MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Escherichia coli O111:H- str. 11128 plasmid pO111_2

Total Repeats: 1643

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013370	T	6	6	27095	27100	0 %	100 %	0 %	0 %	260871156
502	NC_013370	TTC	2	6	27103	27108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260871156
503	NC_013370	TCCGGA	2	12	27114	27125	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	260871156
504	NC_013370	TTCTGC	2	12	27133	27144	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	260871156
505	NC_013370	AAAT	2	8	27234	27241	75 %	25 %	0 %	0 %	260871156
506	NC_013370	TCA	2	6	27311	27316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260871156
507	NC_013370	AGCC	2	8	27336	27343	25 %	0 %	25 %	50 %	260871156
508	NC_013370	GCAG	2	8	27377	27384	25 %	0 %	50 %	25 %	260871156
509	NC_013370	T	6	6	27529	27534	0 %	100 %	0 %	0 %	260871157
510	NC_013370	TTC	2	6	27543	27548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260871157
511	NC_013370	GT	3	6	27574	27579	0 %	50 %	50 %	0 %	260871157
512	NC_013370	AAT	2	6	27591	27596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260871157
513	NC_013370	AT	3	6	27646	27651	50 %	50 %	0 %	0 %	260871157
514	NC_013370	TG	3	6	27758	27763	0 %	50 %	50 %	0 %	260871157
515	NC_013370	ACG	2	6	27836	27841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260871157
516	NC_013370	GCGCTG	2	12	27874	27885	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	260871157
517	NC_013370	TGG	2	6	28113	28118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260871157
518	NC_013370	GAA	2	6	28177	28182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260871157
519	NC_013370	ACC	2	6	28194	28199	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260871157
520	NC_013370	AGC	2	6	28371	28376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260871157
521	NC_013370	CGC	2	6	28573	28578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260871157
522	NC_013370	CAG	2	6	28646	28651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260871157
523	NC_013370	TTG	2	6	28702	28707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260871157
524	NC_013370	TCG	2	6	28853	28858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260871157
525	NC_013370	CGAC	2	8	29029	29036	25 %	0 %	25 %	50 %	260871157
526	NC_013370	AGTC	2	8	29045	29052	25 %	25 %	25 %	25 %	260871157
527	NC_013370	ATTT	2	8	29087	29094	25 %	75 %	0 %	0 %	260871157
528	NC_013370	TGCC	2	8	29147	29154	0 %	25 %	25 %	50 %	260871157
529	NC_013370	TTG	2	6	29168	29173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260871157
530	NC_013370	TGC	2	6	29199	29204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260871157
531	NC_013370	TGA	2	6	29238	29243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260871157
532	NC_013370	ACCA	2	8	29244	29251	50 %	0 %	0 %	50 %	260871157
533	NC_013370	TTG	2	6	29383	29388	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260871157
534	NC_013370	GCA	2	6	29422	29427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260871157
535	NC_013370	GCC	2	6	29635	29640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260871157
536	NC_013370	TCGCTG	2	12	29647	29658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260871157
537	NC_013370	TACT	2	8	29719	29726	25 %	50 %	0 %	25 %	260871157
538	NC_013370	T	6	6	29745	29750	0 %	100 %	0 %	0 %	260871157
539	NC_013370	GCA	2	6	29767	29772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260871157
540	NC_013370	ATCA	2	8	29844	29851	50 %	25 %	0 %	25 %	260871157
541	NC_013370	CAG	2	6	29876	29881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260871157
542	NC_013370	ACAA	2	8	29895	29902	75 %	0 %	0 %	25 %	260871157
543	NC_013370	AGG	2	6	30007	30012	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260871157
544	NC_013370	CGC	2	6	30120	30125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260871157
545	NC_013370	TCCA	2	8	30141	30148	25 %	25 %	0 %	50 %	260871157
546	NC_013370	CAA	2	6	30215	30220	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260871157
547	NC_013370	GTAA	2	8	30309	30316	50 %	25 %	25 %	0 %	260871157
548	NC_013370	AAC	2	6	30324	30329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260871157
549	NC_013370	TCAT	2	8	30337	30344	25 %	50 %	0 %	25 %	260871157
550	NC_013370	AAT	2	6	30431	30436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260871158
551	NC_013370	AAC	2	6	30464	30469	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260871158
552	NC_013370	GC	3	6	30726	30731	0 %	0 %	50 %	50 %	260871158
553	NC_013370	CAA	2	6	30749	30754	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260871158
554	NC_013370	TTG	2	6	30772	30777	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260871158
555	NC_013370	CAA	2	6	30887	30892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260871159
556	NC_013370	ATC	2	6	30893	30898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260871159
557	NC_013370	CCA	2	6	30942	30947	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260871159
558	NC_013370	CAG	2	6	31017	31022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260871159
559	NC_013370	ACA	2	6	31080	31085	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260871159
560	NC_013370	TCT	2	6	31170	31175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260871159
561	NC_013370	ATC	2	6	31245	31250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260871159
562	NC_013370	GCC	2	6	31283	31288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260871159
563	NC_013370	AT	3	6	31358	31363	50 %	50 %	0 %	0 %	260871159
564	NC_013370	TCA	2	6	31446	31451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260871159
565	NC_013370	TGT	2	6	31458	31463	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260871159
566	NC_013370	AAC	2	6	31464	31469	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260871159
567	NC_013370	CGGAA	2	10	31472	31481	40 %	0 %	40 %	20 %	260871159
568	NC_013370	TCC	2	6	31542	31547	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260871159
569	NC_013370	CAA	2	6	31600	31605	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260871159
570	NC_013370	CAT	2	6	31613	31618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260871159
571	NC_013370	TTA	2	6	31683	31688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260871159
572	NC_013370	CTC	3	9	31708	31716	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260871160
573	NC_013370	T	6	6	31852	31857	0 %	100 %	0 %	0 %	260871160
574	NC_013370	AAAG	2	8	31894	31901	75 %	0 %	25 %	0 %	260871160
575	NC_013370	TCCG	2	8	31980	31987	0 %	25 %	25 %	50 %	260871160
576	NC_013370	CTT	2	6	32059	32064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260871160
577	NC_013370	TTC	2	6	32083	32088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260871160
578	NC_013370	AAAT	2	8	32124	32131	75 %	25 %	0 %	0 %	260871160
579	NC_013370	ATC	2	6	32266	32271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260871160
580	NC_013370	GTT	2	6	32312	32317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260871160
581	NC_013370	GTC	2	6	32615	32620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260871160
582	NC_013370	CAG	2	6	32646	32651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260871160
583	NC_013370	CCT	2	6	32712	32717	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260871160
584	NC_013370	TACCG	2	10	32740	32749	20 %	20 %	20 %	40 %	260871160
585	NC_013370	CAAC	2	8	32757	32764	50 %	0 %	0 %	50 %	260871160
586	NC_013370	GTC	2	6	32797	32802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260871160
587	NC_013370	ATC	2	6	32867	32872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260871160
588	NC_013370	AGA	2	6	32932	32937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260871160
589	NC_013370	CGC	2	6	32939	32944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260871160
590	NC_013370	CAGC	2	8	32967	32974	25 %	0 %	25 %	50 %	260871160
591	NC_013370	TAA	2	6	33015	33020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260871160
592	NC_013370	GAAT	2	8	33067	33074	50 %	25 %	25 %	0 %	260871160
593	NC_013370	TAG	2	6	33117	33122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260871160
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595	NC_013370	CAC	2	6	33141	33146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260871161
596	NC_013370	TG	3	6	33151	33156	0 %	50 %	50 %	0 %	260871161
597	NC_013370	CCT	3	9	33413	33421	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260871161
598	NC_013370	TTG	2	6	33481	33486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260871161
599	NC_013370	ATCA	2	8	33490	33497	50 %	25 %	0 %	25 %	260871161
600	NC_013370	TCAT	2	8	33510	33517	25 %	50 %	0 %	25 %	260871162
601	NC_013370	ATC	2	6	33524	33529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260871162
602	NC_013370	GCAA	2	8	33633	33640	50 %	0 %	25 %	25 %	260871162
603	NC_013370	TAT	2	6	33691	33696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260871162
604	NC_013370	TAA	2	6	33742	33747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260871162
605	NC_013370	GGTT	2	8	33773	33780	0 %	50 %	50 %	0 %	260871162
606	NC_013370	GGC	2	6	33794	33799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260871162
607	NC_013370	GTC	2	6	33801	33806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260871162
608	NC_013370	ATT	2	6	33836	33841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260871162
609	NC_013370	GTT	2	6	33926	33931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260871162
610	NC_013370	GCT	2	6	33987	33992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260871162
611	NC_013370	TTC	2	6	34019	34024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260871162
612	NC_013370	TTG	2	6	34074	34079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260871162
613	NC_013370	CAC	2	6	34261	34266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260871162
614	NC_013370	T	6	6	34340	34345	0 %	100 %	0 %	0 %	260871162
615	NC_013370	TTA	2	6	34350	34355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260871162
616	NC_013370	GCTT	2	8	34410	34417	0 %	50 %	25 %	25 %	260871162
617	NC_013370	ACC	2	6	34565	34570	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260871162
618	NC_013370	GCA	2	6	34581	34586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260871162
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620	NC_013370	CAG	2	6	34726	34731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260871162
621	NC_013370	GGT	2	6	34757	34762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260871162
622	NC_013370	CGA	2	6	34769	34774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260871162
623	NC_013370	TGA	2	6	34775	34780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260871162
624	NC_013370	TGG	2	6	34983	34988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260871162
625	NC_013370	GCC	2	6	35157	35162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260871162
626	NC_013370	AAG	2	6	35250	35255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260871162
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628	NC_013370	ATC	2	6	35342	35347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260871162
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