MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli O103:H2 str. 12009 plasmid pO103

Total Repeats: 83

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013354	CT	3	6	36	41	0 %	50 %	0 %	50 %	260718931
2	NC_013354	TC	3	6	1103	1108	0 %	50 %	0 %	50 %	260718931
3	NC_013354	AC	3	6	1683	1688	50 %	0 %	0 %	50 %	260718931
4	NC_013354	GA	3	6	2768	2773	50 %	0 %	50 %	0 %	260718932
5	NC_013354	CA	3	6	2958	2963	50 %	0 %	0 %	50 %	260718932
6	NC_013354	GA	3	6	3610	3615	50 %	0 %	50 %	0 %	260718932
7	NC_013354	AT	3	6	6935	6940	50 %	50 %	0 %	0 %	260718934
8	NC_013354	GC	3	6	7418	7423	0 %	0 %	50 %	50 %	260718935
9	NC_013354	GC	3	6	8503	8508	0 %	0 %	50 %	50 %	260718936
10	NC_013354	TA	3	6	8622	8627	50 %	50 %	0 %	0 %	260718936
11	NC_013354	AG	3	6	9637	9642	50 %	0 %	50 %	0 %	260718938
12	NC_013354	CG	3	6	9795	9800	0 %	0 %	50 %	50 %	260718939
13	NC_013354	GC	3	6	10173	10178	0 %	0 %	50 %	50 %	260718939
14	NC_013354	GA	3	6	11197	11202	50 %	0 %	50 %	0 %	260718940
15	NC_013354	TG	3	6	12037	12042	0 %	50 %	50 %	0 %	260718941
16	NC_013354	AT	3	6	12384	12389	50 %	50 %	0 %	0 %	260718941
17	NC_013354	GC	3	6	15876	15881	0 %	0 %	50 %	50 %	260718946
18	NC_013354	TG	3	6	19167	19172	0 %	50 %	50 %	0 %	260718948
19	NC_013354	TC	3	6	20270	20275	0 %	50 %	0 %	50 %	260718949
20	NC_013354	AG	3	6	20311	20316	50 %	0 %	50 %	0 %	260718949
21	NC_013354	TA	3	6	20372	20377	50 %	50 %	0 %	0 %	260718949
22	NC_013354	TA	3	6	20417	20422	50 %	50 %	0 %	0 %	260718949
23	NC_013354	GA	3	6	20683	20688	50 %	0 %	50 %	0 %	260718949
24	NC_013354	TG	3	6	21935	21940	0 %	50 %	50 %	0 %	260718950
25	NC_013354	GA	3	6	21964	21969	50 %	0 %	50 %	0 %	260718950
26	NC_013354	GA	3	6	24946	24951	50 %	0 %	50 %	0 %	260718953
27	NC_013354	TC	3	6	26819	26824	0 %	50 %	0 %	50 %	260718955
28	NC_013354	GT	3	6	26838	26843	0 %	50 %	50 %	0 %	260718955
29	NC_013354	TG	3	6	26987	26992	0 %	50 %	50 %	0 %	260718956
30	NC_013354	TG	3	6	27060	27065	0 %	50 %	50 %	0 %	260718956
31	NC_013354	TA	3	6	27487	27492	50 %	50 %	0 %	0 %	260718956
32	NC_013354	TC	3	6	27834	27839	0 %	50 %	0 %	50 %	260718956
33	NC_013354	TC	3	6	28296	28301	0 %	50 %	0 %	50 %	260718956
34	NC_013354	GA	3	6	28395	28400	50 %	0 %	50 %	0 %	260718956
35	NC_013354	AT	3	6	28791	28796	50 %	50 %	0 %	0 %	260718956
36	NC_013354	TG	4	8	28931	28938	0 %	50 %	50 %	0 %	260718956
37	NC_013354	GT	4	8	29123	29130	0 %	50 %	50 %	0 %	260718957
38	NC_013354	TA	3	6	29152	29157	50 %	50 %	0 %	0 %	260718957
39	NC_013354	TA	3	6	29279	29284	50 %	50 %	0 %	0 %	260718957
40	NC_013354	TC	3	6	29329	29334	0 %	50 %	0 %	50 %	260718957
41	NC_013354	CT	3	6	29491	29496	0 %	50 %	0 %	50 %	260718957
42	NC_013354	AT	3	6	29839	29844	50 %	50 %	0 %	0 %	260718957
43	NC_013354	AT	3	6	29923	29928	50 %	50 %	0 %	0 %	260718957
44	NC_013354	TA	3	6	30143	30148	50 %	50 %	0 %	0 %	260718957
45	NC_013354	AT	3	6	30432	30437	50 %	50 %	0 %	0 %	260718957
46	NC_013354	AT	3	6	30624	30629	50 %	50 %	0 %	0 %	260718957
47	NC_013354	AG	3	6	30765	30770	50 %	0 %	50 %	0 %	260718957
48	NC_013354	AT	3	6	31263	31268	50 %	50 %	0 %	0 %	260718957
49	NC_013354	GA	3	6	31695	31700	50 %	0 %	50 %	0 %	260718957
50	NC_013354	TA	3	6	32300	32305	50 %	50 %	0 %	0 %	260718958
51	NC_013354	TA	3	6	32400	32405	50 %	50 %	0 %	0 %	260718958
52	NC_013354	AG	3	6	32474	32479	50 %	0 %	50 %	0 %	260718958
53	NC_013354	TA	3	6	38222	38227	50 %	50 %	0 %	0 %	260718961
54	NC_013354	CT	3	6	38249	38254	0 %	50 %	0 %	50 %	260718961
55	NC_013354	AC	3	6	43470	43475	50 %	0 %	0 %	50 %	260718965
56	NC_013354	AG	3	6	44787	44792	50 %	0 %	50 %	0 %	260718965
57	NC_013354	CA	3	6	45378	45383	50 %	0 %	0 %	50 %	260718965
58	NC_013354	GA	3	6	45877	45882	50 %	0 %	50 %	0 %	260718965
59	NC_013354	CA	3	6	45999	46004	50 %	0 %	0 %	50 %	260718965
60	NC_013354	CA	3	6	46077	46082	50 %	0 %	0 %	50 %	260718965
61	NC_013354	CA	3	6	46692	46697	50 %	0 %	0 %	50 %	260718965
62	NC_013354	GT	3	6	46877	46882	0 %	50 %	50 %	0 %	260718965
63	NC_013354	CT	3	6	49119	49124	0 %	50 %	0 %	50 %	260718967
64	NC_013354	GA	3	6	49536	49541	50 %	0 %	50 %	0 %	260718967
65	NC_013354	AG	3	6	49739	49744	50 %	0 %	50 %	0 %	260718967
66	NC_013354	GA	3	6	50110	50115	50 %	0 %	50 %	0 %	260718968
67	NC_013354	TG	3	6	50461	50466	0 %	50 %	50 %	0 %	260718968
68	NC_013354	AT	3	6	51219	51224	50 %	50 %	0 %	0 %	260718970
69	NC_013354	TG	3	6	51260	51265	0 %	50 %	50 %	0 %	260718970
70	NC_013354	TA	3	6	54646	54651	50 %	50 %	0 %	0 %	260718975
71	NC_013354	CT	3	6	54696	54701	0 %	50 %	0 %	50 %	260718975
72	NC_013354	AT	3	6	55037	55042	50 %	50 %	0 %	0 %	260718976
73	NC_013354	CA	3	6	56714	56719	50 %	0 %	0 %	50 %	260718977
74	NC_013354	CT	3	6	57555	57560	0 %	50 %	0 %	50 %	260718978
75	NC_013354	CA	3	6	57853	57858	50 %	0 %	0 %	50 %	260718978
76	NC_013354	CA	3	6	58585	58590	50 %	0 %	0 %	50 %	260718979
77	NC_013354	GA	3	6	61773	61778	50 %	0 %	50 %	0 %	260718984
78	NC_013354	AG	3	6	62120	62125	50 %	0 %	50 %	0 %	260718984
79	NC_013354	TC	3	6	62211	62216	0 %	50 %	0 %	50 %	260718984
80	NC_013354	GC	3	6	65356	65361	0 %	0 %	50 %	50 %	260718986
81	NC_013354	TC	3	6	67283	67288	0 %	50 %	0 %	50 %	260718989
82	NC_013354	AC	3	6	67548	67553	50 %	0 %	0 %	50 %	260718989
83	NC_013354	TC	3	6	73217	73222	0 %	50 %	0 %	50 %	260718995

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.