MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tri-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli S88 plasmid pECOS88

Total Repeats: 1427

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011747	GAA	2	6	226	231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218534478
2	NC_011747	CTG	2	6	264	269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218534478
3	NC_011747	CTT	2	6	288	293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218534478
4	NC_011747	GAT	2	6	527	532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218534478
5	NC_011747	CAC	2	6	533	538	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218534478
6	NC_011747	CGT	3	9	546	554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218534478
7	NC_011747	CGA	2	6	575	580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218534478
8	NC_011747	TGC	2	6	833	838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218534478
9	NC_011747	AGA	2	6	1330	1335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218534479
10	NC_011747	GTA	2	6	1649	1654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218534479
11	NC_011747	CAA	2	6	1816	1821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218534479
12	NC_011747	TTC	2	6	2019	2024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218534479
13	NC_011747	GTT	2	6	2084	2089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218534479
14	NC_011747	GGA	2	6	2120	2125	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218534479
15	NC_011747	GCG	2	6	2636	2641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218534480
16	NC_011747	TGT	2	6	2839	2844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218534480
17	NC_011747	CAG	2	6	2922	2927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218534481
18	NC_011747	ATT	2	6	3575	3580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218534483
19	NC_011747	GCC	2	6	3581	3586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218534483
20	NC_011747	ATT	2	6	3688	3693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218534483
21	NC_011747	TGA	2	6	3694	3699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218534483
22	NC_011747	TGC	2	6	4163	4168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218534484
23	NC_011747	CAC	2	6	4279	4284	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218534484
24	NC_011747	CAG	2	6	4297	4302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218534484
25	NC_011747	CAA	2	6	4353	4358	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218534484
26	NC_011747	CGG	2	6	4685	4690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218534485
27	NC_011747	CAC	2	6	4707	4712	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218534485
28	NC_011747	AGT	2	6	5299	5304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218534486
29	NC_011747	GTA	2	6	5369	5374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218534486
30	NC_011747	GTG	2	6	5377	5382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218534486
31	NC_011747	GTG	2	6	5400	5405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218534486
32	NC_011747	GGT	2	6	5483	5488	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218534486
33	NC_011747	AGG	2	6	5530	5535	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218534486
34	NC_011747	GTC	2	6	5747	5752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218534486
35	NC_011747	CAC	2	6	5753	5758	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218534486
36	NC_011747	CCA	2	6	5782	5787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218534486
37	NC_011747	TAG	2	6	5808	5813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218534486
38	NC_011747	ATT	2	6	5834	5839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218534486
39	NC_011747	GCA	2	6	5943	5948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218534486
40	NC_011747	CTG	2	6	6020	6025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218534486
41	NC_011747	CAG	2	6	6044	6049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218534486
42	NC_011747	GCC	2	6	6086	6091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218534486
43	NC_011747	CGG	2	6	6103	6108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218534486
44	NC_011747	CGG	2	6	6121	6126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218534486
45	NC_011747	TGC	2	6	6138	6143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218534486
46	NC_011747	ATC	2	6	6158	6163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218534486
47	NC_011747	ATT	2	6	6215	6220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218534486
48	NC_011747	GCC	2	6	6246	6251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218534486
49	NC_011747	ACG	2	6	6268	6273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218534486
50	NC_011747	GGT	2	6	6284	6289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218534486
51	NC_011747	TCT	2	6	6295	6300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218534486
52	NC_011747	TGT	2	6	6301	6306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218534486
53	NC_011747	GAA	2	6	6341	6346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218534486
54	NC_011747	CTG	2	6	6458	6463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218534486
55	NC_011747	GTA	2	6	6539	6544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218534486
56	NC_011747	TCG	3	9	6711	6719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218534486
57	NC_011747	ATG	2	6	6792	6797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218534486
58	NC_011747	GCC	2	6	6872	6877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218534486
59	NC_011747	CCG	2	6	6924	6929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218534486
60	NC_011747	CTG	2	6	6966	6971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218534486
61	NC_011747	CAT	2	6	7004	7009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218534486
62	NC_011747	GCC	3	9	7061	7069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218534486
63	NC_011747	GCT	2	6	7235	7240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218534486
64	NC_011747	GCC	2	6	7289	7294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218534486
65	NC_011747	CTG	2	6	7301	7306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218534486
66	NC_011747	GGT	2	6	7334	7339	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218534486
67	NC_011747	TGC	2	6	7366	7371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218534486
68	NC_011747	TCA	2	6	7395	7400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218534486
69	NC_011747	TTG	2	6	7406	7411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218534486
70	NC_011747	CTG	2	6	7417	7422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218534486
71	NC_011747	CAT	2	6	7427	7432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218534486
72	NC_011747	AAG	2	6	7436	7441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218534486
73	NC_011747	ATC	2	6	7479	7484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218534486
74	NC_011747	ATT	2	6	7485	7490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218534486
75	NC_011747	TGT	2	6	7729	7734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218534487
76	NC_011747	TCA	2	6	7767	7772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218534487
77	NC_011747	CAC	2	6	7868	7873	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218534487
78	NC_011747	GAT	2	6	7906	7911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218534487
79	NC_011747	ACT	2	6	7940	7945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218534487
80	NC_011747	GTT	2	6	7953	7958	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218534487
81	NC_011747	GGT	2	6	8014	8019	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218534487
82	NC_011747	TCC	2	6	8109	8114	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218534487
83	NC_011747	TCA	2	6	8154	8159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218534487
84	NC_011747	AGC	2	6	8165	8170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218534487
85	NC_011747	ATT	2	6	8189	8194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218534487
86	NC_011747	CCG	2	6	8218	8223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218534487
87	NC_011747	CAC	2	6	8266	8271	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218534487
88	NC_011747	TCC	2	6	8276	8281	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218534487
89	NC_011747	CGA	2	6	8319	8324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218534487
90	NC_011747	GGT	2	6	8376	8381	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218534487
91	NC_011747	GTT	2	6	8389	8394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218534487
92	NC_011747	CAG	2	6	8524	8529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218534487
93	NC_011747	TCA	2	6	8739	8744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218534487
94	NC_011747	AAG	2	6	8745	8750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218534487
95	NC_011747	TTC	2	6	8762	8767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218534487
96	NC_011747	GCA	2	6	8784	8789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218534487
97	NC_011747	GCA	2	6	8904	8909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218534488
98	NC_011747	GCC	2	6	8917	8922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218534488
99	NC_011747	CAC	2	6	8959	8964	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218534488
100	NC_011747	CTG	2	6	9048	9053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218534488
101	NC_011747	CAG	2	6	9055	9060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218534488
102	NC_011747	AGT	2	6	9159	9164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218534488
103	NC_011747	CCT	2	6	9195	9200	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218534488
104	NC_011747	CTT	2	6	9228	9233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218534488
105	NC_011747	CAG	2	6	9265	9270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218534488
106	NC_011747	ACC	2	6	9374	9379	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218534488
107	NC_011747	TCG	2	6	9458	9463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218534488
108	NC_011747	TGT	2	6	9674	9679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218534488
109	NC_011747	CTG	2	6	9817	9822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218534488
110	NC_011747	CAA	2	6	10015	10020	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218534488
111	NC_011747	TGA	2	6	10022	10027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218534488
112	NC_011747	TTA	2	6	10157	10162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218534488
113	NC_011747	CAG	2	6	10186	10191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218534488
114	NC_011747	AGT	2	6	10256	10261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218534488
115	NC_011747	CAG	2	6	10273	10278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218534488
116	NC_011747	CAG	2	6	10351	10356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218534488
117	NC_011747	ACA	2	6	10530	10535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218534488
118	NC_011747	CCA	2	6	10542	10547	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218534488
119	NC_011747	GGC	2	6	10548	10553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218534488
120	NC_011747	GAA	2	6	10602	10607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218534489
121	NC_011747	TGA	2	6	10609	10614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218534489
122	NC_011747	CAG	3	9	10758	10766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218534489
123	NC_011747	CCG	2	6	10892	10897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218534489
124	NC_011747	TCG	2	6	10930	10935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218534489
125	NC_011747	AAC	2	6	10937	10942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218534489
126	NC_011747	ACG	2	6	11130	11135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218534489
127	NC_011747	CTC	2	6	11316	11321	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218534489
128	NC_011747	GAA	2	6	11339	11344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218534489
129	NC_011747	CTG	2	6	11348	11353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218534489
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252	NC_011747	GCA	3	9	21283	21291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218534501
253	NC_011747	CAT	2	6	21316	21321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218534501
254	NC_011747	GCG	2	6	21340	21345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218534501
255	NC_011747	GAC	2	6	21373	21378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218534501
256	NC_011747	TTG	2	6	21433	21438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218534501
257	NC_011747	GTA	2	6	21566	21571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218534501
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259	NC_011747	TCT	2	6	21751	21756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218534501
260	NC_011747	CTG	2	6	22068	22073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218534502
261	NC_011747	TGT	2	6	22325	22330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218534503
262	NC_011747	TGC	2	6	22368	22373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218534503
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284	NC_011747	TAA	2	6	25271	25276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218534505
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499	NC_011747	GGA	2	6	48228	48233	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218534531
500	NC_011747	CAA	2	6	48369	48374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218534531

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