	6	8076	8081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291615532
74	NC_013957	TGG	2	6	8085	8090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291615532
75	NC_013957	TTC	2	6	8119	8124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291615532
76	NC_013957	TGC	2	6	8193	8198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291615532
77	NC_013957	CAG	2	6	8251	8256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291615532
78	NC_013957	TGC	2	6	8270	8275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291615532
79	NC_013957	CCA	2	6	8277	8282	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291615532
80	NC_013957	CCT	2	6	8303	8308	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291615532
81	NC_013957	CCT	2	6	8322	8327	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291615532
82	NC_013957	TGC	3	9	8329	8337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291615532
83	NC_013957	GAG	2	6	8425	8430	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291615532
84	NC_013957	ATG	2	6	8435	8440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291615532
85	NC_013957	GAT	2	6	8645	8650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291615532
86	NC_013957	GAC	2	6	8666	8671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291615532
87	NC_013957	ATC	2	6	8786	8791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291615532
88	NC_013957	TCT	2	6	9437	9442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291615533
89	NC_013957	GCT	2	6	9540	9545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291615533
90	NC_013957	GTC	2	6	9623	9628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291615533
91	NC_013957	TGG	2	6	9630	9635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291615533
92	NC_013957	GGC	2	6	10622	10627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291615534
93	NC_013957	TGG	2	6	10768	10773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291615534
94	NC_013957	CTT	2	6	10873	10878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291615534
95	NC_013957	AAG	2	6	10910	10915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291615534
96	NC_013957	GCA	2	6	10934	10939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291615534
97	NC_013957	GAT	2	6	11078	11083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291615534
98	NC_013957	TGA	2	6	11284	11289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291615534
99	NC_013957	ATC	2	6	11629	11634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291615535
100	NC_013957	CGC	2	6	11670	11675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291615535
101	NC_013957	TGC	2	6	11679	11684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291615535
102	NC_013957	GCG	2	6	11715	11720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291615535
103	NC_013957	CGG	2	6	11723	11728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291615535
104	NC_013957	GCC	2	6	11884	11889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291615535
105	NC_013957	CAG	2	6	11970	11975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291615535
106	NC_013957	CGG	2	6	12038	12043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291615535
107	NC_013957	GCC	2	6	12102	12107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291615535
108	NC_013957	CGG	2	6	12215	12220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291615535
109	NC_013957	GCC	2	6	12253	12258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291615535
110	NC_013957	CCA	2	6	12293	12298	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291615535
111	NC_013957	CTC	2	6	12399	12404	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291615535
112	NC_013957	CAT	2	6	12416	12421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291615535
113	NC_013957	GCA	2	6	12445	12450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291615535
114	NC_013957	CAG	2	6	12453	12458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291615535
115	NC_013957	GCA	2	6	12461	12466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291615535
116	NC_013957	TGC	2	6	12523	12528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291615535
117	NC_013957	GCA	2	6	12548	12553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291615535
118	NC_013957	CGC	2	6	12646	12651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291615536
119	NC_013957	CGG	2	6	12743	12748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291615536
120	NC_013957	CAG	2	6	12753	12758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291615536
121	NC_013957	AAT	2	6	12822	12827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	291615536
122	NC_013957	CAG	2	6	12921	12926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291615536
123	NC_013957	AGC	2	6	12943	12948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291615536
124	NC_013957	GGT	2	6	12972	12977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291615536
125	NC_013957	CCA	2	6	13025	13030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291615536
126	NC_013957	CCT	2	6	13133	13138	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291615536
127	NC_013957	CCG	2	6	13154	13159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291615536
128	NC_013957	TAA	2	6	13244	13249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	291615536
129	NC_013957	CGG	2	6	13304	13309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291615536
130	NC_013957	GTT	2	6	13573	13578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291615538
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251	NC_013957	TGC	2	6	25526	25531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291615551
252	NC_013957	CGG	2	6	25540	25545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291615551
253	NC_013957	AAT	2	6	25663	25668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	291615551

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.