MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Escherichia coli O55:H7 str. CB9615 chromosome

Total Repeats: 96103

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013941	CGG	2	6	353	358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291280825
2	NC_013941	CAGG	2	8	419	426	25 %	0 %	50 %	25 %	291280825
3	NC_013941	CT	3	6	444	449	0 %	50 %	0 %	50 %	291280825
4	NC_013941	ACCA	2	8	465	472	50 %	0 %	0 %	50 %	291280825
5	NC_013941	TGG	2	6	475	480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291280825
6	NC_013941	GAT	2	6	482	487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291280825
7	NC_013941	A	6	6	490	495	100 %	0 %	0 %	0 %	291280825
8	NC_013941	CGC	3	9	569	577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291280825
9	NC_013941	TCG	2	6	613	618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291280825
10	NC_013941	CGCTG	2	10	692	701	0 %	20 %	40 %	40 %	291280825
11	NC_013941	GC	3	6	753	758	0 %	0 %	50 %	50 %	291280825
12	NC_013941	CTG	2	6	795	800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291280825
13	NC_013941	CCG	2	6	848	853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291280825
14	NC_013941	CCG	2	6	907	912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291280825
15	NC_013941	TGG	2	6	931	936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291280825
16	NC_013941	ACT	2	6	958	963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291280825
17	NC_013941	CGG	2	6	967	972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291280825
18	NC_013941	GCTG	2	8	974	981	0 %	25 %	50 %	25 %	291280825
19	NC_013941	TTG	2	6	998	1003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291280825
20	NC_013941	GGAC	2	8	1012	1019	25 %	0 %	50 %	25 %	291280825
21	NC_013941	TA	3	6	1030	1035	50 %	50 %	0 %	0 %	291280825
22	NC_013941	GTT	2	6	1067	1072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291280825
23	NC_013941	TTC	2	6	1126	1131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291280825
24	NC_013941	TGA	2	6	1232	1237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291280825
25	NC_013941	AAT	2	6	1272	1277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	291280825
26	NC_013941	GGC	2	6	1328	1333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291280825
27	NC_013941	GC	3	6	1332	1337	0 %	0 %	50 %	50 %	291280825
28	NC_013941	TGC	2	6	1343	1348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291280825
29	NC_013941	GTG	2	6	1371	1376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291280825
30	NC_013941	ATC	2	6	1388	1393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291280825
31	NC_013941	TG	3	6	1434	1439	0 %	50 %	50 %	0 %	291280825
32	NC_013941	AAG	2	6	1483	1488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291280825
33	NC_013941	GGT	2	6	1535	1540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291280825
34	NC_013941	TCT	2	6	1635	1640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291280825
35	NC_013941	GAT	2	6	1671	1676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291280825
36	NC_013941	TCA	2	6	1700	1705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291280825
37	NC_013941	CTG	2	6	1773	1778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291280825
38	NC_013941	GAA	2	6	1808	1813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291280825
39	NC_013941	GAA	2	6	1902	1907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291280825
40	NC_013941	ATC	2	6	1966	1971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291280825
41	NC_013941	TTG	2	6	1987	1992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291280825
42	NC_013941	CCAG	2	8	2002	2009	25 %	0 %	25 %	50 %	291280825
43	NC_013941	TCG	2	6	2085	2090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291280825
44	NC_013941	TAC	2	6	2097	2102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291280825
45	NC_013941	TGA	2	6	2213	2218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291280825
46	NC_013941	TGA	2	6	2221	2226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291280825
47	NC_013941	GAT	2	6	2349	2354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291280825
48	NC_013941	ATTGAA	2	12	2430	2441	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	291280825
49	NC_013941	TGC	2	6	2446	2451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291280825
50	NC_013941	CGA	2	6	2510	2515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291280825
51	NC_013941	CG	4	8	2525	2532	0 %	0 %	50 %	50 %	291280825
52	NC_013941	TGA	2	6	2546	2551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291280825
53	NC_013941	TGA	2	6	2582	2587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291280825
54	NC_013941	TAT	2	6	2685	2690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	291280825
55	NC_013941	TGC	2	6	2707	2712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291280825
56	NC_013941	GCG	2	6	2863	2868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291280826
57	NC_013941	CAA	2	6	2937	2942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291280826
58	NC_013941	GCAA	2	8	3029	3036	50 %	0 %	25 %	25 %	291280826
59	NC_013941	GGT	2	6	3105	3110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291280826
60	NC_013941	ATGA	2	8	3127	3134	50 %	25 %	25 %	0 %	291280826
61	NC_013941	GCA	2	6	3206	3211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291280826
62	NC_013941	TGG	2	6	3243	3248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291280826
63	NC_013941	TGA	2	6	3257	3262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291280826
64	NC_013941	GAA	2	6	3265	3270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291280826
65	NC_013941	CAT	2	6	3276	3281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291280826
66	NC_013941	CAGC	2	8	3282	3289	25 %	0 %	25 %	50 %	291280826
67	NC_013941	TGA	2	6	3303	3308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291280826
68	NC_013941	CGC	2	6	3385	3390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291280826
69	NC_013941	ATTGC	2	10	3395	3404	20 %	40 %	20 %	20 %	291280826
70	NC_013941	TTCA	2	8	3427	3434	25 %	50 %	0 %	25 %	291280826
71	NC_013941	TGA	2	6	3473	3478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291280826
72	NC_013941	AGCG	2	8	3564	3571	25 %	0 %	50 %	25 %	291280826
73	NC_013941	TCCGGC	2	12	3577	3588	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	291280826
74	NC_013941	TG	3	6	3605	3610	0 %	50 %	50 %	0 %	291280826
75	NC_013941	CGG	2	6	3704	3709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291280826
76	NC_013941	T	6	6	3820	3825	0 %	100 %	0 %	0 %	291280827
77	NC_013941	CTGA	2	8	3850	3857	25 %	25 %	25 %	25 %	291280827
78	NC_013941	TGA	2	6	3861	3866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291280827
79	NC_013941	TGA	2	6	3924	3929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291280827
80	NC_013941	GC	3	6	3960	3965	0 %	0 %	50 %	50 %	291280827
81	NC_013941	CGG	2	6	4059	4064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291280827
82	NC_013941	GGC	2	6	4252	4257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291280827
83	NC_013941	TGA	3	9	4323	4331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291280827
84	NC_013941	CTA	2	6	4404	4409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291280827
85	NC_013941	GC	3	6	4441	4446	0 %	0 %	50 %	50 %	291280827
86	NC_013941	CGG	2	6	4493	4498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291280827
87	NC_013941	CTG	2	6	4501	4506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291280827
88	NC_013941	TGC	2	6	4542	4547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291280827
89	NC_013941	AAC	2	6	4651	4656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291280827
90	NC_013941	GTT	2	6	4674	4679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291280827
91	NC_013941	CCG	2	6	4680	4685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291280827
92	NC_013941	GCC	2	6	4717	4722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291280827
93	NC_013941	GAT	2	6	4726	4731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291280827
94	NC_013941	AG	3	6	4881	4886	50 %	0 %	50 %	0 %	291280827
95	NC_013941	CCG	2	6	4973	4978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291280827
96	NC_013941	TGC	2	6	4983	4988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291280827
97	NC_013941	TGA	3	9	5000	5008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291280827
98	NC_013941	ATC	2	6	5009	5014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291280827
99	NC_013941	TTA	2	6	5361	5366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	291280828
100	NC_013941	TGG	2	6	5398	5403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291280828
101	NC_013941	ACA	2	6	5406	5411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291280828
102	NC_013941	CCG	2	6	5449	5454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291280828
103	NC_013941	CCG	2	6	5458	5463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291280828
104	NC_013941	TCA	2	6	5481	5486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291280828
105	NC_013941	ATC	2	6	5489	5494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291280828
106	NC_013941	CGG	2	6	5496	5501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291280828
107	NC_013941	GCT	2	6	5687	5692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291280829
108	NC_013941	GGA	2	6	5724	5729	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291280829
109	NC_013941	TCA	2	6	5734	5739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291280829
110	NC_013941	AAG	2	6	5740	5745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291280829
111	NC_013941	CAGT	2	8	5765	5772	25 %	25 %	25 %	25 %	291280829
112	NC_013941	AAT	2	6	5799	5804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	291280829
113	NC_013941	TCA	2	6	5813	5818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291280829
114	NC_013941	TTC	2	6	5866	5871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291280829
115	NC_013941	TTC	2	6	5911	5916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291280829
116	NC_013941	CAC	2	6	5958	5963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291280829
117	NC_013941	TGC	2	6	5976	5981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291280829
118	NC_013941	TTG	2	6	5998	6003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291280829
119	NC_013941	TGA	2	6	6005	6010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291280829
120	NC_013941	GCGG	2	8	6098	6105	0 %	0 %	75 %	25 %	291280829
121	NC_013941	AAATCG	2	12	6151	6162	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	291280829
122	NC_013941	AGCG	2	8	6269	6276	25 %	0 %	50 %	25 %	291280829
123	NC_013941	CTG	2	6	6360	6365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291280829
124	NC_013941	GTG	2	6	6400	6405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291280829
125	NC_013941	CAT	2	6	6542	6547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291280830
126	NC_013941	GCC	2	6	6759	6764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291280830
127	NC_013941	GTT	2	6	6813	6818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291280830
128	NC_013941	AGA	2	6	6830	6835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291280830
129	NC_013941	ATC	2	6	7057	7062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291280830
130	NC_013941	CGC	2	6	7101	7106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291280830
131	NC_013941	TGCCGC	2	12	7107	7118	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	291280830
132	NC_013941	CGC	2	6	7203	7208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291280830
133	NC_013941	GCC	2	6	7209	7214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291280830
134	NC_013941	GCCA	2	8	7226	7233	25 %	0 %	25 %	50 %	291280830
135	NC_013941	TTA	2	6	7283	7288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	291280830
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139	NC_013941	CGG	2	6	7700	7705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291280830
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148	NC_013941	CGCAG	2	10	8359	8368	20 %	0 %	40 %	40 %	291280831
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152	NC_013941	CAG	2	6	8438	8443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291280831
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262	NC_013941	GAA	2	6	14542	14547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291280837
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266	NC_013941	GCA	2	6	14789	14794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291280837
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