MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Escherichia coli O26:H11 str. 11368 chromosome

Total Repeats: 99348

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_013361	GCCATT	2	12	54714	54725	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	260853264
1003	NC_013361	CAA	2	6	54747	54752	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260853264
1004	NC_013361	AACGT	2	10	54801	54810	40 %	20 %	20 %	20 %	260853264
1005	NC_013361	AC	3	6	54861	54866	50 %	0 %	0 %	50 %	260853264
1006	NC_013361	ATC	2	6	54880	54885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260853264
1007	NC_013361	ACG	2	6	55043	55048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853265
1008	NC_013361	GGT	2	6	55064	55069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260853265
1009	NC_013361	AC	3	6	55081	55086	50 %	0 %	0 %	50 %	260853265
1010	NC_013361	ACG	2	6	55134	55139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853265
1011	NC_013361	GTG	3	9	55156	55164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260853265
1012	NC_013361	CGG	2	6	55175	55180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260853265
1013	NC_013361	CAC	2	6	55274	55279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260853265
1014	NC_013361	CTG	2	6	55439	55444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853265
1015	NC_013361	GCC	2	6	55491	55496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260853265
1016	NC_013361	GCC	2	6	55560	55565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260853265
1017	NC_013361	TGG	2	6	55689	55694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260853265
1018	NC_013361	ATT	2	6	55700	55705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260853265
1019	NC_013361	TAA	2	6	55749	55754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260853266
1020	NC_013361	CGGCGT	2	12	55914	55925	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	260853266
1021	NC_013361	GGCA	2	8	55957	55964	25 %	0 %	50 %	25 %	260853266
1022	NC_013361	TCG	2	6	56000	56005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853266
1023	NC_013361	AAT	2	6	56014	56019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260853266
1024	NC_013361	CGT	2	6	56200	56205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853266
1025	NC_013361	TTC	2	6	56224	56229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260853266
1026	NC_013361	CAT	2	6	56239	56244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260853266
1027	NC_013361	CAC	2	6	56245	56250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260853266
1028	NC_013361	T	6	6	56251	56256	0 %	100 %	0 %	0 %	260853266
1029	NC_013361	CGT	2	6	56310	56315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853266
1030	NC_013361	GCA	2	6	56351	56356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853266
1031	NC_013361	CCA	2	6	56400	56405	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260853266
1032	NC_013361	CGGT	2	8	56558	56565	0 %	25 %	50 %	25 %	260853266
1033	NC_013361	AAC	2	6	56587	56592	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260853266
1034	NC_013361	CGG	2	6	56649	56654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260853266
1035	NC_013361	GTT	2	6	56729	56734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260853267
1036	NC_013361	TGC	2	6	56748	56753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853267
1037	NC_013361	TTC	2	6	56754	56759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260853267
1038	NC_013361	TCA	2	6	56774	56779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260853267
1039	NC_013361	CAG	2	6	56838	56843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853267
1040	NC_013361	GA	3	6	56993	56998	50 %	0 %	50 %	0 %	260853267
1041	NC_013361	GCA	2	6	57013	57018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853267
1042	NC_013361	CAG	2	6	57044	57049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853267
1043	NC_013361	GTCA	2	8	57081	57088	25 %	25 %	25 %	25 %	260853267
1044	NC_013361	CAG	2	6	57105	57110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853267
1045	NC_013361	CGC	2	6	57155	57160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260853267
1046	NC_013361	CAA	2	6	57212	57217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260853267
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1048	NC_013361	GCC	2	6	57294	57299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260853267
1049	NC_013361	CTG	2	6	57309	57314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853267
1050	NC_013361	GC	4	8	57379	57386	0 %	0 %	50 %	50 %	260853267
1051	NC_013361	CGT	2	6	57473	57478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853267
1052	NC_013361	CTG	2	6	57492	57497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853267
1053	NC_013361	CGA	2	6	57535	57540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853267
1054	NC_013361	GTT	2	6	57549	57554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260853267
1055	NC_013361	ATC	2	6	57571	57576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260853267
1056	NC_013361	TGT	2	6	57656	57661	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260853267
1057	NC_013361	GCT	2	6	57695	57700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853267
1058	NC_013361	GAT	2	6	57741	57746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260853267
1059	NC_013361	TGG	2	6	57775	57780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260853267
1060	NC_013361	GCGTC	2	10	57785	57794	0 %	20 %	40 %	40 %	260853267
1061	NC_013361	TGC	2	6	57805	57810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853267
1062	NC_013361	AGC	2	6	57819	57824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853267
1063	NC_013361	ACG	2	6	57871	57876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853267
1064	NC_013361	GAC	2	6	57885	57890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853267
1065	NC_013361	G	6	6	57914	57919	0 %	0 %	100 %	0 %	260853267
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1067	NC_013361	TTC	2	6	57973	57978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260853267
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1070	NC_013361	AGC	2	6	58212	58217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853268
1071	NC_013361	GCTT	2	8	58250	58257	0 %	50 %	25 %	25 %	260853268
1072	NC_013361	GTA	3	9	58273	58281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260853268
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1083	NC_013361	GTC	2	6	58709	58714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853268
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1087	NC_013361	GC	4	8	58851	58858	0 %	0 %	50 %	50 %	260853268
1088	NC_013361	CTTCG	2	10	59032	59041	0 %	40 %	20 %	40 %	260853268
1089	NC_013361	TGC	2	6	59049	59054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853268
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1094	NC_013361	TGCGT	2	10	59318	59327	0 %	40 %	40 %	20 %	260853268
1095	NC_013361	ACG	2	6	59458	59463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853268
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1097	NC_013361	ACG	2	6	59587	59592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853268
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1100	NC_013361	AGT	2	6	59667	59672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260853268
1101	NC_013361	TGG	3	9	59673	59681	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260853268
1102	NC_013361	CACC	2	8	59724	59731	25 %	0 %	0 %	75 %	260853268
1103	NC_013361	TTC	2	6	59809	59814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260853268
1104	NC_013361	AAT	2	6	59824	59829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260853268
1105	NC_013361	CTAC	2	8	59834	59841	25 %	25 %	0 %	50 %	260853268
1106	NC_013361	AGG	2	6	59871	59876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260853268
1107	NC_013361	GTT	2	6	59919	59924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260853268
1108	NC_013361	TCA	2	6	59925	59930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260853268
1109	NC_013361	CCA	2	6	59958	59963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260853268
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1111	NC_013361	GTAC	2	8	60080	60087	25 %	25 %	25 %	25 %	260853268
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1115	NC_013361	AT	3	6	60638	60643	50 %	50 %	0 %	0 %	260853269
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1119	NC_013361	CCA	2	6	60808	60813	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260853269
1120	NC_013361	GCCA	2	8	60879	60886	25 %	0 %	25 %	50 %	260853269
1121	NC_013361	GCG	2	6	60927	60932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260853269
1122	NC_013361	GGC	2	6	61055	61060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260853269
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1124	NC_013361	ATG	2	6	61161	61166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260853269
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1244	NC_013361	GGTGA	2	10	67300	67309	20 %	20 %	60 %	0 %	260853272
1245	NC_013361	GGCG	2	8	67336	67343	0 %	0 %	75 %	25 %	260853272
1246	NC_013361	TCA	2	6	67397	67402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260853272
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1499	NC_013361	TCA	2	6	80705	80710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260853284
1500	NC_013361	GGC	2	6	80717	80722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260853284

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