MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli O127:H6 str. E2348/69 plasmid pMAR2

Total Repeats: 112

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011603	TC	3	6	446	451	0 %	50 %	0 %	50 %	215276193
2	NC_011603	CA	3	6	733	738	50 %	0 %	0 %	50 %	215276193
3	NC_011603	AG	3	6	904	909	50 %	0 %	50 %	0 %	215276193
4	NC_011603	TA	3	6	3871	3876	50 %	50 %	0 %	0 %	215276196
5	NC_011603	CT	3	6	3985	3990	0 %	50 %	0 %	50 %	215276196
6	NC_011603	GC	3	6	4193	4198	0 %	0 %	50 %	50 %	215276196
7	NC_011603	AT	3	6	4566	4571	50 %	50 %	0 %	0 %	215276196
8	NC_011603	AT	3	6	5021	5026	50 %	50 %	0 %	0 %	215276196
9	NC_011603	TA	3	6	5893	5898	50 %	50 %	0 %	0 %	215276197
10	NC_011603	AT	3	6	6154	6159	50 %	50 %	0 %	0 %	215276197
11	NC_011603	TC	3	6	7303	7308	0 %	50 %	0 %	50 %	215276199
12	NC_011603	TA	3	6	7438	7443	50 %	50 %	0 %	0 %	215276199
13	NC_011603	TA	3	6	7514	7519	50 %	50 %	0 %	0 %	215276199
14	NC_011603	AT	3	6	8262	8267	50 %	50 %	0 %	0 %	215276199
15	NC_011603	AT	3	6	9041	9046	50 %	50 %	0 %	0 %	215276200
16	NC_011603	GA	4	8	9419	9426	50 %	0 %	50 %	0 %	215276200
17	NC_011603	TA	3	6	9571	9576	50 %	50 %	0 %	0 %	215276200
18	NC_011603	AT	3	6	10297	10302	50 %	50 %	0 %	0 %	215276201
19	NC_011603	TA	3	6	10714	10719	50 %	50 %	0 %	0 %	215276202
20	NC_011603	AG	3	6	11072	11077	50 %	0 %	50 %	0 %	215276202
21	NC_011603	CT	3	6	11341	11346	0 %	50 %	0 %	50 %	215276202
22	NC_011603	AT	3	6	11787	11792	50 %	50 %	0 %	0 %	215276203
23	NC_011603	TA	3	6	12501	12506	50 %	50 %	0 %	0 %	215276205
24	NC_011603	GA	3	6	13411	13416	50 %	0 %	50 %	0 %	215276206
25	NC_011603	AT	4	8	13566	13573	50 %	50 %	0 %	0 %	215276207
26	NC_011603	AT	3	6	17705	17710	50 %	50 %	0 %	0 %	215276210
27	NC_011603	GA	3	6	18062	18067	50 %	0 %	50 %	0 %	215276211
28	NC_011603	TA	3	6	18278	18283	50 %	50 %	0 %	0 %	215276211
29	NC_011603	GA	3	6	18592	18597	50 %	0 %	50 %	0 %	215276212
30	NC_011603	TC	3	6	29617	29622	0 %	50 %	0 %	50 %	215276213
31	NC_011603	CA	3	6	30009	30014	50 %	0 %	0 %	50 %	215276214
32	NC_011603	CA	3	6	32347	32352	50 %	0 %	0 %	50 %	215276216
33	NC_011603	TG	3	6	32406	32411	0 %	50 %	50 %	0 %	215276216
34	NC_011603	TC	3	6	33248	33253	0 %	50 %	0 %	50 %	215276218
35	NC_011603	CG	3	6	33498	33503	0 %	0 %	50 %	50 %	215276218
36	NC_011603	TG	3	6	34151	34156	0 %	50 %	50 %	0 %	215276218
37	NC_011603	GC	3	6	34618	34623	0 %	0 %	50 %	50 %	215276219
38	NC_011603	TG	3	6	34646	34651	0 %	50 %	50 %	0 %	215276219
39	NC_011603	GA	3	6	34764	34769	50 %	0 %	50 %	0 %	215276219
40	NC_011603	CT	3	6	35429	35434	0 %	50 %	0 %	50 %	215276220
41	NC_011603	CA	3	6	36135	36140	50 %	0 %	0 %	50 %	215276221
42	NC_011603	CT	3	6	37426	37431	0 %	50 %	0 %	50 %	215276222
43	NC_011603	GA	3	6	38338	38343	50 %	0 %	50 %	0 %	215276222
44	NC_011603	TG	3	6	39169	39174	0 %	50 %	50 %	0 %	215276222
45	NC_011603	CT	3	6	39290	39295	0 %	50 %	0 %	50 %	215276222
46	NC_011603	TG	3	6	39790	39795	0 %	50 %	50 %	0 %	215276222
47	NC_011603	CT	3	6	40381	40386	0 %	50 %	0 %	50 %	215276222
48	NC_011603	TG	4	8	41695	41702	0 %	50 %	50 %	0 %	215276222
49	NC_011603	GA	3	6	42382	42387	50 %	0 %	50 %	0 %	215276223
50	NC_011603	AT	3	6	42608	42613	50 %	50 %	0 %	0 %	215276224
51	NC_011603	CA	4	8	42709	42716	50 %	0 %	0 %	50 %	215276224
52	NC_011603	CA	3	6	43778	43783	50 %	0 %	0 %	50 %	215276225
53	NC_011603	GT	3	6	44118	44123	0 %	50 %	50 %	0 %	215276225
54	NC_011603	AT	3	6	44738	44743	50 %	50 %	0 %	0 %	215276225
55	NC_011603	GA	3	6	46086	46091	50 %	0 %	50 %	0 %	215276227
56	NC_011603	AT	3	6	46351	46356	50 %	50 %	0 %	0 %	215276227
57	NC_011603	AG	3	6	46490	46495	50 %	0 %	50 %	0 %	215276227
58	NC_011603	TG	3	6	47876	47881	0 %	50 %	50 %	0 %	215276228
59	NC_011603	AC	3	6	48060	48065	50 %	0 %	0 %	50 %	215276228
60	NC_011603	TG	3	6	48692	48697	0 %	50 %	50 %	0 %	215276228
61	NC_011603	GT	3	6	49850	49855	0 %	50 %	50 %	0 %	215276229
62	NC_011603	TG	3	6	50608	50613	0 %	50 %	50 %	0 %	215276229
63	NC_011603	TC	3	6	51111	51116	0 %	50 %	0 %	50 %	215276230
64	NC_011603	AT	3	6	51174	51179	50 %	50 %	0 %	0 %	215276231
65	NC_011603	GA	3	6	51913	51918	50 %	0 %	50 %	0 %	215276232
66	NC_011603	AG	3	6	52324	52329	50 %	0 %	50 %	0 %	215276234
67	NC_011603	AT	3	6	52363	52368	50 %	50 %	0 %	0 %	215276234
68	NC_011603	CG	3	6	58810	58815	0 %	0 %	50 %	50 %	215276243
69	NC_011603	TG	3	6	58859	58864	0 %	50 %	50 %	0 %	215276243
70	NC_011603	CA	3	6	59484	59489	50 %	0 %	0 %	50 %	215276243
71	NC_011603	CT	3	6	59747	59752	0 %	50 %	0 %	50 %	215276243
72	NC_011603	GC	3	6	59753	59758	0 %	0 %	50 %	50 %	215276243
73	NC_011603	AC	3	6	60341	60346	50 %	0 %	0 %	50 %	215276243
74	NC_011603	TG	3	6	60461	60466	0 %	50 %	50 %	0 %	215276243
75	NC_011603	CG	3	6	60777	60782	0 %	0 %	50 %	50 %	215276243
76	NC_011603	AG	3	6	62607	62612	50 %	0 %	50 %	0 %	215276247
77	NC_011603	CG	3	6	62920	62925	0 %	0 %	50 %	50 %	215276248
78	NC_011603	GC	3	6	63615	63620	0 %	0 %	50 %	50 %	215276249
79	NC_011603	GC	3	6	64678	64683	0 %	0 %	50 %	50 %	215276250
80	NC_011603	AT	3	6	65622	65627	50 %	50 %	0 %	0 %	215276251
81	NC_011603	AG	3	6	65834	65839	50 %	0 %	50 %	0 %	215276251
82	NC_011603	CT	3	6	66692	66697	0 %	50 %	0 %	50 %	215276254
83	NC_011603	TA	3	6	67475	67480	50 %	50 %	0 %	0 %	215276255
84	NC_011603	CT	3	6	67482	67487	0 %	50 %	0 %	50 %	215276255
85	NC_011603	CA	3	6	67669	67674	50 %	0 %	0 %	50 %	215276255
86	NC_011603	TC	3	6	67915	67920	0 %	50 %	0 %	50 %	215276256
87	NC_011603	GA	3	6	67979	67984	50 %	0 %	50 %	0 %	215276256
88	NC_011603	CA	3	6	71937	71942	50 %	0 %	0 %	50 %	215276259
89	NC_011603	CG	3	6	72590	72595	0 %	0 %	50 %	50 %	215276259
90	NC_011603	GA	3	6	72840	72845	50 %	0 %	50 %	0 %	215276259
91	NC_011603	TC	3	6	74695	74700	0 %	50 %	0 %	50 %	215276260
92	NC_011603	CG	3	6	74870	74875	0 %	0 %	50 %	50 %	215276260
93	NC_011603	GT	3	6	75714	75719	0 %	50 %	50 %	0 %	215276262
94	NC_011603	AG	3	6	79382	79387	50 %	0 %	50 %	0 %	215276265
95	NC_011603	TG	3	6	81815	81820	0 %	50 %	50 %	0 %	215276266
96	NC_011603	AT	3	6	85503	85508	50 %	50 %	0 %	0 %	215276268
97	NC_011603	AC	3	6	86587	86592	50 %	0 %	0 %	50 %	215276270
98	NC_011603	AT	3	6	88211	88216	50 %	50 %	0 %	0 %	215276271
99	NC_011603	GT	3	6	88575	88580	0 %	50 %	50 %	0 %	215276271
100	NC_011603	AC	3	6	88981	88986	50 %	0 %	0 %	50 %	215276272
101	NC_011603	GA	3	6	90272	90277	50 %	0 %	50 %	0 %	215276273
102	NC_011603	GC	3	6	90548	90553	0 %	0 %	50 %	50 %	215276274
103	NC_011603	TC	3	6	90593	90598	0 %	50 %	0 %	50 %	215276274
104	NC_011603	GC	3	6	91428	91433	0 %	0 %	50 %	50 %	215276275
105	NC_011603	CT	4	8	91945	91952	0 %	50 %	0 %	50 %	215276276
106	NC_011603	AT	3	6	93014	93019	50 %	50 %	0 %	0 %	215276278
107	NC_011603	CG	3	6	93122	93127	0 %	0 %	50 %	50 %	215276278
108	NC_011603	CA	3	6	93326	93331	50 %	0 %	0 %	50 %	215276278
109	NC_011603	GA	3	6	93682	93687	50 %	0 %	50 %	0 %	215276278
110	NC_011603	GA	3	6	94156	94161	50 %	0 %	50 %	0 %	215276278
111	NC_011603	GA	3	6	95810	95815	50 %	0 %	50 %	0 %	215276279
112	NC_011603	CT	3	6	96922	96927	0 %	50 %	0 %	50 %	215276281

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.