MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Escherichia coli O26:H11 str. 11368 chromosome

Total Repeats: 99348

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_013361	CTT	2	6	163094	163099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260853356
3002	NC_013361	GCT	2	6	163135	163140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853356
3003	NC_013361	ACG	2	6	163209	163214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853356
3004	NC_013361	TTCA	2	8	163233	163240	25 %	50 %	0 %	25 %	260853356
3005	NC_013361	CTT	2	6	163325	163330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260853356
3006	NC_013361	TAC	2	6	163510	163515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260853357
3007	NC_013361	T	6	6	163533	163538	0 %	100 %	0 %	0 %	260853357
3008	NC_013361	CAG	2	6	163553	163558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853357
3009	NC_013361	C	6	6	163589	163594	0 %	0 %	0 %	100 %	260853357
3010	NC_013361	GC	3	6	163641	163646	0 %	0 %	50 %	50 %	260853357
3011	NC_013361	GCA	2	6	163673	163678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853357
3012	NC_013361	TCA	2	6	163721	163726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260853357
3013	NC_013361	GTTC	2	8	163781	163788	0 %	50 %	25 %	25 %	260853357
3014	NC_013361	AAAT	2	8	163982	163989	75 %	25 %	0 %	0 %	260853357
3015	NC_013361	GT	3	6	164020	164025	0 %	50 %	50 %	0 %	260853357
3016	NC_013361	A	6	6	164158	164163	100 %	0 %	0 %	0 %	260853357
3017	NC_013361	CG	3	6	164187	164192	0 %	0 %	50 %	50 %	260853357
3018	NC_013361	GCG	2	6	164257	164262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260853358
3019	NC_013361	GAG	2	6	164289	164294	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260853358
3020	NC_013361	GGC	2	6	164340	164345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260853358
3021	NC_013361	AAC	2	6	164416	164421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260853358
3022	NC_013361	GGC	2	6	164475	164480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260853358
3023	NC_013361	ACCAC	2	10	164494	164503	40 %	0 %	0 %	60 %	260853358
3024	NC_013361	TCA	2	6	164529	164534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260853358
3025	NC_013361	TCCG	2	8	164563	164570	0 %	25 %	25 %	50 %	260853358
3026	NC_013361	CGG	2	6	164644	164649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260853358
3027	NC_013361	GT	3	6	164678	164683	0 %	50 %	50 %	0 %	260853358
3028	NC_013361	GC	3	6	164685	164690	0 %	0 %	50 %	50 %	260853358
3029	NC_013361	GTC	2	6	164837	164842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853359
3030	NC_013361	TGC	2	6	164852	164857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853359
3031	NC_013361	TTAC	2	8	164871	164878	25 %	50 %	0 %	25 %	260853359
3032	NC_013361	CGC	2	6	164893	164898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260853359
3033	NC_013361	TAT	2	6	164902	164907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260853359
3034	NC_013361	CTG	2	6	164955	164960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853359
3035	NC_013361	CTG	2	6	164991	164996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853359
3036	NC_013361	CGT	2	6	165003	165008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853359
3037	NC_013361	GGC	2	6	165011	165016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260853359
3038	NC_013361	GCT	2	6	165044	165049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853359
3039	NC_013361	TGCG	2	8	165085	165092	0 %	25 %	50 %	25 %	260853359
3040	NC_013361	AGT	2	6	165125	165130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260853359
3041	NC_013361	GAT	2	6	165152	165157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260853359
3042	NC_013361	TTGGCG	2	12	165234	165245	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	260853359
3043	NC_013361	CAA	2	6	165261	165266	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260853359
3044	NC_013361	TGA	2	6	165275	165280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260853359
3045	NC_013361	CTG	2	6	165288	165293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853359
3046	NC_013361	GCA	2	6	165326	165331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853359
3047	NC_013361	TGC	2	6	165334	165339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853359
3048	NC_013361	CGT	2	6	165350	165355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853359
3049	NC_013361	TGC	2	6	165454	165459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853359
3050	NC_013361	AAC	2	6	165523	165528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260853359
3051	NC_013361	TCC	2	6	165607	165612	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260853359
3052	NC_013361	GTG	2	6	165636	165641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260853359
3053	NC_013361	TGG	3	9	165691	165699	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260853359
3054	NC_013361	GC	3	6	165800	165805	0 %	0 %	50 %	50 %	260853359
3055	NC_013361	CTGC	2	8	165827	165834	0 %	25 %	25 %	50 %	260853359
3056	NC_013361	CGC	2	6	165863	165868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260853359
3057	NC_013361	GCTG	2	8	165961	165968	0 %	25 %	50 %	25 %	260853359
3058	NC_013361	AGT	2	6	165980	165985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260853359
3059	NC_013361	A	6	6	166060	166065	100 %	0 %	0 %	0 %	260853359
3060	NC_013361	GAA	2	6	166115	166120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260853359
3061	NC_013361	CGA	3	9	166121	166129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853359
3062	NC_013361	GCT	2	6	166131	166136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853359
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3064	NC_013361	GCC	2	6	166169	166174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260853359
3065	NC_013361	GGCGT	2	10	166197	166206	0 %	20 %	60 %	20 %	260853359
3066	NC_013361	GCA	2	6	166229	166234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853359
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3068	NC_013361	CGC	2	6	166300	166305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260853359
3069	NC_013361	TCG	2	6	166337	166342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853359
3070	NC_013361	ACG	2	6	166402	166407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853359
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3072	NC_013361	TTA	2	6	166440	166445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260853359
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3077	NC_013361	TGA	3	9	166790	166798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260853359
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3079	NC_013361	GCA	2	6	166919	166924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853359
3080	NC_013361	CCCG	2	8	167003	167010	0 %	0 %	25 %	75 %	260853359
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3084	NC_013361	CGACG	2	10	167236	167245	20 %	0 %	40 %	40 %	260853359
3085	NC_013361	CAAA	2	8	167452	167459	75 %	0 %	0 %	25 %	260853360
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3088	NC_013361	ACG	2	6	167496	167501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853360
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3091	NC_013361	GCAAAG	2	12	167550	167561	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	260853360
3092	NC_013361	GGCT	2	8	167585	167592	0 %	25 %	50 %	25 %	260853360
3093	NC_013361	GCT	2	6	167596	167601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853360
3094	NC_013361	A	6	6	167661	167666	100 %	0 %	0 %	0 %	260853360
3095	NC_013361	CTGC	2	8	167699	167706	0 %	25 %	25 %	50 %	260853360
3096	NC_013361	GCT	2	6	167773	167778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853360
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3099	NC_013361	AAG	2	6	167889	167894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260853360
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3101	NC_013361	ATC	2	6	167928	167933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260853360
3102	NC_013361	CGA	2	6	167937	167942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853360
3103	NC_013361	AAC	2	6	167957	167962	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260853360
3104	NC_013361	TTC	2	6	167975	167980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260853360
3105	NC_013361	AGC	2	6	168027	168032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853360
3106	NC_013361	GTTT	2	8	168033	168040	0 %	75 %	25 %	0 %	260853360
3107	NC_013361	TGG	2	6	168069	168074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260853360
3108	NC_013361	AGA	2	6	168091	168096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260853360
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3110	NC_013361	CGAA	2	8	168258	168265	50 %	0 %	25 %	25 %	260853360
3111	NC_013361	CG	3	6	168289	168294	0 %	0 %	50 %	50 %	260853360
3112	NC_013361	GCG	2	6	168351	168356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260853360
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3116	NC_013361	CTG	2	6	168530	168535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853360
3117	NC_013361	CAACAG	2	12	168536	168547	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	260853360
3118	NC_013361	ATT	2	6	168548	168553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260853360
3119	NC_013361	TC	3	6	168618	168623	0 %	50 %	0 %	50 %	260853360
3120	NC_013361	CAGC	2	8	168626	168633	25 %	0 %	25 %	50 %	260853360
3121	NC_013361	TC	3	6	168691	168696	0 %	50 %	0 %	50 %	260853360
3122	NC_013361	GCC	2	6	168752	168757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260853360
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3240	NC_013361	TGG	2	6	174492	174497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260853364
3241	NC_013361	TGG	2	6	174579	174584	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260853364
3242	NC_013361	GCG	2	6	174693	174698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260853364
3243	NC_013361	GCG	2	6	174726	174731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260853364
3244	NC_013361	TGA	2	6	174778	174783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260853364
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3247	NC_013361	TCA	2	6	174852	174857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260853364
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3255	NC_013361	GCT	2	6	175078	175083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853364
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3268	NC_013361	CGC	2	6	175528	175533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260853364
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3480	NC_013361	TGC	2	6	186119	186124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853373
3481	NC_013361	ATT	2	6	186247	186252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260853374
3482	NC_013361	GACT	2	8	186305	186312	25 %	25 %	25 %	25 %	260853374
3483	NC_013361	GTC	2	6	186326	186331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853374
3484	NC_013361	TCA	2	6	186390	186395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260853374
3485	NC_013361	CTT	2	6	186430	186435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260853374
3486	NC_013361	CGA	2	6	186460	186465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853374
3487	NC_013361	GTT	2	6	186554	186559	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260853374
3488	NC_013361	TTC	2	6	186590	186595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260853374
3489	NC_013361	GGC	2	6	186825	186830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260853375
3490	NC_013361	CCACG	2	10	186858	186867	20 %	0 %	20 %	60 %	260853375
3491	NC_013361	ACCA	2	8	186946	186953	50 %	0 %	0 %	50 %	260853375
3492	NC_013361	CCG	2	6	186971	186976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260853375
3493	NC_013361	TCA	2	6	187010	187015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260853375
3494	NC_013361	CTT	2	6	187023	187028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260853375
3495	NC_013361	ACA	2	6	187173	187178	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260853375
3496	NC_013361	T	7	7	187220	187226	0 %	100 %	0 %	0 %	260853375
3497	NC_013361	G	6	6	187287	187292	0 %	0 %	100 %	0 %	260853375
3498	NC_013361	ATA	2	6	187335	187340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260853375
3499	NC_013361	CGC	2	6	187347	187352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260853375
3500	NC_013361	TGC	2	6	187468	187473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853375

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