MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Escherichia coli O26:H11 str. 11368 plasmid pO26_2

Total Repeats: 1177

Go To Repeat Summary Page

< Previous 1 23Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_013362	CGGA	2	8	52810	52817	25 %	0 %	50 %	25 %	260752003
1002	NC_013362	GACCT	2	10	52869	52878	20 %	20 %	20 %	40 %	260752003
1003	NC_013362	ATG	2	6	52902	52907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260752003
1004	NC_013362	TGAT	2	8	52933	52940	25 %	50 %	25 %	0 %	260752003
1005	NC_013362	TGA	2	6	53002	53007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260752003
1006	NC_013362	CGGA	2	8	53008	53015	25 %	0 %	50 %	25 %	260752003
1007	NC_013362	AC	3	6	53096	53101	50 %	0 %	0 %	50 %	260752003
1008	NC_013362	GGT	2	6	53108	53113	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260752003
1009	NC_013362	GCA	2	6	53126	53131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260752003
1010	NC_013362	GGA	2	6	53366	53371	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260752003
1011	NC_013362	GGC	2	6	53396	53401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260752003
1012	NC_013362	CGG	2	6	53509	53514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260752003
1013	NC_013362	CGCA	2	8	53532	53539	25 %	0 %	25 %	50 %	260752003
1014	NC_013362	AGG	2	6	53560	53565	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260752003
1015	NC_013362	GCA	2	6	53576	53581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260752003
1016	NC_013362	GCC	2	6	53669	53674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260752003
1017	NC_013362	AGC	2	6	53731	53736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260752003
1018	NC_013362	GTCC	2	8	53798	53805	0 %	25 %	25 %	50 %	260752003
1019	NC_013362	CAT	2	6	53822	53827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260752003
1020	NC_013362	CCGT	2	8	53915	53922	0 %	25 %	25 %	50 %	260752003
1021	NC_013362	ATG	2	6	53988	53993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260752003
1022	NC_013362	GCT	2	6	54027	54032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260752003
1023	NC_013362	TCGC	2	8	54038	54045	0 %	25 %	25 %	50 %	260752003
1024	NC_013362	CGT	2	6	54096	54101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260752003
1025	NC_013362	CTG	2	6	54189	54194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260752003
1026	NC_013362	G	6	6	54311	54316	0 %	0 %	100 %	0 %	260752003
1027	NC_013362	CCA	2	6	54331	54336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260752003
1028	NC_013362	TCA	2	6	54337	54342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260752003
1029	NC_013362	AG	3	6	54413	54418	50 %	0 %	50 %	0 %	260752003
1030	NC_013362	CTGG	2	8	54539	54546	0 %	25 %	50 %	25 %	260752003
1031	NC_013362	GGT	2	6	54701	54706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260752003
1032	NC_013362	TCC	2	6	54714	54719	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260752003
1033	NC_013362	CAG	2	6	54725	54730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260752003
1034	NC_013362	CCGG	2	8	54743	54750	0 %	0 %	50 %	50 %	260752003
1035	NC_013362	A	6	6	54751	54756	100 %	0 %	0 %	0 %	260752003
1036	NC_013362	GCGA	2	8	54772	54779	25 %	0 %	50 %	25 %	260752003
1037	NC_013362	CGG	2	6	54818	54823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260752003
1038	NC_013362	GTT	2	6	54867	54872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260752003
1039	NC_013362	GGGC	2	8	54879	54886	0 %	0 %	75 %	25 %	260752003
1040	NC_013362	CCTG	2	8	54899	54906	0 %	25 %	25 %	50 %	260752003
1041	NC_013362	CA	3	6	55004	55009	50 %	0 %	0 %	50 %	260752003
1042	NC_013362	CCT	2	6	55120	55125	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260752003
1043	NC_013362	GGT	2	6	55130	55135	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260752003
1044	NC_013362	CAG	2	6	55221	55226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260752003
1045	NC_013362	GGT	2	6	55247	55252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260752003
1046	NC_013362	CTG	2	6	55287	55292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260752003
1047	NC_013362	TGC	2	6	55310	55315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260752003
1048	NC_013362	ATGTGG	2	12	55384	55395	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	260752003
1049	NC_013362	CTG	2	6	55416	55421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260752003
1050	NC_013362	CGT	2	6	55432	55437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260752003
1051	NC_013362	A	6	6	55447	55452	100 %	0 %	0 %	0 %	260752003
1052	NC_013362	TTC	2	6	55456	55461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260752003
1053	NC_013362	AGG	2	6	55480	55485	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260752003
1054	NC_013362	CGC	2	6	55492	55497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260752003
1055	NC_013362	GA	3	6	55503	55508	50 %	0 %	50 %	0 %	260752003
1056	NC_013362	GC	3	6	55547	55552	0 %	0 %	50 %	50 %	260752003
1057	NC_013362	GGT	2	6	55592	55597	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260752003
1058	NC_013362	CA	3	6	55625	55630	50 %	0 %	0 %	50 %	260752003
1059	NC_013362	TGC	2	6	55660	55665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260752003
1060	NC_013362	CG	3	6	55710	55715	0 %	0 %	50 %	50 %	260752003
1061	NC_013362	GCA	2	6	55784	55789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260752003
1062	NC_013362	TGG	2	6	55849	55854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260752003
1063	NC_013362	GGT	3	9	55896	55904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260752003
1064	NC_013362	CAG	2	6	55971	55976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260752003
1065	NC_013362	TGC	2	6	55985	55990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260752003
1066	NC_013362	AGG	2	6	56125	56130	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260752003
1067	NC_013362	GCA	2	6	56198	56203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260752003
1068	NC_013362	ATG	2	6	56362	56367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260752003
1069	NC_013362	CGT	2	6	56451	56456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260752003
1070	NC_013362	TGG	2	6	56494	56499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260752003
1071	NC_013362	CGGA	2	8	56752	56759	25 %	0 %	50 %	25 %	260752003
1072	NC_013362	CAG	2	6	56760	56765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260752003
1073	NC_013362	AGC	2	6	56947	56952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260752003
1074	NC_013362	TGA	2	6	56969	56974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260752003
1075	NC_013362	CAA	2	6	56999	57004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260752003
1076	NC_013362	GTT	2	6	57077	57082	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260752003
1077	NC_013362	GGC	2	6	57110	57115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260752003
1078	NC_013362	TTC	2	6	57127	57132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260752003
1079	NC_013362	GTG	2	6	57301	57306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260752003
1080	NC_013362	GA	3	6	57367	57372	50 %	0 %	50 %	0 %	260752003
1081	NC_013362	CTG	2	6	57375	57380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260752003
1082	NC_013362	GTG	3	9	57435	57443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260752003
1083	NC_013362	GGT	2	6	57489	57494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260752003
1084	NC_013362	ACA	2	6	57517	57522	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260752003
1085	NC_013362	CCG	2	6	57599	57604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260752003
1086	NC_013362	CGC	2	6	57615	57620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260752003
1087	NC_013362	ACCTG	2	10	57656	57665	20 %	20 %	20 %	40 %	260752003
1088	NC_013362	CTG	2	6	57819	57824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260752003
1089	NC_013362	GCA	2	6	57836	57841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260752003
1090	NC_013362	TGA	2	6	57917	57922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260752004
1091	NC_013362	AACACG	2	12	57931	57942	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	260752004
1092	NC_013362	TCTGG	2	10	57993	58002	0 %	40 %	40 %	20 %	260752004
1093	NC_013362	ATC	2	6	58021	58026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260752004
1094	NC_013362	TGGGGA	2	12	58198	58209	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	260752004
1095	NC_013362	TAT	2	6	58228	58233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260752004
1096	NC_013362	TGG	2	6	58321	58326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260752004
1097	NC_013362	TGC	2	6	58346	58351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260752004
1098	NC_013362	GCT	2	6	58398	58403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260752004
1099	NC_013362	CTG	2	6	58474	58479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260752004
1100	NC_013362	CCA	2	6	58505	58510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260752004
1101	NC_013362	GCG	2	6	58516	58521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260752004
1102	NC_013362	TGA	2	6	58538	58543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260752004
1103	NC_013362	T	6	6	58608	58613	0 %	100 %	0 %	0 %	260752004
1104	NC_013362	CAT	2	6	58797	58802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260752005
1105	NC_013362	CAC	2	6	58809	58814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260752005
1106	NC_013362	CCA	2	6	58816	58821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260752005
1107	NC_013362	AGC	2	6	58857	58862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260752005
1108	NC_013362	GGC	2	6	58878	58883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260752005
1109	NC_013362	A	7	7	58884	58890	100 %	0 %	0 %	0 %	260752005
1110	NC_013362	TGG	2	6	58966	58971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260752005
1111	NC_013362	C	6	6	58994	58999	0 %	0 %	0 %	100 %	260752005
1112	NC_013362	A	6	6	59071	59076	100 %	0 %	0 %	0 %	260752005
1113	NC_013362	TGCC	2	8	59139	59146	0 %	25 %	25 %	50 %	260752005
1114	NC_013362	AGG	3	9	59186	59194	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260752005
1115	NC_013362	CCG	2	6	59226	59231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260752005
1116	NC_013362	TGA	2	6	59268	59273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260752005
1117	NC_013362	A	8	8	59279	59286	100 %	0 %	0 %	0 %	260752005
1118	NC_013362	TGGA	2	8	59505	59512	25 %	25 %	50 %	0 %	260752006
1119	NC_013362	GCA	2	6	59564	59569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260752006
1120	NC_013362	GAA	2	6	59914	59919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260752007
1121	NC_013362	AAT	2	6	59920	59925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260752007
1122	NC_013362	ATT	2	6	60019	60024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260752007
1123	NC_013362	CAG	2	6	60037	60042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260752007
1124	NC_013362	CGT	2	6	60045	60050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260752007
1125	NC_013362	TTC	2	6	60053	60058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260752007
1126	NC_013362	CAGG	2	8	60096	60103	25 %	0 %	50 %	25 %	260752007
1127	NC_013362	GTG	2	6	60107	60112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260752007
1128	NC_013362	AAT	2	6	60121	60126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260752007
1129	NC_013362	TGT	2	6	60166	60171	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260752007
1130	NC_013362	GCA	2	6	60172	60177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260752007
1131	NC_013362	CAT	2	6	60198	60203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260752007
1132	NC_013362	AAG	2	6	60245	60250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260752007
1133	NC_013362	TCG	2	6	60267	60272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260752007
1134	NC_013362	TGC	3	9	60291	60299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260752007
1135	NC_013362	AAC	2	6	60335	60340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260752007
1136	NC_013362	GCA	2	6	60387	60392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260752007
1137	NC_013362	TAA	2	6	60441	60446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260752007
1138	NC_013362	CA	3	6	60458	60463	50 %	0 %	0 %	50 %	260752007
1139	NC_013362	TCG	2	6	60516	60521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260752007
1140	NC_013362	ATT	2	6	60917	60922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260752008
1141	NC_013362	ATT	2	6	60941	60946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260752008
1142	NC_013362	AGA	2	6	61080	61085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260752008
1143	NC_013362	GCT	2	6	61087	61092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260752008
1144	NC_013362	GGT	2	6	61149	61154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260752008
1145	NC_013362	GTG	2	6	61225	61230	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260752008
1146	NC_013362	GCG	2	6	61282	61287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260752008
1147	NC_013362	TTG	2	6	61299	61304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260752008
1148	NC_013362	CAG	2	6	61305	61310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260752008
1149	NC_013362	GAT	2	6	61319	61324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260752008
1150	NC_013362	GCCA	2	8	61325	61332	25 %	0 %	25 %	50 %	260752008
1151	NC_013362	TTC	2	6	61362	61367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260752008
1152	NC_013362	AGGC	2	8	61382	61389	25 %	0 %	50 %	25 %	260752008
1153	NC_013362	CTG	2	6	61427	61432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260752008
1154	NC_013362	ACA	2	6	61457	61462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260752008
1155	NC_013362	CAG	2	6	61472	61477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260752008
1156	NC_013362	TGA	2	6	61678	61683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260752009
1157	NC_013362	TTA	2	6	61705	61710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260752009
1158	NC_013362	T	6	6	61740	61745	0 %	100 %	0 %	0 %	260752009
1159	NC_013362	AG	3	6	61811	61816	50 %	0 %	50 %	0 %	260752009
1160	NC_013362	CA	3	6	61866	61871	50 %	0 %	0 %	50 %	260752009
1161	NC_013362	GGT	2	6	61905	61910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260752009
1162	NC_013362	CAG	2	6	61915	61920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260752009
1163	NC_013362	ATG	2	6	61935	61940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260752009
1164	NC_013362	AAC	2	6	61957	61962	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260752009
1165	NC_013362	ATT	2	6	62016	62021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260752009
1166	NC_013362	ACT	2	6	62332	62337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260752010
1167	NC_013362	AG	3	6	62358	62363	50 %	0 %	50 %	0 %	260752010
1168	NC_013362	GTGTT	2	10	62419	62428	0 %	60 %	40 %	0 %	260752010
1169	NC_013362	GTG	2	6	62485	62490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260752010
1170	NC_013362	CAGA	2	8	62813	62820	50 %	0 %	25 %	25 %	260752011
1171	NC_013362	TCA	2	6	62837	62842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260752011
1172	NC_013362	CAG	2	6	62894	62899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260752011
1173	NC_013362	CTG	2	6	62952	62957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260752011
1174	NC_013362	TG	3	6	62982	62987	0 %	50 %	50 %	0 %	260752011
1175	NC_013362	GAT	2	6	63013	63018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260752011
1176	NC_013362	AGA	2	6	63036	63041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260752011
1177	NC_013362	CTAA	2	8	63052	63059	50 %	25 %	0 %	25 %	260752011

< Previous 1 23Next >