MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Escherichia coli O26:H11 str. 11368 plasmid pO26_2

Total Repeats: 1177

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013362	CGT	2	6	28486	28491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260751973
502	NC_013362	GCC	2	6	28516	28521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260751973
503	NC_013362	TGCC	2	8	28589	28596	0 %	25 %	25 %	50 %	260751973
504	NC_013362	GCCCG	2	10	28602	28611	0 %	0 %	40 %	60 %	260751973
505	NC_013362	CGC	2	6	28652	28657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260751973
506	NC_013362	CCG	2	6	28678	28683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260751973
507	NC_013362	CCA	3	9	28714	28722	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260751973
508	NC_013362	TGG	2	6	28925	28930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260751973
509	NC_013362	TTG	2	6	28970	28975	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260751973
510	NC_013362	G	6	6	28988	28993	0 %	0 %	100 %	0 %	260751973
511	NC_013362	GTG	2	6	29119	29124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260751973
512	NC_013362	TTG	2	6	29168	29173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260751973
513	NC_013362	GC	3	6	29196	29201	0 %	0 %	50 %	50 %	260751973
514	NC_013362	GGC	2	6	29275	29280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260751973
515	NC_013362	ACT	2	6	29309	29314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260751973
516	NC_013362	GTG	2	6	29377	29382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260751973
517	NC_013362	ACGC	2	8	29430	29437	25 %	0 %	25 %	50 %	260751973
518	NC_013362	AGAGC	2	10	29438	29447	40 %	0 %	40 %	20 %	260751973
519	NC_013362	GAA	2	6	29449	29454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260751973
520	NC_013362	AGC	2	6	29534	29539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260751973
521	NC_013362	GCA	2	6	29556	29561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260751973
522	NC_013362	AGGG	2	8	29579	29586	25 %	0 %	75 %	0 %	260751973
523	NC_013362	ATA	2	6	29601	29606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260751973
524	NC_013362	ATGCC	2	10	29623	29632	20 %	20 %	20 %	40 %	260751974
525	NC_013362	TGT	2	6	29641	29646	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260751974
526	NC_013362	GTTG	2	8	29661	29668	0 %	50 %	50 %	0 %	260751974
527	NC_013362	CTG	2	6	29717	29722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260751974
528	NC_013362	ACA	2	6	29745	29750	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260751974
529	NC_013362	G	6	6	29892	29897	0 %	0 %	100 %	0 %	260751974
530	NC_013362	ATGT	2	8	29975	29982	25 %	50 %	25 %	0 %	260751974
531	NC_013362	AAATG	2	10	30027	30036	60 %	20 %	20 %	0 %	260751974
532	NC_013362	GGT	2	6	30043	30048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260751974
533	NC_013362	GAAG	2	8	30067	30074	50 %	0 %	50 %	0 %	260751974
534	NC_013362	TGA	2	6	30133	30138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260751974
535	NC_013362	AACA	2	8	30142	30149	75 %	0 %	0 %	25 %	260751974
536	NC_013362	AAC	2	6	30152	30157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260751974
537	NC_013362	TTA	2	6	30190	30195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260751975
538	NC_013362	GAT	2	6	30228	30233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260751975
539	NC_013362	ATGC	2	8	30237	30244	25 %	25 %	25 %	25 %	260751975
540	NC_013362	CAC	2	6	30260	30265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260751975
541	NC_013362	TCCT	2	8	30274	30281	0 %	50 %	0 %	50 %	260751975
542	NC_013362	GCT	2	6	30330	30335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260751975
543	NC_013362	TGA	2	6	30343	30348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260751975
544	NC_013362	AGG	2	6	30349	30354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260751975
545	NC_013362	TCT	2	6	30375	30380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260751975
546	NC_013362	ATT	2	6	30453	30458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260751975
547	NC_013362	A	7	7	30511	30517	100 %	0 %	0 %	0 %	260751976
548	NC_013362	ATC	2	6	30624	30629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260751976
549	NC_013362	GAA	2	6	30687	30692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260751976
550	NC_013362	TTTA	2	8	30743	30750	25 %	75 %	0 %	0 %	260751977
551	NC_013362	CTG	2	6	30756	30761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260751977
552	NC_013362	TTA	2	6	30768	30773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260751977
553	NC_013362	CCA	2	6	30817	30822	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260751977
554	NC_013362	A	6	6	30867	30872	100 %	0 %	0 %	0 %	260751977
555	NC_013362	TCCG	2	8	30974	30981	0 %	25 %	25 %	50 %	260751977
556	NC_013362	GCA	2	6	30982	30987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260751977
557	NC_013362	CTG	2	6	31020	31025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260751977
558	NC_013362	CAC	2	6	31027	31032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260751977
559	NC_013362	TCAGT	2	10	31078	31087	20 %	40 %	20 %	20 %	260751977
560	NC_013362	GCA	2	6	31134	31139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260751977
561	NC_013362	ATC	2	6	31177	31182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260751977
562	NC_013362	T	6	6	31197	31202	0 %	100 %	0 %	0 %	260751977
563	NC_013362	TTA	2	6	31204	31209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260751977
564	NC_013362	ATTA	2	8	31236	31243	50 %	50 %	0 %	0 %	260751977
565	NC_013362	GTGA	2	8	31379	31386	25 %	25 %	50 %	0 %	260751978
566	NC_013362	ACAGA	2	10	31412	31421	60 %	0 %	20 %	20 %	260751978
567	NC_013362	AAAT	2	8	31455	31462	75 %	25 %	0 %	0 %	260751978
568	NC_013362	CGG	2	6	31520	31525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260751978
569	NC_013362	A	6	6	31612	31617	100 %	0 %	0 %	0 %	260751979
570	NC_013362	ATGAGC	2	12	31633	31644	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	260751979
571	NC_013362	CTG	2	6	31775	31780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260751979
572	NC_013362	ATT	2	6	31807	31812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260751979
573	NC_013362	GGA	2	6	31823	31828	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260751979
574	NC_013362	GTC	2	6	31846	31851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260751979
575	NC_013362	CTGA	2	8	31875	31882	25 %	25 %	25 %	25 %	260751979
576	NC_013362	TGT	2	6	31921	31926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260751979
577	NC_013362	A	6	6	31932	31937	100 %	0 %	0 %	0 %	260751979
578	NC_013362	ATGCA	2	10	31990	31999	40 %	20 %	20 %	20 %	260751979
579	NC_013362	A	6	6	32055	32060	100 %	0 %	0 %	0 %	260751979
580	NC_013362	A	6	6	32178	32183	100 %	0 %	0 %	0 %	260751980
581	NC_013362	TTC	2	6	32246	32251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260751980
582	NC_013362	AAC	2	6	32329	32334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260751980
583	NC_013362	G	7	7	32353	32359	0 %	0 %	100 %	0 %	260751980
584	NC_013362	ATGAA	2	10	32388	32397	60 %	20 %	20 %	0 %	260751980
585	NC_013362	AT	3	6	32402	32407	50 %	50 %	0 %	0 %	260751981
586	NC_013362	TTG	2	6	32433	32438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260751981
587	NC_013362	TGTA	2	8	32455	32462	25 %	50 %	25 %	0 %	260751981
588	NC_013362	CAA	2	6	32489	32494	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260751981
589	NC_013362	AAC	2	6	32508	32513	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260751981
590	NC_013362	GCA	2	6	32543	32548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260751981
591	NC_013362	GAAAT	2	10	32634	32643	60 %	20 %	20 %	0 %	260751981
592	NC_013362	AAC	2	6	32694	32699	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260751981
593	NC_013362	ATG	2	6	32712	32717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260751981
594	NC_013362	TAA	2	6	32870	32875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260751982
595	NC_013362	CT	3	6	32906	32911	0 %	50 %	0 %	50 %	260751982
596	NC_013362	CTG	2	6	32994	32999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260751982
597	NC_013362	ATGA	2	8	33036	33043	50 %	25 %	25 %	0 %	260751982
598	NC_013362	CAC	2	6	33044	33049	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260751982
599	NC_013362	TGC	2	6	33121	33126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260751982
600	NC_013362	CG	3	6	33139	33144	0 %	0 %	50 %	50 %	260751982
601	NC_013362	TGGT	2	8	33181	33188	0 %	50 %	50 %	0 %	260751982
602	NC_013362	TAT	2	6	33267	33272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260751982
603	NC_013362	GAAT	2	8	33310	33317	50 %	25 %	25 %	0 %	260751982
604	NC_013362	GAA	2	6	33371	33376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260751982
605	NC_013362	A	7	7	33375	33381	100 %	0 %	0 %	0 %	260751982
606	NC_013362	TGGAAA	2	12	33397	33408	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	260751982
607	NC_013362	ATC	2	6	33420	33425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260751982
608	NC_013362	CGT	2	6	33430	33435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260751982
609	NC_013362	CAC	2	6	33452	33457	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260751982
610	NC_013362	GAT	2	6	33500	33505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260751982
611	NC_013362	TCTGA	2	10	33558	33567	20 %	40 %	20 %	20 %	260751982
612	NC_013362	GT	3	6	33575	33580	0 %	50 %	50 %	0 %	260751982
613	NC_013362	GGA	2	6	33581	33586	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260751982
614	NC_013362	CTG	2	6	33735	33740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260751982
615	NC_013362	TGG	3	9	33787	33795	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260751982
616	NC_013362	CCT	2	6	33862	33867	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260751982
617	NC_013362	CCGT	2	8	33882	33889	0 %	25 %	25 %	50 %	260751982
618	NC_013362	G	6	6	33910	33915	0 %	0 %	100 %	0 %	260751982
619	NC_013362	TCT	2	6	33945	33950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260751982
620	NC_013362	AAT	2	6	33993	33998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260751982
621	NC_013362	CCTG	2	8	34099	34106	0 %	25 %	25 %	50 %	260751982
622	NC_013362	GC	3	6	34163	34168	0 %	0 %	50 %	50 %	260751982
623	NC_013362	AG	3	6	34169	34174	50 %	0 %	50 %	0 %	260751982
624	NC_013362	CTG	2	6	34233	34238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260751982
625	NC_013362	CACC	2	8	34240	34247	25 %	0 %	0 %	75 %	260751982
626	NC_013362	TTC	2	6	34278	34283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260751982
627	NC_013362	ACA	2	6	34306	34311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260751982
628	NC_013362	GTG	2	6	34398	34403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260751982
629	NC_013362	TG	3	6	34432	34437	0 %	50 %	50 %	0 %	260751982
630	NC_013362	G	6	6	34445	34450	0 %	0 %	100 %	0 %	260751982
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