MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli SE15 plasmid pECSF1

Total Repeats: 186

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013655	CG	3	6	618	623	0 %	0 %	50 %	50 %	281427818
2	NC_013655	TG	3	6	1895	1900	0 %	50 %	50 %	0 %	281427818
3	NC_013655	AC	3	6	2110	2115	50 %	0 %	0 %	50 %	281427819
4	NC_013655	CT	3	6	3457	3462	0 %	50 %	0 %	50 %	281427821
5	NC_013655	GT	4	8	3469	3476	0 %	50 %	50 %	0 %	281427821
6	NC_013655	GT	3	6	3482	3487	0 %	50 %	50 %	0 %	281427821
7	NC_013655	TG	3	6	7548	7553	0 %	50 %	50 %	0 %	281427828
8	NC_013655	GA	3	6	7734	7739	50 %	0 %	50 %	0 %	281427828
9	NC_013655	TA	3	6	7742	7747	50 %	50 %	0 %	0 %	281427828
10	NC_013655	AG	3	6	8066	8071	50 %	0 %	50 %	0 %	281427828
11	NC_013655	CT	3	6	8903	8908	0 %	50 %	0 %	50 %	281427830
12	NC_013655	CT	3	6	9376	9381	0 %	50 %	0 %	50 %	281427832
13	NC_013655	AT	3	6	9588	9593	50 %	50 %	0 %	0 %	281427832
14	NC_013655	GC	3	6	10532	10537	0 %	0 %	50 %	50 %	281427833
15	NC_013655	GC	3	6	11595	11600	0 %	0 %	50 %	50 %	281427834
16	NC_013655	CG	3	6	12290	12295	0 %	0 %	50 %	50 %	281427835
17	NC_013655	GT	3	6	13595	13600	0 %	50 %	50 %	0 %	281427838
18	NC_013655	AT	3	6	14050	14055	50 %	50 %	0 %	0 %	281427840
19	NC_013655	TA	3	6	14145	14150	50 %	50 %	0 %	0 %	281427840
20	NC_013655	CG	3	6	15408	15413	0 %	0 %	50 %	50 %	281427843
21	NC_013655	CA	3	6	15724	15729	50 %	0 %	0 %	50 %	281427843
22	NC_013655	GT	3	6	15844	15849	0 %	50 %	50 %	0 %	281427843
23	NC_013655	GC	3	6	16432	16437	0 %	0 %	50 %	50 %	281427843
24	NC_013655	AG	3	6	16438	16443	50 %	0 %	50 %	0 %	281427843
25	NC_013655	TG	3	6	16701	16706	0 %	50 %	50 %	0 %	281427843
26	NC_013655	CA	3	6	17326	17331	50 %	0 %	0 %	50 %	281427843
27	NC_013655	AG	3	6	17645	17650	50 %	0 %	50 %	0 %	281427843
28	NC_013655	AT	3	6	19815	19820	50 %	50 %	0 %	0 %	281427847
29	NC_013655	AT	3	6	19976	19981	50 %	50 %	0 %	0 %	281427847
30	NC_013655	AC	3	6	20185	20190	50 %	0 %	0 %	50 %	281427848
31	NC_013655	GA	3	6	20242	20247	50 %	0 %	50 %	0 %	281427848
32	NC_013655	CA	3	6	21775	21780	50 %	0 %	0 %	50 %	281427849
33	NC_013655	TA	3	6	23623	23628	50 %	50 %	0 %	0 %	281427852
34	NC_013655	CT	3	6	24229	24234	0 %	50 %	0 %	50 %	281427853
35	NC_013655	TC	3	6	24640	24645	0 %	50 %	0 %	50 %	281427854
36	NC_013655	AC	3	6	25073	25078	50 %	0 %	0 %	50 %	281427855
37	NC_013655	AT	3	6	25379	25384	50 %	50 %	0 %	0 %	281427856
38	NC_013655	AT	4	8	25519	25526	50 %	50 %	0 %	0 %	281427857
39	NC_013655	CA	3	6	25944	25949	50 %	0 %	0 %	50 %	281427858
40	NC_013655	GT	3	6	26876	26881	0 %	50 %	50 %	0 %	281427858
41	NC_013655	TG	3	6	27678	27683	0 %	50 %	50 %	0 %	281427859
42	NC_013655	AC	3	6	27859	27864	50 %	0 %	0 %	50 %	281427859
43	NC_013655	GT	3	6	28492	28497	0 %	50 %	50 %	0 %	281427859
44	NC_013655	CA	3	6	28676	28681	50 %	0 %	0 %	50 %	281427859
45	NC_013655	TA	3	6	30231	30236	50 %	50 %	0 %	0 %	281427860
46	NC_013655	CT	3	6	30258	30263	0 %	50 %	0 %	50 %	281427860
47	NC_013655	TC	3	6	31705	31710	0 %	50 %	0 %	50 %	281427862
48	NC_013655	TG	4	8	31814	31821	0 %	50 %	50 %	0 %	281427862
49	NC_013655	CT	3	6	33343	33348	0 %	50 %	0 %	50 %	281427866
50	NC_013655	AT	3	6	35119	35124	50 %	50 %	0 %	0 %	281427867
51	NC_013655	AC	3	6	35739	35744	50 %	0 %	0 %	50 %	281427867
52	NC_013655	GT	3	6	36078	36083	0 %	50 %	50 %	0 %	281427867
53	NC_013655	CT	4	8	36494	36501	0 %	50 %	0 %	50 %	281427867
54	NC_013655	AC	3	6	37434	37439	50 %	0 %	0 %	50 %	281427868
55	NC_013655	AT	3	6	37561	37566	50 %	50 %	0 %	0 %	281427868
56	NC_013655	AG	3	6	38751	38756	50 %	0 %	50 %	0 %	281427868
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58	NC_013655	GA	3	6	39841	39846	50 %	0 %	50 %	0 %	281427868
59	NC_013655	CA	3	6	39963	39968	50 %	0 %	0 %	50 %	281427868
60	NC_013655	GT	3	6	40841	40846	0 %	50 %	50 %	0 %	281427868
61	NC_013655	GA	3	6	41705	41710	50 %	0 %	50 %	0 %	281427868
62	NC_013655	CT	3	6	43083	43088	0 %	50 %	0 %	50 %	281427870
63	NC_013655	GA	3	6	43483	43488	50 %	0 %	50 %	0 %	281427870
64	NC_013655	GA	3	6	43500	43505	50 %	0 %	50 %	0 %	281427870
65	NC_013655	AG	3	6	43703	43708	50 %	0 %	50 %	0 %	281427870
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71	NC_013655	GA	3	6	46949	46954	50 %	0 %	50 %	0 %	281427876
72	NC_013655	AG	3	6	48784	48789	50 %	0 %	50 %	0 %	281427877
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74	NC_013655	AG	3	6	50832	50837	50 %	0 %	50 %	0 %	281427878
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81	NC_013655	CG	3	6	57332	57337	0 %	0 %	50 %	50 %	281427886
82	NC_013655	GC	3	6	57417	57422	0 %	0 %	50 %	50 %	281427886
83	NC_013655	GC	3	6	57966	57971	0 %	0 %	50 %	50 %	281427886
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104	NC_013655	AT	4	8	69641	69648	50 %	50 %	0 %	0 %	281427902
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111	NC_013655	CT	3	6	72788	72793	0 %	50 %	0 %	50 %	281427905
112	NC_013655	AT	3	6	74729	74734	50 %	50 %	0 %	0 %	281427907
113	NC_013655	CG	3	6	75211	75216	0 %	0 %	50 %	50 %	281427907
114	NC_013655	AC	3	6	75247	75252	50 %	0 %	0 %	50 %	281427907
115	NC_013655	GC	3	6	75419	75424	0 %	0 %	50 %	50 %	281427907
116	NC_013655	CT	3	6	75801	75806	0 %	50 %	0 %	50 %	281427907
117	NC_013655	CG	3	6	76199	76204	0 %	0 %	50 %	50 %	281427907
118	NC_013655	TC	3	6	76278	76283	0 %	50 %	0 %	50 %	281427908
119	NC_013655	AC	3	6	76654	76659	50 %	0 %	0 %	50 %	281427908
120	NC_013655	CA	3	6	77207	77212	50 %	0 %	0 %	50 %	281427908
121	NC_013655	TC	3	6	78232	78237	0 %	50 %	0 %	50 %	281427909
122	NC_013655	CA	3	6	78238	78243	50 %	0 %	0 %	50 %	281427909
123	NC_013655	AT	3	6	78874	78879	50 %	50 %	0 %	0 %	281427911
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126	NC_013655	CA	3	6	80877	80882	50 %	0 %	0 %	50 %	281427912
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.