MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli O157:H7 str. TW14359 chromosome

Total Repeats: 2980

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013008	CGCTG	2	10	710	719	0 %	20 %	40 %	40 %	254791138
2	NC_013008	ATTGC	2	10	3413	3422	20 %	40 %	20 %	20 %	254791139
3	NC_013008	CGCAG	2	10	8377	8386	20 %	0 %	40 %	40 %	254791144
4	NC_013008	CGTAC	2	10	9805	9814	20 %	20 %	20 %	40 %	254791145
5	NC_013008	CGCGC	2	10	10792	10801	0 %	0 %	40 %	60 %	254791147
6	NC_013008	CCGAT	2	10	16509	16518	20 %	20 %	20 %	40 %	254791153
7	NC_013008	AGCGA	2	10	16897	16906	40 %	0 %	40 %	20 %	254791153
8	NC_013008	AATGT	2	10	21847	21856	40 %	40 %	20 %	0 %	254791155
9	NC_013008	TGCAA	2	10	22060	22069	40 %	20 %	20 %	20 %	254791155
10	NC_013008	ATAAA	2	10	22131	22140	80 %	20 %	0 %	0 %	254791155
11	NC_013008	TAAAA	2	10	22404	22413	80 %	20 %	0 %	0 %	254791155
12	NC_013008	ATTGC	2	10	24146	24155	20 %	40 %	20 %	20 %	254791157
13	NC_013008	GCGAA	2	10	36843	36852	40 %	0 %	40 %	20 %	254791169
14	NC_013008	CCGTT	2	10	37737	37746	0 %	40 %	20 %	40 %	254791169
15	NC_013008	CACGG	2	10	38114	38123	20 %	0 %	40 %	40 %	254791169
16	NC_013008	CGAAT	2	10	40856	40865	40 %	20 %	20 %	20 %	254791174
17	NC_013008	CCATG	2	10	42394	42403	20 %	20 %	20 %	40 %	254791175
18	NC_013008	CCGTA	2	10	44040	44049	20 %	20 %	20 %	40 %	254791176
19	NC_013008	GTACA	2	10	44530	44539	40 %	20 %	20 %	20 %	254791176
20	NC_013008	TTAAA	2	10	44778	44787	60 %	40 %	0 %	0 %	254791176
21	NC_013008	ACCCA	2	10	45521	45530	40 %	0 %	0 %	60 %	254791177
22	NC_013008	TTTGA	2	10	47148	47157	20 %	60 %	20 %	0 %	254791178
23	NC_013008	CGGCG	2	10	47399	47408	0 %	0 %	60 %	40 %	254791178
24	NC_013008	AATCA	2	10	47681	47690	60 %	20 %	0 %	20 %	254791179
25	NC_013008	CGGTT	2	10	48636	48645	0 %	40 %	40 %	20 %	254791180
26	NC_013008	TGGCG	2	10	50327	50336	0 %	20 %	60 %	20 %	254791182
27	NC_013008	TGCAC	2	10	52089	52098	20 %	20 %	20 %	40 %	254791183
28	NC_013008	AGGGC	2	10	53174	53183	20 %	0 %	60 %	20 %	254791184
29	NC_013008	GGCGC	2	10	53208	53217	0 %	0 %	60 %	40 %	254791184
30	NC_013008	GAAAC	2	10	54021	54030	60 %	0 %	20 %	20 %	254791184
31	NC_013008	AACGT	2	10	56494	56503	40 %	20 %	20 %	20 %	254791189
32	NC_013008	GCGTC	2	10	59478	59487	0 %	20 %	40 %	40 %	254791192
33	NC_013008	ATGTT	2	10	60292	60301	20 %	60 %	20 %	0 %	254791193
34	NC_013008	CTTCG	2	10	60725	60734	0 %	40 %	20 %	40 %	254791193
35	NC_013008	TGCGT	2	10	61011	61020	0 %	40 %	40 %	20 %	254791193
36	NC_013008	AAAGT	2	10	68078	68087	60 %	20 %	20 %	0 %	254791197
37	NC_013008	GTGCT	2	10	69341	69350	0 %	40 %	40 %	20 %	254791198
38	NC_013008	GGTGA	2	10	70325	70334	20 %	20 %	60 %	0 %	254791198
39	NC_013008	CAGCG	2	10	71693	71702	20 %	0 %	40 %	40 %	254791200
40	NC_013008	GGATC	2	10	74188	74197	20 %	20 %	40 %	20 %	254791201
41	NC_013008	GGCAA	2	10	80840	80849	40 %	0 %	40 %	20 %	254791207
42	NC_013008	TTGCT	2	10	81575	81584	0 %	60 %	20 %	20 %	254791208
43	NC_013008	GATGG	2	10	82311	82320	20 %	20 %	60 %	0 %	254791208
44	NC_013008	GCTTC	2	10	83456	83465	0 %	40 %	20 %	40 %	254791209
45	NC_013008	CCTGG	2	10	84564	84573	0 %	20 %	40 %	40 %	254791210
46	NC_013008	GACCG	2	10	86831	86840	20 %	0 %	40 %	40 %	254791212
47	NC_013008	ATGTT	2	10	89378	89387	20 %	60 %	20 %	0 %	254791214
48	NC_013008	TGCAT	2	10	90320	90329	20 %	40 %	20 %	20 %	254791215
49	NC_013008	ATTCC	2	10	90490	90499	20 %	40 %	0 %	40 %	254791215
50	NC_013008	TTACG	2	10	91382	91391	20 %	40 %	20 %	20 %	254791215
51	NC_013008	AGTTC	2	10	95583	95592	20 %	40 %	20 %	20 %	254791219
52	NC_013008	CGTGG	2	10	96956	96965	0 %	20 %	60 %	20 %	254791221
53	NC_013008	GGGCT	2	10	101335	101344	0 %	20 %	60 %	20 %	254791224
54	NC_013008	GCCTG	2	10	101795	101804	0 %	20 %	40 %	40 %	254791225
55	NC_013008	ACCGT	2	10	103708	103717	20 %	20 %	20 %	40 %	254791226
56	NC_013008	ATCAG	2	10	105481	105490	40 %	20 %	20 %	20 %	254791228
57	NC_013008	TGACG	2	10	106953	106962	20 %	20 %	40 %	20 %	254791229
58	NC_013008	AGCCG	2	10	107249	107258	20 %	0 %	40 %	40 %	254791229
59	NC_013008	GCGCA	2	10	109577	109586	20 %	0 %	40 %	40 %	254791231
60	NC_013008	TGGCG	2	10	110571	110580	0 %	20 %	60 %	20 %	254791232
61	NC_013008	CCGGC	2	10	113541	113550	0 %	0 %	40 %	60 %	254791235
62	NC_013008	CGCGG	2	10	116750	116759	0 %	0 %	60 %	40 %	254791238
63	NC_013008	ATCCC	2	10	118994	119003	20 %	20 %	0 %	60 %	254791241
64	NC_013008	CATCG	2	10	119007	119016	20 %	20 %	20 %	40 %	254791241
65	NC_013008	TAACG	2	10	119701	119710	40 %	20 %	20 %	20 %	254791241
66	NC_013008	ATGCC	2	10	120160	120169	20 %	20 %	20 %	40 %	254791241
67	NC_013008	AATGC	2	10	121443	121452	40 %	20 %	20 %	20 %	254791242
68	NC_013008	TCTGT	2	10	122389	122398	0 %	60 %	20 %	20 %	254791244
69	NC_013008	GCATG	2	10	123482	123491	20 %	20 %	40 %	20 %	254791245
70	NC_013008	AGCAG	2	10	124820	124829	40 %	0 %	40 %	20 %	254791247
71	NC_013008	CGAAG	2	10	126735	126744	40 %	0 %	40 %	20 %	254791248
72	NC_013008	ACACG	2	10	126868	126877	40 %	0 %	20 %	40 %	254791248
73	NC_013008	TCGCG	2	10	127129	127138	0 %	20 %	40 %	40 %	254791248
74	NC_013008	GCATC	2	10	127219	127228	20 %	20 %	20 %	40 %	254791248
75	NC_013008	GACTG	2	10	128537	128546	20 %	20 %	40 %	20 %	254791249
76	NC_013008	AGAGC	2	10	128947	128956	40 %	0 %	40 %	20 %	254791249
77	NC_013008	AGGCG	2	10	134102	134111	20 %	0 %	60 %	20 %	254791252
78	NC_013008	GGTTG	2	10	134855	134864	0 %	40 %	60 %	0 %	254791252
79	NC_013008	TCTGG	2	10	137501	137510	0 %	40 %	40 %	20 %	254791253
80	NC_013008	GGGCA	2	10	138913	138922	20 %	0 %	60 %	20 %	254791254
81	NC_013008	CAGCG	2	10	139192	139201	20 %	0 %	40 %	40 %	254791255
82	NC_013008	ACGAC	2	10	140472	140481	40 %	0 %	20 %	40 %	254791256
83	NC_013008	CCGTC	2	10	146177	146186	0 %	20 %	20 %	60 %	254791260
84	NC_013008	GTGAA	2	10	146187	146196	40 %	20 %	40 %	0 %	254791260
85	NC_013008	GTTCA	2	10	146574	146583	20 %	40 %	20 %	20 %	254791261
86	NC_013008	ATCCA	2	10	146900	146909	40 %	20 %	0 %	40 %	254791261
87	NC_013008	CTTTA	2	10	148163	148172	20 %	60 %	0 %	20 %	254791263
88	NC_013008	TGGCG	2	10	148390	148399	0 %	20 %	60 %	20 %	254791263
89	NC_013008	TTTCA	2	10	150703	150712	20 %	60 %	0 %	20 %	254791266
90	NC_013008	CCGCA	2	10	153439	153448	20 %	0 %	20 %	60 %	254791269
91	NC_013008	CCTTT	2	10	155404	155413	0 %	60 %	0 %	40 %	254791270
92	NC_013008	TTTAA	2	10	156964	156973	40 %	60 %	0 %	0 %	254791273
93	NC_013008	TGGTT	2	10	157326	157335	0 %	60 %	40 %	0 %	254791274
94	NC_013008	GCGAG	2	10	162726	162735	20 %	0 %	60 %	20 %	254791278
95	NC_013008	GGCGT	2	10	163164	163173	0 %	20 %	60 %	20 %	254791278
96	NC_013008	ACCAC	2	10	166067	166076	40 %	0 %	0 %	60 %	254791282
97	NC_013008	GGCGT	2	10	167770	167779	0 %	20 %	60 %	20 %	254791283
98	NC_013008	CGACG	2	10	168809	168818	20 %	0 %	40 %	40 %	254791283
99	NC_013008	CTGCG	2	10	170945	170954	0 %	20 %	40 %	40 %	254791284
100	NC_013008	AAAAC	2	10	172796	172805	80 %	0 %	0 %	20 %	254791285
101	NC_013008	TGGTT	2	10	173053	173062	0 %	60 %	40 %	0 %	254791285
102	NC_013008	AACCT	2	10	175134	175143	40 %	20 %	0 %	40 %	254791287
103	NC_013008	TGGTC	2	10	175176	175185	0 %	40 %	40 %	20 %	254791287
104	NC_013008	TGGCG	2	10	176421	176430	0 %	20 %	60 %	20 %	254791288
105	NC_013008	GGTCC	2	10	181985	181994	0 %	20 %	40 %	40 %	254791293
106	NC_013008	ACGGG	2	10	183902	183911	20 %	0 %	60 %	20 %	254791295
107	NC_013008	GTGAT	2	10	186061	186070	20 %	40 %	40 %	0 %	254791296
108	NC_013008	GTGAT	2	10	186352	186361	20 %	40 %	40 %	0 %	254791296
109	NC_013008	GCCAG	2	10	190071	190080	20 %	0 %	40 %	40 %	254791300
110	NC_013008	GTTCT	2	10	191512	191521	0 %	60 %	20 %	20 %	254791300
111	NC_013008	CTGAA	2	10	193504	193513	40 %	20 %	20 %	20 %	254791302
112	NC_013008	AAGCG	2	10	193568	193577	40 %	0 %	40 %	20 %	254791302
113	NC_013008	TGGTG	2	10	195474	195483	0 %	40 %	60 %	0 %	254791304
114	NC_013008	TGCAC	2	10	195600	195609	20 %	20 %	20 %	40 %	254791304
115	NC_013008	TGCGC	2	10	195993	196002	0 %	20 %	40 %	40 %	254791304
116	NC_013008	CATGG	2	10	197694	197703	20 %	20 %	40 %	20 %	254791306
117	NC_013008	CAGAT	2	10	198733	198742	40 %	20 %	20 %	20 %	254791307
118	NC_013008	ACTTT	2	10	198866	198875	20 %	60 %	0 %	20 %	254791307
119	NC_013008	GACGT	2	10	202786	202795	20 %	20 %	40 %	20 %	254791310
120	NC_013008	CGACG	2	10	204612	204621	20 %	0 %	40 %	40 %	254791312
121	NC_013008	CCACG	2	10	206453	206462	20 %	0 %	20 %	60 %	254791314
122	NC_013008	ATGCC	2	10	207180	207189	20 %	20 %	20 %	40 %	254791315
123	NC_013008	TGGCC	2	10	208506	208515	0 %	20 %	40 %	40 %	254791317
124	NC_013008	ACCGC	2	10	208519	208528	20 %	0 %	20 %	60 %	254791317
125	NC_013008	GTAAC	2	10	209249	209258	40 %	20 %	20 %	20 %	254791317
126	NC_013008	AGCCG	2	10	209877	209886	20 %	0 %	40 %	40 %	254791317
127	NC_013008	GGTGG	2	10	209986	209995	0 %	20 %	80 %	0 %	254791317
128	NC_013008	TTAGT	2	10	216947	216956	20 %	60 %	20 %	0 %	254791321
129	NC_013008	ACGGT	2	10	221030	221039	20 %	20 %	40 %	20 %	254791327
130	NC_013008	TGATT	2	10	223871	223880	20 %	60 %	20 %	0 %	254791330
131	NC_013008	CGCAA	2	10	225321	225330	40 %	0 %	20 %	40 %	254791332
132	NC_013008	GTGAA	2	10	235703	235712	40 %	20 %	40 %	0 %	254791337
133	NC_013008	TAATT	2	10	235887	235896	40 %	60 %	0 %	0 %	254791337
134	NC_013008	ACTGG	2	10	238825	238834	20 %	20 %	40 %	20 %	254791340
135	NC_013008	CGCGG	2	10	239870	239879	0 %	0 %	60 %	40 %	254791342
136	NC_013008	GCGCG	2	10	245583	245592	0 %	0 %	60 %	40 %	254791350
137	NC_013008	CCAGA	2	10	245652	245661	40 %	0 %	20 %	40 %	254791350
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141	NC_013008	ATTTC	2	10	255650	255659	20 %	60 %	0 %	20 %	254791355
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146	NC_013008	ACTGT	2	10	264789	264798	20 %	40 %	20 %	20 %	254791366
147	NC_013008	AAGGC	2	10	266802	266811	40 %	0 %	40 %	20 %	254791367
148	NC_013008	GCCCG	2	10	267266	267275	0 %	0 %	40 %	60 %	254791368
149	NC_013008	CGGGG	2	10	267495	267504	0 %	0 %	80 %	20 %	254791368
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151	NC_013008	TGACC	2	10	269132	269141	20 %	20 %	20 %	40 %	254791368
152	NC_013008	GGCAG	2	10	270406	270415	20 %	0 %	60 %	20 %	254791368
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155	NC_013008	AGCGC	2	10	277125	277134	20 %	0 %	40 %	40 %	254791375
156	NC_013008	GGTGT	2	10	277183	277192	0 %	40 %	60 %	0 %	254791375
157	NC_013008	AGCAA	2	10	278076	278085	60 %	0 %	20 %	20 %	254791375
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165	NC_013008	GCATC	2	10	290433	290442	20 %	20 %	20 %	40 %	254791389
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254	NC_013008	ACGGA	2	10	455307	455316	40 %	0 %	40 %	20 %	254791549
255	NC_013008	GCACA	2	10	455520	455529	40 %	0 %	20 %	40 %	254791549
256	NC_013008	TGACA	2	10	455571	455580	40 %	20 %	20 %	20 %	254791549
257	NC_013008	GTTGA	2	10	462724	462733	20 %	40 %	40 %	0 %	254791553
258	NC_013008	AAATC	2	10	463202	463211	60 %	20 %	0 %	20 %	254791554
259	NC_013008	GATGG	2	10	466920	466929	20 %	20 %	60 %	0 %	254791561
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