MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli O157:H7 str. TW14359 plasmid pO157

Total Repeats: 171

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013010	GA	3	6	7	12	50 %	0 %	50 %	0 %	254667449
2	NC_013010	AC	3	6	1707	1712	50 %	0 %	0 %	50 %	254667449
3	NC_013010	CA	3	6	2289	2294	50 %	0 %	0 %	50 %	254667449
4	NC_013010	TA	3	6	2675	2680	50 %	50 %	0 %	0 %	254667449
5	NC_013010	GC	3	6	2956	2961	0 %	0 %	50 %	50 %	254667450
6	NC_013010	GC	3	6	6556	6561	0 %	0 %	50 %	50 %	254667452
7	NC_013010	GC	3	6	6693	6698	0 %	0 %	50 %	50 %	254667452
8	NC_013010	CG	3	6	7303	7308	0 %	0 %	50 %	50 %	254667453
9	NC_013010	CG	3	6	7921	7926	0 %	0 %	50 %	50 %	254667453
10	NC_013010	CA	3	6	8216	8221	50 %	0 %	0 %	50 %	254667453
11	NC_013010	AG	3	6	9877	9882	50 %	0 %	50 %	0 %	254667457
12	NC_013010	GC	3	6	10206	10211	0 %	0 %	50 %	50 %	254667457
13	NC_013010	TG	3	6	13058	13063	0 %	50 %	50 %	0 %	254667461
14	NC_013010	AG	3	6	13581	13586	50 %	0 %	50 %	0 %	254667461
15	NC_013010	TA	3	6	14313	14318	50 %	50 %	0 %	0 %	254667462
16	NC_013010	TC	3	6	15340	15345	0 %	50 %	0 %	50 %	254667464
17	NC_013010	CT	3	6	16408	16413	0 %	50 %	0 %	50 %	254667465
18	NC_013010	AT	3	6	16481	16486	50 %	50 %	0 %	0 %	254667465
19	NC_013010	TA	3	6	16582	16587	50 %	50 %	0 %	0 %	254667465
20	NC_013010	TC	3	6	17187	17192	0 %	50 %	0 %	50 %	254667466
21	NC_013010	AT	3	6	17619	17624	50 %	50 %	0 %	0 %	254667466
22	NC_013010	CT	3	6	18117	18122	0 %	50 %	0 %	50 %	254667466
23	NC_013010	AT	3	6	18258	18263	50 %	50 %	0 %	0 %	254667466
24	NC_013010	AT	3	6	18450	18455	50 %	50 %	0 %	0 %	254667466
25	NC_013010	TA	3	6	18739	18744	50 %	50 %	0 %	0 %	254667466
26	NC_013010	AT	3	6	18959	18964	50 %	50 %	0 %	0 %	254667466
27	NC_013010	TA	3	6	19042	19047	50 %	50 %	0 %	0 %	254667466
28	NC_013010	AG	3	6	19391	19396	50 %	0 %	50 %	0 %	254667466
29	NC_013010	GA	3	6	19553	19558	50 %	0 %	50 %	0 %	254667466
30	NC_013010	TA	3	6	19603	19608	50 %	50 %	0 %	0 %	254667466
31	NC_013010	TA	3	6	19730	19735	50 %	50 %	0 %	0 %	254667466
32	NC_013010	CA	3	6	19758	19763	50 %	0 %	0 %	50 %	254667466
33	NC_013010	CA	4	8	19949	19956	50 %	0 %	0 %	50 %	254667467
34	NC_013010	TA	3	6	20090	20095	50 %	50 %	0 %	0 %	254667467
35	NC_013010	TC	3	6	20487	20492	0 %	50 %	0 %	50 %	254667467
36	NC_013010	GA	3	6	20586	20591	50 %	0 %	50 %	0 %	254667467
37	NC_013010	GA	3	6	21048	21053	50 %	0 %	50 %	0 %	254667467
38	NC_013010	TA	3	6	21395	21400	50 %	50 %	0 %	0 %	254667467
39	NC_013010	CA	3	6	21822	21827	50 %	0 %	0 %	50 %	254667467
40	NC_013010	CA	3	6	21895	21900	50 %	0 %	0 %	50 %	254667467
41	NC_013010	CA	3	6	22043	22048	50 %	0 %	0 %	50 %	254667468
42	NC_013010	GA	3	6	22063	22068	50 %	0 %	50 %	0 %	254667468
43	NC_013010	AT	3	6	23646	23651	50 %	50 %	0 %	0 %	254667469
44	NC_013010	AT	3	6	23778	23783	50 %	50 %	0 %	0 %	254667470
45	NC_013010	AT	3	6	23911	23916	50 %	50 %	0 %	0 %	254667470
46	NC_013010	CT	3	6	25867	25872	0 %	50 %	0 %	50 %	254667474
47	NC_013010	CA	3	6	26165	26170	50 %	0 %	0 %	50 %	254667474
48	NC_013010	GT	3	6	26587	26592	0 %	50 %	50 %	0 %	254667475
49	NC_013010	TC	4	8	27544	27551	0 %	50 %	0 %	50 %	254667477
50	NC_013010	CG	3	6	27894	27899	0 %	0 %	50 %	50 %	254667478
51	NC_013010	CG	3	6	28043	28048	0 %	0 %	50 %	50 %	254667478
52	NC_013010	CG	3	6	28173	28178	0 %	0 %	50 %	50 %	254667478
53	NC_013010	GC	3	6	29761	29766	0 %	0 %	50 %	50 %	254667481
54	NC_013010	TC	4	8	29865	29872	0 %	50 %	0 %	50 %	254667481
55	NC_013010	CA	3	6	30202	30207	50 %	0 %	0 %	50 %	254667482
56	NC_013010	CT	3	6	31103	31108	0 %	50 %	0 %	50 %	254667484
57	NC_013010	TC	4	8	32961	32968	0 %	50 %	0 %	50 %	254667485
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59	NC_013010	TC	3	6	34063	34068	0 %	50 %	0 %	50 %	254667487
60	NC_013010	GC	3	6	35589	35594	0 %	0 %	50 %	50 %	254667488
61	NC_013010	GC	3	6	36133	36138	0 %	0 %	50 %	50 %	254667489
62	NC_013010	AC	3	6	37928	37933	50 %	0 %	0 %	50 %	254667490
63	NC_013010	TG	3	6	38116	38121	0 %	50 %	50 %	0 %	254667490
64	NC_013010	TG	3	6	38133	38138	0 %	50 %	50 %	0 %	254667490
65	NC_013010	CA	3	6	39464	39469	50 %	0 %	0 %	50 %	254667492
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67	NC_013010	TG	3	6	39727	39732	0 %	50 %	50 %	0 %	254667493
68	NC_013010	GC	3	6	40060	40065	0 %	0 %	50 %	50 %	254667494
69	NC_013010	CA	3	6	40320	40325	50 %	0 %	0 %	50 %	254667494
70	NC_013010	TC	3	6	41625	41630	0 %	50 %	0 %	50 %	254667497
71	NC_013010	CG	3	6	42694	42699	0 %	0 %	50 %	50 %	254667500
72	NC_013010	CA	3	6	43154	43159	50 %	0 %	0 %	50 %	254667500
73	NC_013010	CG	3	6	43998	44003	0 %	0 %	50 %	50 %	254667504
74	NC_013010	GA	3	6	44173	44178	50 %	0 %	50 %	0 %	254667504
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104	NC_013010	AT	3	6	58867	58872	50 %	50 %	0 %	0 %	254667518
105	NC_013010	AT	3	6	59101	59106	50 %	50 %	0 %	0 %	254667518
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108	NC_013010	AT	3	6	60441	60446	50 %	50 %	0 %	0 %	254667518
109	NC_013010	TA	3	6	60627	60632	50 %	50 %	0 %	0 %	254667518
110	NC_013010	TA	3	6	61207	61212	50 %	50 %	0 %	0 %	254667518
111	NC_013010	GT	3	6	61269	61274	0 %	50 %	50 %	0 %	254667518
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113	NC_013010	AT	4	8	61418	61425	50 %	50 %	0 %	0 %	254667518
114	NC_013010	GA	3	6	61709	61714	50 %	0 %	50 %	0 %	254667518
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123	NC_013010	TA	3	6	64772	64777	50 %	50 %	0 %	0 %	254667518
124	NC_013010	AT	4	8	64912	64919	50 %	50 %	0 %	0 %	254667518
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.