MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Escherichia coli O26:H11 str. 11368 chromosome

Total Repeats: 99348

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_013361	CA	3	6	279112	279117	50 %	0 %	0 %	50 %	260853451
5003	NC_013361	TGAAAA	2	12	279129	279140	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	260853451
5004	NC_013361	CTGCG	2	10	279162	279171	0 %	20 %	40 %	40 %	260853451
5005	NC_013361	TTA	2	6	279280	279285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260853451
5006	NC_013361	AAC	2	6	279347	279352	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260853451
5007	NC_013361	GCA	2	6	279368	279373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853451
5008	NC_013361	CGC	2	6	279438	279443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260853451
5009	NC_013361	TAT	2	6	279466	279471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260853451
5010	NC_013361	GCC	2	6	279498	279503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260853451
5011	NC_013361	ATT	2	6	279526	279531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260853451
5012	NC_013361	A	7	7	279552	279558	100 %	0 %	0 %	0 %	260853451
5013	NC_013361	CCG	2	6	279603	279608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260853451
5014	NC_013361	CCG	2	6	279770	279775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260853451
5015	NC_013361	AT	3	6	279831	279836	50 %	50 %	0 %	0 %	260853451
5016	NC_013361	GCA	2	6	279869	279874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853451
5017	NC_013361	CG	3	6	279902	279907	0 %	0 %	50 %	50 %	260853451
5018	NC_013361	TGC	2	6	280063	280068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853452
5019	NC_013361	CGTTT	2	10	280100	280109	0 %	60 %	20 %	20 %	260853452
5020	NC_013361	GC	3	6	280126	280131	0 %	0 %	50 %	50 %	260853452
5021	NC_013361	CAG	2	6	280152	280157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853452
5022	NC_013361	AGC	3	9	280165	280173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853452
5023	NC_013361	GAT	2	6	280200	280205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260853452
5024	NC_013361	GAT	2	6	280217	280222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260853452
5025	NC_013361	GCCA	2	8	280224	280231	25 %	0 %	25 %	50 %	260853452
5026	NC_013361	CT	3	6	280242	280247	0 %	50 %	0 %	50 %	260853452
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5030	NC_013361	GGC	2	6	280428	280433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260853453
5031	NC_013361	GCC	2	6	280627	280632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260853453
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5034	NC_013361	GAA	2	6	280810	280815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260853453
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5040	NC_013361	CT	3	6	281265	281270	0 %	50 %	0 %	50 %	260853453
5041	NC_013361	CCG	2	6	281281	281286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260853453
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5045	NC_013361	AAGC	2	8	281358	281365	50 %	0 %	25 %	25 %	260853453
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5054	NC_013361	CGG	2	6	281720	281725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260853453
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5121	NC_013361	GCAAA	2	10	285082	285091	60 %	0 %	20 %	20 %	260853457
5122	NC_013361	ACA	2	6	285113	285118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260853457
5123	NC_013361	GCG	2	6	285163	285168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260853457
5124	NC_013361	GCAGGA	2	12	285234	285245	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	260853457
5125	NC_013361	A	6	6	285245	285250	100 %	0 %	0 %	0 %	260853457
5126	NC_013361	CGG	3	9	285293	285301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260853457
5127	NC_013361	AGT	2	6	285315	285320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260853457
5128	NC_013361	GAC	2	6	285334	285339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853457
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5130	NC_013361	CAA	2	6	285352	285357	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260853457
5131	NC_013361	GAC	2	6	285391	285396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853457
5132	NC_013361	GCTG	2	8	285410	285417	0 %	25 %	50 %	25 %	260853457
5133	NC_013361	TCA	2	6	285451	285456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260853458
5134	NC_013361	GCT	2	6	285530	285535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853458
5135	NC_013361	AGGGC	2	10	285574	285583	20 %	0 %	60 %	20 %	260853458
5136	NC_013361	ATC	2	6	285615	285620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260853458
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5138	NC_013361	GAA	2	6	285654	285659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260853458
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5140	NC_013361	CGA	2	6	285796	285801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853458
5141	NC_013361	ATT	2	6	285807	285812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260853458
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5143	NC_013361	AGC	2	6	288601	288606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853459
5144	NC_013361	CGG	2	6	288611	288616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260853459
5145	NC_013361	TCC	2	6	288703	288708	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260853459
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5149	NC_013361	GGT	2	6	288885	288890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260853459
5150	NC_013361	GCT	2	6	288908	288913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853459
5151	NC_013361	AGTAA	2	10	288952	288961	60 %	20 %	20 %	0 %	260853459
5152	NC_013361	CCG	2	6	289024	289029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260853459
5153	NC_013361	AGC	2	6	289030	289035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853459
5154	NC_013361	TCA	2	6	289037	289042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260853459
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5156	NC_013361	CGGG	2	8	289064	289071	0 %	0 %	75 %	25 %	260853459
5157	NC_013361	T	6	6	289101	289106	0 %	100 %	0 %	0 %	260853459
5158	NC_013361	CGT	2	6	289134	289139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853459
5159	NC_013361	ATCGC	2	10	289273	289282	20 %	20 %	20 %	40 %	260853459
5160	NC_013361	GC	3	6	289281	289286	0 %	0 %	50 %	50 %	260853459
5161	NC_013361	TGT	2	6	289768	289773	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260853460
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5166	NC_013361	A	6	6	290083	290088	100 %	0 %	0 %	0 %	260853461
5167	NC_013361	TTG	2	6	290167	290172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260853461
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5230	NC_013361	T	6	6	293000	293005	0 %	100 %	0 %	0 %	260853466
5231	NC_013361	TG	3	6	293010	293015	0 %	50 %	50 %	0 %	260853466
5232	NC_013361	CAG	3	9	293194	293202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853466
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5234	NC_013361	CAC	2	6	293251	293256	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260853466
5235	NC_013361	CGTTC	2	10	293257	293266	0 %	40 %	20 %	40 %	260853466
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5239	NC_013361	CAG	3	9	293405	293413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853466
5240	NC_013361	CGA	2	6	293427	293432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853466
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5242	NC_013361	CGC	3	9	293506	293514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260853466
5243	NC_013361	CAC	2	6	293575	293580	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260853466
5244	NC_013361	CGC	2	6	293584	293589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260853466
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5247	NC_013361	GTC	2	6	293815	293820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853466
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5480	NC_013361	GGC	2	6	305095	305100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260853477
5481	NC_013361	GATC	2	8	305171	305178	25 %	25 %	25 %	25 %	260853478
5482	NC_013361	GCG	2	6	305193	305198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260853478
5483	NC_013361	CTGGTG	2	12	305214	305225	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	260853478
5484	NC_013361	GCG	2	6	305279	305284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260853478
5485	NC_013361	GAA	2	6	305291	305296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260853478
5486	NC_013361	GGC	2	6	305364	305369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260853478
5487	NC_013361	TGG	2	6	305374	305379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260853478
5488	NC_013361	GCG	2	6	305431	305436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260853478
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5490	NC_013361	CAG	2	6	305623	305628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853479
5491	NC_013361	CGG	3	9	305654	305662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260853479
5492	NC_013361	GCG	2	6	305671	305676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260853479
5493	NC_013361	AGC	2	6	305738	305743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853479
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5495	NC_013361	TTGC	2	8	305850	305857	0 %	50 %	25 %	25 %	260853480
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5497	NC_013361	CGG	2	6	305962	305967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260853480
5498	NC_013361	GCCGC	2	10	306078	306087	0 %	0 %	40 %	60 %	260853480
5499	NC_013361	CGC	2	6	306097	306102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260853480
5500	NC_013361	GGT	2	6	306152	306157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260853480

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