MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli O55:H7 str. CB9615 plasmid pO55

Total Repeats: 21

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013942	TCCTCT	2	12	1300	1311	0 %	50 %	0 %	50 %	291285843
2	NC_013942	TCTGGT	2	12	4928	4939	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	291285850
3	NC_013942	TTTATA	2	12	8275	8286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	291285856
4	NC_013942	AACACG	2	12	10550	10561	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	291285860
5	NC_013942	CACCAG	2	12	17114	17125	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	291285870
6	NC_013942	AAATAA	2	12	18349	18360	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	291285873
7	NC_013942	TTTTCC	2	12	20429	20440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291285875
8	NC_013942	ATAAGG	2	12	23245	23256	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	291285877
9	NC_013942	TAGAGG	2	12	24410	24421	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	291285879
10	NC_013942	GTGAAT	2	12	25721	25732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291285881
11	NC_013942	GCAGAG	2	12	33080	33091	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	291285894
12	NC_013942	ATGCTC	2	12	35687	35698	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	291285899
13	NC_013942	TGCTGA	2	12	36875	36886	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	291285901
14	NC_013942	CAATAA	2	12	38694	38705	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	291285903
15	NC_013942	TGACCC	2	12	40682	40693	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	291285907
16	NC_013942	ACCCGC	2	12	44753	44764	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	291285910
17	NC_013942	TGCTCC	2	12	46964	46975	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	291285911
18	NC_013942	CAGGAG	2	12	47623	47634	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	291285912
19	NC_013942	CAATAT	2	12	50083	50094	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	291285915
20	NC_013942	TATCCA	2	12	57213	57224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291285928
21	NC_013942	GTGTCA	2	12	57411	57422	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	291285928

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.