MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli O111:H- str. 11128 plasmid pO111_3

Total Repeats: 112

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013366	CT	3	6	131	136	0 %	50 %	0 %	50 %	260751836
2	NC_013366	AT	3	6	204	209	50 %	50 %	0 %	0 %	260751836
3	NC_013366	TA	3	6	305	310	50 %	50 %	0 %	0 %	260751836
4	NC_013366	TC	3	6	910	915	0 %	50 %	0 %	50 %	260751837
5	NC_013366	AT	3	6	1342	1347	50 %	50 %	0 %	0 %	260751837
6	NC_013366	CT	3	6	1840	1845	0 %	50 %	0 %	50 %	260751837
7	NC_013366	AT	3	6	1981	1986	50 %	50 %	0 %	0 %	260751837
8	NC_013366	AT	3	6	2173	2178	50 %	50 %	0 %	0 %	260751837
9	NC_013366	TA	3	6	2462	2467	50 %	50 %	0 %	0 %	260751837
10	NC_013366	AT	3	6	2682	2687	50 %	50 %	0 %	0 %	260751837
11	NC_013366	TA	3	6	2765	2770	50 %	50 %	0 %	0 %	260751837
12	NC_013366	AG	3	6	3114	3119	50 %	0 %	50 %	0 %	260751837
13	NC_013366	GA	3	6	3276	3281	50 %	0 %	50 %	0 %	260751837
14	NC_013366	TA	3	6	3326	3331	50 %	50 %	0 %	0 %	260751837
15	NC_013366	TA	3	6	3453	3458	50 %	50 %	0 %	0 %	260751837
16	NC_013366	CA	3	6	3481	3486	50 %	0 %	0 %	50 %	260751837
17	NC_013366	CA	4	8	3672	3679	50 %	0 %	0 %	50 %	260751838
18	NC_013366	TA	3	6	3813	3818	50 %	50 %	0 %	0 %	260751838
19	NC_013366	TC	3	6	4210	4215	0 %	50 %	0 %	50 %	260751838
20	NC_013366	GA	3	6	4309	4314	50 %	0 %	50 %	0 %	260751838
21	NC_013366	GA	3	6	4771	4776	50 %	0 %	50 %	0 %	260751838
22	NC_013366	TA	3	6	5118	5123	50 %	50 %	0 %	0 %	260751838
23	NC_013366	CA	3	6	5545	5550	50 %	0 %	0 %	50 %	260751838
24	NC_013366	CA	3	6	5618	5623	50 %	0 %	0 %	50 %	260751838
25	NC_013366	CA	3	6	5766	5771	50 %	0 %	0 %	50 %	260751839
26	NC_013366	GA	3	6	5786	5791	50 %	0 %	50 %	0 %	260751839
27	NC_013366	CT	3	6	7491	7496	0 %	50 %	0 %	50 %	260751840
28	NC_013366	CT	3	6	9255	9260	0 %	50 %	0 %	50 %	260751841
29	NC_013366	CT	3	6	10057	10062	0 %	50 %	0 %	50 %	260751842
30	NC_013366	AT	3	6	11467	11472	50 %	50 %	0 %	0 %	260751844
31	NC_013366	TG	3	6	11508	11513	0 %	50 %	50 %	0 %	260751844
32	NC_013366	AG	3	6	13131	13136	50 %	0 %	50 %	0 %	260751847
33	NC_013366	GC	3	6	13145	13150	0 %	0 %	50 %	50 %	260751847
34	NC_013366	TG	3	6	13218	13223	0 %	50 %	50 %	0 %	260751847
35	NC_013366	GC	3	6	14103	14108	0 %	0 %	50 %	50 %	260751848
36	NC_013366	CG	3	6	15325	15330	0 %	0 %	50 %	50 %	260751849
37	NC_013366	TG	3	6	15457	15462	0 %	50 %	50 %	0 %	260751850
38	NC_013366	TG	3	6	16332	16337	0 %	50 %	50 %	0 %	260751851
39	NC_013366	TG	3	6	16619	16624	0 %	50 %	50 %	0 %	260751851
40	NC_013366	TG	3	6	16917	16922	0 %	50 %	50 %	0 %	260751851
41	NC_013366	CA	3	6	18061	18066	50 %	0 %	0 %	50 %	260751854
42	NC_013366	TC	4	8	18259	18266	0 %	50 %	0 %	50 %	260751854
43	NC_013366	GT	4	8	18973	18980	0 %	50 %	50 %	0 %	260751855
44	NC_013366	TC	3	6	19274	19279	0 %	50 %	0 %	50 %	260751855
45	NC_013366	AG	3	6	19746	19751	50 %	0 %	50 %	0 %	260751855
46	NC_013366	TA	3	6	20817	20822	50 %	50 %	0 %	0 %	260751855
47	NC_013366	GA	3	6	21974	21979	50 %	0 %	50 %	0 %	260751855
48	NC_013366	AT	3	6	22902	22907	50 %	50 %	0 %	0 %	260751856
49	NC_013366	GC	3	6	23239	23244	0 %	0 %	50 %	50 %	260751856
50	NC_013366	TC	4	8	23343	23350	0 %	50 %	0 %	50 %	260751856
51	NC_013366	CA	3	6	23680	23685	50 %	0 %	0 %	50 %	260751857
52	NC_013366	AT	3	6	24389	24394	50 %	50 %	0 %	0 %	260751858
53	NC_013366	AG	4	8	25586	25593	50 %	0 %	50 %	0 %	260751860
54	NC_013366	CT	3	6	26838	26843	0 %	50 %	0 %	50 %	260751861
55	NC_013366	AC	3	6	26881	26886	50 %	0 %	0 %	50 %	260751861
56	NC_013366	GA	3	6	27068	27073	50 %	0 %	50 %	0 %	260751861
57	NC_013366	TG	3	6	29261	29266	0 %	50 %	50 %	0 %	260751863
58	NC_013366	TG	3	6	29548	29553	0 %	50 %	50 %	0 %	260751863
59	NC_013366	TG	3	6	29846	29851	0 %	50 %	50 %	0 %	260751863
60	NC_013366	CG	3	6	35036	35041	0 %	0 %	50 %	50 %	260751869
61	NC_013366	GC	3	6	36131	36136	0 %	0 %	50 %	50 %	260751871
62	NC_013366	AG	3	6	36724	36729	50 %	0 %	50 %	0 %	260751872
63	NC_013366	CG	3	6	37400	37405	0 %	0 %	50 %	50 %	260751873
64	NC_013366	TG	3	6	37955	37960	0 %	50 %	50 %	0 %	260751873
65	NC_013366	TG	3	6	38677	38682	0 %	50 %	50 %	0 %	260751873
66	NC_013366	AC	3	6	38892	38897	50 %	0 %	0 %	50 %	260751874
67	NC_013366	TC	3	6	39043	39048	0 %	50 %	0 %	50 %	260751874
68	NC_013366	AG	3	6	39875	39880	50 %	0 %	50 %	0 %	260751875
69	NC_013366	TG	3	6	40103	40108	0 %	50 %	50 %	0 %	260751876
70	NC_013366	GT	4	8	40255	40262	0 %	50 %	50 %	0 %	260751877
71	NC_013366	GT	3	6	40268	40273	0 %	50 %	50 %	0 %	260751877
72	NC_013366	TC	3	6	44019	44024	0 %	50 %	0 %	50 %	260751881
73	NC_013366	AG	3	6	44521	44526	50 %	0 %	50 %	0 %	260751882
74	NC_013366	TA	3	6	44818	44823	50 %	50 %	0 %	0 %	260751882
75	NC_013366	CT	3	6	46329	46334	0 %	50 %	0 %	50 %	260751886
76	NC_013366	AT	3	6	46541	46546	50 %	50 %	0 %	0 %	260751886
77	NC_013366	GC	3	6	47485	47490	0 %	0 %	50 %	50 %	260751887
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79	NC_013366	GC	3	6	48548	48553	0 %	0 %	50 %	50 %	260751888
80	NC_013366	CG	3	6	49243	49248	0 %	0 %	50 %	50 %	260751889
81	NC_013366	AC	3	6	50892	50897	50 %	0 %	0 %	50 %	260751890
82	NC_013366	TC	4	8	52155	52162	0 %	50 %	0 %	50 %	260751891
83	NC_013366	CT	3	6	54408	54413	0 %	50 %	0 %	50 %	260751893
84	NC_013366	AT	3	6	54547	54552	50 %	50 %	0 %	0 %	260751893
85	NC_013366	AT	3	6	54683	54688	50 %	50 %	0 %	0 %	260751893
86	NC_013366	TC	3	6	54812	54817	0 %	50 %	0 %	50 %	260751893
87	NC_013366	AT	3	6	56160	56165	50 %	50 %	0 %	0 %	260751895
88	NC_013366	AC	3	6	56780	56785	50 %	0 %	0 %	50 %	260751895
89	NC_013366	GT	3	6	57119	57124	0 %	50 %	50 %	0 %	260751895
90	NC_013366	AC	3	6	58484	58489	50 %	0 %	0 %	50 %	260751896
91	NC_013366	AG	3	6	59801	59806	50 %	0 %	50 %	0 %	260751896
92	NC_013366	CA	3	6	60392	60397	50 %	0 %	0 %	50 %	260751896
93	NC_013366	GA	3	6	60891	60896	50 %	0 %	50 %	0 %	260751896
94	NC_013366	CA	3	6	61013	61018	50 %	0 %	0 %	50 %	260751896
95	NC_013366	CT	3	6	64133	64138	0 %	50 %	0 %	50 %	260751898
96	NC_013366	AG	3	6	64753	64758	50 %	0 %	50 %	0 %	260751898
97	NC_013366	AC	3	6	65346	65351	50 %	0 %	0 %	50 %	260751899
98	NC_013366	TG	3	6	65475	65480	0 %	50 %	50 %	0 %	260751899
99	NC_013366	AG	3	6	65982	65987	50 %	0 %	50 %	0 %	260751900
100	NC_013366	AG	3	6	66784	66789	50 %	0 %	50 %	0 %	260751901
101	NC_013366	TC	3	6	69210	69215	0 %	50 %	0 %	50 %	260751902
102	NC_013366	AC	3	6	69238	69243	50 %	0 %	0 %	50 %	260751902
103	NC_013366	TC	3	6	70491	70496	0 %	50 %	0 %	50 %	260751903
104	NC_013366	AT	3	6	70756	70761	50 %	50 %	0 %	0 %	260751903
105	NC_013366	TA	3	6	70802	70807	50 %	50 %	0 %	0 %	260751903
106	NC_013366	CT	3	6	70863	70868	0 %	50 %	0 %	50 %	260751903
107	NC_013366	GA	3	6	70904	70909	50 %	0 %	50 %	0 %	260751903
108	NC_013366	CA	3	6	72011	72016	50 %	0 %	0 %	50 %	260751904
109	NC_013366	TA	3	6	72568	72573	50 %	50 %	0 %	0 %	260751905
110	NC_013366	TG	3	6	75483	75488	0 %	50 %	50 %	0 %	260751907
111	NC_013366	TG	3	6	75770	75775	0 %	50 %	50 %	0 %	260751907
112	NC_013366	TG	3	6	76068	76073	0 %	50 %	50 %	0 %	260751907

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.