MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Escherichia coli O111:H- str. 11128 plasmid pO111_2

Total Repeats: 1643

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013370	GCT	2	6	219	224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260871127
2	NC_013370	CTTGAG	2	12	240	251	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	260871127
3	NC_013370	ACGC	2	8	335	342	25 %	0 %	25 %	50 %	260871127
4	NC_013370	CTG	2	6	408	413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260871127
5	NC_013370	AAT	2	6	419	424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260871127
6	NC_013370	ACG	2	6	491	496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260871128
7	NC_013370	CAAAA	2	10	497	506	80 %	0 %	0 %	20 %	260871128
8	NC_013370	GCT	2	6	508	513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260871128
9	NC_013370	AATGAA	2	12	526	537	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	260871128
10	NC_013370	AGA	2	6	570	575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260871128
11	NC_013370	GATA	2	8	636	643	50 %	25 %	25 %	0 %	260871128
12	NC_013370	A	6	6	670	675	100 %	0 %	0 %	0 %	260871128
13	NC_013370	A	7	7	677	683	100 %	0 %	0 %	0 %	260871128
14	NC_013370	AGC	2	6	705	710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260871128
15	NC_013370	GAT	2	6	757	762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260871128
16	NC_013370	ATT	2	6	784	789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260871128
17	NC_013370	ATA	2	6	833	838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260871128
18	NC_013370	TGA	2	6	899	904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260871129
19	NC_013370	GGC	2	6	995	1000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260871129
20	NC_013370	TCG	2	6	1136	1141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260871129
21	NC_013370	GAAAA	2	10	1201	1210	80 %	0 %	20 %	0 %	260871129
22	NC_013370	GTTC	2	8	1272	1279	0 %	50 %	25 %	25 %	260871129
23	NC_013370	TGA	2	6	1532	1537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260871129
24	NC_013370	A	6	6	1568	1573	100 %	0 %	0 %	0 %	260871129
25	NC_013370	CAT	2	6	1588	1593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260871129
26	NC_013370	CCA	2	6	1594	1599	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260871129
27	NC_013370	GATT	2	8	1648	1655	25 %	50 %	25 %	0 %	260871129
28	NC_013370	CCTGG	2	10	1688	1697	0 %	20 %	40 %	40 %	260871129
29	NC_013370	CG	3	6	1724	1729	0 %	0 %	50 %	50 %	260871129
30	NC_013370	TGG	2	6	1775	1780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260871129
31	NC_013370	CTG	2	6	1851	1856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260871129
32	NC_013370	CTGT	2	8	1961	1968	0 %	50 %	25 %	25 %	260871130
33	NC_013370	TGA	2	6	2091	2096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260871130
34	NC_013370	GGA	3	9	2104	2112	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260871130
35	NC_013370	GCGCG	2	10	2114	2123	0 %	0 %	60 %	40 %	260871130
36	NC_013370	GGTAA	2	10	2162	2171	40 %	20 %	40 %	0 %	260871130
37	NC_013370	ATG	2	6	2222	2227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260871130
38	NC_013370	A	7	7	2232	2238	100 %	0 %	0 %	0 %	260871130
39	NC_013370	TAA	2	6	2493	2498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260871131
40	NC_013370	AGC	2	6	2509	2514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260871131
41	NC_013370	TCA	2	6	2581	2586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260871131
42	NC_013370	CTT	2	6	2597	2602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260871131
43	NC_013370	CAA	2	6	2720	2725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260871131
44	NC_013370	CCA	2	6	2801	2806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260871131
45	NC_013370	GCT	2	6	2807	2812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260871131
46	NC_013370	TGG	2	6	2821	2826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260871131
47	NC_013370	CAGC	2	8	2855	2862	25 %	0 %	25 %	50 %	260871131
48	NC_013370	CTC	2	6	3005	3010	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260871131
49	NC_013370	GA	3	6	3027	3032	50 %	0 %	50 %	0 %	260871131
50	NC_013370	GC	3	6	3033	3038	0 %	0 %	50 %	50 %	260871131
51	NC_013370	AGT	2	6	3062	3067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260871131
52	NC_013370	CAA	2	6	3128	3133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260871131
53	NC_013370	ATG	2	6	3150	3155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260871131
54	NC_013370	TCA	2	6	3250	3255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260871131
55	NC_013370	AAC	2	6	3267	3272	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260871131
56	NC_013370	CTGAA	2	10	3288	3297	40 %	20 %	20 %	20 %	260871131
57	NC_013370	TG	3	6	3341	3346	0 %	50 %	50 %	0 %	260871131
58	NC_013370	CCT	2	6	3347	3352	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260871131
59	NC_013370	CAG	2	6	3423	3428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260871131
60	NC_013370	GTT	2	6	3467	3472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260871131
61	NC_013370	AGT	2	6	3485	3490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260871131
62	NC_013370	ATC	2	6	3553	3558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260871131
63	NC_013370	CCT	2	6	3592	3597	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260871132
64	NC_013370	GA	3	6	3632	3637	50 %	0 %	50 %	0 %	260871132
65	NC_013370	GAGC	2	8	3696	3703	25 %	0 %	50 %	25 %	260871132
66	NC_013370	TCT	2	6	3708	3713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260871132
67	NC_013370	CAG	2	6	3900	3905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260871133
68	NC_013370	CCA	2	6	3928	3933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260871133
69	NC_013370	GGAT	2	8	4286	4293	25 %	25 %	50 %	0 %	260871134
70	NC_013370	GCC	2	6	4361	4366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260871134
71	NC_013370	TGG	2	6	4369	4374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260871134
72	NC_013370	CTTTT	2	10	4375	4384	0 %	80 %	0 %	20 %	260871134
73	NC_013370	T	6	6	4381	4386	0 %	100 %	0 %	0 %	260871134
74	NC_013370	GTT	2	6	4417	4422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260871134
75	NC_013370	CTG	2	6	4454	4459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260871134
76	NC_013370	CAA	2	6	4467	4472	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260871134
77	NC_013370	CGC	3	9	4510	4518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260871134
78	NC_013370	GCT	2	6	4533	4538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260871134
79	NC_013370	TGG	2	6	4580	4585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260871134
80	NC_013370	TTA	2	6	4601	4606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260871134
81	NC_013370	TCC	2	6	4748	4753	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260871134
82	NC_013370	A	6	6	4783	4788	100 %	0 %	0 %	0 %	260871134
83	NC_013370	ACA	2	6	4871	4876	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260871134
84	NC_013370	ATG	2	6	5111	5116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260871135
85	NC_013370	TTC	2	6	5128	5133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260871135
86	NC_013370	CGA	2	6	5181	5186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260871135
87	NC_013370	GTA	2	6	5311	5316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260871135
88	NC_013370	TC	3	6	5333	5338	0 %	50 %	0 %	50 %	260871136
89	NC_013370	GTC	2	6	5394	5399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260871136
90	NC_013370	CTT	2	6	5402	5407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260871136
91	NC_013370	GAC	2	6	5543	5548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260871136
92	NC_013370	TAA	2	6	5574	5579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260871136
93	NC_013370	T	6	6	5580	5585	0 %	100 %	0 %	0 %	260871136
94	NC_013370	GAA	2	6	5661	5666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260871136
95	NC_013370	TCT	2	6	5680	5685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260871136
96	NC_013370	AAC	2	6	5695	5700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260871136
97	NC_013370	TTG	2	6	5808	5813	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260871137
98	NC_013370	CCA	2	6	5859	5864	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260871137
99	NC_013370	TTC	2	6	5884	5889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260871137
100	NC_013370	CAGC	2	8	5901	5908	25 %	0 %	25 %	50 %	260871137
101	NC_013370	GCG	2	6	5998	6003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260871137
102	NC_013370	CAT	2	6	6018	6023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260871137
103	NC_013370	CGG	2	6	6032	6037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260871137
104	NC_013370	TGG	2	6	6077	6082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260871137
105	NC_013370	TGA	2	6	6096	6101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260871137
106	NC_013370	CTT	2	6	6107	6112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260871137
107	NC_013370	GGC	2	6	6126	6131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260871137
108	NC_013370	TCC	2	6	6139	6144	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260871137
109	NC_013370	CCA	2	6	6293	6298	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260871137
110	NC_013370	CGT	2	6	6422	6427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260871137
111	NC_013370	TGG	2	6	6464	6469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260871137
112	NC_013370	GCG	2	6	6508	6513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260871137
113	NC_013370	CTG	2	6	6542	6547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260871137
114	NC_013370	CG	3	6	6553	6558	0 %	0 %	50 %	50 %	260871137
115	NC_013370	TGC	2	6	6561	6566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260871137
116	NC_013370	CTGTG	2	10	6621	6630	0 %	40 %	40 %	20 %	260871137
117	NC_013370	TCAG	2	8	6838	6845	25 %	25 %	25 %	25 %	260871137
118	NC_013370	CAT	2	6	6888	6893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260871137
119	NC_013370	GAC	2	6	6916	6921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260871137
120	NC_013370	GC	3	6	6926	6931	0 %	0 %	50 %	50 %	260871137
121	NC_013370	CAA	2	6	6983	6988	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260871137
122	NC_013370	GCT	2	6	7055	7060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260871137
123	NC_013370	ATG	2	6	7087	7092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260871137
124	NC_013370	CCA	2	6	7117	7122	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260871137
125	NC_013370	GC	3	6	7240	7245	0 %	0 %	50 %	50 %	260871137
126	NC_013370	GTA	2	6	7296	7301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260871137
127	NC_013370	ATA	2	6	7330	7335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260871137
128	NC_013370	ACTC	2	8	7340	7347	25 %	25 %	0 %	50 %	260871137
129	NC_013370	TTTA	2	8	7386	7393	25 %	75 %	0 %	0 %	260871137
130	NC_013370	TCC	2	6	7399	7404	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260871137
131	NC_013370	AAT	2	6	7456	7461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260871137
132	NC_013370	GA	3	6	7484	7489	50 %	0 %	50 %	0 %	260871137
133	NC_013370	ACG	2	6	7520	7525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260871137
134	NC_013370	CG	3	6	7524	7529	0 %	0 %	50 %	50 %	260871137
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262	NC_013370	CGCT	2	8	13515	13522	0 %	25 %	25 %	50 %	260871138
263	NC_013370	ATC	2	6	13560	13565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260871138
264	NC_013370	AGC	2	6	13598	13603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260871138
265	NC_013370	ATT	2	6	13606	13611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260871138
266	NC_013370	AGC	2	6	13640	13645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260871138
267	NC_013370	GC	3	6	13661	13666	0 %	0 %	50 %	50 %	260871138
268	NC_013370	CTG	2	6	13704	13709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260871138
269	NC_013370	TAT	2	6	13712	13717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260871138
270	NC_013370	GGC	2	6	13811	13816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260871138
271	NC_013370	CCT	2	6	13838	13843	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260871138
272	NC_013370	CGG	2	6	13865	13870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260871138
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274	NC_013370	GC	3	6	13916	13921	0 %	0 %	50 %	50 %	260871138
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278	NC_013370	CAA	2	6	14058	14063	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260871138
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281	NC_013370	GAAC	2	8	14228	14235	50 %	0 %	25 %	25 %	260871138
282	NC_013370	GAC	2	6	14253	14258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260871138
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285	NC_013370	ACGGTC	2	12	14507	14518	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	260871139
286	NC_013370	TGG	2	6	14567	14572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260871139
287	NC_013370	GAC	2	6	14632	14637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260871139
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292	NC_013370	ACC	2	6	14770	14775	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260871139
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299	NC_013370	AGG	2	6	15278	15283	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260871139
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383	NC_013370	CTTC	2	8	20106	20113	0 %	50 %	0 %	50 %	260871147
384	NC_013370	TGG	2	6	20263	20268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260871147
385	NC_013370	T	6	6	20279	20284	0 %	100 %	0 %	0 %	260871147
386	NC_013370	GGA	2	6	20323	20328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260871147
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388	NC_013370	T	6	6	20386	20391	0 %	100 %	0 %	0 %	260871147
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496	NC_013370	TTGTA	2	10	26857	26866	20 %	60 %	20 %	0 %	260871155
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499	NC_013370	CAGT	2	8	27000	27007	25 %	25 %	25 %	25 %	260871156
500	NC_013370	TCC	2	6	27020	27025	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260871156

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