MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Escherichia coli O111:H- str. 11128 plasmid pO111_2

Total Repeats: 1643

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_013370	AG	3	6	90889	90894	50 %	0 %	50 %	0 %	260871238
1502	NC_013370	GAT	2	6	90963	90968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260871238
1503	NC_013370	GAT	3	9	91029	91037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260871238
1504	NC_013370	GATA	2	8	91073	91080	50 %	25 %	25 %	0 %	260871238
1505	NC_013370	CG	4	8	91100	91107	0 %	0 %	50 %	50 %	260871238
1506	NC_013370	CTT	2	6	91149	91154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260871238
1507	NC_013370	GAT	2	6	91245	91250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260871238
1508	NC_013370	AAAG	2	8	91356	91363	75 %	0 %	25 %	0 %	260871238
1509	NC_013370	ACGA	2	8	91423	91430	50 %	0 %	25 %	25 %	260871238
1510	NC_013370	AGC	2	6	91460	91465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260871238
1511	NC_013370	TGG	2	6	91484	91489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260871238
1512	NC_013370	GAT	2	6	91554	91559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260871238
1513	NC_013370	GCC	2	6	91626	91631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260871238
1514	NC_013370	GCC	2	6	91633	91638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260871238
1515	NC_013370	AGA	2	6	91673	91678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260871238
1516	NC_013370	TCG	2	6	91690	91695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260871238
1517	NC_013370	GGT	2	6	91701	91706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260871238
1518	NC_013370	GAG	2	6	91773	91778	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260871238
1519	NC_013370	GAA	2	6	91785	91790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260871238
1520	NC_013370	GAT	3	9	91812	91820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260871238
1521	NC_013370	TGG	2	6	91863	91868	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260871239
1522	NC_013370	TGT	2	6	91905	91910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260871239
1523	NC_013370	GCA	2	6	91930	91935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260871239
1524	NC_013370	GCA	2	6	91957	91962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260871239
1525	NC_013370	TCA	2	6	92040	92045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260871239
1526	NC_013370	CTG	2	6	92139	92144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260871239
1527	NC_013370	T	7	7	92194	92200	0 %	100 %	0 %	0 %	260871239
1528	NC_013370	GAG	2	6	92258	92263	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260871239
1529	NC_013370	ATC	2	6	92286	92291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260871239
1530	NC_013370	ATC	2	6	92300	92305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260871239
1531	NC_013370	GTGA	2	8	92321	92328	25 %	25 %	50 %	0 %	260871239
1532	NC_013370	CTT	2	6	92384	92389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260871239
1533	NC_013370	CAC	2	6	92429	92434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260871239
1534	NC_013370	ATA	2	6	92480	92485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260871239
1535	NC_013370	GAA	2	6	92495	92500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260871239
1536	NC_013370	GTG	2	6	92586	92591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260871239
1537	NC_013370	TCT	2	6	92617	92622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260871239
1538	NC_013370	TGA	2	6	92629	92634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260871239
1539	NC_013370	TGG	2	6	92707	92712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260871239
1540	NC_013370	TTA	2	6	92733	92738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260871239
1541	NC_013370	ATG	2	6	92744	92749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260871239
1542	NC_013370	GCC	2	6	92828	92833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260871239
1543	NC_013370	GATGGC	2	12	92888	92899	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	260871239
1544	NC_013370	CTGAT	2	10	92916	92925	20 %	40 %	20 %	20 %	260871239
1545	NC_013370	GC	3	6	93013	93018	0 %	0 %	50 %	50 %	260871239
1546	NC_013370	GGC	2	6	93034	93039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260871239
1547	NC_013370	GAA	2	6	93163	93168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260871239
1548	NC_013370	A	6	6	93167	93172	100 %	0 %	0 %	0 %	260871239
1549	NC_013370	TGA	2	6	93277	93282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260871239
1550	NC_013370	AATG	2	8	93299	93306	50 %	25 %	25 %	0 %	260871239
1551	NC_013370	TAA	2	6	93318	93323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260871240
1552	NC_013370	T	6	6	93330	93335	0 %	100 %	0 %	0 %	260871240
1553	NC_013370	CGC	2	6	93461	93466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260871240
1554	NC_013370	T	7	7	93474	93480	0 %	100 %	0 %	0 %	260871240
1555	NC_013370	TGG	2	6	93509	93514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260871240
1556	NC_013370	TCT	2	6	93602	93607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260871240
1557	NC_013370	GGT	2	6	93610	93615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260871240
1558	NC_013370	AGG	2	6	93632	93637	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260871240
1559	NC_013370	CTA	2	6	93650	93655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260871240
1560	NC_013370	AGA	2	6	93738	93743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260871240
1561	NC_013370	GCTC	2	8	93748	93755	0 %	25 %	25 %	50 %	260871240
1562	NC_013370	TC	3	6	93814	93819	0 %	50 %	0 %	50 %	260871240
1563	NC_013370	AGG	2	6	93854	93859	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260871240
1564	NC_013370	ATC	2	6	93925	93930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260871241
1565	NC_013370	ATA	2	6	93946	93951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260871241
1566	NC_013370	GGA	2	6	93971	93976	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260871241
1567	NC_013370	TCG	2	6	94000	94005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260871241
1568	NC_013370	CCAC	2	8	94020	94027	25 %	0 %	0 %	75 %	260871241
1569	NC_013370	CTT	2	6	94170	94175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260871241
1570	NC_013370	GATG	2	8	94227	94234	25 %	25 %	50 %	0 %	260871241
1571	NC_013370	GACG	2	8	94241	94248	25 %	0 %	50 %	25 %	260871241
1572	NC_013370	GTAA	2	8	94387	94394	50 %	25 %	25 %	0 %	260871241
1573	NC_013370	CCAC	2	8	94401	94408	25 %	0 %	0 %	75 %	260871241
1574	NC_013370	TTCC	2	8	94566	94573	0 %	50 %	0 %	50 %	260871241
1575	NC_013370	AAC	2	6	94577	94582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260871241
1576	NC_013370	TGA	2	6	94613	94618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260871241
1577	NC_013370	TC	4	8	94641	94648	0 %	50 %	0 %	50 %	260871241
1578	NC_013370	GTC	2	6	94657	94662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260871241
1579	NC_013370	TGC	2	6	94664	94669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260871241
1580	NC_013370	GAT	2	6	94692	94697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260871241
1581	NC_013370	CAG	2	6	94789	94794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260871241
1582	NC_013370	CAT	2	6	94798	94803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260871241
1583	NC_013370	T	6	6	94803	94808	0 %	100 %	0 %	0 %	260871241
1584	NC_013370	GCG	2	6	94872	94877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260871242
1585	NC_013370	CCA	2	6	94936	94941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260871242
1586	NC_013370	GCC	2	6	95032	95037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260871242
1587	NC_013370	GAT	2	6	95206	95211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260871243
1588	NC_013370	CA	3	6	95228	95233	50 %	0 %	0 %	50 %	260871243
1589	NC_013370	ACT	2	6	95274	95279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260871243
1590	NC_013370	AAC	2	6	95292	95297	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260871243
1591	NC_013370	TGT	2	6	95337	95342	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260871243
1592	NC_013370	AGG	2	6	95412	95417	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260871243
1593	NC_013370	CA	3	6	95418	95423	50 %	0 %	0 %	50 %	260871243
1594	NC_013370	A	6	6	95451	95456	100 %	0 %	0 %	0 %	260871243
1595	NC_013370	TTCAG	2	10	95467	95476	20 %	40 %	20 %	20 %	260871243
1596	NC_013370	TGG	2	6	95487	95492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260871243
1597	NC_013370	TGA	2	6	95509	95514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260871243
1598	NC_013370	ATC	2	6	95607	95612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260871243
1599	NC_013370	TTG	2	6	95631	95636	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260871243
1600	NC_013370	ACT	2	6	95703	95708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260871243
1601	NC_013370	CTCA	2	8	95734	95741	25 %	25 %	0 %	50 %	260871243
1602	NC_013370	CCA	2	6	95941	95946	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260871243
1603	NC_013370	CAG	2	6	95954	95959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260871243
1604	NC_013370	TGG	2	6	95961	95966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260871243
1605	NC_013370	CCG	2	6	95967	95972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260871243
1606	NC_013370	GTT	2	6	96041	96046	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260871243
1607	NC_013370	CAG	2	6	96131	96136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260871243
1608	NC_013370	GTG	2	6	96170	96175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260871243
1609	NC_013370	GAT	2	6	96179	96184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260871243
1610	NC_013370	CAG	2	6	96233	96238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260871243
1611	NC_013370	GGC	2	6	96283	96288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260871243
1612	NC_013370	AAT	2	6	96291	96296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260871243
1613	NC_013370	GC	3	6	96333	96338	0 %	0 %	50 %	50 %	260871244
1614	NC_013370	CTT	2	6	96367	96372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260871244
1615	NC_013370	GC	3	6	96385	96390	0 %	0 %	50 %	50 %	260871244
1616	NC_013370	T	7	7	96442	96448	0 %	100 %	0 %	0 %	260871244
1617	NC_013370	AT	3	6	96472	96477	50 %	50 %	0 %	0 %	260871244
1618	NC_013370	GAT	2	6	96502	96507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260871244
1619	NC_013370	TGA	3	9	96558	96566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260871244
1620	NC_013370	AC	3	6	96597	96602	50 %	0 %	0 %	50 %	260871244
1621	NC_013370	CA	3	6	96603	96608	50 %	0 %	0 %	50 %	260871244
1622	NC_013370	TAAC	2	8	96620	96627	50 %	25 %	0 %	25 %	260871244
1623	NC_013370	CAT	2	6	96636	96641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260871244
1624	NC_013370	GCA	2	6	96675	96680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260871244
1625	NC_013370	TCC	2	6	96722	96727	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260871244
1626	NC_013370	TTG	2	6	96750	96755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260871244
1627	NC_013370	ATCA	2	8	96826	96833	50 %	25 %	0 %	25 %	260871244
1628	NC_013370	AAT	2	6	96838	96843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260871244
1629	NC_013370	TCTG	2	8	96878	96885	0 %	50 %	25 %	25 %	260871244
1630	NC_013370	GAC	2	6	97062	97067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260871244
1631	NC_013370	GGC	2	6	97075	97080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260871244
1632	NC_013370	T	7	7	97108	97114	0 %	100 %	0 %	0 %	260871244
1633	NC_013370	GTT	2	6	97152	97157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260871244
1634	NC_013370	CTGG	2	8	97301	97308	0 %	25 %	50 %	25 %	260871245
1635	NC_013370	ATC	2	6	97344	97349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260871245
1636	NC_013370	GTC	2	6	97353	97358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260871245
1637	NC_013370	AGT	2	6	97394	97399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260871245
1638	NC_013370	CGT	2	6	97469	97474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260871245
1639	NC_013370	TGGT	2	8	97478	97485	0 %	50 %	50 %	0 %	260871245
1640	NC_013370	TGAA	2	8	97486	97493	50 %	25 %	25 %	0 %	260871245
1641	NC_013370	ACA	2	6	97520	97525	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260871246
1642	NC_013370	AAC	2	6	97581	97586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260871247
1643	NC_013370	TG	3	6	97594	97599	0 %	50 %	50 %	0 %	260871247

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.