MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli UMN026 plasmid p2ESCUM

Total Repeats: 80

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011739	TATT	2	8	320	327	25 %	75 %	0 %	0 %	218454960
2	NC_011739	AAGA	2	8	363	370	75 %	0 %	25 %	0 %	218454960
3	NC_011739	ATGA	2	8	1183	1190	50 %	25 %	25 %	0 %	218454960
4	NC_011739	GAAA	2	8	1310	1317	75 %	0 %	25 %	0 %	218454961
5	NC_011739	CTGG	2	8	1481	1488	0 %	25 %	50 %	25 %	218454961
6	NC_011739	AATA	2	8	2003	2010	75 %	25 %	0 %	0 %	218454962
7	NC_011739	ATTA	2	8	2024	2031	50 %	50 %	0 %	0 %	218454962
8	NC_011739	ATGA	2	8	2040	2047	50 %	25 %	25 %	0 %	218454962
9	NC_011739	CCAG	2	8	2687	2694	25 %	0 %	25 %	50 %	218454963
10	NC_011739	TCTG	2	8	3436	3443	0 %	50 %	25 %	25 %	218454965
11	NC_011739	ACAA	2	8	3460	3467	75 %	0 %	0 %	25 %	218454965
12	NC_011739	TATT	2	8	3700	3707	25 %	75 %	0 %	0 %	218454966
13	NC_011739	AATG	2	8	4425	4432	50 %	25 %	25 %	0 %	218454967
14	NC_011739	GTCT	2	8	5155	5162	0 %	50 %	25 %	25 %	218454968
15	NC_011739	TTCA	2	8	5454	5461	25 %	50 %	0 %	25 %	218454968
16	NC_011739	CCAT	2	8	6255	6262	25 %	25 %	0 %	50 %	218454969
17	NC_011739	TGTT	2	8	6291	6298	0 %	75 %	25 %	0 %	218454969
18	NC_011739	ATTT	2	8	6651	6658	25 %	75 %	0 %	0 %	218454969
19	NC_011739	AAGC	2	8	7077	7084	50 %	0 %	25 %	25 %	218454970
20	NC_011739	GTAC	2	8	7487	7494	25 %	25 %	25 %	25 %	218454971
21	NC_011739	ACTC	2	8	7855	7862	25 %	25 %	0 %	50 %	218454972
22	NC_011739	TTTG	2	8	7915	7922	0 %	75 %	25 %	0 %	218454972
23	NC_011739	CAGG	2	8	8134	8141	25 %	0 %	50 %	25 %	218454972
24	NC_011739	GACA	2	8	9263	9270	50 %	0 %	25 %	25 %	218454972
25	NC_011739	GAAG	2	8	9960	9967	50 %	0 %	50 %	0 %	218454973
26	NC_011739	TTTA	2	8	10015	10022	25 %	75 %	0 %	0 %	218454973
27	NC_011739	CTGG	2	8	10049	10056	0 %	25 %	50 %	25 %	218454973
28	NC_011739	TGAA	2	8	10075	10082	50 %	25 %	25 %	0 %	218454973
29	NC_011739	CTTC	2	8	10270	10277	0 %	50 %	0 %	50 %	218454973
30	NC_011739	TAAA	2	8	10715	10722	75 %	25 %	0 %	0 %	218454974
31	NC_011739	AAAT	2	8	10767	10774	75 %	25 %	0 %	0 %	218454974
32	NC_011739	TGTT	2	8	10913	10920	0 %	75 %	25 %	0 %	218454975
33	NC_011739	CTTT	2	8	11221	11228	0 %	75 %	0 %	25 %	218454975
34	NC_011739	AGTT	2	8	11262	11269	25 %	50 %	25 %	0 %	218454976
35	NC_011739	GTCT	2	8	11477	11484	0 %	50 %	25 %	25 %	218454976
36	NC_011739	ATTT	2	8	11946	11953	25 %	75 %	0 %	0 %	218454977
37	NC_011739	AGAC	2	8	12017	12024	50 %	0 %	25 %	25 %	218454977
38	NC_011739	ATGA	2	8	12433	12440	50 %	25 %	25 %	0 %	218454978
39	NC_011739	CTTG	2	8	13585	13592	0 %	50 %	25 %	25 %	218454981
40	NC_011739	CTGA	2	8	13735	13742	25 %	25 %	25 %	25 %	218454981
41	NC_011739	CAGT	2	8	14901	14908	25 %	25 %	25 %	25 %	218454981
42	NC_011739	AAAG	2	8	15952	15959	75 %	0 %	25 %	0 %	218454982
43	NC_011739	CCAG	2	8	16420	16427	25 %	0 %	25 %	50 %	218454983
44	NC_011739	AACA	2	8	16522	16529	75 %	0 %	0 %	25 %	218454983
45	NC_011739	CCTG	2	8	16871	16878	0 %	25 %	25 %	50 %	218454983
46	NC_011739	TTCT	2	8	17266	17273	0 %	75 %	0 %	25 %	218454983
47	NC_011739	TTCC	2	8	17763	17770	0 %	50 %	0 %	50 %	218454984
48	NC_011739	AACA	2	8	17874	17881	75 %	0 %	0 %	25 %	218454984
49	NC_011739	TTCG	2	8	17884	17891	0 %	50 %	25 %	25 %	218454984
50	NC_011739	GAAG	2	8	18190	18197	50 %	0 %	50 %	0 %	218454984
51	NC_011739	ATTC	2	8	18886	18893	25 %	50 %	0 %	25 %	218454985
52	NC_011739	ATCC	2	8	19955	19962	25 %	25 %	0 %	50 %	218454986
53	NC_011739	AACC	2	8	20386	20393	50 %	0 %	0 %	50 %	218454987
54	NC_011739	ACTG	2	8	21108	21115	25 %	25 %	25 %	25 %	218454988
55	NC_011739	CCTG	2	8	21294	21301	0 %	25 %	25 %	50 %	218454988
56	NC_011739	GTAA	2	8	21482	21489	50 %	25 %	25 %	0 %	218454989
57	NC_011739	AGAT	2	8	21676	21683	50 %	25 %	25 %	0 %	218454989
58	NC_011739	CTCC	2	8	22301	22308	0 %	25 %	0 %	75 %	218454989
59	NC_011739	GAAA	2	8	22878	22885	75 %	0 %	25 %	0 %	218454989
60	NC_011739	TCAT	2	8	23356	23363	25 %	50 %	0 %	25 %	218454989
61	NC_011739	TCAT	2	8	23515	23522	25 %	50 %	0 %	25 %	218454989
62	NC_011739	CCAG	2	8	23973	23980	25 %	0 %	25 %	50 %	218454989
63	NC_011739	CATA	2	8	23993	24000	50 %	25 %	0 %	25 %	218454989
64	NC_011739	GTAG	2	8	25269	25276	25 %	25 %	50 %	0 %	218454992
65	NC_011739	TAAA	2	8	25927	25934	75 %	25 %	0 %	0 %	218454993
66	NC_011739	TTTC	2	8	25941	25948	0 %	75 %	0 %	25 %	218454993
67	NC_011739	GCTG	2	8	26257	26264	0 %	25 %	50 %	25 %	218454994
68	NC_011739	TTCT	2	8	26785	26792	0 %	75 %	0 %	25 %	218454994
69	NC_011739	CAAT	2	8	28028	28035	50 %	25 %	0 %	25 %	218454996
70	NC_011739	TTTA	2	8	28436	28443	25 %	75 %	0 %	0 %	218454998
71	NC_011739	CAAT	2	8	28732	28739	50 %	25 %	0 %	25 %	218454999
72	NC_011739	CTTT	2	8	28747	28754	0 %	75 %	0 %	25 %	218454999
73	NC_011739	CGAA	2	8	29851	29858	50 %	0 %	25 %	25 %	218455002
74	NC_011739	TTAA	2	8	30384	30391	50 %	50 %	0 %	0 %	218455004
75	NC_011739	ATTC	2	8	30454	30461	25 %	50 %	0 %	25 %	218455004
76	NC_011739	AGAA	2	8	31506	31513	75 %	0 %	25 %	0 %	218455006
77	NC_011739	ATTT	2	8	31581	31588	25 %	75 %	0 %	0 %	218455006
78	NC_011739	CGAA	2	8	31931	31938	50 %	0 %	25 %	25 %	218455006
79	NC_011739	TAAC	2	8	32787	32794	50 %	25 %	0 %	25 %	218455008
80	NC_011739	TCTG	2	8	33057	33064	0 %	50 %	25 %	25 %	218455008

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.