MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli O111:H- str. 11128 plasmid pO111_3

Total Repeats: 171

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013366	GAAA	2	8	253	260	75 %	0 %	25 %	0 %	260751836
2	NC_013366	GAAA	2	8	504	511	75 %	0 %	25 %	0 %	260751836
3	NC_013366	TAAA	2	8	525	532	75 %	25 %	0 %	0 %	260751837
4	NC_013366	TTCT	2	8	1218	1225	0 %	75 %	0 %	25 %	260751837
5	NC_013366	CTTT	2	8	1436	1443	0 %	75 %	0 %	25 %	260751837
6	NC_013366	GAGC	2	8	1466	1473	25 %	0 %	50 %	25 %	260751837
7	NC_013366	AATG	2	8	1763	1770	50 %	25 %	25 %	0 %	260751837
8	NC_013366	TGCT	2	8	1851	1858	0 %	50 %	25 %	25 %	260751837
9	NC_013366	AGAA	2	8	2146	2153	75 %	0 %	25 %	0 %	260751837
10	NC_013366	AACA	2	8	2285	2292	75 %	0 %	0 %	25 %	260751837
11	NC_013366	TATG	2	8	2479	2486	25 %	50 %	25 %	0 %	260751837
12	NC_013366	TTGC	2	8	3609	3616	0 %	50 %	25 %	25 %	260751838
13	NC_013366	TTGC	2	8	4266	4273	0 %	50 %	25 %	25 %	260751838
14	NC_013366	AATA	2	8	4580	4587	75 %	25 %	0 %	0 %	260751838
15	NC_013366	ATGG	2	8	4742	4749	25 %	25 %	50 %	0 %	260751838
16	NC_013366	TTCT	2	8	6151	6158	0 %	75 %	0 %	25 %	260751839
17	NC_013366	TAAA	2	8	6316	6323	75 %	25 %	0 %	0 %	260751839
18	NC_013366	AGGA	2	8	6385	6392	50 %	0 %	50 %	0 %	260751839
19	NC_013366	ATAC	2	8	6717	6724	50 %	25 %	0 %	25 %	260751839
20	NC_013366	GAAA	2	8	6996	7003	75 %	0 %	25 %	0 %	260751839
21	NC_013366	CTTC	2	8	7406	7413	0 %	50 %	0 %	50 %	260751840
22	NC_013366	TGGA	2	8	7552	7559	25 %	25 %	50 %	0 %	260751840
23	NC_013366	CCGC	2	8	8155	8162	0 %	0 %	25 %	75 %	260751841
24	NC_013366	GGAT	2	8	8595	8602	25 %	25 %	50 %	0 %	260751841
25	NC_013366	GTCA	2	8	8762	8769	25 %	25 %	25 %	25 %	260751841
26	NC_013366	GCCG	2	8	8866	8873	0 %	0 %	50 %	50 %	260751841
27	NC_013366	GCGA	2	8	10000	10007	25 %	0 %	50 %	25 %	260751842
28	NC_013366	GAAT	2	8	11751	11758	50 %	25 %	25 %	0 %	260751844
29	NC_013366	TAAA	2	8	11914	11921	75 %	25 %	0 %	0 %	260751844
30	NC_013366	GCCA	2	8	12630	12637	25 %	0 %	25 %	50 %	260751846
31	NC_013366	GGCT	2	8	12688	12695	0 %	25 %	50 %	25 %	260751846
32	NC_013366	CAGA	2	8	13049	13056	50 %	0 %	25 %	25 %	260751847
33	NC_013366	TGTA	2	8	13159	13166	25 %	50 %	25 %	0 %	260751847
34	NC_013366	TACC	2	8	13991	13998	25 %	25 %	0 %	50 %	260751848
35	NC_013366	CCGA	2	8	14034	14041	25 %	0 %	25 %	50 %	260751848
36	NC_013366	ACAG	2	8	14131	14138	50 %	0 %	25 %	25 %	260751848
37	NC_013366	CAGA	2	8	14226	14233	50 %	0 %	25 %	25 %	260751848
38	NC_013366	ATCA	2	8	15216	15223	50 %	25 %	0 %	25 %	260751849
39	NC_013366	CAGG	2	8	15573	15580	25 %	0 %	50 %	25 %	260751850
40	NC_013366	CTTC	2	8	16422	16429	0 %	50 %	0 %	50 %	260751851
41	NC_013366	CCAG	2	8	17008	17015	25 %	0 %	25 %	50 %	260751851
42	NC_013366	GTCT	2	8	17804	17811	0 %	50 %	25 %	25 %	260751852
43	NC_013366	TTTC	2	8	18036	18043	0 %	75 %	0 %	25 %	260751854
44	NC_013366	GGCA	2	8	18281	18288	25 %	0 %	50 %	25 %	260751854
45	NC_013366	GGCC	2	8	18554	18561	0 %	0 %	50 %	50 %	260751855
46	NC_013366	GTCC	2	8	19007	19014	0 %	25 %	25 %	50 %	260751855
47	NC_013366	CGTG	2	8	19046	19053	0 %	25 %	50 %	25 %	260751855
48	NC_013366	GTTT	2	8	19457	19464	0 %	75 %	25 %	0 %	260751855
49	NC_013366	GGTC	2	8	19715	19722	0 %	25 %	50 %	25 %	260751855
50	NC_013366	GAAT	2	8	19895	19902	50 %	25 %	25 %	0 %	260751855
51	NC_013366	AGCG	2	8	20130	20137	25 %	0 %	50 %	25 %	260751855
52	NC_013366	GGAA	2	8	20222	20229	50 %	0 %	50 %	0 %	260751855
53	NC_013366	TGAA	2	8	20256	20263	50 %	25 %	25 %	0 %	260751855
54	NC_013366	GAAT	2	8	20685	20692	50 %	25 %	25 %	0 %	260751855
55	NC_013366	TGGC	2	8	20762	20769	0 %	25 %	50 %	25 %	260751855
56	NC_013366	TGTA	2	8	21857	21864	25 %	50 %	25 %	0 %	260751855
57	NC_013366	CCAC	2	8	22722	22729	25 %	0 %	0 %	75 %	260751856
58	NC_013366	GTAA	2	8	23089	23096	50 %	25 %	25 %	0 %	260751856
59	NC_013366	CCAC	2	8	23103	23110	25 %	0 %	0 %	75 %	260751856
60	NC_013366	TGAT	2	8	23927	23934	25 %	50 %	25 %	0 %	260751858
61	NC_013366	GAAA	2	8	24182	24189	75 %	0 %	25 %	0 %	260751858
62	NC_013366	TACA	2	8	24606	24613	50 %	25 %	0 %	25 %	260751858
63	NC_013366	GGAA	2	8	25662	25669	50 %	0 %	50 %	0 %	260751860
64	NC_013366	TTAC	2	8	25841	25848	25 %	50 %	0 %	25 %	260751860
65	NC_013366	CCAT	2	8	26000	26007	25 %	25 %	0 %	50 %	260751860
66	NC_013366	GTGG	2	8	26208	26215	0 %	25 %	75 %	0 %	260751860
67	NC_013366	TTGT	2	8	27079	27086	0 %	75 %	25 %	0 %	260751861
68	NC_013366	CTTT	3	12	27136	27147	0 %	75 %	0 %	25 %	260751861
69	NC_013366	CCTG	2	8	27324	27331	0 %	25 %	25 %	50 %	260751862
70	NC_013366	GTTT	2	8	27633	27640	0 %	75 %	25 %	0 %	260751862
71	NC_013366	TTCT	2	8	27771	27778	0 %	75 %	0 %	25 %	260751862
72	NC_013366	GCAA	2	8	27884	27891	50 %	0 %	25 %	25 %	260751862
73	NC_013366	CTTC	2	8	29351	29358	0 %	50 %	0 %	50 %	260751863
74	NC_013366	CCAG	2	8	29937	29944	25 %	0 %	25 %	50 %	260751863
75	NC_013366	GTCT	2	8	30655	30662	0 %	50 %	25 %	25 %	260751864
76	NC_013366	GGCA	2	8	31371	31378	25 %	0 %	50 %	25 %	260751865
77	NC_013366	ACTG	2	8	32287	32294	25 %	25 %	25 %	25 %	260751867
78	NC_013366	AGTA	2	8	32734	32741	50 %	25 %	25 %	0 %	260751868
79	NC_013366	ACTG	2	8	35659	35666	25 %	25 %	25 %	25 %	260751870
80	NC_013366	GTCG	2	8	35941	35948	0 %	25 %	50 %	25 %	260751871
81	NC_013366	CAGA	2	8	36061	36068	50 %	0 %	25 %	25 %	260751871
82	NC_013366	TAAG	2	8	36718	36725	50 %	25 %	25 %	0 %	260751872
83	NC_013366	AAGC	2	8	36820	36827	50 %	0 %	25 %	25 %	260751873
84	NC_013366	GAAC	2	8	37793	37800	50 %	0 %	25 %	25 %	260751873
85	NC_013366	GAAG	2	8	38258	38265	50 %	0 %	50 %	0 %	260751873
86	NC_013366	CTGG	2	8	38668	38675	0 %	25 %	50 %	25 %	260751873
87	NC_013366	GGCG	2	8	39282	39289	0 %	0 %	75 %	25 %	260751875
88	NC_013366	GCTG	2	8	39328	39335	0 %	25 %	50 %	25 %	260751875
89	NC_013366	GAGG	2	8	39625	39632	25 %	0 %	75 %	0 %	260751875
90	NC_013366	AGTG	2	8	40009	40016	25 %	25 %	50 %	0 %	260751876
91	NC_013366	AGAA	2	8	40111	40118	75 %	0 %	25 %	0 %	260751876
92	NC_013366	CTGA	2	8	41411	41418	25 %	25 %	25 %	25 %	260751879
93	NC_013366	TCAG	2	8	41478	41485	25 %	25 %	25 %	25 %	260751879
94	NC_013366	GAAA	2	8	42220	42227	75 %	0 %	25 %	0 %	260751880
95	NC_013366	ATTT	2	8	42252	42259	25 %	75 %	0 %	0 %	260751880
96	NC_013366	ATTT	2	8	44444	44451	25 %	75 %	0 %	0 %	260751882
97	NC_013366	CAGA	2	8	45405	45412	50 %	0 %	25 %	25 %	260751883
98	NC_013366	TATT	2	8	45863	45870	25 %	75 %	0 %	0 %	260751884
99	NC_013366	ACCA	2	8	45966	45973	50 %	0 %	0 %	50 %	260751885
100	NC_013366	CTGG	2	8	46772	46779	0 %	25 %	50 %	25 %	260751886
101	NC_013366	CCGT	2	8	47240	47247	0 %	25 %	25 %	50 %	260751887
102	NC_013366	CAGC	2	8	47454	47461	25 %	0 %	25 %	50 %	260751887
103	NC_013366	GCCA	2	8	47464	47471	25 %	0 %	25 %	50 %	260751887
104	NC_013366	TCTG	2	8	47624	47631	0 %	50 %	25 %	25 %	260751888
105	NC_013366	AACA	2	8	47814	47821	75 %	0 %	0 %	25 %	260751888
106	NC_013366	TGTT	2	8	49079	49086	0 %	75 %	25 %	0 %	260751889
107	NC_013366	ATGT	2	8	49330	49337	25 %	50 %	25 %	0 %	260751889
108	NC_013366	AACA	2	8	49497	49504	75 %	0 %	0 %	25 %	260751889
109	NC_013366	TGAA	2	8	50223	50230	50 %	25 %	25 %	0 %	260751890
110	NC_013366	CAGC	2	8	51021	51028	25 %	0 %	25 %	50 %	260751890
111	NC_013366	CAGC	2	8	51105	51112	25 %	0 %	25 %	50 %	260751890
112	NC_013366	CTGT	2	8	51281	51288	0 %	50 %	25 %	25 %	260751890
113	NC_013366	CCAC	2	8	51534	51541	25 %	0 %	0 %	75 %	260751891
114	NC_013366	GATG	2	8	51741	51748	25 %	25 %	50 %	0 %	260751891
115	NC_013366	GACG	2	8	51755	51762	25 %	0 %	50 %	25 %	260751891
116	NC_013366	GTAA	2	8	51901	51908	50 %	25 %	25 %	0 %	260751891
117	NC_013366	CCAC	2	8	51915	51922	25 %	0 %	0 %	75 %	260751891
118	NC_013366	TTCC	2	8	52080	52087	0 %	50 %	0 %	50 %	260751891
119	NC_013366	TCAC	2	8	54361	54368	25 %	25 %	0 %	50 %	260751893
120	NC_013366	GTTA	2	8	54858	54865	25 %	50 %	25 %	0 %	260751893
121	NC_013366	TGAG	2	8	54995	55002	25 %	25 %	50 %	0 %	260751894
122	NC_013366	AATC	2	8	55589	55596	50 %	25 %	0 %	25 %	260751894
123	NC_013366	TCTG	2	8	56426	56433	0 %	50 %	25 %	25 %	260751895
124	NC_013366	GGCT	2	8	57001	57008	0 %	25 %	50 %	25 %	260751895
125	NC_013366	CGGA	2	8	58198	58205	25 %	0 %	50 %	25 %	260751896
126	NC_013366	CGGA	2	8	58396	58403	25 %	0 %	50 %	25 %	260751896
127	NC_013366	CGCA	2	8	58920	58927	25 %	0 %	25 %	50 %	260751896
128	NC_013366	CGGT	2	8	59044	59051	0 %	25 %	50 %	25 %	260751896
129	NC_013366	GTCC	2	8	59186	59193	0 %	25 %	25 %	50 %	260751896
130	NC_013366	CCGT	2	8	59303	59310	0 %	25 %	25 %	50 %	260751896
131	NC_013366	TCGC	2	8	59426	59433	0 %	25 %	25 %	50 %	260751896
132	NC_013366	CTGG	2	8	59927	59934	0 %	25 %	50 %	25 %	260751896
133	NC_013366	CCGG	2	8	60131	60138	0 %	0 %	50 %	50 %	260751896
134	NC_013366	GCGA	2	8	60160	60167	25 %	0 %	50 %	25 %	260751896
135	NC_013366	GGGC	2	8	60267	60274	0 %	0 %	75 %	25 %	260751896
136	NC_013366	CCTG	2	8	60287	60294	0 %	25 %	25 %	50 %	260751896
137	NC_013366	CGGT	2	8	61102	61109	0 %	25 %	50 %	25 %	260751896
138	NC_013366	CGGA	2	8	62140	62147	25 %	0 %	50 %	25 %	260751896
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.